MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 20231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021881	AAG	2	6	371151	371156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464849
5002	NC_021881	ATT	2	6	371344	371349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464849
5003	NC_021881	TGC	2	6	371363	371368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464849
5004	NC_021881	CTT	2	6	371385	371390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464849
5005	NC_021881	ATC	2	6	371396	371401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464849
5006	NC_021881	GGA	2	6	371452	371457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464849
5007	NC_021881	TTA	2	6	371533	371538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464849
5008	NC_021881	TAT	2	6	371925	371930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464849
5009	NC_021881	GTG	2	6	372071	372076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464849
5010	NC_021881	CAG	2	6	372131	372136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464849
5011	NC_021881	GTT	2	6	372154	372159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464849
5012	NC_021881	AAG	2	6	372245	372250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464849
5013	NC_021881	ATG	2	6	372265	372270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464849
5014	NC_021881	GGA	2	6	372280	372285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464849
5015	NC_021881	CGT	2	6	372310	372315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464849
5016	NC_021881	CAT	2	6	372364	372369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021881	TAG	2	6	372401	372406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5018	NC_021881	AAG	2	6	372698	372703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464850
5019	NC_021881	CAA	2	6	372795	372800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464850
5020	NC_021881	GTA	2	6	372980	372985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5021	NC_021881	AAT	2	6	373072	373077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464850
5022	NC_021881	ATG	2	6	373100	373105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5023	NC_021881	ATA	2	6	373235	373240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464850
5024	NC_021881	TAA	2	6	373269	373274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464850
5025	NC_021881	AGG	2	6	373319	373324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464850
5026	NC_021881	ATT	2	6	373362	373367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5027	NC_021881	TGA	2	6	373434	373439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5028	NC_021881	CAG	2	6	373540	373545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5029	NC_021881	AAG	2	6	373593	373598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464850
5030	NC_021881	ATC	2	6	373602	373607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
5031	NC_021881	GCA	2	6	373617	373622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5032	NC_021881	TTA	2	6	373655	373660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5033	NC_021881	GAA	2	6	373725	373730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464850
5034	NC_021881	TTC	2	6	373733	373738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464850
5035	NC_021881	ATC	2	6	373766	373771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
5036	NC_021881	AGT	2	6	373816	373821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5037	NC_021881	AGC	2	6	373962	373967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5038	NC_021881	GTG	2	6	374102	374107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464850
5039	NC_021881	TCT	2	6	374116	374121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464850
5040	NC_021881	ATG	2	6	374123	374128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5041	NC_021881	TAC	2	6	374169	374174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
5042	NC_021881	CCT	2	6	374359	374364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464850
5043	NC_021881	CAA	2	6	374383	374388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464850
5044	NC_021881	TCA	2	6	374422	374427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
5045	NC_021881	AGA	2	6	374439	374444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464850
5046	NC_021881	AAT	2	6	374551	374556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464850
5047	NC_021881	TTC	2	6	374617	374622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464850
5048	NC_021881	TTC	2	6	374627	374632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464850
5049	NC_021881	GGT	2	6	374755	374760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464850
5050	NC_021881	GCA	2	6	374763	374768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5051	NC_021881	AAT	2	6	374800	374805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464850
5052	NC_021881	TAT	2	6	374892	374897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5053	NC_021881	TTA	3	9	374945	374953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5054	NC_021881	ATA	2	6	375028	375033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464850
5055	NC_021881	AGG	2	6	375054	375059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464850
5056	NC_021881	TAT	2	6	375177	375182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5057	NC_021881	ATG	2	6	375211	375216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5058	NC_021881	TAT	2	6	375240	375245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5059	NC_021881	TTA	2	6	375262	375267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5060	NC_021881	TCA	2	6	375284	375289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
5061	NC_021881	GCA	2	6	375379	375384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5062	NC_021881	TGC	2	6	375438	375443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5063	NC_021881	TAT	2	6	375519	375524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464850
5064	NC_021881	CTT	2	6	375532	375537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464850
5065	NC_021881	CTA	2	6	375668	375673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
5066	NC_021881	GTA	2	6	375719	375724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5067	NC_021881	CAG	2	6	375737	375742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5068	NC_021881	CTG	2	6	375743	375748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5069	NC_021881	GTT	2	6	375775	375780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464850
5070	NC_021881	TGA	2	6	375786	375791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5071	NC_021881	ATG	2	6	375887	375892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5072	NC_021881	GAG	2	6	375968	375973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464850
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5074	NC_021881	TGG	2	6	376053	376058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464850
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5076	NC_021881	GGC	2	6	376079	376084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464850
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5078	NC_021881	TGA	2	6	376146	376151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5079	NC_021881	GAC	2	6	376219	376224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
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5083	NC_021881	GAC	2	6	376342	376347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464850
5084	NC_021881	CTA	2	6	376361	376366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464850
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5087	NC_021881	GGA	2	6	376686	376691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464850
5088	NC_021881	GTG	2	6	376757	376762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464850
5089	NC_021881	GAT	2	6	376771	376776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5090	NC_021881	GAT	2	6	376792	376797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464850
5091	NC_021881	TGG	2	6	376825	376830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021881	GCA	2	6	376846	376851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021881	CAG	2	6	376930	376935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464851
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5096	NC_021881	TGA	2	6	377210	377215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464851
5097	NC_021881	GTA	2	6	377229	377234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464851
5098	NC_021881	GTC	2	6	377347	377352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464851
5099	NC_021881	TGT	2	6	377386	377391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464851
5100	NC_021881	ACA	2	6	377457	377462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464851
5101	NC_021881	ATG	2	6	377485	377490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464851
5102	NC_021881	GTA	2	6	377544	377549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464851
5103	NC_021881	GGT	2	6	377613	377618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464851
5104	NC_021881	GAA	2	6	377717	377722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464851
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5106	NC_021881	ATA	2	6	377958	377963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464851
5107	NC_021881	AGT	2	6	377966	377971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464851
5108	NC_021881	AAC	2	6	378009	378014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464851
5109	NC_021881	GCT	2	6	378122	378127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464851
5110	NC_021881	TTA	2	6	378358	378363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464851
5111	NC_021881	TAT	2	6	378369	378374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464851
5112	NC_021881	ATC	2	6	378435	378440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464851
5113	NC_021881	TAT	2	6	378450	378455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464851
5114	NC_021881	GGT	3	9	378561	378569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464851
5115	NC_021881	TGG	2	6	378665	378670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464851
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