MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 2809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015851	CCT	2	6	220284	220289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783845
2502	NC_015851	AGG	2	6	220329	220334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783845
2503	NC_015851	CCT	2	6	220371	220376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783845
2504	NC_015851	AAT	2	6	220399	220404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783845
2505	NC_015851	TCC	2	6	220430	220435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783845
2506	NC_015851	CCA	2	6	220465	220470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783845
2507	NC_015851	CCT	2	6	220575	220580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783845
2508	NC_015851	AGG	2	6	220586	220591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783845
2509	NC_015851	CGA	2	6	220618	220623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783845
2510	NC_015851	GAA	2	6	220697	220702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783845
2511	NC_015851	CCG	2	6	220767	220772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783845
2512	NC_015851	ACG	2	6	220808	220813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783845
2513	NC_015851	CTC	2	6	220849	220854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783845
2514	NC_015851	CAG	2	6	220855	220860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783845
2515	NC_015851	CCG	2	6	220909	220914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783845
2516	NC_015851	CAA	2	6	220915	220920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783845
2517	NC_015851	TCG	2	6	220955	220960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783845
2518	NC_015851	CTC	2	6	220987	220992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783845
2519	NC_015851	CGC	2	6	221868	221873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783846
2520	NC_015851	GGA	2	6	221892	221897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783846
2521	NC_015851	TCG	2	6	221909	221914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783846
2522	NC_015851	TTC	2	6	221998	222003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783846
2523	NC_015851	CAT	2	6	222859	222864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783848
2524	NC_015851	GAA	2	6	222941	222946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783848
2525	NC_015851	GTG	2	6	223112	223117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783848
2526	NC_015851	GTT	2	6	223159	223164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783848
2527	NC_015851	ACA	2	6	223194	223199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783848
2528	NC_015851	GGT	2	6	223265	223270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783848
2529	NC_015851	GAG	2	6	223316	223321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783848
2530	NC_015851	GAG	2	6	224523	224528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783850
2531	NC_015851	CTT	2	6	224581	224586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783850
2532	NC_015851	AGC	2	6	224641	224646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783850
2533	NC_015851	TGT	2	6	225187	225192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783851
2534	NC_015851	CAT	2	6	225203	225208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783851
2535	NC_015851	GCC	2	6	225257	225262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783851
2536	NC_015851	TGG	2	6	225267	225272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783851
2537	NC_015851	GGC	2	6	225275	225280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783851
2538	NC_015851	TCG	2	6	225471	225476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783851
2539	NC_015851	CTT	2	6	225599	225604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783851
2540	NC_015851	CGG	2	6	225655	225660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783851
2541	NC_015851	CTT	2	6	225682	225687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783851
2542	NC_015851	TGC	2	6	225705	225710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783851
2543	NC_015851	CGA	2	6	225906	225911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783851
2544	NC_015851	CAG	2	6	225914	225919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783851
2545	NC_015851	ACC	2	6	225963	225968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783851
2546	NC_015851	GGA	2	6	225999	226004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783851
2547	NC_015851	AGC	2	6	226061	226066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783851
2548	NC_015851	ACC	2	6	226074	226079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783851
2549	NC_015851	TCT	2	6	226087	226092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783851
2550	NC_015851	ATC	2	6	226176	226181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783851
2551	NC_015851	TTG	2	6	226545	226550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783852
2552	NC_015851	ACC	2	6	226556	226561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783852
2553	NC_015851	ATA	2	6	226571	226576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783852
2554	NC_015851	CTT	2	6	226600	226605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783852
2555	NC_015851	CAG	2	6	226619	226624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783852
2556	NC_015851	GAT	2	6	226781	226786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783852
2557	NC_015851	GCG	2	6	226935	226940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783852
2558	NC_015851	AAC	2	6	227030	227035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783852
2559	NC_015851	TTG	3	9	227151	227159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783852
2560	NC_015851	CGC	2	6	227309	227314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783853
2561	NC_015851	GAT	2	6	227329	227334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783853
2562	NC_015851	TGA	2	6	227370	227375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783853
2563	NC_015851	CAA	2	6	227479	227484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783853
2564	NC_015851	GGC	2	6	227491	227496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783853
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2567	NC_015851	GCC	2	6	227578	227583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783854
2568	NC_015851	GCT	2	6	227655	227660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2569	NC_015851	GCA	2	6	227670	227675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2570	NC_015851	TGG	2	6	227693	227698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783854
2571	NC_015851	AAG	2	6	227720	227725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783854
2572	NC_015851	CCT	2	6	227733	227738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783854
2573	NC_015851	TGA	2	6	227748	227753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783854
2574	NC_015851	CAG	2	6	227944	227949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2575	NC_015851	TGC	2	6	227979	227984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2576	NC_015851	CCT	2	6	228048	228053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783854
2577	NC_015851	TCG	2	6	228149	228154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2578	NC_015851	TCG	2	6	228311	228316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2579	NC_015851	CTT	2	6	228343	228348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783854
2580	NC_015851	GCC	2	6	228367	228372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783854
2581	NC_015851	GCC	2	6	228421	228426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783854
2582	NC_015851	CAG	3	9	228535	228543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783854
2583	NC_015851	GCG	2	6	228592	228597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783854
2584	NC_015851	TTC	2	6	229264	229269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783855
2585	NC_015851	TGC	2	6	229286	229291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783855
2586	NC_015851	CCA	2	6	229302	229307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783855
2587	NC_015851	GGC	2	6	229318	229323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783855
2588	NC_015851	ACC	2	6	229385	229390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783855
2589	NC_015851	TCT	2	6	229479	229484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783855
2590	NC_015851	ATC	2	6	229490	229495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783855
2591	NC_015851	GCT	2	6	229587	229592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783855
2592	NC_015851	CGA	2	6	230195	230200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783856
2593	NC_015851	TCG	2	6	230227	230232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783856
2594	NC_015851	GAA	2	6	230375	230380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783856
2595	NC_015851	GGA	2	6	230442	230447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783857
2596	NC_015851	GCG	2	6	230457	230462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783857
2597	NC_015851	GCG	2	6	230518	230523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783857
2598	NC_015851	AAT	2	6	231019	231024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783858
2599	NC_015851	CAT	2	6	231037	231042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783858
2600	NC_015851	GGC	2	6	231097	231102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783858
2601	NC_015851	TGA	2	6	231194	231199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783858
2602	NC_015851	ATG	2	6	231251	231256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783858
2603	NC_015851	GAT	2	6	231534	231539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783859
2604	NC_015851	CGG	2	6	231551	231556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783859
2605	NC_015851	AGA	2	6	231623	231628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783859
2606	NC_015851	GGT	2	6	231636	231641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783859
2607	NC_015851	AGC	2	6	231692	231697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783859
2608	NC_015851	TCC	2	6	231711	231716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783859
2609	NC_015851	TGG	2	6	231746	231751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783859
2610	NC_015851	CTG	2	6	231796	231801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783859
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2612	NC_015851	TCG	2	6	231974	231979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783859
2613	NC_015851	AGC	2	6	232004	232009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783859
2614	NC_015851	AAG	2	6	232111	232116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783859
2615	NC_015851	GCG	2	6	232231	232236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783859
2616	NC_015851	GAG	2	6	232300	232305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783859
2617	NC_015851	GCC	2	6	232435	232440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783859
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