MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 16461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011988	CAT	2	6	281129	281134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106356
3502	NC_011988	GGC	2	6	281136	281141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106356
3503	NC_011988	GAT	2	6	281189	281194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106356
3504	NC_011988	TGC	2	6	281241	281246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356
3505	NC_011988	GCG	2	6	281253	281258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106356
3506	NC_011988	CAC	3	9	281267	281275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106356
3507	NC_011988	ATG	2	6	281343	281348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106356
3508	NC_011988	CAT	2	6	281356	281361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106357
3509	NC_011988	TGC	2	6	281365	281370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106357
3510	NC_011988	GCA	2	6	281378	281383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106357
3511	NC_011988	ATC	2	6	281398	281403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106357
3512	NC_011988	CAG	3	9	281467	281475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106357
3513	NC_011988	CAC	2	6	281494	281499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106357
3514	NC_011988	GAT	2	6	281781	281786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106357
3515	NC_011988	GGC	2	6	281918	281923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106357
3516	NC_011988	TGC	2	6	281931	281936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106357
3517	NC_011988	GGT	2	6	281999	282004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106357
3518	NC_011988	GTT	2	6	282039	282044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106357
3519	NC_011988	GCA	2	6	282071	282076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106357
3520	NC_011988	GTG	2	6	282311	282316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106357
3521	NC_011988	CCG	2	6	282522	282527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106357
3522	NC_011988	TTC	2	6	282544	282549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106357
3523	NC_011988	GGT	2	6	282562	282567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106357
3524	NC_011988	CTG	2	6	282613	282618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106357
3525	NC_011988	GCC	2	6	282638	282643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106357
3526	NC_011988	GCC	2	6	282731	282736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106357
3527	NC_011988	GGC	2	6	282748	282753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106357
3528	NC_011988	GCG	2	6	282860	282865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106358
3529	NC_011988	CAC	2	6	282908	282913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106358
3530	NC_011988	GCA	2	6	283053	283058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106358
3531	NC_011988	GCA	2	6	283081	283086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106358
3532	NC_011988	GGC	2	6	283130	283135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106358
3533	NC_011988	GGC	2	6	283169	283174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106358
3534	NC_011988	ATG	2	6	283176	283181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106358
3535	NC_011988	GTG	2	6	283182	283187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106358
3536	NC_011988	GCT	2	6	283230	283235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106358
3537	NC_011988	TCA	2	6	283258	283263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106358
3538	NC_011988	GCC	2	6	283392	283397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106358
3539	NC_011988	GAT	2	6	283550	283555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106358
3540	NC_011988	AGA	2	6	283564	283569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106358
3541	NC_011988	CCG	2	6	283601	283606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106358
3542	NC_011988	GCA	2	6	283653	283658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106359
3543	NC_011988	ATC	2	6	283763	283768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106359
3544	NC_011988	GCC	2	6	283792	283797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106359
3545	NC_011988	CGG	2	6	283824	283829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106359
3546	NC_011988	CAG	2	6	283846	283851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106359
3547	NC_011988	CCG	2	6	283945	283950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106359
3548	NC_011988	CCG	2	6	283962	283967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106359
3549	NC_011988	GTG	2	6	284024	284029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106359
3550	NC_011988	CAG	2	6	284041	284046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106359
3551	NC_011988	ACC	2	6	284117	284122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106359
3552	NC_011988	GCG	2	6	284160	284165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106359
3553	NC_011988	ACC	2	6	284279	284284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106359
3554	NC_011988	CAT	2	6	284317	284322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106359
3555	NC_011988	CAA	2	6	284398	284403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106359
3556	NC_011988	CAG	2	6	284434	284439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106359
3557	NC_011988	ATG	2	6	284486	284491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106359
3558	NC_011988	TGA	2	6	284501	284506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106360
3559	NC_011988	GAC	2	6	284628	284633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106360
3560	NC_011988	GCG	2	6	284713	284718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106360
3561	NC_011988	GCG	2	6	284768	284773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106360
3562	NC_011988	CCA	2	6	284819	284824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106360
3563	NC_011988	CGG	2	6	284861	284866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106360
3564	NC_011988	TCA	2	6	284918	284923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106360
3565	NC_011988	ACG	2	6	284926	284931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106360
3566	NC_011988	CTT	2	6	284951	284956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106360
3567	NC_011988	GGC	2	6	284993	284998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106360
3568	NC_011988	AGC	3	9	285070	285078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106360
3569	NC_011988	GAT	2	6	285093	285098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106360
3570	NC_011988	CTG	3	9	285120	285128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106360
3571	NC_011988	CAC	2	6	285221	285226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106360
3572	NC_011988	CGC	2	6	285313	285318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106360
3573	NC_011988	ATC	2	6	285391	285396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106360
3574	NC_011988	TCG	2	6	285404	285409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106360
3575	NC_011988	GGT	2	6	285438	285443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106360
3576	NC_011988	AAT	2	6	285635	285640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106361
3577	NC_011988	GCG	2	6	285644	285649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106361
3578	NC_011988	TCA	2	6	285671	285676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106361
3579	NC_011988	TGA	2	6	285731	285736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106361
3580	NC_011988	GGA	2	6	285738	285743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106361
3581	NC_011988	GGT	2	6	285744	285749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106361
3582	NC_011988	TGA	2	6	285806	285811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106361
3583	NC_011988	GCA	2	6	286022	286027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106361
3584	NC_011988	CAG	2	6	286044	286049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106361
3585	NC_011988	TTC	2	6	286051	286056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106361
3586	NC_011988	CAT	2	6	286316	286321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106361
3587	NC_011988	CAG	2	6	286365	286370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106361
3588	NC_011988	CGG	3	9	286427	286435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106361
3589	NC_011988	GGC	2	6	286518	286523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106361
3590	NC_011988	GCA	2	6	286618	286623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106361
3591	NC_011988	CGC	2	6	286626	286631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106361
3592	NC_011988	ATC	2	6	286886	286891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106362
3593	NC_011988	GGT	2	6	287032	287037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106362
3594	NC_011988	TCA	2	6	287201	287206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106362
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3597	NC_011988	CAA	2	6	287475	287480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106362
3598	NC_011988	CGG	2	6	287502	287507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106362
3599	NC_011988	CAG	2	6	287623	287628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106362
3600	NC_011988	CAG	2	6	287692	287697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106362
3601	NC_011988	TGG	2	6	288055	288060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106363
3602	NC_011988	GCA	2	6	288097	288102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3603	NC_011988	CGT	2	6	288103	288108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3604	NC_011988	CCT	2	6	288157	288162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106363
3605	NC_011988	CCG	2	6	288174	288179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106363
3606	NC_011988	CTG	2	6	288379	288384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3607	NC_011988	CGG	2	6	288516	288521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106363
3608	NC_011988	CTG	2	6	288615	288620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3609	NC_011988	CCT	2	6	288643	288648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106363
3610	NC_011988	GTC	2	6	288788	288793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3611	NC_011988	GGC	2	6	288932	288937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106363
3612	NC_011988	GTC	2	6	288977	288982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3613	NC_011988	CGC	2	6	289147	289152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106363
3614	NC_011988	AAG	2	6	289290	289295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106363
3615	NC_011988	AGC	3	9	289332	289340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106363
3616	NC_011988	TGC	2	6	289371	289376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106363
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3618	NC_011988	CAG	2	6	289552	289557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106363
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3972	NC_011988	CTT	2	6	315617	315622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106385
3973	NC_011988	ATC	2	6	315657	315662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106385
3974	NC_011988	GTC	2	6	315717	315722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106385
3975	NC_011988	GGC	2	6	315750	315755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106385
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