MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 30452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021738	GTC	2	6	440130	440135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656094
5502	NC_021738	CAC	2	6	440180	440185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656094
5503	NC_021738	CAT	2	6	440342	440347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656094
5504	NC_021738	ATA	2	6	440428	440433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656094
5505	NC_021738	TTA	2	6	440551	440556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021738	ACA	2	6	440908	440913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656095
5507	NC_021738	ATT	2	6	440952	440957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656095
5508	NC_021738	CAA	2	6	441009	441014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656095
5509	NC_021738	CTT	2	6	441035	441040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656095
5510	NC_021738	GCT	2	6	441079	441084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5511	NC_021738	AAT	2	6	441129	441134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656095
5512	NC_021738	TGT	2	6	441176	441181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656095
5513	NC_021738	AAT	2	6	441246	441251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656095
5514	NC_021738	ACA	2	6	441293	441298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656095
5515	NC_021738	AAT	2	6	441490	441495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656095
5516	NC_021738	CAT	2	6	441542	441547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656095
5517	NC_021738	CGC	2	6	441606	441611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525656095
5518	NC_021738	ATC	2	6	441627	441632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656095
5519	NC_021738	TTC	2	6	441660	441665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656095
5520	NC_021738	AGC	2	6	441673	441678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5521	NC_021738	AGC	2	6	441816	441821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5522	NC_021738	GCT	2	6	441829	441834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5523	NC_021738	TAC	2	6	441881	441886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656095
5524	NC_021738	AGC	2	6	441894	441899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5525	NC_021738	TCA	2	6	441946	441951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656095
5526	NC_021738	TGC	2	6	442028	442033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5527	NC_021738	TCT	2	6	442198	442203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656095
5528	NC_021738	AGC	2	6	442204	442209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656095
5529	NC_021738	TTG	2	6	442317	442322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656095
5530	NC_021738	CCA	2	6	442453	442458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656096
5531	NC_021738	TCT	2	6	442481	442486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656096
5532	NC_021738	ACC	2	6	442496	442501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656096
5533	NC_021738	AGT	2	6	442598	442603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656096
5534	NC_021738	CAC	2	6	442611	442616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656096
5535	NC_021738	GGT	2	6	442647	442652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656096
5536	NC_021738	CAT	2	6	442653	442658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656096
5537	NC_021738	GAA	2	6	442685	442690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656096
5538	NC_021738	TAA	2	6	442776	442781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656096
5539	NC_021738	CAT	2	6	442981	442986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656096
5540	NC_021738	TAG	2	6	443043	443048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656096
5541	NC_021738	TAA	2	6	443184	443189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656096
5542	NC_021738	CAA	2	6	443224	443229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656096
5543	NC_021738	ATC	2	6	443293	443298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656096
5544	NC_021738	AAT	2	6	443386	443391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656096
5545	NC_021738	TAA	2	6	443446	443451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656096
5546	NC_021738	TAC	2	6	443508	443513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_021738	AAG	2	6	443571	443576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021738	TCA	2	6	443655	443660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656097
5549	NC_021738	CTT	2	6	443848	443853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656097
5550	NC_021738	CGT	2	6	443947	443952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656097
5551	NC_021738	ATC	2	6	444047	444052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656097
5552	NC_021738	TGG	2	6	444104	444109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656097
5553	NC_021738	TTC	2	6	444122	444127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656097
5554	NC_021738	CTG	2	6	444190	444195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656097
5555	NC_021738	AAG	2	6	444271	444276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656097
5556	NC_021738	GTG	2	6	444363	444368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656097
5557	NC_021738	CGG	2	6	444423	444428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656097
5558	NC_021738	GTA	2	6	444513	444518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656097
5559	NC_021738	TGA	2	6	444600	444605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656097
5560	NC_021738	TCA	2	6	444663	444668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656097
5561	NC_021738	TAA	2	6	444689	444694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656097
5562	NC_021738	AAT	2	6	444725	444730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656097
5563	NC_021738	TGT	2	6	444745	444750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656097
5564	NC_021738	GAA	2	6	444768	444773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656097
5565	NC_021738	GCA	2	6	444960	444965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656097
5566	NC_021738	AAT	2	6	444974	444979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656097
5567	NC_021738	ACC	2	6	445067	445072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656097
5568	NC_021738	CGG	2	6	445415	445420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656097
5569	NC_021738	TGC	2	6	445452	445457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656097
5570	NC_021738	GTG	2	6	445571	445576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656097
5571	NC_021738	CAT	2	6	445595	445600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656097
5572	NC_021738	GCA	2	6	445761	445766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656097
5573	NC_021738	CGG	2	6	445771	445776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656097
5574	NC_021738	ATT	2	6	445790	445795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656097
5575	NC_021738	TTC	2	6	445874	445879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656097
5576	NC_021738	TAC	2	6	445919	445924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_021738	ATA	2	6	445955	445960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021738	CAG	2	6	446059	446064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_021738	TAT	2	6	446138	446143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021738	TTA	2	6	446161	446166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656098
5581	NC_021738	TGC	2	6	446177	446182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656098
5582	NC_021738	GAA	2	6	446241	446246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656098
5583	NC_021738	TGA	3	9	446480	446488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656098
5584	NC_021738	CCA	2	6	446496	446501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656098
5585	NC_021738	GAT	2	6	446507	446512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656098
5586	NC_021738	ATT	2	6	446564	446569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656098
5587	NC_021738	TAT	2	6	446771	446776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656098
5588	NC_021738	AAG	2	6	446863	446868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656098
5589	NC_021738	TTA	2	6	447018	447023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656098
5590	NC_021738	TAA	2	6	447071	447076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656098
5591	NC_021738	TAA	2	6	447215	447220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656098
5592	NC_021738	ATG	2	6	447222	447227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656098
5593	NC_021738	CAA	2	6	447236	447241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656098
5594	NC_021738	TAT	2	6	447260	447265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656098
5595	NC_021738	GAT	2	6	447336	447341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656098
5596	NC_021738	TGA	2	6	447440	447445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656098
5597	NC_021738	TGA	2	6	447464	447469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656098
5598	NC_021738	GTG	2	6	447498	447503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656098
5599	NC_021738	TGC	2	6	447556	447561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656098
5600	NC_021738	CAG	2	6	447637	447642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656098
5601	NC_021738	ATT	2	6	447652	447657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656098
5602	NC_021738	GCT	2	6	447661	447666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656098
5603	NC_021738	GTT	2	6	447683	447688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656098
5604	NC_021738	GCT	2	6	447762	447767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656098
5605	NC_021738	TAC	2	6	447955	447960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_021738	CAA	2	6	448029	448034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656099
5607	NC_021738	ACC	2	6	448101	448106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656099
5608	NC_021738	CCA	2	6	448238	448243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656099
5609	NC_021738	ATC	2	6	448279	448284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656099
5610	NC_021738	TGC	2	6	448559	448564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656099
5611	NC_021738	ATC	2	6	448597	448602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656099
5612	NC_021738	ATC	2	6	448618	448623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656099
5613	NC_021738	ATG	2	6	448699	448704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656099
5614	NC_021738	TGC	2	6	448763	448768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656099
5615	NC_021738	TGA	2	6	448817	448822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656099
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5617	NC_021738	CTG	2	6	449279	449284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656100
5618	NC_021738	CAC	2	6	449301	449306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656100
5619	NC_021738	CAC	2	6	449308	449313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656100
5620	NC_021738	AAT	2	6	449437	449442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656100
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5626	NC_021738	TAA	2	6	449899	449904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656100
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5647	NC_021738	CTT	2	6	451179	451184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656100
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5652	NC_021738	CTA	2	6	451461	451466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5982	NC_021738	TCA	2	6	484082	484087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5983	NC_021738	CTT	2	6	484150	484155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656120
5984	NC_021738	ATC	2	6	484341	484346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656120
5985	NC_021738	TGC	2	6	484398	484403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656120
5986	NC_021738	GCT	2	6	484516	484521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656120
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5992	NC_021738	TAA	2	6	485127	485132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656120
5993	NC_021738	GAT	2	6	485327	485332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656120
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5997	NC_021738	TAA	2	6	485605	485610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656121
5998	NC_021738	AAT	2	6	485793	485798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656121
5999	NC_021738	AAT	2	6	485804	485809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656121
6000	NC_021738	AGC	2	6	485905	485910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656121

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