MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 2010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021082	TTCCC	2	10	692056	692065	0 %	40 %	0 %	60 %	482885391
502	NC_021082	AGCAG	2	10	693591	693600	40 %	0 %	40 %	20 %	482885392
503	NC_021082	CTTGG	2	10	694632	694641	0 %	40 %	40 %	20 %	482885392
504	NC_021082	GCCCA	2	10	694888	694897	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
505	NC_021082	CCATA	2	10	695882	695891	40 %	20 %	0 %	40 %	482885393
506	NC_021082	CAAAT	2	10	696543	696552	60 %	20 %	0 %	20 %	482885394
507	NC_021082	CTTTT	2	10	696645	696654	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
508	NC_021082	ATTGA	2	10	697362	697371	40 %	40 %	20 %	0 %	482885395
509	NC_021082	GGTAA	2	10	700026	700035	40 %	20 %	40 %	0 %	482885398
510	NC_021082	AAAGT	2	10	702118	702127	60 %	20 %	20 %	0 %	482885402
511	NC_021082	GCTCA	2	10	705133	705142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_021082	ATTTT	2	10	708164	708173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021082	AAATT	2	10	709434	709443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021082	TTATC	2	10	709832	709841	20 %	60 %	0 %	20 %	482885415
515	NC_021082	TAAAA	2	10	711135	711144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021082	CCCGG	2	10	711687	711696	0 %	0 %	40 %	60 %	482885417
517	NC_021082	TAAAT	2	10	713753	713762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021082	GTTTG	2	10	717214	717223	0 %	60 %	40 %	0 %	482885421
519	NC_021082	AAATA	2	10	717402	717411	80 %	20 %	0 %	0 %	482885421
520	NC_021082	TTGCA	2	10	717725	717734	20 %	40 %	20 %	20 %	482885422
521	NC_021082	TTTGG	2	10	720239	720248	0 %	60 %	40 %	0 %	482885424
522	NC_021082	CGCAA	2	10	723082	723091	40 %	0 %	20 %	40 %	482885427
523	NC_021082	TTTTA	2	10	725556	725565	20 %	80 %	0 %	0 %	482885429
524	NC_021082	GTATT	2	10	725878	725887	20 %	60 %	20 %	0 %	482885430
525	NC_021082	TGGCT	2	10	729001	729010	0 %	40 %	40 %	20 %	482885434
526	NC_021082	TACGG	2	10	730487	730496	20 %	20 %	40 %	20 %	482885435
527	NC_021082	GTTTT	2	10	732303	732312	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021082	TGATT	2	10	737201	737210	20 %	60 %	20 %	0 %	482885441
529	NC_021082	CGGAA	2	10	740464	740473	40 %	0 %	40 %	20 %	482885447
530	NC_021082	GAATG	2	10	741177	741186	40 %	20 %	40 %	0 %	482885447
531	NC_021082	CATTG	2	10	742315	742324	20 %	40 %	20 %	20 %	482885448
532	NC_021082	CGGCA	2	10	745725	745734	20 %	0 %	40 %	40 %	482885453
533	NC_021082	GCACG	2	10	750684	750693	20 %	0 %	40 %	40 %	482885459
534	NC_021082	TTGAA	2	10	752157	752166	40 %	40 %	20 %	0 %	482885460
535	NC_021082	GGAAT	2	10	752650	752659	40 %	20 %	40 %	0 %	482885460
536	NC_021082	TTCTT	2	10	760393	760402	0 %	80 %	0 %	20 %	482885463
537	NC_021082	TATCG	2	10	760929	760938	20 %	40 %	20 %	20 %	482885464
538	NC_021082	TCTTG	2	10	764570	764579	0 %	60 %	20 %	20 %	482885468
539	NC_021082	AAAAT	2	10	765018	765027	80 %	20 %	0 %	0 %	482885469
540	NC_021082	TAGCA	2	10	768447	768456	40 %	20 %	20 %	20 %	482885472
541	NC_021082	TAACC	2	10	770409	770418	40 %	20 %	0 %	40 %	482885474
542	NC_021082	AATGT	2	10	771169	771178	40 %	40 %	20 %	0 %	482885475
543	NC_021082	CATTC	2	10	771453	771462	20 %	40 %	0 %	40 %	482885475
544	NC_021082	GGTAG	2	10	772899	772908	20 %	20 %	60 %	0 %	482885476
545	NC_021082	GGCGA	2	10	773757	773766	20 %	0 %	60 %	20 %	482885477
546	NC_021082	GGAGT	2	10	773973	773982	20 %	20 %	60 %	0 %	482885478
547	NC_021082	GCAAT	2	10	775103	775112	40 %	20 %	20 %	20 %	482885479
548	NC_021082	ACTTA	2	10	777383	777392	40 %	40 %	0 %	20 %	482885481
549	NC_021082	TGCCT	2	10	779402	779411	0 %	40 %	20 %	40 %	482885484
550	NC_021082	CGGTA	2	10	782533	782542	20 %	20 %	40 %	20 %	482885487
551	NC_021082	TAAAA	2	10	787241	787250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021082	ATCAA	2	10	789995	790004	60 %	20 %	0 %	20 %	482885492
553	NC_021082	TTAAC	2	10	790974	790983	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
554	NC_021082	GCCAA	2	10	791107	791116	40 %	0 %	20 %	40 %	482885493
555	NC_021082	CACCG	2	10	791982	791991	20 %	0 %	20 %	60 %	482885493
556	NC_021082	GTGAG	2	10	792345	792354	20 %	20 %	60 %	0 %	482885493
557	NC_021082	ATAGC	2	10	792412	792421	40 %	20 %	20 %	20 %	482885493
558	NC_021082	TCTGT	2	10	792454	792463	0 %	60 %	20 %	20 %	482885493
559	NC_021082	TTTAT	2	10	796137	796146	20 %	80 %	0 %	0 %	482885498
560	NC_021082	ATCTG	2	10	798857	798866	20 %	40 %	20 %	20 %	482885502
561	NC_021082	AATGG	2	10	801906	801915	40 %	20 %	40 %	0 %	482885504
562	NC_021082	ATTCA	2	10	805962	805971	40 %	40 %	0 %	20 %	482885505
563	NC_021082	GGTGG	2	10	806784	806793	0 %	20 %	80 %	0 %	482885506
564	NC_021082	AAACT	2	10	807418	807427	60 %	20 %	0 %	20 %	482885506
565	NC_021082	AAGGT	2	10	808988	808997	40 %	20 %	40 %	0 %	482885507
566	NC_021082	AGGCG	2	10	809205	809214	20 %	0 %	60 %	20 %	482885507
567	NC_021082	GCTAC	2	10	809429	809438	20 %	20 %	20 %	40 %	482885507
568	NC_021082	CTTTA	2	10	810974	810983	20 %	60 %	0 %	20 %	482885508
569	NC_021082	ACACC	2	10	815019	815028	40 %	0 %	0 %	60 %	482885510
570	NC_021082	AAAAC	2	10	815043	815052	80 %	0 %	0 %	20 %	482885510
571	NC_021082	TTGTG	2	10	817440	817449	0 %	60 %	40 %	0 %	482885515
572	NC_021082	AATAT	2	10	817945	817954	60 %	40 %	0 %	0 %	482885515
573	NC_021082	GAGTT	2	10	821610	821619	20 %	40 %	40 %	0 %	482885522
574	NC_021082	ATTTA	2	10	825718	825727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021082	AATTA	2	10	826436	826445	60 %	40 %	0 %	0 %	482885526
576	NC_021082	AACCC	2	10	827675	827684	40 %	0 %	0 %	60 %	482885527
577	NC_021082	AAGCC	2	10	827738	827747	40 %	0 %	20 %	40 %	482885527
578	NC_021082	ATGCA	2	10	828075	828084	40 %	20 %	20 %	20 %	482885527
579	NC_021082	AGTTG	2	10	830055	830064	20 %	40 %	40 %	0 %	482885529
580	NC_021082	CGGAA	2	10	830710	830719	40 %	0 %	40 %	20 %	482885530
581	NC_021082	TGAGA	2	10	830743	830752	40 %	20 %	40 %	0 %	482885530
582	NC_021082	ATCGA	2	10	831085	831094	40 %	20 %	20 %	20 %	482885531
583	NC_021082	TTATC	2	10	835458	835467	20 %	60 %	0 %	20 %	482885534
584	NC_021082	CAATT	2	10	836809	836818	40 %	40 %	0 %	20 %	482885537
585	NC_021082	AATCA	2	10	837358	837367	60 %	20 %	0 %	20 %	482885537
586	NC_021082	CGGCA	2	10	839773	839782	20 %	0 %	40 %	40 %	482885541
587	NC_021082	TTTAA	2	10	843280	843289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021082	TATCG	2	10	844989	844998	20 %	40 %	20 %	20 %	482885545
589	NC_021082	GCCAA	2	10	848633	848642	40 %	0 %	20 %	40 %	482885550
590	NC_021082	TATTT	2	10	850439	850448	20 %	80 %	0 %	0 %	482885552
591	NC_021082	TGCAT	2	10	851229	851238	20 %	40 %	20 %	20 %	482885552
592	NC_021082	GGAAA	2	10	855821	855830	60 %	0 %	40 %	0 %	482885557
593	NC_021082	CATTT	2	10	856962	856971	20 %	60 %	0 %	20 %	482885558
594	NC_021082	AGAAT	2	10	857252	857261	60 %	20 %	20 %	0 %	482885558
595	NC_021082	ATTAC	2	10	859087	859096	40 %	40 %	0 %	20 %	482885560
596	NC_021082	TAAGT	2	10	862784	862793	40 %	40 %	20 %	0 %	482885562
597	NC_021082	TAACT	2	10	863531	863540	40 %	40 %	0 %	20 %	482885562
598	NC_021082	GGTGA	2	10	863853	863862	20 %	20 %	60 %	0 %	482885562
599	NC_021082	CAAAA	2	10	868892	868901	80 %	0 %	0 %	20 %	482885568
600	NC_021082	AGAAA	2	10	869103	869112	80 %	0 %	20 %	0 %	482885568
601	NC_021082	TGTTT	2	10	871640	871649	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021082	GAAAG	2	10	873294	873303	60 %	0 %	40 %	0 %	482885571
603	NC_021082	GTAGT	2	10	874051	874060	20 %	40 %	40 %	0 %	482885572
604	NC_021082	ACCTG	2	10	874241	874250	20 %	20 %	20 %	40 %	482885572
605	NC_021082	CAGTT	2	10	874252	874261	20 %	40 %	20 %	20 %	482885572
606	NC_021082	TTTTA	2	10	874663	874672	20 %	80 %	0 %	0 %	482885572
607	NC_021082	AATCA	2	10	875228	875237	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
608	NC_021082	TTAAC	2	10	875608	875617	40 %	40 %	0 %	20 %	482885573
609	NC_021082	ATGAA	2	10	876523	876532	60 %	20 %	20 %	0 %	482885573
610	NC_021082	CGGTT	2	10	878594	878603	0 %	40 %	40 %	20 %	482885575
611	NC_021082	GGTTT	2	10	881693	881702	0 %	60 %	40 %	0 %	482885579
612	NC_021082	GGTTT	2	10	882676	882685	0 %	60 %	40 %	0 %	482885580
613	NC_021082	CTTTA	2	10	882940	882949	20 %	60 %	0 %	20 %	482885580
614	NC_021082	GCTTG	2	10	883058	883067	0 %	40 %	40 %	20 %	482885580
615	NC_021082	GAATT	2	10	883309	883318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021082	GTAGT	2	10	883836	883845	20 %	40 %	40 %	0 %	482885581
617	NC_021082	GGAAT	2	10	884486	884495	40 %	20 %	40 %	0 %	482885581
618	NC_021082	TGATG	2	10	886099	886108	20 %	40 %	40 %	0 %	482885582
619	NC_021082	GGTGG	2	10	887349	887358	0 %	20 %	80 %	0 %	482885584
620	NC_021082	CCAAC	2	10	891187	891196	40 %	0 %	0 %	60 %	482885590
621	NC_021082	AGGCT	2	10	892250	892259	20 %	20 %	40 %	20 %	482885591
622	NC_021082	CGTTT	2	10	895775	895784	0 %	60 %	20 %	20 %	482885591
623	NC_021082	GTATT	2	10	896234	896243	20 %	60 %	20 %	0 %	482885591
624	NC_021082	TCGTT	2	10	897516	897525	0 %	60 %	20 %	20 %	482885592
625	NC_021082	ATTGC	2	10	897961	897970	20 %	40 %	20 %	20 %	482885593
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627	NC_021082	TGCAT	2	10	898284	898293	20 %	40 %	20 %	20 %	482885593
628	NC_021082	TTTGG	2	10	899038	899047	0 %	60 %	40 %	0 %	482885594
629	NC_021082	ACGGC	2	10	901547	901556	20 %	0 %	40 %	40 %	482885598
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997	NC_021082	TTTAT	2	10	1364359	1364368	20 %	80 %	0 %	0 %	482886063
998	NC_021082	CGGCT	2	10	1365719	1365728	0 %	20 %	40 %	40 %	482886064
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