MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 16461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011988	ATC	2	6	197884	197889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106291
2502	NC_011988	CCG	2	6	197897	197902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106291
2503	NC_011988	CCA	2	6	197962	197967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106291
2504	NC_011988	CGC	2	6	198037	198042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106291
2505	NC_011988	GCA	2	6	198043	198048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106291
2506	NC_011988	ATC	2	6	198084	198089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106291
2507	NC_011988	TGC	2	6	198107	198112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106291
2508	NC_011988	TCA	2	6	198139	198144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106291
2509	NC_011988	TGC	2	6	198175	198180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106291
2510	NC_011988	ATC	2	6	198238	198243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106291
2511	NC_011988	GCG	2	6	198273	198278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106291
2512	NC_011988	CAA	2	6	198298	198303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106291
2513	NC_011988	ATC	2	6	198512	198517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106292
2514	NC_011988	CGG	2	6	198524	198529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106292
2515	NC_011988	GTC	2	6	198584	198589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106292
2516	NC_011988	TCG	2	6	198645	198650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106292
2517	NC_011988	TAT	2	6	198679	198684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106292
2518	NC_011988	GCG	2	6	198806	198811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106292
2519	NC_011988	CCG	2	6	198870	198875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106292
2520	NC_011988	GTT	2	6	198916	198921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106292
2521	NC_011988	CCG	2	6	198975	198980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106292
2522	NC_011988	TGA	2	6	199423	199428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106292
2523	NC_011988	CTG	2	6	199481	199486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106292
2524	NC_011988	ACG	2	6	199563	199568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106292
2525	NC_011988	CGC	2	6	199582	199587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106292
2526	NC_011988	ACT	2	6	199590	199595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106292
2527	NC_011988	TGG	2	6	199605	199610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106292
2528	NC_011988	CGC	2	6	199692	199697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106293
2529	NC_011988	CGA	2	6	199723	199728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106293
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2531	NC_011988	TGC	3	9	199845	199853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106293
2532	NC_011988	ACC	2	6	199901	199906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106293
2533	NC_011988	GAA	2	6	199973	199978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106293
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2539	NC_011988	GGC	2	6	202206	202211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106294
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2542	NC_011988	GTC	2	6	202291	202296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106294
2543	NC_011988	ATG	2	6	202436	202441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106294
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2551	NC_011988	CGG	2	6	202949	202954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106294
2552	NC_011988	CGG	2	6	203083	203088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106295
2553	NC_011988	GCC	2	6	203104	203109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106295
2554	NC_011988	CGC	2	6	203165	203170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106295
2555	NC_011988	AGC	2	6	203171	203176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106295
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2557	NC_011988	CGC	2	6	203282	203287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106295
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2559	NC_011988	ATG	2	6	203435	203440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106295
2560	NC_011988	AGC	2	6	203468	203473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106295
2561	NC_011988	ATC	2	6	203587	203592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106295
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2567	NC_011988	GCA	2	6	203923	203928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106295
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2572	NC_011988	GAC	2	6	204427	204432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106296
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2601	NC_011988	GCT	2	6	206983	206988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106298
2602	NC_011988	CGC	2	6	207018	207023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106298
2603	NC_011988	CGG	2	6	207035	207040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106298
2604	NC_011988	TCT	2	6	207056	207061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106298
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2606	NC_011988	GAC	2	6	207082	207087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106298
2607	NC_011988	GGC	2	6	207124	207129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106298
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2620	NC_011988	GAC	2	6	208877	208882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106300
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2737	NC_011988	GAA	2	6	218052	218057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106306
2738	NC_011988	TCG	2	6	218089	218094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106306
2739	NC_011988	TGA	2	6	218126	218131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106306
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2741	NC_011988	ACG	2	6	218383	218388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106306
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2745	NC_011988	TCG	2	6	218713	218718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106306
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2756	NC_011988	CAG	2	6	220823	220828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106308
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2762	NC_011988	GAT	2	6	221618	221623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106309
2763	NC_011988	CGC	2	6	221703	221708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106309
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2853	NC_011988	ATG	2	6	230192	230197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106315
2854	NC_011988	GCC	2	6	230350	230355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106315
2855	NC_011988	ATC	2	6	230406	230411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106315
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2858	NC_011988	ATG	2	6	230659	230664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106315
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2863	NC_011988	CTG	2	6	231479	231484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106316
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2970	NC_011988	GTC	2	6	240694	240699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106325
2971	NC_011988	TCT	2	6	240754	240759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106326
2972	NC_011988	CGT	2	6	240768	240773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106326
2973	NC_011988	CGT	2	6	240964	240969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106326
2974	NC_011988	CGC	2	6	241005	241010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106326
2975	NC_011988	TCC	2	6	241134	241139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106326
2976	NC_011988	CCG	2	6	241144	241149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106326
2977	NC_011988	TTC	2	6	241253	241258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106326
2978	NC_011988	TCG	2	6	241266	241271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106326
2979	NC_011988	ATC	2	6	241570	241575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106327
2980	NC_011988	CTT	2	6	241580	241585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106327
2981	NC_011988	CGT	2	6	241621	241626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106327
2982	NC_011988	TGA	2	6	241672	241677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106327
2983	NC_011988	TGA	2	6	241726	241731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106327
2984	NC_011988	GCC	2	6	241803	241808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106327
2985	NC_011988	TCA	2	6	241842	241847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106327
2986	NC_011988	TCG	2	6	241857	241862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106327
2987	NC_011988	CAA	2	6	242218	242223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106328
2988	NC_011988	CGG	2	6	242237	242242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106328
2989	NC_011988	CTG	2	6	242263	242268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106328
2990	NC_011988	CGG	2	6	242331	242336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106328
2991	NC_011988	TCA	3	9	242348	242356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106328
2992	NC_011988	CTG	2	6	242383	242388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106328
2993	NC_011988	TGA	2	6	242393	242398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106328
2994	NC_011988	CCG	2	6	242444	242449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106328
2995	NC_011988	GTG	2	6	242527	242532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106328
2996	NC_011988	AGA	2	6	242720	242725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106328
2997	NC_011988	CAA	2	6	242856	242861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106328
2998	NC_011988	AAC	2	6	242926	242931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106328
2999	NC_011988	GTC	2	6	242991	242996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106328
3000	NC_011988	CGC	2	6	243118	243123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106328

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