MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 20231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021881	GCT	2	6	406541	406546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464329
5502	NC_021881	TGC	2	6	406836	406841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464863
5503	NC_021881	TGC	2	6	406934	406939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464863
5504	NC_021881	GTG	2	6	407054	407059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464863
5505	NC_021881	TGC	2	6	407109	407114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464863
5506	NC_021881	TTG	2	6	407117	407122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464863
5507	NC_021881	TCG	2	6	407377	407382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464863
5508	NC_021881	GGT	2	6	407406	407411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464863
5509	NC_021881	TTA	2	6	407507	407512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464863
5510	NC_021881	CTT	2	6	407537	407542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464863
5511	NC_021881	GAT	2	6	407590	407595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464863
5512	NC_021881	TAG	2	6	407627	407632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464863
5513	NC_021881	ATG	2	6	407633	407638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464863
5514	NC_021881	AGG	2	6	407836	407841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464330
5515	NC_021881	GTA	2	6	407862	407867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464330
5516	NC_021881	TAC	2	6	407875	407880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464330
5517	NC_021881	CAA	2	6	408014	408019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464330
5518	NC_021881	TAG	2	6	408047	408052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464330
5519	NC_021881	TCT	2	6	408118	408123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464331
5520	NC_021881	GAT	2	6	408343	408348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464331
5521	NC_021881	AGG	2	6	408388	408393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464331
5522	NC_021881	GTG	2	6	408463	408468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464331
5523	NC_021881	TGG	2	6	408537	408542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464331
5524	NC_021881	TTC	2	6	408597	408602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464331
5525	NC_021881	TAG	2	6	408605	408610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464331
5526	NC_021881	CAT	2	6	408698	408703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_021881	GAG	2	6	408801	408806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021881	ATA	2	6	408946	408951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464332
5529	NC_021881	CTG	2	6	408965	408970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464332
5530	NC_021881	TTC	3	9	408971	408979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464332
5531	NC_021881	ATG	2	6	409001	409006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464332
5532	NC_021881	GGT	2	6	409112	409117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464332
5533	NC_021881	GGT	2	6	409120	409125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464332
5534	NC_021881	ATC	2	6	409149	409154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464332
5535	NC_021881	TAA	2	6	409323	409328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464332
5536	NC_021881	TAA	2	6	409353	409358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464332
5537	NC_021881	TGT	2	6	409371	409376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464332
5538	NC_021881	ATG	2	6	409433	409438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464332
5539	NC_021881	TCT	2	6	409460	409465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464332
5540	NC_021881	TGA	2	6	409511	409516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464332
5541	NC_021881	TGC	2	6	409596	409601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464332
5542	NC_021881	TGC	2	6	409632	409637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464332
5543	NC_021881	AGT	2	6	409641	409646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464332
5544	NC_021881	TGT	2	6	409659	409664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464332
5545	NC_021881	AGG	2	6	409807	409812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464333
5546	NC_021881	GGA	2	6	410051	410056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464333
5547	NC_021881	TAG	2	6	410075	410080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464333
5548	NC_021881	TGA	2	6	410102	410107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464333
5549	NC_021881	GCT	4	12	410115	410126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464333
5550	NC_021881	GTG	2	6	410152	410157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464333
5551	NC_021881	GCT	3	9	410235	410243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464333
5552	NC_021881	TAG	2	6	410245	410250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464333
5553	NC_021881	GGT	2	6	410259	410264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464333
5554	NC_021881	TGA	2	6	410273	410278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464333
5555	NC_021881	GCT	2	6	410319	410324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464333
5556	NC_021881	TGT	2	6	410363	410368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464333
5557	NC_021881	AGA	2	6	410434	410439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464333
5558	NC_021881	GAG	2	6	410469	410474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464333
5559	NC_021881	TCT	2	6	410528	410533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464333
5560	NC_021881	CGT	2	6	410691	410696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021881	CAT	2	6	410880	410885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464334
5562	NC_021881	ATG	2	6	410959	410964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464334
5563	NC_021881	TAG	2	6	411068	411073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464334
5564	NC_021881	TTA	2	6	411092	411097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464334
5565	NC_021881	TGA	2	6	411242	411247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464334
5566	NC_021881	TGG	2	6	411287	411292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464334
5567	NC_021881	TTC	2	6	411449	411454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464334
5568	NC_021881	TTA	2	6	411470	411475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464334
5569	NC_021881	ATA	2	6	411613	411618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464334
5570	NC_021881	TGA	2	6	411761	411766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021881	CGC	2	6	411831	411836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_021881	TTA	2	6	411967	411972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464865
5573	NC_021881	ATT	2	6	412100	412105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464865
5574	NC_021881	TAG	2	6	412147	412152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464865
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5577	NC_021881	GCT	2	6	412581	412586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464865
5578	NC_021881	TAT	2	6	412678	412683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021881	TAT	2	6	412743	412748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021881	TGC	3	9	412851	412859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_021881	TGA	3	9	412957	412965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464335
5582	NC_021881	CAC	2	6	413029	413034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464335
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5584	NC_021881	GTT	2	6	413168	413173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464335
5585	NC_021881	CAG	2	6	413276	413281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464335
5586	NC_021881	AGA	2	6	413299	413304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464335
5587	NC_021881	GTG	2	6	413364	413369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464335
5588	NC_021881	GGT	2	6	413376	413381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464335
5589	NC_021881	GGA	2	6	413418	413423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464335
5590	NC_021881	GAT	2	6	413477	413482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464335
5591	NC_021881	AAG	2	6	413501	413506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464335
5592	NC_021881	CTG	2	6	413511	413516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464335
5593	NC_021881	GCT	2	6	413551	413556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464336
5594	NC_021881	TAA	2	6	413693	413698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464336
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5598	NC_021881	ATT	2	6	414122	414127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464336
5599	NC_021881	ATT	2	6	414326	414331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464336
5600	NC_021881	CTT	2	6	414402	414407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464336
5601	NC_021881	GTT	2	6	414444	414449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464336
5602	NC_021881	TGC	2	6	414491	414496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464336
5603	NC_021881	GGT	2	6	414598	414603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464336
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5605	NC_021881	TTA	2	6	414651	414656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464336
5606	NC_021881	ATG	2	6	414758	414763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464337
5607	NC_021881	TGC	2	6	414798	414803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464337
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5610	NC_021881	GCT	3	9	415124	415132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464337
5611	NC_021881	AAT	2	6	415133	415138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464337
5612	NC_021881	TCC	2	6	415147	415152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464337
5613	NC_021881	TGA	2	6	415164	415169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464337
5614	NC_021881	TGA	2	6	415237	415242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464337
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5617	NC_021881	AAG	2	6	415415	415420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464337
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5982	NC_021881	GAT	2	6	446173	446178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5983	NC_021881	GAT	2	6	446200	446205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5984	NC_021881	TCT	2	6	446256	446261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5985	NC_021881	GGA	2	6	446387	446392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5986	NC_021881	TGT	2	6	446393	446398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5987	NC_021881	GCT	2	6	446463	446468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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