MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 30452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021738	CGT	2	6	40338	40343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655752
502	NC_021738	GGA	2	6	40434	40439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655752
503	NC_021738	GTG	2	6	40441	40446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655752
504	NC_021738	TGA	2	6	40526	40531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
505	NC_021738	AGA	2	6	40538	40543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655752
506	NC_021738	GTT	2	6	40554	40559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655752
507	NC_021738	TAT	2	6	40793	40798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655752
508	NC_021738	TGA	2	6	40805	40810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
509	NC_021738	GTG	3	9	40834	40842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655752
510	NC_021738	ATC	2	6	40935	40940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655752
511	NC_021738	GAT	2	6	40968	40973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
512	NC_021738	TGC	2	6	41171	41176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655752
513	NC_021738	GAA	2	6	41214	41219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655752
514	NC_021738	ACG	2	6	41249	41254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655752
515	NC_021738	ATC	2	6	41280	41285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655752
516	NC_021738	TTG	2	6	41317	41322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655752
517	NC_021738	GAA	2	6	41730	41735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655752
518	NC_021738	TGA	2	6	41804	41809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655752
519	NC_021738	CCA	2	6	41883	41888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655752
520	NC_021738	GTG	2	6	41890	41895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655752
521	NC_021738	ATA	2	6	41944	41949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655752
522	NC_021738	AAG	2	6	42018	42023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021738	TCA	2	6	42164	42169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655753
524	NC_021738	TAA	2	6	42229	42234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655753
525	NC_021738	CTT	2	6	42264	42269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655753
526	NC_021738	AAG	2	6	42272	42277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655753
527	NC_021738	GTT	2	6	42308	42313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655753
528	NC_021738	AAT	2	6	42343	42348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655753
529	NC_021738	CAT	2	6	42418	42423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655753
530	NC_021738	ACA	2	6	42524	42529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655753
531	NC_021738	AGA	2	6	42580	42585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655753
532	NC_021738	ATA	2	6	42636	42641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655753
533	NC_021738	GAT	2	6	42751	42756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655753
534	NC_021738	CTT	2	6	42816	42821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655753
535	NC_021738	ATC	2	6	42872	42877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655753
536	NC_021738	AGC	3	9	42892	42900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655753
537	NC_021738	AAT	2	6	42940	42945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655753
538	NC_021738	ACC	2	6	43006	43011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655753
539	NC_021738	ATC	2	6	43052	43057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655753
540	NC_021738	ATC	2	6	43127	43132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655753
541	NC_021738	TGC	3	9	43201	43209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655753
542	NC_021738	AAT	2	6	43279	43284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655753
543	NC_021738	GCA	2	6	43310	43315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655753
544	NC_021738	TAA	2	6	43402	43407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655753
545	NC_021738	TGT	2	6	43409	43414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655753
546	NC_021738	TAC	2	6	43705	43710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021738	AAT	2	6	43734	43739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021738	TTA	2	6	43746	43751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655754
549	NC_021738	GAG	2	6	43820	43825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655754
550	NC_021738	TTA	2	6	44039	44044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655754
551	NC_021738	AAT	2	6	44243	44248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655754
552	NC_021738	GTG	2	6	44318	44323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655754
553	NC_021738	TTA	2	6	44489	44494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655754
554	NC_021738	ATG	3	9	44559	44567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655754
555	NC_021738	TTA	2	6	44670	44675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655754
556	NC_021738	TTA	3	9	44975	44983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655755
557	NC_021738	GCC	2	6	44984	44989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655755
558	NC_021738	TTA	2	6	45020	45025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655755
559	NC_021738	TGA	2	6	45031	45036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655755
560	NC_021738	TGG	2	6	45124	45129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655755
561	NC_021738	GCA	3	9	45197	45205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655755
562	NC_021738	CCG	2	6	45344	45349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655755
563	NC_021738	GAT	2	6	45520	45525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655755
564	NC_021738	ATT	2	6	45612	45617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655755
565	NC_021738	TGG	2	6	45618	45623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655755
566	NC_021738	CAA	2	6	45858	45863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655755
567	NC_021738	AGA	2	6	45979	45984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655755
568	NC_021738	TGT	2	6	46257	46262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655756
569	NC_021738	GCG	2	6	46270	46275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655756
570	NC_021738	AGT	2	6	46304	46309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655756
571	NC_021738	CAC	2	6	46329	46334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655756
572	NC_021738	GTT	2	6	46509	46514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655756
573	NC_021738	TGT	2	6	46562	46567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655756
574	NC_021738	AGA	2	6	46829	46834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655756
575	NC_021738	TGA	2	6	46837	46842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655756
576	NC_021738	GAA	2	6	46875	46880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021738	ATA	2	6	46933	46938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
578	NC_021738	ATA	2	6	46940	46945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
579	NC_021738	GCA	2	6	47021	47026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655757
580	NC_021738	GTT	2	6	47075	47080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655757
581	NC_021738	AGC	2	6	47137	47142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655757
582	NC_021738	ATA	2	6	47207	47212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
583	NC_021738	ATC	2	6	47222	47227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655757
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586	NC_021738	CAG	2	6	47313	47318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655757
587	NC_021738	CAT	2	6	47343	47348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655757
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589	NC_021738	TAA	2	6	47682	47687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
590	NC_021738	CAA	2	6	47739	47744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655757
591	NC_021738	AAT	2	6	47860	47865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
592	NC_021738	GCA	2	6	47879	47884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655757
593	NC_021738	CAT	2	6	47896	47901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655757
594	NC_021738	AAT	2	6	47947	47952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
595	NC_021738	CAT	2	6	48087	48092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655757
596	NC_021738	CAT	2	6	48112	48117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655757
597	NC_021738	TAA	2	6	48135	48140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655757
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599	NC_021738	ATC	2	6	48357	48362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655758
600	NC_021738	TAA	2	6	48432	48437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655758
601	NC_021738	TAC	2	6	48485	48490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655758
602	NC_021738	AAT	2	6	48549	48554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655758
603	NC_021738	TAA	2	6	48612	48617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655758
604	NC_021738	GCG	2	6	48690	48695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655758
605	NC_021738	CAA	2	6	48704	48709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655758
606	NC_021738	GCT	2	6	48727	48732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655758
607	NC_021738	TAA	2	6	48774	48779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655758
608	NC_021738	ATA	2	6	48887	48892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021738	CTT	2	6	48903	48908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021738	TAA	2	6	48992	48997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021738	GAA	2	6	49015	49020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021738	TAT	2	6	49078	49083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021738	AAT	2	6	49119	49124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021738	ATT	2	6	49178	49183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021738	ATG	2	6	49237	49242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655759
616	NC_021738	CAA	2	6	49267	49272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655759
617	NC_021738	ATT	2	6	49275	49280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655759
618	NC_021738	GGC	2	6	49347	49352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655759
619	NC_021738	GGT	2	6	49420	49425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655759
620	NC_021738	CAG	2	6	49514	49519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655759
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622	NC_021738	TGA	2	6	49548	49553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655759
623	NC_021738	ATT	2	6	49637	49642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655759
624	NC_021738	GTC	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655759
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626	NC_021738	CTG	2	6	49799	49804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655759
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