MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 30452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021738	TGG	2	6	78386	78391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655782
1002	NC_021738	CAG	2	6	78473	78478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655782
1003	NC_021738	TTA	2	6	78606	78611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655783
1004	NC_021738	GCT	2	6	78633	78638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655783
1005	NC_021738	TCA	2	6	78642	78647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655783
1006	NC_021738	GGT	2	6	78675	78680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655783
1007	NC_021738	ACA	2	6	78811	78816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655784
1008	NC_021738	TCG	2	6	78828	78833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655784
1009	NC_021738	GAA	2	6	78934	78939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1010	NC_021738	TTA	2	6	78964	78969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655784
1011	NC_021738	AAG	2	6	79004	79009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1012	NC_021738	TGA	2	6	79010	79015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655784
1013	NC_021738	CGG	2	6	79074	79079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655784
1014	NC_021738	AGA	2	6	79119	79124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1015	NC_021738	TGA	2	6	79230	79235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655784
1016	NC_021738	TGA	2	6	79323	79328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655784
1017	NC_021738	ATT	2	6	79357	79362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655784
1018	NC_021738	GGT	2	6	79366	79371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655784
1019	NC_021738	GAA	2	6	79378	79383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1020	NC_021738	GGT	2	6	79441	79446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655784
1021	NC_021738	AGA	2	6	79467	79472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1022	NC_021738	GAA	2	6	79852	79857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1023	NC_021738	TGA	2	6	79866	79871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655784
1024	NC_021738	AAG	2	6	79904	79909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655784
1025	NC_021738	CAA	2	6	79963	79968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021738	ATG	2	6	80111	80116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021738	GCA	2	6	80118	80123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021738	GAA	2	6	80170	80175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021738	GAT	2	6	80176	80181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021738	TTC	2	6	80182	80187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021738	TTA	2	6	80195	80200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021738	ATG	2	6	80360	80365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021738	GAA	2	6	80379	80384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021738	AGA	2	6	80417	80422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021738	ATT	2	6	80523	80528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655785
1036	NC_021738	CAG	2	6	80630	80635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655785
1037	NC_021738	TAA	2	6	80778	80783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655786
1038	NC_021738	TGA	2	6	80922	80927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655786
1039	NC_021738	TTG	2	6	80962	80967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655786
1040	NC_021738	CCA	2	6	81010	81015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655786
1041	NC_021738	GCC	2	6	81103	81108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655786
1042	NC_021738	AAT	2	6	81109	81114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655786
1043	NC_021738	CAA	2	6	81147	81152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655786
1044	NC_021738	AAT	2	6	81392	81397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655786
1045	NC_021738	CTG	2	6	81436	81441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655786
1046	NC_021738	TAT	2	6	81537	81542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655786
1047	NC_021738	TCA	2	6	81632	81637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655786
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1049	NC_021738	CAG	2	6	82123	82128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655787
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1051	NC_021738	ATT	2	6	82399	82404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655788
1052	NC_021738	CAT	2	6	82489	82494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655788
1053	NC_021738	TCG	2	6	82656	82661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655788
1054	NC_021738	AAG	2	6	82704	82709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655788
1055	NC_021738	CAG	2	6	82905	82910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655788
1056	NC_021738	TTG	2	6	82911	82916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655788
1057	NC_021738	AAG	2	6	82962	82967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655788
1058	NC_021738	CTT	2	6	83040	83045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655788
1059	NC_021738	GTT	2	6	83166	83171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655788
1060	NC_021738	TTC	2	6	83600	83605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655788
1061	NC_021738	CTT	2	6	83628	83633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655788
1062	NC_021738	TTC	2	6	83827	83832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655788
1063	NC_021738	CAC	2	6	83869	83874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655788
1064	NC_021738	ATA	2	6	83918	83923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655788
1065	NC_021738	AAG	2	6	83996	84001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655788
1066	NC_021738	CAT	2	6	84133	84138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655788
1067	NC_021738	ATC	2	6	84196	84201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655788
1068	NC_021738	ACA	2	6	84206	84211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655788
1069	NC_021738	GGT	2	6	84286	84291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655788
1070	NC_021738	GTT	2	6	84341	84346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655788
1071	NC_021738	GAG	2	6	84360	84365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655788
1072	NC_021738	ATT	2	6	84438	84443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021738	ATA	3	9	84448	84456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021738	ATG	2	6	84520	84525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655789
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1080	NC_021738	AGC	2	6	85281	85286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655789
1081	NC_021738	ATT	2	6	85387	85392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655789
1082	NC_021738	TTA	2	6	85445	85450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655790
1083	NC_021738	ATA	2	6	85476	85481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655790
1084	NC_021738	TAA	2	6	85526	85531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655790
1085	NC_021738	TCT	2	6	85562	85567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655790
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1087	NC_021738	TCT	2	6	85614	85619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655790
1088	NC_021738	TGC	2	6	85744	85749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655790
1089	NC_021738	ATT	2	6	85901	85906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655791
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1091	NC_021738	GTT	2	6	85997	86002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655791
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1093	NC_021738	CAA	2	6	86210	86215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655791
1094	NC_021738	TCA	2	6	86281	86286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655791
1095	NC_021738	CAG	2	6	86391	86396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655791
1096	NC_021738	AAT	2	6	86448	86453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655791
1097	NC_021738	CAT	2	6	86463	86468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655791
1098	NC_021738	GCC	2	6	86591	86596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655792
1099	NC_021738	CAT	2	6	86615	86620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655792
1100	NC_021738	ATT	2	6	86640	86645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655792
1101	NC_021738	TAG	2	6	86654	86659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655792
1102	NC_021738	GCG	2	6	86724	86729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655792
1103	NC_021738	GAA	2	6	86744	86749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655792
1104	NC_021738	CTT	2	6	86875	86880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655792
1105	NC_021738	GAT	2	6	86978	86983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655792
1106	NC_021738	CAT	2	6	87041	87046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655792
1107	NC_021738	AAT	2	6	87146	87151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655792
1108	NC_021738	CAT	2	6	87215	87220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655793
1109	NC_021738	TAA	2	6	87221	87226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655793
1110	NC_021738	AAG	2	6	87315	87320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655793
1111	NC_021738	CAG	2	6	87388	87393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655793
1112	NC_021738	CCA	2	6	87466	87471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655793
1113	NC_021738	TAA	3	9	87497	87505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655793
1114	NC_021738	ATA	2	6	87564	87569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655793
1115	NC_021738	ATG	2	6	87720	87725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655794
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1117	NC_021738	CTT	2	6	87819	87824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655794
1118	NC_021738	TAA	2	6	87850	87855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655794
1119	NC_021738	CGG	2	6	87878	87883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655794
1120	NC_021738	ATC	2	6	87931	87936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655794
1121	NC_021738	GAT	2	6	88042	88047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655794
1122	NC_021738	TTC	3	9	88048	88056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655794
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1124	NC_021738	ACA	2	6	88229	88234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655795
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1375	NC_021738	CAC	2	6	110065	110070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655812
1376	NC_021738	ACC	2	6	110084	110089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655812
1377	NC_021738	TGA	2	6	110131	110136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655812
1378	NC_021738	AAG	2	6	110145	110150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655812
1379	NC_021738	CAT	2	6	110474	110479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655812
1380	NC_021738	GGC	2	6	110507	110512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655812
1381	NC_021738	CTT	2	6	110596	110601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655812
1382	NC_021738	ATC	2	6	110727	110732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655812
1383	NC_021738	ATT	2	6	110866	110871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655813
1384	NC_021738	CGA	2	6	111025	111030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655813
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1386	NC_021738	AGT	2	6	111211	111216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655813
1387	NC_021738	CTA	2	6	111229	111234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655813
1388	NC_021738	CTG	2	6	111238	111243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655813
1389	NC_021738	CAA	2	6	111358	111363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655813
1390	NC_021738	ATT	2	6	111432	111437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655813
1391	NC_021738	ATT	2	6	111444	111449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1392	NC_021738	ATA	2	6	111515	111520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1393	NC_021738	CAA	2	6	111759	111764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655814
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1398	NC_021738	TAG	2	6	112030	112035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655814
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1402	NC_021738	ATT	2	6	112351	112356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655815
1403	NC_021738	CAA	2	6	112493	112498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655815
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1406	NC_021738	TTG	2	6	113277	113282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_021738	ATA	2	6	114794	114799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_021738	ATT	2	6	114810	114815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_021738	AGT	2	6	114847	114852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1427	NC_021738	ATT	2	6	115274	115279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655817
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1479	NC_021738	ATT	2	6	120885	120890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_021738	TCC	2	6	121473	121478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655825
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1492	NC_021738	TCA	2	6	122277	122282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655825
1493	NC_021738	AGC	2	6	122304	122309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655825
1494	NC_021738	GAT	2	6	122341	122346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655825
1495	NC_021738	ACT	2	6	122379	122384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655825
1496	NC_021738	CGG	2	6	122445	122450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655825
1497	NC_021738	CAC	2	6	122613	122618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655825
1498	NC_021738	TGG	2	6	122676	122681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655825
1499	NC_021738	AGT	2	6	122686	122691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655825
1500	NC_021738	ACA	2	6	122807	122812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655825

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