MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 20231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021881	TAC	2	6	294061	294066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464282
4002	NC_021881	ATT	2	6	294140	294145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464282
4003	NC_021881	ACT	2	6	294190	294195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464282
4004	NC_021881	ATG	2	6	294228	294233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464282
4005	NC_021881	TAC	2	6	294316	294321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464282
4006	NC_021881	TCC	2	6	294560	294565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464282
4007	NC_021881	TAT	3	9	294616	294624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464282
4008	NC_021881	CAG	2	6	294672	294677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464282
4009	NC_021881	GAA	2	6	294737	294742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464282
4010	NC_021881	TTC	2	6	294758	294763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464282
4011	NC_021881	ACC	2	6	294804	294809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464282
4012	NC_021881	AAC	2	6	294872	294877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464282
4013	NC_021881	CCT	2	6	294941	294946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464283
4014	NC_021881	AGT	2	6	294969	294974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464283
4015	NC_021881	ACG	2	6	294998	295003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464283
4016	NC_021881	ACT	2	6	295004	295009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464283
4017	NC_021881	ATA	2	6	295019	295024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464283
4018	NC_021881	TAC	2	6	295097	295102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464283
4019	NC_021881	ATC	2	6	295175	295180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464283
4020	NC_021881	AGC	2	6	295191	295196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464283
4021	NC_021881	ACC	2	6	295199	295204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464283
4022	NC_021881	TAG	2	6	295338	295343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464284
4023	NC_021881	TGG	2	6	295648	295653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021881	TTC	2	6	295677	295682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_021881	CAA	2	6	295732	295737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_021881	TCG	2	6	295854	295859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021881	GAA	2	6	295888	295893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021881	TCG	2	6	295894	295899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021881	GGA	2	6	296148	296153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021881	AAG	2	6	296174	296179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464285
4031	NC_021881	CTG	2	6	296349	296354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464285
4032	NC_021881	ATC	2	6	296360	296365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464285
4033	NC_021881	CTG	2	6	296474	296479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464285
4034	NC_021881	GCG	2	6	296547	296552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464285
4035	NC_021881	TGA	2	6	296568	296573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464285
4036	NC_021881	GTA	2	6	296769	296774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464285
4037	NC_021881	ATC	2	6	296863	296868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464285
4038	NC_021881	CTA	2	6	296917	296922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464285
4039	NC_021881	GGA	2	6	296928	296933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464285
4040	NC_021881	TGT	2	6	297043	297048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464286
4041	NC_021881	CAC	2	6	297135	297140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464286
4042	NC_021881	TTC	2	6	297147	297152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464286
4043	NC_021881	GTC	2	6	297234	297239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464286
4044	NC_021881	TGC	2	6	297249	297254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464286
4045	NC_021881	GTA	2	6	297277	297282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464286
4046	NC_021881	GAT	3	9	297493	297501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464286
4047	NC_021881	CCG	2	6	297599	297604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_021881	TGT	2	6	297805	297810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021881	GTT	2	6	297823	297828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021881	TTA	2	6	297878	297883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021881	GTG	2	6	297884	297889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021881	GTT	2	6	297928	297933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021881	GAT	2	6	297957	297962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021881	ATG	2	6	297984	297989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021881	TAA	3	9	298119	298127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021881	CAC	2	6	298471	298476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464287
4057	NC_021881	ATC	2	6	298571	298576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464287
4058	NC_021881	TGT	2	6	298612	298617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464287
4059	NC_021881	AAG	2	6	298730	298735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464287
4060	NC_021881	GGA	2	6	298750	298755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464287
4061	NC_021881	AAG	2	6	298762	298767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464287
4062	NC_021881	TGG	2	6	298789	298794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464287
4063	NC_021881	GCA	2	6	298831	298836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464287
4064	NC_021881	GTT	2	6	298931	298936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464287
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4069	NC_021881	GTT	2	6	299048	299053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464287
4070	NC_021881	TGG	2	6	299163	299168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021881	TTG	2	6	299229	299234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464288
4072	NC_021881	TTG	2	6	299242	299247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464288
4073	NC_021881	TGT	2	6	299294	299299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464288
4074	NC_021881	TTA	2	6	299306	299311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464288
4075	NC_021881	TAG	2	6	299322	299327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464288
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4079	NC_021881	GAA	2	6	299694	299699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464288
4080	NC_021881	ATT	2	6	299706	299711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464288
4081	NC_021881	ACC	2	6	299902	299907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464288
4082	NC_021881	GGT	2	6	299957	299962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464288
4083	NC_021881	TAC	2	6	299966	299971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464288
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4085	NC_021881	TGA	2	6	300030	300035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464288
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4087	NC_021881	CAT	2	6	300135	300140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464288
4088	NC_021881	ACT	2	6	300166	300171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464288
4089	NC_021881	GCA	2	6	300185	300190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464288
4090	NC_021881	GAG	2	6	300314	300319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464288
4091	NC_021881	GGT	2	6	300399	300404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021881	ATA	2	6	300418	300423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021881	CAG	2	6	300466	300471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_021881	CAG	2	6	300560	300565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_021881	GAT	2	6	300707	300712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021881	GAT	2	6	301062	301067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464290
4097	NC_021881	TAT	2	6	301141	301146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464290
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4100	NC_021881	GGA	2	6	301343	301348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464290
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4102	NC_021881	TTA	2	6	301422	301427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464290
4103	NC_021881	GTT	2	6	301538	301543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464290
4104	NC_021881	GAA	2	6	301588	301593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464290
4105	NC_021881	AAG	2	6	301657	301662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464290
4106	NC_021881	TGA	2	6	301672	301677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464290
4107	NC_021881	GCT	2	6	301680	301685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464290
4108	NC_021881	GAG	2	6	301722	301727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464290
4109	NC_021881	TCT	2	6	301845	301850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464290
4110	NC_021881	TGC	2	6	301865	301870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464290
4111	NC_021881	CTG	2	6	302017	302022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464290
4112	NC_021881	TGA	2	6	302082	302087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464290
4113	NC_021881	TTG	2	6	302157	302162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464291
4114	NC_021881	TAC	2	6	302164	302169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464291
4115	NC_021881	GGC	2	6	302254	302259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464291
4116	NC_021881	GGA	2	6	302293	302298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464291
4117	NC_021881	TTG	3	9	302310	302318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464291
4118	NC_021881	TGT	2	6	302443	302448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464291
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4120	NC_021881	TCA	2	6	302818	302823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464291
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4364	NC_021881	GTA	2	6	322500	322505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464299
4365	NC_021881	ATG	2	6	322585	322590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464299
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4367	NC_021881	CGA	2	6	322850	322855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464299
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4369	NC_021881	TAG	2	6	323021	323026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464299
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4383	NC_021881	CAT	2	6	324239	324244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464300
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4390	NC_021881	TAC	2	6	324591	324596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464300
4391	NC_021881	CTA	2	6	324665	324670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464300
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4421	NC_021881	AGC	2	6	327226	327231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4422	NC_021881	TGA	2	6	327267	327272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4425	NC_021881	TTG	2	6	327519	327524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464303
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4428	NC_021881	GTG	2	6	327643	327648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4433	NC_021881	GAA	2	6	328055	328060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464304
4434	NC_021881	AGT	2	6	328061	328066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464304
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4461	NC_021881	TTA	2	6	329800	329805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4470	NC_021881	CAA	2	6	330300	330305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464305
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4478	NC_021881	CAT	2	6	330535	330540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464305
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4482	NC_021881	CGA	2	6	330835	330840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464305
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4485	NC_021881	TGC	2	6	330955	330960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464305
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