MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 2809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015851	TTC	2	6	175126	175131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783799
2002	NC_015851	CTG	2	6	175165	175170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783799
2003	NC_015851	GCG	2	6	175259	175264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783799
2004	NC_015851	CGC	2	6	175450	175455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783799
2005	NC_015851	TGG	2	6	175491	175496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783799
2006	NC_015851	AGG	2	6	175705	175710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783800
2007	NC_015851	GTT	2	6	175850	175855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783800
2008	NC_015851	GCG	2	6	175862	175867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783800
2009	NC_015851	GCC	2	6	176009	176014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783801
2010	NC_015851	GGC	2	6	176032	176037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783801
2011	NC_015851	TGG	2	6	176217	176222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783801
2012	NC_015851	GCT	2	6	176396	176401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783802
2013	NC_015851	AAG	2	6	176410	176415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783802
2014	NC_015851	CGA	2	6	176495	176500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783802
2015	NC_015851	CGC	2	6	176621	176626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783802
2016	NC_015851	CGC	2	6	176706	176711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783802
2017	NC_015851	GCG	2	6	176794	176799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783802
2018	NC_015851	GAA	2	6	176820	176825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783802
2019	NC_015851	GGC	2	6	177107	177112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783803
2020	NC_015851	CAT	2	6	177113	177118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783803
2021	NC_015851	TTG	2	6	177186	177191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783803
2022	NC_015851	CGG	2	6	177222	177227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783803
2023	NC_015851	AGC	2	6	177465	177470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783803
2024	NC_015851	CCT	2	6	177505	177510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783803
2025	NC_015851	CGC	3	9	177848	177856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783803
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2027	NC_015851	TTG	2	6	177873	177878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783803
2028	NC_015851	GCG	2	6	177906	177911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783803
2029	NC_015851	AGT	2	6	177955	177960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783803
2030	NC_015851	CCG	3	9	178028	178036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783803
2031	NC_015851	TGG	2	6	178398	178403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783804
2032	NC_015851	TCG	2	6	178688	178693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783804
2033	NC_015851	GAT	2	6	178771	178776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783804
2034	NC_015851	TGG	2	6	178952	178957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783805
2035	NC_015851	CGT	2	6	179022	179027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783805
2036	NC_015851	TGG	2	6	179055	179060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783805
2037	NC_015851	AGC	2	6	179189	179194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783805
2038	NC_015851	CTG	2	6	179231	179236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783805
2039	NC_015851	GTC	2	6	179441	179446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783805
2040	NC_015851	CGT	2	6	179461	179466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783805
2041	NC_015851	CAC	2	6	179510	179515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783805
2042	NC_015851	ATG	2	6	179540	179545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783805
2043	NC_015851	ACC	2	6	179574	179579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783805
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2045	NC_015851	GCA	2	6	179753	179758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783806
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2047	NC_015851	TGA	2	6	179834	179839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783806
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2049	NC_015851	TGC	2	6	179889	179894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783806
2050	NC_015851	GAT	2	6	179928	179933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783806
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2052	NC_015851	CAG	2	6	180303	180308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783806
2053	NC_015851	TCG	2	6	180343	180348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783806
2054	NC_015851	GAT	2	6	180353	180358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783806
2055	NC_015851	CCA	2	6	180442	180447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783807
2056	NC_015851	GCA	2	6	180472	180477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783807
2057	NC_015851	CGC	2	6	180484	180489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783807
2058	NC_015851	GCC	2	6	180521	180526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783807
2059	NC_015851	CGC	2	6	180595	180600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783807
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2061	NC_015851	GCC	2	6	180658	180663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783807
2062	NC_015851	TTC	3	9	180915	180923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783807
2063	NC_015851	AGC	2	6	181092	181097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783807
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2065	NC_015851	TCG	2	6	181312	181317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
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2067	NC_015851	GCT	2	6	181408	181413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
2068	NC_015851	TCG	2	6	181582	181587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
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2071	NC_015851	ATC	2	6	181824	181829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783808
2072	NC_015851	TAC	2	6	181835	181840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783808
2073	NC_015851	CAT	2	6	181975	181980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783808
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2084	NC_015851	GCC	2	6	183409	183414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783809
2085	NC_015851	CAA	2	6	183504	183509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783809
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2091	NC_015851	AGC	2	6	183680	183685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783810
2092	NC_015851	GGC	2	6	183687	183692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783810
2093	NC_015851	GTG	2	6	183717	183722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783810
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2097	NC_015851	CCA	3	9	184041	184049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
2098	NC_015851	CGC	2	6	184277	184282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783811
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2101	NC_015851	CGT	2	6	185246	185251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
2102	NC_015851	GCC	2	6	185252	185257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783812
2103	NC_015851	GAG	2	6	185354	185359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783812
2104	NC_015851	CCA	2	6	185398	185403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783812
2105	NC_015851	TCA	2	6	185670	185675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783812
2106	NC_015851	AAC	2	6	185774	185779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783812
2107	NC_015851	TGC	2	6	185878	185883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
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2109	NC_015851	GAT	2	6	186007	186012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783813
2110	NC_015851	CTG	2	6	186029	186034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783813
2111	NC_015851	TCA	2	6	186042	186047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783813
2112	NC_015851	GAT	2	6	186061	186066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783813
2113	NC_015851	GTG	3	9	186164	186172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783813
2114	NC_015851	GCG	2	6	186254	186259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783813
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2117	NC_015851	GCA	2	6	186760	186765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783814
2118	NC_015851	GGA	2	6	186943	186948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783814
2119	NC_015851	GCG	2	6	187013	187018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783814
2120	NC_015851	CAT	2	6	187076	187081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783814
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2122	NC_015851	GGT	2	6	187120	187125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783814
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2476	NC_015851	TGC	2	6	217793	217798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783843
2477	NC_015851	AGT	2	6	217858	217863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783843
2478	NC_015851	AGT	3	9	217914	217922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783843
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2480	NC_015851	GAC	2	6	217960	217965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783843
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2482	NC_015851	GAT	2	6	218497	218502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783843
2483	NC_015851	CCG	2	6	218989	218994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783844
2484	NC_015851	AGC	2	6	219169	219174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783844
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2486	NC_015851	GCC	2	6	219374	219379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783844
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