MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 30452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021738	TCA	2	6	320928	320933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_021738	TAT	2	6	320993	320998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021738	CAA	2	6	321144	321149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_021738	TGC	2	6	321215	321220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_021738	GAA	2	6	321460	321465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021738	TAT	2	6	321518	321523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021738	TCT	2	6	321681	321686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655980
4008	NC_021738	TTC	2	6	321807	321812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655980
4009	NC_021738	ATA	2	6	321847	321852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655980
4010	NC_021738	GTT	2	6	321871	321876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021738	ATA	2	6	322203	322208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655981
4012	NC_021738	TGA	2	6	322261	322266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
4013	NC_021738	GTG	2	6	322326	322331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655981
4014	NC_021738	GCA	2	6	322396	322401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655981
4015	NC_021738	GAT	2	6	322463	322468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
4016	NC_021738	TGA	2	6	322512	322517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
4017	NC_021738	GAA	2	6	322574	322579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655981
4018	NC_021738	TTA	2	6	322715	322720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655981
4019	NC_021738	TAT	3	9	322765	322773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655981
4020	NC_021738	GAA	2	6	322784	322789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655981
4021	NC_021738	GCA	2	6	322819	322824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655981
4022	NC_021738	ATT	2	6	322829	322834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655981
4023	NC_021738	CAA	2	6	323083	323088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655982
4024	NC_021738	GAA	2	6	323140	323145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655982
4025	NC_021738	TTG	2	6	323366	323371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655982
4026	NC_021738	GCT	2	6	323383	323388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655982
4027	NC_021738	CTT	2	6	323394	323399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655982
4028	NC_021738	AAG	2	6	323531	323536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655982
4029	NC_021738	GCT	2	6	323581	323586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655982
4030	NC_021738	GCT	2	6	323635	323640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655982
4031	NC_021738	CGC	2	6	323644	323649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655982
4032	NC_021738	TGA	2	6	323661	323666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655982
4033	NC_021738	CGA	2	6	323775	323780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655982
4034	NC_021738	CTG	2	6	323933	323938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655983
4035	NC_021738	ACA	2	6	323967	323972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655983
4036	NC_021738	TCT	2	6	323982	323987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655983
4037	NC_021738	GCC	2	6	324056	324061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655983
4038	NC_021738	TGT	2	6	324077	324082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655983
4039	NC_021738	CAG	2	6	324095	324100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655983
4040	NC_021738	TGC	2	6	324287	324292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655627
4041	NC_021738	AAG	2	6	324327	324332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655627
4042	NC_021738	GCT	2	6	324396	324401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655627
4043	NC_021738	ATT	2	6	324452	324457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021738	CTA	2	6	324475	324480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021738	ACA	2	6	324634	324639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655984
4046	NC_021738	ACT	2	6	324826	324831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655984
4047	NC_021738	GGT	2	6	324979	324984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655984
4048	NC_021738	GAC	2	6	325013	325018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655984
4049	NC_021738	TGG	2	6	325079	325084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655984
4050	NC_021738	GTT	2	6	325353	325358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655984
4051	NC_021738	ACG	2	6	325548	325553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655984
4052	NC_021738	GAA	2	6	325604	325609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655984
4053	NC_021738	ACA	2	6	325615	325620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655984
4054	NC_021738	GAA	2	6	325781	325786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655984
4055	NC_021738	TGT	2	6	325808	325813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655984
4056	NC_021738	TGA	2	6	325936	325941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655984
4057	NC_021738	CCG	2	6	325959	325964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655984
4058	NC_021738	ACG	2	6	326047	326052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655984
4059	NC_021738	ACC	2	6	326163	326168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655984
4060	NC_021738	GAA	2	6	326213	326218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655984
4061	NC_021738	AAG	2	6	326238	326243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655984
4062	NC_021738	TAG	2	6	326262	326267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655984
4063	NC_021738	TGG	2	6	326313	326318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655984
4064	NC_021738	GTG	2	6	326361	326366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655984
4065	NC_021738	ACA	2	6	326430	326435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655984
4066	NC_021738	AAG	2	6	326457	326462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655984
4067	NC_021738	TGA	2	6	326595	326600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021738	TTA	2	6	326721	326726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655985
4069	NC_021738	GTG	2	6	326788	326793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655985
4070	NC_021738	TCA	2	6	326993	326998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655985
4071	NC_021738	ATC	2	6	327192	327197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655985
4072	NC_021738	CTG	2	6	327285	327290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655985
4073	NC_021738	CAC	2	6	327568	327573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_021738	TGG	2	6	327581	327586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021738	ATT	2	6	327619	327624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021738	AAT	2	6	327676	327681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021738	ATC	2	6	327686	327691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_021738	TAA	2	6	327713	327718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021738	CAT	2	6	327722	327727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_021738	TTA	2	6	327749	327754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021738	TAA	2	6	327770	327775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021738	GCA	2	6	327893	327898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_021738	CTG	3	9	328067	328075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655986
4084	NC_021738	AAC	2	6	328119	328124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655986
4085	NC_021738	TCT	2	6	328129	328134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655986
4086	NC_021738	CAA	2	6	328235	328240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655986
4087	NC_021738	TGA	2	6	328335	328340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655986
4088	NC_021738	ACC	2	6	328368	328373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655986
4089	NC_021738	AGT	2	6	328419	328424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655986
4090	NC_021738	CTT	2	6	328448	328453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655986
4091	NC_021738	AAG	2	6	328511	328516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655986
4092	NC_021738	AAC	2	6	328605	328610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655986
4093	NC_021738	TTC	2	6	328612	328617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655986
4094	NC_021738	TCA	2	6	328648	328653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655986
4095	NC_021738	ACT	2	6	328759	328764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655986
4096	NC_021738	TCA	2	6	328882	328887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655986
4097	NC_021738	TGC	2	6	328896	328901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655986
4098	NC_021738	TAC	2	6	329005	329010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_021738	CTA	2	6	329160	329165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655987
4100	NC_021738	TGA	2	6	329181	329186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655987
4101	NC_021738	AAC	2	6	329211	329216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655987
4102	NC_021738	GAT	2	6	329408	329413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655987
4103	NC_021738	CAC	2	6	329493	329498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655987
4104	NC_021738	GAA	2	6	329549	329554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655987
4105	NC_021738	TAA	2	6	329583	329588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021738	ATT	2	6	329599	329604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021738	AAT	2	6	329631	329636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021738	AAT	2	6	329686	329691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655988
4109	NC_021738	TCA	2	6	329726	329731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655988
4110	NC_021738	CAG	2	6	329793	329798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655988
4111	NC_021738	CAT	2	6	329827	329832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655988
4112	NC_021738	ATA	2	6	329993	329998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655988
4113	NC_021738	ATA	2	6	330018	330023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655988
4114	NC_021738	GTA	2	6	330247	330252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655988
4115	NC_021738	CCG	2	6	330323	330328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655988
4116	NC_021738	CAC	3	9	330340	330348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655988
4117	NC_021738	AGC	2	6	330364	330369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655988
4118	NC_021738	GCA	2	6	330416	330421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655988
4119	NC_021738	TCA	2	6	330488	330493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655988
4120	NC_021738	GGT	2	6	330494	330499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655988
4121	NC_021738	GCT	2	6	330605	330610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655988
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4242	NC_021738	AAT	2	6	339803	339808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4477	NC_021738	TAA	2	6	356634	356639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4478	NC_021738	TAA	2	6	356647	356652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656011
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