MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 2010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TTTAG	2	10	1775	1784	20 %	60 %	20 %	0 %	482884696
2	NC_021082	TCTGC	2	10	3477	3486	0 %	40 %	20 %	40 %	482884698
3	NC_021082	TCGGA	2	10	5244	5253	20 %	20 %	40 %	20 %	482884699
4	NC_021082	CCACC	2	10	9454	9463	20 %	0 %	0 %	80 %	482884702
5	NC_021082	TGCTT	2	10	11426	11435	0 %	60 %	20 %	20 %	482884706
6	NC_021082	TAAAT	2	10	12501	12510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021082	ACGAA	2	10	13588	13597	60 %	0 %	20 %	20 %	482884709
8	NC_021082	AAAAT	2	10	13773	13782	80 %	20 %	0 %	0 %	482884709
9	NC_021082	GTTTT	2	10	18027	18036	0 %	80 %	20 %	0 %	482884714
10	NC_021082	CCACG	2	10	20163	20172	20 %	0 %	20 %	60 %	482884716
11	NC_021082	AACCG	2	10	22241	22250	40 %	0 %	20 %	40 %	482884717
12	NC_021082	ATATT	2	10	23117	23126	40 %	60 %	0 %	0 %	482884718
13	NC_021082	TTTAC	2	10	24598	24607	20 %	60 %	0 %	20 %	482884720
14	NC_021082	ACTAG	2	10	26092	26101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021082	GCCGA	2	10	27600	27609	20 %	0 %	40 %	40 %	482884723
16	NC_021082	GCACA	2	10	27861	27870	40 %	0 %	20 %	40 %	482884723
17	NC_021082	CTGCT	2	10	28744	28753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021082	AGCTC	2	10	29021	29030	20 %	20 %	20 %	40 %	482884726
19	NC_021082	TACGC	2	10	30569	30578	20 %	20 %	20 %	40 %	482884728
20	NC_021082	GCCAA	2	10	35133	35142	40 %	0 %	20 %	40 %	482884732
21	NC_021082	TGGTT	2	10	37035	37044	0 %	60 %	40 %	0 %	482884734
22	NC_021082	TATTT	2	10	38768	38777	20 %	80 %	0 %	0 %	482884736
23	NC_021082	GAAAT	2	10	40456	40465	60 %	20 %	20 %	0 %	482884737
24	NC_021082	TTTTG	2	10	45183	45192	0 %	80 %	20 %	0 %	482884744
25	NC_021082	GCCGA	2	10	47466	47475	20 %	0 %	40 %	40 %	482884746
26	NC_021082	AACCA	2	10	47577	47586	60 %	0 %	0 %	40 %	482884746
27	NC_021082	CAGCT	2	10	48815	48824	20 %	20 %	20 %	40 %	482884747
28	NC_021082	AATTA	2	10	50258	50267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021082	AAGCA	2	10	51967	51976	60 %	0 %	20 %	20 %	482884751
30	NC_021082	GTTGC	2	10	52343	52352	0 %	40 %	40 %	20 %	482884751
31	NC_021082	CGATT	2	10	56607	56616	20 %	40 %	20 %	20 %	482884755
32	NC_021082	TGTCT	2	10	57566	57575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021082	TTTTA	2	10	58994	59003	20 %	80 %	0 %	0 %	482884758
34	NC_021082	AGTGA	2	10	59235	59244	40 %	20 %	40 %	0 %	482884758
35	NC_021082	GTTTT	2	10	65499	65508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021082	TTAAA	2	10	67474	67483	60 %	40 %	0 %	0 %	482884767
37	NC_021082	GAAAA	2	10	67893	67902	80 %	0 %	20 %	0 %	482884767
38	NC_021082	ATGTT	2	10	68458	68467	20 %	60 %	20 %	0 %	482884767
39	NC_021082	AAATT	2	10	69493	69502	60 %	40 %	0 %	0 %	482884767
40	NC_021082	GAATG	2	10	70572	70581	40 %	20 %	40 %	0 %	482884768
41	NC_021082	AAGCT	2	10	71394	71403	40 %	20 %	20 %	20 %	482884769
42	NC_021082	TTTAT	2	10	73041	73050	20 %	80 %	0 %	0 %	482884770
43	NC_021082	AAAAC	2	10	73685	73694	80 %	0 %	0 %	20 %	482884771
44	NC_021082	CGATT	2	10	74235	74244	20 %	40 %	20 %	20 %	482884771
45	NC_021082	ATTTT	2	10	75137	75146	20 %	80 %	0 %	0 %	482884772
46	NC_021082	GTCCG	2	10	76575	76584	0 %	20 %	40 %	40 %	482884773
47	NC_021082	ACCGC	2	10	78519	78528	20 %	0 %	20 %	60 %	482884774
48	NC_021082	TGGCT	2	10	78798	78807	0 %	40 %	40 %	20 %	482884774
49	NC_021082	TGATG	2	10	79673	79682	20 %	40 %	40 %	0 %	482884775
50	NC_021082	AATTA	2	10	80993	81002	60 %	40 %	0 %	0 %	482884777
51	NC_021082	AATTC	2	10	83156	83165	40 %	40 %	0 %	20 %	482884778
52	NC_021082	AACAA	2	10	85458	85467	80 %	0 %	0 %	20 %	482884780
53	NC_021082	CATGC	2	10	86082	86091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021082	AACGG	2	10	86319	86328	40 %	0 %	40 %	20 %	482884781
55	NC_021082	CACCG	2	10	86872	86881	20 %	0 %	20 %	60 %	482884781
56	NC_021082	TGCCG	2	10	87319	87328	0 %	20 %	40 %	40 %	482884781
57	NC_021082	TTTGC	2	10	89784	89793	0 %	60 %	20 %	20 %	482884783
58	NC_021082	ATATA	2	10	90028	90037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021082	CATCG	2	10	90724	90733	20 %	20 %	20 %	40 %	482884784
60	NC_021082	TTGTG	2	10	91150	91159	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021082	ACTTA	2	10	91327	91336	40 %	40 %	0 %	20 %	482884785
62	NC_021082	ATTTT	2	10	92172	92181	20 %	80 %	0 %	0 %	482884786
63	NC_021082	GCAAC	2	10	92687	92696	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021082	AAGCC	2	10	92840	92849	40 %	0 %	20 %	40 %	482884787
65	NC_021082	AAAAC	2	10	96230	96239	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021082	ATCAA	2	10	97323	97332	60 %	20 %	0 %	20 %	482884794
67	NC_021082	CCGCA	2	10	98314	98323	20 %	0 %	20 %	60 %	482884794
68	NC_021082	AAATT	2	10	101299	101308	60 %	40 %	0 %	0 %	482884796
69	NC_021082	AGGGG	2	10	103938	103947	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021082	ATGCA	2	10	107620	107629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021082	TTTAG	2	10	108742	108751	20 %	60 %	20 %	0 %	482884806
72	NC_021082	ATCAG	2	10	108808	108817	40 %	20 %	20 %	20 %	482884806
73	NC_021082	TATTT	2	10	109317	109326	20 %	80 %	0 %	0 %	482884806
74	NC_021082	CGGCT	2	10	111959	111968	0 %	20 %	40 %	40 %	482884810
75	NC_021082	CAGTT	2	10	114728	114737	20 %	40 %	20 %	20 %	482884814
76	NC_021082	GCAGG	2	10	115068	115077	20 %	0 %	60 %	20 %	482884814
77	NC_021082	TCAGC	2	10	115753	115762	20 %	20 %	20 %	40 %	482884815
78	NC_021082	CAAAA	2	10	119294	119303	80 %	0 %	0 %	20 %	482884820
79	NC_021082	AGTAA	2	10	120079	120088	60 %	20 %	20 %	0 %	482884821
80	NC_021082	AACAG	2	10	121188	121197	60 %	0 %	20 %	20 %	482884821
81	NC_021082	TAAGT	2	10	121504	121513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021082	CTGCC	2	10	122211	122220	0 %	20 %	20 %	60 %	482884822
83	NC_021082	ATTTT	2	10	122987	122996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021082	TAAAT	2	10	123052	123061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021082	TCGGC	2	10	125045	125054	0 %	20 %	40 %	40 %	482884827
86	NC_021082	TAAAT	2	10	125501	125510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021082	AGACT	2	10	125562	125571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021082	GCTAT	2	10	128670	128679	20 %	40 %	20 %	20 %	482884833
89	NC_021082	TGCTT	2	10	129920	129929	0 %	60 %	20 %	20 %	482884837
90	NC_021082	CCAAA	2	10	132822	132831	60 %	0 %	0 %	40 %	482884840
91	NC_021082	TGAAG	2	10	134362	134371	40 %	20 %	40 %	0 %	482884842
92	NC_021082	AAATG	2	10	136296	136305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021082	ATATG	2	10	136306	136315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021082	TACGA	2	10	138672	138681	40 %	20 %	20 %	20 %	482884845
95	NC_021082	ACCAG	2	10	139536	139545	40 %	0 %	20 %	40 %	482884845
96	NC_021082	TTAAA	2	10	139783	139792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021082	AAAAT	2	10	140861	140870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021082	GCAAT	2	10	141418	141427	40 %	20 %	20 %	20 %	482884848
99	NC_021082	TTGGC	2	10	141592	141601	0 %	40 %	40 %	20 %	482884848
100	NC_021082	CATAT	2	10	142773	142782	40 %	40 %	0 %	20 %	482884849
101	NC_021082	GCAAT	2	10	145721	145730	40 %	20 %	20 %	20 %	482884853
102	NC_021082	TTTAT	2	10	150717	150726	20 %	80 %	0 %	0 %	482884856
103	NC_021082	TTTCA	2	10	151025	151034	20 %	60 %	0 %	20 %	482884856
104	NC_021082	TTATT	2	10	153778	153787	20 %	80 %	0 %	0 %	482884858
105	NC_021082	CGATT	2	10	158364	158373	20 %	40 %	20 %	20 %	482884861
106	NC_021082	AAAGA	2	10	158799	158808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021082	AAAGT	2	10	159509	159518	60 %	20 %	20 %	0 %	482884862
108	NC_021082	AAATC	2	10	161867	161876	60 %	20 %	0 %	20 %	482884865
109	NC_021082	CCGCT	2	10	163856	163865	0 %	20 %	20 %	60 %	482884867
110	NC_021082	CACTG	2	10	164070	164079	20 %	20 %	20 %	40 %	482884867
111	NC_021082	ATTTG	2	10	164555	164564	20 %	60 %	20 %	0 %	482884868
112	NC_021082	CGGTA	2	10	164618	164627	20 %	20 %	40 %	20 %	482884868
113	NC_021082	ATTGG	2	10	164923	164932	20 %	40 %	40 %	0 %	482884868
114	NC_021082	GATGT	2	10	165184	165193	20 %	40 %	40 %	0 %	482884869
115	NC_021082	TTATT	2	10	165282	165291	20 %	80 %	0 %	0 %	482884869
116	NC_021082	GTGAA	2	10	170197	170206	40 %	20 %	40 %	0 %	482884877
117	NC_021082	TCAAA	2	10	170265	170274	60 %	20 %	0 %	20 %	482884877
118	NC_021082	AGCAA	2	10	171280	171289	60 %	0 %	20 %	20 %	482884879
119	NC_021082	AAATC	2	10	172903	172912	60 %	20 %	0 %	20 %	482884881
120	NC_021082	TCGGT	2	10	173538	173547	0 %	40 %	40 %	20 %	482884882
121	NC_021082	GCACG	2	10	176691	176700	20 %	0 %	40 %	40 %	482884886
122	NC_021082	AAATC	2	10	176910	176919	60 %	20 %	0 %	20 %	482884886
123	NC_021082	TTAAT	2	10	177632	177641	40 %	60 %	0 %	0 %	482884887
124	NC_021082	TCTGC	2	10	178518	178527	0 %	40 %	20 %	40 %	482884889
125	NC_021082	ATAAA	2	10	178743	178752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021082	CAATT	2	10	181241	181250	40 %	40 %	0 %	20 %	482884891
127	NC_021082	ATTTT	2	10	181625	181634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021082	AATTT	2	10	181639	181648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021082	TTTAC	2	10	181857	181866	20 %	60 %	0 %	20 %	482884892
130	NC_021082	GCCAA	2	10	182114	182123	40 %	0 %	20 %	40 %	482884892
131	NC_021082	TCACC	2	10	182993	183002	20 %	20 %	0 %	60 %	482884893
132	NC_021082	GCGGG	2	10	187013	187022	0 %	0 %	80 %	20 %	482884896
133	NC_021082	AATAA	2	10	189517	189526	80 %	20 %	0 %	0 %	482884896
134	NC_021082	CAAAC	2	10	190952	190961	60 %	0 %	0 %	40 %	482884898
135	NC_021082	TAATT	2	10	193245	193254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021082	GTGAT	2	10	194140	194149	20 %	40 %	40 %	0 %	482884900
137	NC_021082	ATTGT	2	10	194381	194390	20 %	60 %	20 %	0 %	482884900
138	NC_021082	TGGGT	2	10	195267	195276	0 %	40 %	60 %	0 %	482884901
139	NC_021082	TCCGC	2	10	196925	196934	0 %	20 %	20 %	60 %	482884903
140	NC_021082	TAATT	2	10	198123	198132	40 %	60 %	0 %	0 %	482884903
141	NC_021082	GAAAA	2	10	200112	200121	80 %	0 %	20 %	0 %	482884906
142	NC_021082	TCTAT	2	10	201334	201343	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021082	GGAAT	2	10	203753	203762	40 %	20 %	40 %	0 %	482884913
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145	NC_021082	TGCAA	2	10	204909	204918	40 %	20 %	20 %	20 %	482884914
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151	NC_021082	AAAGA	2	10	214357	214366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021082	TGCGT	2	10	214966	214975	0 %	40 %	40 %	20 %	482884925
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159	NC_021082	TACCA	2	10	230752	230761	40 %	20 %	0 %	40 %	482884934
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172	NC_021082	CAATT	2	10	251100	251109	40 %	40 %	0 %	20 %	482884959
173	NC_021082	CTCTT	2	10	251474	251483	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_021082	CTGAG	2	10	252000	252009	20 %	20 %	40 %	20 %	482884961
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176	NC_021082	TCAAA	2	10	257750	257759	60 %	20 %	0 %	20 %	482884969
177	NC_021082	TTTTA	2	10	260768	260777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021082	TGGCT	2	10	262958	262967	0 %	40 %	40 %	20 %	482884975
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181	NC_021082	ATACA	2	10	266030	266039	60 %	20 %	0 %	20 %	482884980
182	NC_021082	GTGCA	2	10	266223	266232	20 %	20 %	40 %	20 %	482884981
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184	NC_021082	CTAAC	2	10	268948	268957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_021082	CGACT	2	10	269277	269286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
186	NC_021082	TCGGT	2	10	269652	269661	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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212	NC_021082	TTTTA	2	10	308893	308902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_021082	CTTTT	2	10	366166	366175	0 %	80 %	0 %	20 %	482885073
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258	NC_021082	TGCCT	2	10	367771	367780	0 %	40 %	20 %	40 %	482885073
259	NC_021082	CAAGC	2	10	368241	368250	40 %	0 %	20 %	40 %	482885073
260	NC_021082	AAATT	2	10	368714	368723	60 %	40 %	0 %	0 %	482885073
261	NC_021082	GCAAC	2	10	368994	369003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_021082	GATTG	2	10	369272	369281	20 %	40 %	40 %	0 %	482885074
263	NC_021082	TTGAA	2	10	371393	371402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021082	TTGGT	2	10	372221	372230	0 %	60 %	40 %	0 %	482885077
265	NC_021082	GGTTT	2	10	372408	372417	0 %	60 %	40 %	0 %	482885077
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