MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 20231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021881	GTA	2	6	258698	258703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464245
3502	NC_021881	CCA	2	6	258750	258755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464245
3503	NC_021881	TTC	2	6	258848	258853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464245
3504	NC_021881	GTT	2	6	258881	258886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464245
3505	NC_021881	TAG	2	6	258901	258906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464245
3506	NC_021881	TCC	2	6	258926	258931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464245
3507	NC_021881	ATT	2	6	258948	258953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464245
3508	NC_021881	TCT	2	6	258954	258959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464245
3509	NC_021881	ATA	2	6	258964	258969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464245
3510	NC_021881	AGA	2	6	259047	259052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464245
3511	NC_021881	CTT	2	6	259087	259092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464245
3512	NC_021881	AGC	2	6	259125	259130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464245
3513	NC_021881	AGA	2	6	259208	259213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464245
3514	NC_021881	TCG	2	6	259305	259310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464245
3515	NC_021881	GCA	3	9	259413	259421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464245
3516	NC_021881	ATA	2	6	259438	259443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464245
3517	NC_021881	TTA	2	6	259471	259476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464245
3518	NC_021881	GAG	2	6	259690	259695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464813
3519	NC_021881	AGT	2	6	259739	259744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464813
3520	NC_021881	AGA	2	6	259783	259788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464813
3521	NC_021881	GGT	2	6	259826	259831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464813
3522	NC_021881	GAT	2	6	259952	259957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464813
3523	NC_021881	GAA	2	6	259979	259984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464813
3524	NC_021881	GTG	2	6	259998	260003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464813
3525	NC_021881	AGA	3	9	260005	260013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464813
3526	NC_021881	GGA	2	6	260107	260112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464813
3527	NC_021881	ATG	2	6	260259	260264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464813
3528	NC_021881	GAA	2	6	260330	260335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464813
3529	NC_021881	CTG	2	6	260360	260365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464813
3530	NC_021881	ATG	2	6	260382	260387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464813
3531	NC_021881	ACA	2	6	260555	260560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464813
3532	NC_021881	TCT	2	6	260582	260587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464813
3533	NC_021881	GTT	2	6	260764	260769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464246
3534	NC_021881	CTG	2	6	260791	260796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464246
3535	NC_021881	TAC	2	6	260823	260828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464246
3536	NC_021881	ATG	2	6	260895	260900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464246
3537	NC_021881	AAG	2	6	260980	260985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464246
3538	NC_021881	TGA	2	6	261024	261029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464246
3539	NC_021881	GCA	3	9	261065	261073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464246
3540	NC_021881	GTT	2	6	261074	261079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464246
3541	NC_021881	TGC	2	6	261255	261260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464246
3542	NC_021881	ACA	2	6	261355	261360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464246
3543	NC_021881	TGG	2	6	261414	261419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464246
3544	NC_021881	AGA	2	6	261474	261479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464246
3545	NC_021881	TAA	2	6	261537	261542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464246
3546	NC_021881	AGT	2	6	261561	261566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021881	TGC	2	6	261669	261674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021881	GTT	2	6	261751	261756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464814
3549	NC_021881	ATT	2	6	261874	261879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464814
3550	NC_021881	ACA	2	6	261889	261894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021881	TTA	2	6	261985	261990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464247
3552	NC_021881	TTC	2	6	262038	262043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464247
3553	NC_021881	GTG	2	6	262055	262060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464247
3554	NC_021881	ATA	2	6	262157	262162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464247
3555	NC_021881	ATC	2	6	262238	262243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464247
3556	NC_021881	CTA	2	6	262273	262278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464247
3557	NC_021881	AAC	2	6	262381	262386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021881	TAT	2	6	262440	262445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021881	ATT	2	6	262456	262461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021881	TGG	2	6	262677	262682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464248
3561	NC_021881	TGC	2	6	262700	262705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464248
3562	NC_021881	TGA	2	6	262828	262833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464248
3563	NC_021881	ATC	2	6	262888	262893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464248
3564	NC_021881	CTA	2	6	262932	262937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464248
3565	NC_021881	TGA	2	6	263029	263034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464248
3566	NC_021881	ATC	2	6	263044	263049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464248
3567	NC_021881	AGA	2	6	263111	263116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464248
3568	NC_021881	TAT	2	6	263134	263139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464248
3569	NC_021881	TTA	2	6	263242	263247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464248
3570	NC_021881	AAC	2	6	263286	263291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464248
3571	NC_021881	TAG	2	6	263482	263487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464248
3572	NC_021881	GCA	2	6	263613	263618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464248
3573	NC_021881	CTT	2	6	263749	263754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464249
3574	NC_021881	CCA	2	6	263760	263765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464249
3575	NC_021881	CAA	2	6	263790	263795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464249
3576	NC_021881	TCA	2	6	264134	264139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464249
3577	NC_021881	ATA	2	6	264155	264160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464249
3578	NC_021881	TCT	2	6	264206	264211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464249
3579	NC_021881	TGA	2	6	264232	264237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464249
3580	NC_021881	ACT	2	6	264263	264268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464249
3581	NC_021881	TCA	2	6	264284	264289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464249
3582	NC_021881	TTC	2	6	264385	264390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464249
3583	NC_021881	ACC	2	6	264592	264597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464249
3584	NC_021881	ATT	2	6	264660	264665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021881	AAG	2	6	264711	264716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021881	TGT	2	6	264862	264867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021881	CAT	2	6	264894	264899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_021881	CTT	2	6	264997	265002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021881	CAT	2	6	265092	265097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
3590	NC_021881	TCT	2	6	265149	265154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464815
3591	NC_021881	CTT	2	6	265164	265169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464815
3592	NC_021881	CTT	2	6	265218	265223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464815
3593	NC_021881	ACA	2	6	265240	265245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464815
3594	NC_021881	ACC	2	6	265249	265254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464815
3595	NC_021881	TCC	2	6	265322	265327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464815
3596	NC_021881	GCT	2	6	265415	265420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464815
3597	NC_021881	CAT	2	6	265473	265478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
3598	NC_021881	ACC	2	6	265510	265515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464815
3599	NC_021881	GCT	2	6	265525	265530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464815
3600	NC_021881	AGC	2	6	265584	265589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464815
3601	NC_021881	CAT	2	6	265713	265718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
3602	NC_021881	TCA	2	6	265740	265745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
3603	NC_021881	TAA	2	6	265923	265928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464815
3604	NC_021881	ATT	2	6	265946	265951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464815
3605	NC_021881	CAT	2	6	265957	265962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
3606	NC_021881	AGT	2	6	266019	266024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464815
3607	NC_021881	CGC	2	6	266103	266108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464815
3608	NC_021881	CAA	2	6	266159	266164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464815
3609	NC_021881	ACA	2	6	266194	266199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_021881	GCA	2	6	266313	266318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464816
3611	NC_021881	CTT	2	6	266447	266452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464816
3612	NC_021881	TTA	2	6	266604	266609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464817
3613	NC_021881	CTC	2	6	266729	266734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464817
3614	NC_021881	TCT	2	6	266763	266768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464817
3615	NC_021881	CCA	2	6	266791	266796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464817
3616	NC_021881	AGT	2	6	266802	266807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464817
3617	NC_021881	CAG	2	6	266845	266850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464817
3618	NC_021881	CAA	2	6	266950	266955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464817
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