MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 2809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015851	CGA	2	6	136179	136184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1502	NC_015851	CCA	2	6	136260	136265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783762
1503	NC_015851	CCG	2	6	136368	136373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783762
1504	NC_015851	TGT	2	6	136491	136496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783762
1505	NC_015851	CGT	2	6	136527	136532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1506	NC_015851	CGA	3	9	136551	136559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1507	NC_015851	CCT	2	6	136563	136568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783762
1508	NC_015851	GCG	2	6	136637	136642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783762
1509	NC_015851	TCG	2	6	136812	136817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1510	NC_015851	CGG	2	6	136842	136847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783762
1511	NC_015851	CGC	2	6	136866	136871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783762
1512	NC_015851	GGC	2	6	136923	136928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783762
1513	NC_015851	GAC	2	6	136942	136947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1514	NC_015851	TCG	2	6	136994	136999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1515	NC_015851	ATG	2	6	137027	137032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783762
1516	NC_015851	GCC	2	6	137039	137044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783762
1517	NC_015851	CCA	2	6	137108	137113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783762
1518	NC_015851	TGT	2	6	137172	137177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783762
1519	NC_015851	CGA	2	6	137178	137183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1520	NC_015851	CGT	2	6	137310	137315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1521	NC_015851	ATT	2	6	137334	137339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783763
1522	NC_015851	CCA	2	6	137415	137420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783763
1523	NC_015851	TGC	2	6	137520	137525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783763
1524	NC_015851	GCC	2	6	137528	137533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783763
1525	NC_015851	TCG	2	6	137555	137560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783763
1526	NC_015851	TCT	2	6	137596	137601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783764
1527	NC_015851	GGA	2	6	137736	137741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783764
1528	NC_015851	TGA	2	6	137771	137776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783764
1529	NC_015851	CTC	2	6	137844	137849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783764
1530	NC_015851	GGT	2	6	137853	137858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783764
1531	NC_015851	GCC	2	6	137923	137928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783764
1532	NC_015851	CGG	2	6	137975	137980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1533	NC_015851	CAG	2	6	138081	138086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1534	NC_015851	TGC	2	6	138125	138130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1535	NC_015851	GCA	2	6	138263	138268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1536	NC_015851	CGG	2	6	138325	138330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1537	NC_015851	GTC	2	6	138379	138384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1538	NC_015851	GGC	2	6	138423	138428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1539	NC_015851	TCG	2	6	138523	138528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1540	NC_015851	TCG	3	9	138553	138561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1541	NC_015851	TTC	2	6	138621	138626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783764
1542	NC_015851	AGC	2	6	138661	138666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1543	NC_015851	GTG	2	6	138697	138702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783764
1544	NC_015851	CGG	2	6	138842	138847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1545	NC_015851	GCG	2	6	138886	138891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1546	NC_015851	ATC	2	6	138919	138924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783764
1547	NC_015851	TCG	2	6	138925	138930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1548	NC_015851	CTT	2	6	138984	138989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783764
1549	NC_015851	CGG	2	6	139006	139011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1550	NC_015851	CCA	2	6	139085	139090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783764
1551	NC_015851	CCA	2	6	139094	139099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783764
1552	NC_015851	GTT	2	6	139143	139148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783764
1553	NC_015851	CCT	2	6	139169	139174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783764
1554	NC_015851	TCG	2	6	139216	139221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1555	NC_015851	CTG	2	6	139416	139421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1556	NC_015851	GTC	2	6	139476	139481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1557	NC_015851	GCG	2	6	139544	139549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1558	NC_015851	CAG	2	6	139596	139601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1559	NC_015851	GGC	2	6	139740	139745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
1560	NC_015851	CCA	2	6	139787	139792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783764
1561	NC_015851	CGA	2	6	139886	139891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1562	NC_015851	CTT	2	6	139902	139907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783764
1563	NC_015851	CGA	2	6	140006	140011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783764
1564	NC_015851	CGG	2	6	140203	140208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783765
1565	NC_015851	CGG	2	6	140255	140260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783765
1566	NC_015851	CTC	2	6	140316	140321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783765
1567	NC_015851	GGC	2	6	140328	140333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783765
1568	NC_015851	GCT	2	6	140366	140371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783765
1569	NC_015851	ATC	2	6	140407	140412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783765
1570	NC_015851	GGT	2	6	140444	140449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783766
1571	NC_015851	CGG	2	6	140468	140473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783766
1572	NC_015851	GTC	2	6	140505	140510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783766
1573	NC_015851	CGG	2	6	140525	140530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783766
1574	NC_015851	CCG	2	6	140641	140646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783766
1575	NC_015851	CGA	2	6	140666	140671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783766
1576	NC_015851	GGT	2	6	140676	140681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783766
1577	NC_015851	CAC	2	6	140799	140804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783766
1578	NC_015851	TCG	2	6	141169	141174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783767
1579	NC_015851	CAG	2	6	141180	141185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783767
1580	NC_015851	GCC	2	6	141222	141227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783767
1581	NC_015851	TCC	2	6	141259	141264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783767
1582	NC_015851	GGC	2	6	141295	141300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783767
1583	NC_015851	GCC	2	6	141305	141310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783767
1584	NC_015851	GGA	2	6	141341	141346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783767
1585	NC_015851	TCG	2	6	141379	141384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783767
1586	NC_015851	CCG	2	6	141388	141393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783767
1587	NC_015851	GGT	2	6	141623	141628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783767
1588	NC_015851	TCG	2	6	141869	141874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783768
1589	NC_015851	ACC	2	6	141907	141912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783768
1590	NC_015851	TGG	2	6	141993	141998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783768
1591	NC_015851	CGG	2	6	142028	142033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783768
1592	NC_015851	GGC	2	6	142036	142041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783768
1593	NC_015851	TCG	2	6	142052	142057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783768
1594	NC_015851	GTC	2	6	142159	142164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783768
1595	NC_015851	GTC	2	6	142357	142362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783768
1596	NC_015851	TCC	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783768
1597	NC_015851	GGT	2	6	142416	142421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783768
1598	NC_015851	CCG	2	6	142448	142453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783768
1599	NC_015851	GTG	2	6	142462	142467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783768
1600	NC_015851	CGC	2	6	142486	142491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783768
1601	NC_015851	GCG	2	6	142498	142503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783768
1602	NC_015851	TCG	2	6	143216	143221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783769
1603	NC_015851	CTT	2	6	143332	143337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783769
1604	NC_015851	ACG	2	6	143372	143377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783769
1605	NC_015851	GTC	2	6	143380	143385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783769
1606	NC_015851	GAT	2	6	143425	143430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783769
1607	NC_015851	GCT	2	6	143434	143439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783769
1608	NC_015851	TCG	3	9	143501	143509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783769
1609	NC_015851	GAT	2	6	143527	143532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783769
1610	NC_015851	GCG	2	6	143569	143574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783770
1611	NC_015851	TCT	2	6	143590	143595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783770
1612	NC_015851	CGA	2	6	143604	143609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783770
1613	NC_015851	ATC	2	6	143641	143646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783770
1614	NC_015851	ATG	2	6	143803	143808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783770
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1617	NC_015851	CGC	2	6	144227	144232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783770
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1619	NC_015851	GTG	2	6	144295	144300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783770
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1999	NC_015851	CCG	2	6	174590	174595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783798
2000	NC_015851	TTA	2	6	174686	174691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783798

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