MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 16461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011988	TGA	2	6	243128	243133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106328
3002	NC_011988	GCC	2	6	243423	243428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106328
3003	NC_011988	GCG	2	6	243469	243474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106328
3004	NC_011988	CCA	2	6	243599	243604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106328
3005	NC_011988	GGC	2	6	244147	244152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106328
3006	NC_011988	CCG	2	6	244229	244234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106328
3007	NC_011988	GCC	2	6	244254	244259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106328
3008	NC_011988	AGA	2	6	244295	244300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106328
3009	NC_011988	CGG	2	6	244392	244397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106328
3010	NC_011988	TAT	2	6	244447	244452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106328
3011	NC_011988	GAA	2	6	244480	244485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106328
3012	NC_011988	GGT	2	6	244519	244524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106328
3013	NC_011988	GGC	2	6	244579	244584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106328
3014	NC_011988	GCG	2	6	244794	244799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106329
3015	NC_011988	GTC	2	6	245126	245131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106329
3016	NC_011988	ATG	3	9	245217	245225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106329
3017	NC_011988	GCA	2	6	245310	245315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106329
3018	NC_011988	ATC	2	6	245331	245336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106329
3019	NC_011988	TCC	2	6	245400	245405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106329
3020	NC_011988	GCG	2	6	245457	245462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106329
3021	NC_011988	CAG	2	6	245468	245473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106329
3022	NC_011988	TCA	2	6	245478	245483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106329
3023	NC_011988	GCT	2	6	245566	245571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106329
3024	NC_011988	AGC	2	6	245601	245606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106329
3025	NC_011988	TCA	2	6	245752	245757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106329
3026	NC_011988	CGC	2	6	245779	245784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106329
3027	NC_011988	CGC	2	6	245823	245828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106329
3028	NC_011988	CCG	2	6	245842	245847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106329
3029	NC_011988	GTG	2	6	245853	245858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106329
3030	NC_011988	AGA	2	6	246058	246063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106330
3031	NC_011988	GCC	2	6	246128	246133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106330
3032	NC_011988	CAT	2	6	246139	246144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106330
3033	NC_011988	GGC	2	6	246160	246165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106330
3034	NC_011988	GAC	2	6	246221	246226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106330
3035	NC_011988	GCC	2	6	246398	246403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106330
3036	NC_011988	ATG	2	6	246411	246416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106330
3037	NC_011988	TTC	2	6	246458	246463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106330
3038	NC_011988	TGC	2	6	246477	246482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106330
3039	NC_011988	TGA	2	6	246553	246558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106330
3040	NC_011988	GCT	2	6	246596	246601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106330
3041	NC_011988	GGC	2	6	246962	246967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106330
3042	NC_011988	GCT	2	6	246991	246996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106330
3043	NC_011988	CAA	2	6	247072	247077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106330
3044	NC_011988	CGG	2	6	247161	247166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106330
3045	NC_011988	GAT	2	6	247174	247179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106330
3046	NC_011988	ACA	2	6	247224	247229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106330
3047	NC_011988	GGC	2	6	247276	247281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106330
3048	NC_011988	CGA	2	6	247303	247308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106330
3049	NC_011988	GCT	2	6	247501	247506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3050	NC_011988	TGC	2	6	247644	247649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3051	NC_011988	GAC	2	6	247651	247656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3052	NC_011988	GCT	2	6	247846	247851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3053	NC_011988	GCC	2	6	247879	247884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106331
3054	NC_011988	GCT	3	9	247909	247917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3055	NC_011988	CTT	2	6	247947	247952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106331
3056	NC_011988	TCG	2	6	247973	247978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3057	NC_011988	GTG	2	6	248057	248062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106331
3058	NC_011988	TGA	2	6	248115	248120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106331
3059	NC_011988	CTG	2	6	248138	248143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106331
3060	NC_011988	CGG	3	9	248149	248157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106331
3061	NC_011988	GCG	2	6	248214	248219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106331
3062	NC_011988	GCG	2	6	248234	248239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106331
3063	NC_011988	GTT	2	6	248598	248603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106332
3064	NC_011988	CCG	2	6	248624	248629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106332
3065	NC_011988	TCG	2	6	248834	248839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106332
3066	NC_011988	GCC	2	6	248848	248853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106332
3067	NC_011988	CAA	2	6	248982	248987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106332
3068	NC_011988	TGG	2	6	248990	248995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106332
3069	NC_011988	GGA	2	6	249198	249203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106332
3070	NC_011988	TTC	2	6	249265	249270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106332
3071	NC_011988	CGG	2	6	249390	249395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106332
3072	NC_011988	ATA	2	6	249433	249438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106333
3073	NC_011988	TCG	2	6	249505	249510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106333
3074	NC_011988	GAA	2	6	249756	249761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106333
3075	NC_011988	CCG	2	6	249797	249802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106333
3076	NC_011988	CGG	2	6	249818	249823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106333
3077	NC_011988	CAG	3	9	249825	249833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106333
3078	NC_011988	CAC	2	6	249968	249973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106333
3079	NC_011988	ATC	2	6	250023	250028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106333
3080	NC_011988	GAT	2	6	250068	250073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106333
3081	NC_011988	CGC	2	6	250120	250125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106333
3082	NC_011988	TGT	2	6	250429	250434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106333
3083	NC_011988	TTG	2	6	250456	250461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106333
3084	NC_011988	GCT	2	6	250599	250604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106334
3085	NC_011988	CAG	2	6	250617	250622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106334
3086	NC_011988	CAC	2	6	250703	250708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106334
3087	NC_011988	GGA	2	6	250742	250747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106334
3088	NC_011988	TGC	2	6	250796	250801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106334
3089	NC_011988	TGG	2	6	250915	250920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106334
3090	NC_011988	GAT	2	6	250994	250999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106334
3091	NC_011988	ATC	2	6	251055	251060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106334
3092	NC_011988	GCG	2	6	251081	251086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106334
3093	NC_011988	TGA	2	6	251128	251133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106334
3094	NC_011988	TGC	2	6	251225	251230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106334
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3098	NC_011988	ATT	2	6	251466	251471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106335
3099	NC_011988	GCT	2	6	251608	251613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3100	NC_011988	AAC	2	6	251818	251823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106335
3101	NC_011988	TGC	2	6	251944	251949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3102	NC_011988	CTG	2	6	251981	251986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3103	NC_011988	TTG	2	6	252035	252040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106335
3104	NC_011988	GCC	3	9	252150	252158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106335
3105	NC_011988	GTC	2	6	252281	252286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3106	NC_011988	CGG	2	6	252379	252384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106335
3107	NC_011988	GCT	2	6	252409	252414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3108	NC_011988	GAT	2	6	252485	252490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106335
3109	NC_011988	GAT	2	6	252610	252615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106335
3110	NC_011988	TAC	2	6	252623	252628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106335
3111	NC_011988	GAC	2	6	252645	252650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3112	NC_011988	CAG	2	6	252669	252674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106335
3113	NC_011988	GGT	2	6	252679	252684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106335
3114	NC_011988	ATT	2	6	252769	252774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106335
3115	NC_011988	CGC	2	6	252775	252780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106335
3116	NC_011988	GCC	2	6	252876	252881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106336
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3118	NC_011988	GGC	2	6	252952	252957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106336
3119	NC_011988	GAC	2	6	252966	252971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106336
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3225	NC_011988	GCG	2	6	262505	262510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106340
3226	NC_011988	GAG	2	6	262535	262540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106340
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3228	NC_011988	GCC	2	6	262599	262604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106340
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3231	NC_011988	CGT	2	6	262952	262957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106341
3232	NC_011988	GCC	2	6	262989	262994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106341
3233	NC_011988	CAG	2	6	263103	263108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106341
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3355	NC_011988	GGC	2	6	271801	271806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106349
3356	NC_011988	GGT	2	6	271915	271920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106349
3357	NC_011988	GCA	2	6	271986	271991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106349
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3362	NC_011988	TGC	2	6	272137	272142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106349
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3471	NC_011988	GAT	2	6	279418	279423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106354
3472	NC_011988	CGC	2	6	279496	279501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106355
3473	NC_011988	AGC	2	6	279594	279599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106355
3474	NC_011988	TGC	2	6	279600	279605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106355
3475	NC_011988	TCC	2	6	279655	279660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106355
3476	NC_011988	GCA	2	6	279725	279730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106355
3477	NC_011988	ACA	2	6	279892	279897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106355
3478	NC_011988	GCG	3	9	279916	279924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106355
3479	NC_011988	AGA	2	6	279943	279948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106355
3480	NC_011988	GCA	2	6	279995	280000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106355
3481	NC_011988	GGC	2	6	280042	280047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106355
3482	NC_011988	CGC	2	6	280062	280067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106355
3483	NC_011988	GCC	2	6	280153	280158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106355
3484	NC_011988	TGT	2	6	280284	280289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106355
3485	NC_011988	GCG	2	6	280298	280303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106355
3486	NC_011988	GCA	2	6	280322	280327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106355
3487	NC_011988	GCG	2	6	280359	280364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106355
3488	NC_011988	GCC	2	6	280380	280385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106355
3489	NC_011988	CCG	2	6	280487	280492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106355
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3492	NC_011988	CTG	2	6	280678	280683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356
3493	NC_011988	CTG	2	6	280726	280731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356
3494	NC_011988	TGC	2	6	280738	280743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356
3495	NC_011988	CAT	2	6	280823	280828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106356
3496	NC_011988	CGC	2	6	280843	280848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106356
3497	NC_011988	TCC	2	6	280887	280892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106356
3498	NC_011988	GCC	2	6	280985	280990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106356
3499	NC_011988	CGC	2	6	281015	281020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106356
3500	NC_011988	TCG	2	6	281112	281117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106356

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