MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 16461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011988	TCG	2	6	1248108	1248113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107152
16002	NC_011988	AGA	2	6	1248160	1248165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107152
16003	NC_011988	GCA	2	6	1248208	1248213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107152
16004	NC_011988	TCT	2	6	1248262	1248267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107152
16005	NC_011988	CGC	2	6	1248268	1248273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107152
16006	NC_011988	CGG	3	9	1248295	1248303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107152
16007	NC_011988	TGA	2	6	1248606	1248611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107153
16008	NC_011988	GGC	2	6	1248730	1248735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16009	NC_011988	GGC	2	6	1248748	1248753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16010	NC_011988	CTT	2	6	1248871	1248876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107153
16011	NC_011988	CGG	2	6	1248953	1248958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16012	NC_011988	GGC	2	6	1249002	1249007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16013	NC_011988	TCC	2	6	1249150	1249155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107153
16014	NC_011988	GTT	2	6	1249197	1249202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107153
16015	NC_011988	TGC	2	6	1249211	1249216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16016	NC_011988	GTG	2	6	1249331	1249336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107153
16017	NC_011988	GCG	2	6	1249393	1249398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16018	NC_011988	CTG	2	6	1249414	1249419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16019	NC_011988	GAA	2	6	1249530	1249535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107153
16020	NC_011988	ACA	2	6	1249538	1249543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107153
16021	NC_011988	GCG	2	6	1249619	1249624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16022	NC_011988	CTG	2	6	1249694	1249699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16023	NC_011988	GCA	2	6	1249704	1249709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16024	NC_011988	CGC	2	6	1249907	1249912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107153
16025	NC_011988	AGG	2	6	1249913	1249918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107153
16026	NC_011988	CTG	2	6	1249930	1249935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16027	NC_011988	GCG	2	6	1250012	1250017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16028	NC_011988	ATG	2	6	1250039	1250044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107153
16029	NC_011988	TGG	2	6	1250186	1250191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107153
16030	NC_011988	GCT	2	6	1250226	1250231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16031	NC_011988	GAA	2	6	1250305	1250310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107153
16032	NC_011988	TTG	2	6	1250348	1250353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107153
16033	NC_011988	TGC	2	6	1250354	1250359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16034	NC_011988	TGG	2	6	1250364	1250369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107153
16035	NC_011988	TCA	2	6	1250610	1250615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107153
16036	NC_011988	GCG	2	6	1250873	1250878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16037	NC_011988	TTA	2	6	1250913	1250918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107153
16038	NC_011988	GCG	2	6	1250929	1250934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
16039	NC_011988	GCT	2	6	1250964	1250969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
16040	NC_011988	GTG	2	6	1251193	1251198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107154
16041	NC_011988	GAC	2	6	1251267	1251272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107154
16042	NC_011988	TCC	2	6	1251454	1251459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107154
16043	NC_011988	AGA	2	6	1251739	1251744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107154
16044	NC_011988	CCA	2	6	1251800	1251805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107154
16045	NC_011988	CGG	2	6	1251865	1251870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107154
16046	NC_011988	GGC	2	6	1251882	1251887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107154
16047	NC_011988	GCA	2	6	1251920	1251925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107154
16048	NC_011988	CGC	2	6	1251939	1251944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107154
16049	NC_011988	GAT	2	6	1251990	1251995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107154
16050	NC_011988	GCG	2	6	1252061	1252066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107154
16051	NC_011988	GCT	2	6	1252078	1252083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107154
16052	NC_011988	ATG	2	6	1252210	1252215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107154
16053	NC_011988	CGA	2	6	1252220	1252225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107154
16054	NC_011988	GCC	2	6	1252315	1252320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107154
16055	NC_011988	GCC	2	6	1252392	1252397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107155
16056	NC_011988	CGC	2	6	1252417	1252422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107155
16057	NC_011988	CGC	2	6	1252632	1252637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107155
16058	NC_011988	AAT	2	6	1252670	1252675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107155
16059	NC_011988	GCA	2	6	1252689	1252694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107155
16060	NC_011988	GCG	2	6	1252697	1252702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107155
16061	NC_011988	GAT	3	9	1252820	1252828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107155
16062	NC_011988	GCT	2	6	1253361	1253366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107156
16063	NC_011988	GCG	2	6	1253468	1253473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107156
16064	NC_011988	CTG	2	6	1253873	1253878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107157
16065	NC_011988	TCC	2	6	1254003	1254008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107157
16066	NC_011988	TCA	2	6	1254022	1254027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107157
16067	NC_011988	ATT	2	6	1254030	1254035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107157
16068	NC_011988	GCG	2	6	1254048	1254053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107157
16069	NC_011988	CAG	3	9	1254062	1254070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107157
16070	NC_011988	AGG	2	6	1254075	1254080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107157
16071	NC_011988	GAA	2	6	1254106	1254111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107157
16072	NC_011988	ATG	3	9	1254162	1254170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107157
16073	NC_011988	GCC	2	6	1254182	1254187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107157
16074	NC_011988	CCG	2	6	1254244	1254249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107157
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16076	NC_011988	GTC	3	9	1254374	1254382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107157
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16081	NC_011988	CCT	2	6	1254673	1254678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107158
16082	NC_011988	GCC	2	6	1254753	1254758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107158
16083	NC_011988	CAT	2	6	1254839	1254844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107158
16084	NC_011988	GCG	2	6	1254868	1254873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107158
16085	NC_011988	CCA	2	6	1254878	1254883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107158
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16087	NC_011988	CGC	2	6	1254998	1255003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107158
16088	NC_011988	GCC	2	6	1255110	1255115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107158
16089	NC_011988	GTG	2	6	1255173	1255178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107158
16090	NC_011988	TGG	2	6	1255256	1255261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107158
16091	NC_011988	GCC	2	6	1255301	1255306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107158
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16098	NC_011988	GCC	2	6	1255758	1255763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107158
16099	NC_011988	AGG	2	6	1255778	1255783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107158
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16101	NC_011988	TGC	2	6	1255838	1255843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107158
16102	NC_011988	TGA	2	6	1256023	1256028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107159
16103	NC_011988	GGA	2	6	1256162	1256167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107159
16104	NC_011988	GTG	2	6	1256478	1256483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107159
16105	NC_011988	CGG	2	6	1256647	1256652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107159
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16107	NC_011988	GCC	2	6	1256741	1256746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107159
16108	NC_011988	CGC	2	6	1256749	1256754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107159
16109	NC_011988	CTT	2	6	1256815	1256820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107159
16110	NC_011988	CAG	2	6	1256822	1256827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107159
16111	NC_011988	TGT	2	6	1257055	1257060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107159
16112	NC_011988	AGG	2	6	1257184	1257189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107159
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16114	NC_011988	TCG	2	6	1257252	1257257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107159
16115	NC_011988	CGA	2	6	1257330	1257335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107159
16116	NC_011988	GCC	2	6	1257365	1257370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107159
16117	NC_011988	TGA	2	6	1257421	1257426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107159
16118	NC_011988	ACG	2	6	1257495	1257500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107159
16119	NC_011988	GCG	2	6	1257563	1257568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107159
16120	NC_011988	GAT	2	6	1257644	1257649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107159
16121	NC_011988	GCG	2	6	1257700	1257705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107159
16122	NC_011988	CGC	2	6	1257865	1257870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107159
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16128	NC_011988	GGC	2	6	1258497	1258502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107160
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16131	NC_011988	ACG	2	6	1258612	1258617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107160
16132	NC_011988	TGA	2	6	1258661	1258666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107160
16133	NC_011988	GCG	2	6	1258730	1258735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107160
16134	NC_011988	ATG	2	6	1258778	1258783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107160
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16137	NC_011988	CGA	2	6	1258928	1258933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107160
16138	NC_011988	CGG	2	6	1258942	1258947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107160
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16144	NC_011988	ACG	2	6	1259213	1259218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107161
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16152	NC_011988	GCC	2	6	1259594	1259599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107161
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16223	NC_011988	TGC	2	6	1264391	1264396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107166
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16452	NC_011988	GCT	2	6	1282003	1282008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107180
16453	NC_011988	ATG	2	6	1282050	1282055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107180
16454	NC_011988	ATT	2	6	1282064	1282069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107180
16455	NC_011988	GAT	2	6	1282348	1282353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107180
16456	NC_011988	TCA	2	6	1282748	1282753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107181
16457	NC_011988	TGA	2	6	1282884	1282889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107181
16458	NC_011988	CGG	2	6	1282895	1282900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107181
16459	NC_011988	GAC	2	6	1283041	1283046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107181
16460	NC_011988	CGG	3	9	1283063	1283071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107181
16461	NC_011988	AGG	2	6	1283093	1283098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107181

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