MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 2809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015851	GAT	2	6	89449	89454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783711
1002	NC_015851	CGC	2	6	89497	89502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783711
1003	NC_015851	CGG	2	6	89747	89752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783711
1004	NC_015851	TGG	2	6	89808	89813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1005	NC_015851	CAG	3	9	89907	89915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1006	NC_015851	GTG	2	6	90089	90094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1007	NC_015851	ATC	2	6	90290	90295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783711
1008	NC_015851	TGG	3	9	90465	90473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1009	NC_015851	GCG	2	6	90506	90511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783711
1010	NC_015851	TGG	2	6	90516	90521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1011	NC_015851	GCG	2	6	90533	90538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783711
1012	NC_015851	CAA	2	6	90778	90783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783711
1013	NC_015851	CTG	2	6	90878	90883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1014	NC_015851	ACG	2	6	90918	90923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1015	NC_015851	GTG	2	6	90932	90937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1016	NC_015851	TCG	2	6	90939	90944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1017	NC_015851	TGG	2	6	91008	91013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1018	NC_015851	GTC	2	6	91148	91153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1019	NC_015851	TCG	2	6	91188	91193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1020	NC_015851	AGC	2	6	91276	91281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1021	NC_015851	GGT	2	6	91315	91320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1022	NC_015851	CGG	2	6	91332	91337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783711
1023	NC_015851	CTG	2	6	91397	91402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1024	NC_015851	TGC	2	6	91411	91416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783711
1025	NC_015851	TGG	2	6	91455	91460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783711
1026	NC_015851	TCC	2	6	91481	91486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783711
1027	NC_015851	ACC	2	6	91667	91672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783712
1028	NC_015851	CAC	2	6	91720	91725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783712
1029	NC_015851	GCC	2	6	91736	91741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783712
1030	NC_015851	TGG	2	6	91824	91829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783712
1031	NC_015851	CTG	2	6	91850	91855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783712
1032	NC_015851	GTG	2	6	91868	91873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783712
1033	NC_015851	GAC	2	6	91880	91885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783712
1034	NC_015851	GTG	2	6	91901	91906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783712
1035	NC_015851	TGG	2	6	91935	91940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783712
1036	NC_015851	AAT	2	6	92017	92022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783712
1037	NC_015851	CCG	2	6	92228	92233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783713
1038	NC_015851	GAA	2	6	92254	92259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783713
1039	NC_015851	TCA	2	6	92510	92515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783714
1040	NC_015851	TGA	2	6	92528	92533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783714
1041	NC_015851	TGG	2	6	93161	93166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783715
1042	NC_015851	ATG	2	6	93249	93254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783715
1043	NC_015851	TCA	2	6	93310	93315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783715
1044	NC_015851	TGG	2	6	93363	93368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783715
1045	NC_015851	ATG	2	6	93396	93401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783715
1046	NC_015851	GAC	2	6	93899	93904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783716
1047	NC_015851	ATG	2	6	94036	94041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783716
1048	NC_015851	TGC	2	6	94083	94088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783716
1049	NC_015851	ATA	2	6	94204	94209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783716
1050	NC_015851	GCA	2	6	94217	94222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783716
1051	NC_015851	CCA	2	6	94255	94260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783716
1052	NC_015851	CAG	2	6	94376	94381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783716
1053	NC_015851	AGG	2	6	94571	94576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783716
1054	NC_015851	TGT	2	6	94616	94621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783716
1055	NC_015851	CAA	2	6	94772	94777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783716
1056	NC_015851	CCA	2	6	94871	94876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783716
1057	NC_015851	GCC	3	9	94930	94938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783716
1058	NC_015851	CAG	2	6	95250	95255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783716
1059	NC_015851	GGC	3	9	95342	95350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783717
1060	NC_015851	TGC	2	6	95364	95369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783717
1061	NC_015851	CTG	2	6	95370	95375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783717
1062	NC_015851	CTG	2	6	95388	95393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783717
1063	NC_015851	ACC	2	6	95493	95498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783717
1064	NC_015851	GCC	2	6	95568	95573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783717
1065	NC_015851	CCG	2	6	95692	95697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783717
1066	NC_015851	GCC	2	6	95766	95771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783717
1067	NC_015851	GGC	2	6	95834	95839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783717
1068	NC_015851	AGC	3	9	95844	95852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783717
1069	NC_015851	GCA	2	6	95854	95859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783717
1070	NC_015851	GGT	2	6	95977	95982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783718
1071	NC_015851	GCC	2	6	96007	96012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783718
1072	NC_015851	CTG	2	6	96055	96060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783718
1073	NC_015851	TGC	2	6	96257	96262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783718
1074	NC_015851	GCT	2	6	96304	96309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783718
1075	NC_015851	ACT	2	6	96412	96417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783718
1076	NC_015851	CGT	2	6	96664	96669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783718
1077	NC_015851	CAG	2	6	96802	96807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783718
1078	NC_015851	GAT	2	6	96837	96842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783718
1079	NC_015851	GCA	2	6	96957	96962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783718
1080	NC_015851	CGC	2	6	96969	96974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783718
1081	NC_015851	AAC	2	6	97051	97056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783718
1082	NC_015851	CAA	2	6	97104	97109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783718
1083	NC_015851	CGC	2	6	97332	97337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783718
1084	NC_015851	GGC	2	6	97453	97458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783718
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1087	NC_015851	CAC	2	6	97604	97609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783719
1088	NC_015851	ATA	2	6	97731	97736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783719
1089	NC_015851	ATA	2	6	97851	97856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783719
1090	NC_015851	ATG	2	6	97905	97910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783719
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1092	NC_015851	ATG	2	6	98075	98080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783719
1093	NC_015851	TCG	2	6	98159	98164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783719
1094	NC_015851	GCC	2	6	98234	98239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783719
1095	NC_015851	AGA	2	6	98424	98429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783719
1096	NC_015851	GAT	2	6	98456	98461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783719
1097	NC_015851	TGA	3	9	98520	98528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783719
1098	NC_015851	CAG	2	6	98549	98554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783719
1099	NC_015851	ATG	2	6	98643	98648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783719
1100	NC_015851	AGT	2	6	99958	99963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783720
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1103	NC_015851	CAA	2	6	100534	100539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783721
1104	NC_015851	CCT	2	6	100575	100580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783721
1105	NC_015851	GCC	2	6	100587	100592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783721
1106	NC_015851	CCA	2	6	100598	100603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783721
1107	NC_015851	TTA	2	6	100617	100622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783721
1108	NC_015851	TGC	2	6	101121	101126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783722
1109	NC_015851	ATG	2	6	101217	101222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783722
1110	NC_015851	AGT	2	6	101285	101290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783722
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1117	NC_015851	GGA	2	6	101951	101956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783722
1118	NC_015851	CAC	2	6	101969	101974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783722
1119	NC_015851	AAT	2	6	102056	102061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783722
1120	NC_015851	CCA	2	6	102135	102140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783722
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1122	NC_015851	TGG	2	6	102194	102199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783722
1123	NC_015851	CAG	2	6	102333	102338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783722
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1126	NC_015851	GCT	2	6	102622	102627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783723
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1240	NC_015851	GAT	2	6	115208	115213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783734
1241	NC_015851	AAT	2	6	115293	115298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783734
1242	NC_015851	CGA	2	6	115454	115459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783734
1243	NC_015851	TTG	2	6	115675	115680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783735
1244	NC_015851	TCA	2	6	115752	115757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783735
1245	NC_015851	CAC	2	6	115773	115778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783735
1246	NC_015851	GAC	2	6	115788	115793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783735
1247	NC_015851	ATA	2	6	116113	116118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783735
1248	NC_015851	GGT	2	6	116175	116180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783735
1249	NC_015851	GGC	2	6	116266	116271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783735
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1251	NC_015851	CAT	2	6	116325	116330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783735
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1254	NC_015851	CTG	2	6	116711	116716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783736
1255	NC_015851	ACC	2	6	116759	116764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783736
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1264	NC_015851	GAA	2	6	118012	118017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783737
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1270	NC_015851	TGG	2	6	118823	118828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783738
1271	NC_015851	CTA	2	6	118842	118847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783738
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1477	NC_015851	TCC	2	6	134577	134582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783760
1478	NC_015851	GGT	2	6	134588	134593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783760
1479	NC_015851	GGC	4	12	134858	134869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783761
1480	NC_015851	CAG	2	6	134882	134887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783761
1481	NC_015851	CGG	2	6	134910	134915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783761
1482	NC_015851	GCC	2	6	135039	135044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783761
1483	NC_015851	CGG	2	6	135046	135051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783761
1484	NC_015851	CCG	2	6	135244	135249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783761
1485	NC_015851	GAG	2	6	135275	135280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783761
1486	NC_015851	AAG	2	6	135318	135323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783761
1487	NC_015851	CTG	2	6	135338	135343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783761
1488	NC_015851	TTC	2	6	135406	135411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783762
1489	NC_015851	CGT	2	6	135480	135485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1490	NC_015851	TGG	2	6	135525	135530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783762
1491	NC_015851	GTT	2	6	135540	135545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783762
1492	NC_015851	TCG	2	6	135662	135667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
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1494	NC_015851	CAG	2	6	135742	135747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783762
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1498	NC_015851	TCG	2	6	135863	135868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783762
1499	NC_015851	CCG	2	6	136019	136024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783762
1500	NC_015851	GGC	2	6	136171	136176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783762

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