MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 16461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011988	TCG	3	9	392277	392285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106448
5002	NC_011988	GAA	2	6	392288	392293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106448
5003	NC_011988	GCA	2	6	392335	392340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106448
5004	NC_011988	GGT	2	6	392342	392347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106448
5005	NC_011988	GCG	2	6	392421	392426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106448
5006	NC_011988	CAG	2	6	392572	392577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5007	NC_011988	GGC	3	9	392593	392601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106449
5008	NC_011988	AGC	2	6	392720	392725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5009	NC_011988	AGC	2	6	392735	392740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5010	NC_011988	TCG	2	6	392886	392891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5011	NC_011988	CAG	2	6	392974	392979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5012	NC_011988	GCA	3	9	393083	393091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5013	NC_011988	CAG	2	6	393133	393138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5014	NC_011988	CCA	2	6	393228	393233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106449
5015	NC_011988	AGC	2	6	393263	393268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5016	NC_011988	GAC	2	6	393292	393297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5017	NC_011988	GTC	2	6	393308	393313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106449
5018	NC_011988	GCG	2	6	393334	393339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106449
5019	NC_011988	CGG	2	6	393433	393438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106450
5020	NC_011988	CTC	2	6	393458	393463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106450
5021	NC_011988	GTG	2	6	393484	393489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106450
5022	NC_011988	ATG	2	6	393582	393587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106450
5023	NC_011988	GCA	3	9	393604	393612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106450
5024	NC_011988	TTG	2	6	393622	393627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106450
5025	NC_011988	TCC	2	6	393660	393665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106450
5026	NC_011988	TTC	2	6	393680	393685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106450
5027	NC_011988	CAC	2	6	393707	393712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106450
5028	NC_011988	ACG	2	6	393741	393746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106450
5029	NC_011988	GCG	2	6	393781	393786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106450
5030	NC_011988	AAG	2	6	393788	393793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106450
5031	NC_011988	CGG	2	6	393847	393852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106450
5032	NC_011988	GAT	2	6	393887	393892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106450
5033	NC_011988	CCG	2	6	393893	393898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106450
5034	NC_011988	GCC	2	6	393963	393968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106450
5035	NC_011988	CGG	2	6	394054	394059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106450
5036	NC_011988	GAA	2	6	394144	394149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106450
5037	NC_011988	CCA	2	6	394260	394265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106451
5038	NC_011988	GAA	2	6	394271	394276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106451
5039	NC_011988	CGA	2	6	394486	394491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106451
5040	NC_011988	CGG	2	6	394499	394504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106451
5041	NC_011988	GAT	2	6	394532	394537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106451
5042	NC_011988	TCA	2	6	394560	394565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106451
5043	NC_011988	GGT	2	6	394628	394633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106451
5044	NC_011988	CTG	2	6	394706	394711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106451
5045	NC_011988	TTG	2	6	394719	394724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106451
5046	NC_011988	TGG	2	6	394876	394881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106451
5047	NC_011988	CTG	2	6	394896	394901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106451
5048	NC_011988	CGG	2	6	394924	394929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106451
5049	NC_011988	CAC	2	6	394985	394990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106451
5050	NC_011988	GGC	2	6	395090	395095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106451
5051	NC_011988	CAG	2	6	395442	395447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106452
5052	NC_011988	TCC	2	6	395575	395580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106452
5053	NC_011988	GAT	2	6	395730	395735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106452
5054	NC_011988	CAG	2	6	395760	395765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106452
5055	NC_011988	GCC	2	6	395784	395789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106452
5056	NC_011988	GCA	2	6	395810	395815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106452
5057	NC_011988	GCG	2	6	395908	395913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106452
5058	NC_011988	CGG	2	6	395954	395959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106452
5059	NC_011988	GCC	2	6	396003	396008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106452
5060	NC_011988	TGC	2	6	396014	396019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106452
5061	NC_011988	ATC	2	6	396097	396102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106452
5062	NC_011988	GGC	2	6	396113	396118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106452
5063	NC_011988	CCA	2	6	396122	396127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106452
5064	NC_011988	TCG	2	6	396154	396159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106452
5065	NC_011988	AAG	2	6	396235	396240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106452
5066	NC_011988	TGT	2	6	396248	396253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106452
5067	NC_011988	ATC	2	6	396277	396282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106452
5068	NC_011988	CCG	2	6	396369	396374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106452
5069	NC_011988	GTC	2	6	397023	397028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106453
5070	NC_011988	AGT	2	6	397104	397109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106453
5071	NC_011988	GTC	2	6	397155	397160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106453
5072	NC_011988	CGT	2	6	397301	397306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106453
5073	NC_011988	CCG	2	6	397313	397318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106453
5074	NC_011988	GCG	2	6	397360	397365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106453
5075	NC_011988	CGG	2	6	397381	397386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106453
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5077	NC_011988	CGG	2	6	397418	397423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106453
5078	NC_011988	CTG	2	6	397449	397454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106453
5079	NC_011988	GCG	2	6	397482	397487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106453
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5083	NC_011988	GCA	2	6	397678	397683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106453
5084	NC_011988	TGA	2	6	397781	397786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106453
5085	NC_011988	GCC	2	6	397859	397864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106453
5086	NC_011988	GCC	2	6	397911	397916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106453
5087	NC_011988	ACC	2	6	398106	398111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106454
5088	NC_011988	CAT	2	6	398271	398276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106454
5089	NC_011988	GCG	2	6	398443	398448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106454
5090	NC_011988	TGA	2	6	398504	398509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106454
5091	NC_011988	CCA	2	6	398620	398625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106454
5092	NC_011988	GGC	2	6	398853	398858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106454
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5099	NC_011988	GGC	2	6	399612	399617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106455
5100	NC_011988	CAT	2	6	399674	399679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106455
5101	NC_011988	GCC	2	6	399756	399761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106455
5102	NC_011988	GTC	2	6	399863	399868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106455
5103	NC_011988	CGG	2	6	399916	399921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106455
5104	NC_011988	GCG	2	6	400041	400046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106455
5105	NC_011988	GGC	2	6	400142	400147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106455
5106	NC_011988	AGA	2	6	400195	400200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106455
5107	NC_011988	GCC	2	6	400206	400211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106455
5108	NC_011988	CTG	2	6	400433	400438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106456
5109	NC_011988	GCT	2	6	400456	400461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106456
5110	NC_011988	TGA	2	6	400473	400478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106456
5111	NC_011988	AGG	2	6	400485	400490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106456
5112	NC_011988	TTA	2	6	400584	400589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106456
5113	NC_011988	TGT	2	6	400603	400608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106456
5114	NC_011988	TTC	2	6	400678	400683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106456
5115	NC_011988	TCG	3	9	400728	400736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106456
5116	NC_011988	TGC	2	6	400788	400793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106456
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5118	NC_011988	CTG	2	6	400904	400909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106456
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5473	NC_011988	GGC	2	6	427534	427539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106478
5474	NC_011988	GTC	2	6	427655	427660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106478
5475	NC_011988	TGA	2	6	427665	427670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106478
5476	NC_011988	TGG	2	6	427700	427705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106478
5477	NC_011988	GTG	2	6	427766	427771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106478
5478	NC_011988	ATC	2	6	427799	427804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106478
5479	NC_011988	CTA	2	6	427831	427836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106478
5480	NC_011988	GCT	2	6	427896	427901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106479
5481	NC_011988	TGA	2	6	427953	427958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106479
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5487	NC_011988	ATC	2	6	428068	428073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106479
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5491	NC_011988	TCG	2	6	428156	428161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106479
5492	NC_011988	GCC	2	6	428196	428201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106479
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