MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013205	GTC	2	6	314831	314836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510293
5002	NC_013205	CTG	2	6	314863	314868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510293
5003	NC_013205	CGT	2	6	314878	314883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510293
5004	NC_013205	TTC	2	6	315082	315087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510293
5005	NC_013205	GGT	2	6	315147	315152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013205	GAG	2	6	315170	315175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013205	GAC	2	6	315218	315223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510294
5008	NC_013205	ACG	2	6	315256	315261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510294
5009	NC_013205	TCT	2	6	315351	315356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510294
5010	NC_013205	GAT	2	6	315357	315362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510294
5011	NC_013205	TGT	2	6	315446	315451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510294
5012	NC_013205	ATG	2	6	315466	315471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510294
5013	NC_013205	AAC	2	6	315510	315515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510294
5014	NC_013205	TAT	2	6	315553	315558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510294
5015	NC_013205	TGC	2	6	315900	315905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510294
5016	NC_013205	ATC	2	6	315952	315957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510294
5017	NC_013205	CGA	2	6	315973	315978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510294
5018	NC_013205	TAT	2	6	315979	315984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510294
5019	NC_013205	ATC	2	6	315993	315998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510294
5020	NC_013205	GAA	2	6	316125	316130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510294
5021	NC_013205	TCA	2	6	316199	316204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510294
5022	NC_013205	TTA	2	6	316353	316358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510294
5023	NC_013205	TCT	2	6	316426	316431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510294
5024	NC_013205	ATG	2	6	316475	316480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510294
5025	NC_013205	GCT	2	6	316775	316780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_013205	TGC	2	6	316791	316796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013205	ACG	2	6	316965	316970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_013205	ACG	2	6	317058	317063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_013205	GAA	2	6	317222	317227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_013205	CGG	2	6	317413	317418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_013205	AAG	2	6	317451	317456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510295
5032	NC_013205	AAG	2	6	317520	317525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510295
5033	NC_013205	ACA	2	6	317609	317614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510295
5034	NC_013205	CAC	2	6	317618	317623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510295
5035	NC_013205	CAG	2	6	317649	317654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510295
5036	NC_013205	TCG	2	6	317797	317802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510295
5037	NC_013205	CGC	2	6	318404	318409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510295
5038	NC_013205	GAC	2	6	318417	318422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510295
5039	NC_013205	GGA	2	6	318509	318514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510295
5040	NC_013205	AGC	2	6	318859	318864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510295
5041	NC_013205	CGC	2	6	318933	318938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510295
5042	NC_013205	GGT	2	6	319021	319026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510295
5043	NC_013205	ACC	2	6	319380	319385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_013205	CAG	2	6	319388	319393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_013205	CGT	2	6	319498	319503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_013205	GAA	2	6	319535	319540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013205	GGC	2	6	319558	319563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013205	CGC	2	6	319738	319743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_013205	CCA	2	6	319780	319785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_013205	GCA	2	6	319838	319843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_013205	GGC	2	6	319876	319881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013205	GCG	2	6	319999	320004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_013205	CAT	2	6	320023	320028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_013205	ACC	2	6	320037	320042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_013205	CGA	2	6	320058	320063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_013205	ACG	2	6	320085	320090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_013205	CGA	2	6	320118	320123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013205	GAC	2	6	320226	320231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013205	TGG	2	6	320525	320530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510296
5060	NC_013205	TCG	2	6	320537	320542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510296
5061	NC_013205	TCG	2	6	320579	320584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510296
5062	NC_013205	CTG	2	6	320593	320598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510296
5063	NC_013205	CGC	2	6	320731	320736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510296
5064	NC_013205	GCC	2	6	320905	320910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510296
5065	NC_013205	TCG	2	6	320918	320923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510296
5066	NC_013205	GCT	2	6	320997	321002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510296
5067	NC_013205	GCA	2	6	321346	321351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_013205	TCG	2	6	321364	321369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_013205	GCG	2	6	321399	321404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_013205	GCC	3	9	321462	321470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_013205	GTG	2	6	321640	321645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013205	CGC	2	6	321710	321715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_013205	TGA	2	6	321868	321873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013205	GCC	2	6	321885	321890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_013205	CGA	2	6	321914	321919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_013205	CAG	2	6	322064	322069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_013205	AAG	2	6	322140	322145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013205	TCC	2	6	322161	322166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510297
5079	NC_013205	CGC	2	6	322246	322251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510297
5080	NC_013205	GGA	2	6	322330	322335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510297
5081	NC_013205	GCC	2	6	322364	322369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510297
5082	NC_013205	CGT	2	6	322384	322389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510297
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5084	NC_013205	TCG	2	6	322467	322472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510297
5085	NC_013205	GGC	2	6	322524	322529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510297
5086	NC_013205	GAG	2	6	322649	322654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510297
5087	NC_013205	GCG	2	6	322663	322668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510297
5088	NC_013205	GGC	2	6	322766	322771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510297
5089	NC_013205	GCG	2	6	322806	322811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510297
5090	NC_013205	GGT	2	6	323010	323015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510297
5091	NC_013205	CGA	2	6	323092	323097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510297
5092	NC_013205	GCG	2	6	323183	323188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510297
5093	NC_013205	AGG	2	6	323226	323231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510297
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5095	NC_013205	CGC	2	6	323288	323293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510297
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5099	NC_013205	GAG	2	6	323414	323419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510297
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5101	NC_013205	CGG	2	6	323692	323697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510298
5102	NC_013205	AAC	2	6	323728	323733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510298
5103	NC_013205	ACG	2	6	323746	323751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510298
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5105	NC_013205	TGG	2	6	323810	323815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510298
5106	NC_013205	CGC	2	6	323838	323843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510298
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5108	NC_013205	GTT	2	6	323964	323969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510298
5109	NC_013205	AAG	2	6	323989	323994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510298
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5111	NC_013205	GAG	2	6	324085	324090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510298
5112	NC_013205	GGC	2	6	324141	324146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510298
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5114	NC_013205	GGA	2	6	324279	324284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510298
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5117	NC_013205	GAG	2	6	324340	324345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510298
5118	NC_013205	GGC	2	6	324381	324386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510298
5119	NC_013205	GAG	2	6	324472	324477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510298
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5249	NC_013205	CCG	2	6	331230	331235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5250	NC_013205	CGG	2	6	331246	331251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_013205	GGC	2	6	331288	331293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510300
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5482	NC_013205	CCA	2	6	347839	347844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510315
5483	NC_013205	GCG	2	6	347943	347948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510315
5484	NC_013205	GAT	2	6	347957	347962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510315
5485	NC_013205	TCA	2	6	347986	347991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510315
5486	NC_013205	CGG	2	6	348055	348060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510315
5487	NC_013205	TCA	2	6	348067	348072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510315
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5491	NC_013205	CGC	2	6	348424	348429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510315
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