MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 2010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021082	TCTTA	2	10	2051508	2051517	20 %	60 %	0 %	20 %	482886806
1502	NC_021082	CGGTA	2	10	2051546	2051555	20 %	20 %	40 %	20 %	482886806
1503	NC_021082	ACCAA	2	10	2051788	2051797	60 %	0 %	0 %	40 %	482886806
1504	NC_021082	GGTAT	2	10	2052483	2052492	20 %	40 %	40 %	0 %	482886807
1505	NC_021082	TTGGA	2	10	2053780	2053789	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021082	GATTT	2	10	2054575	2054584	20 %	60 %	20 %	0 %	482886810
1507	NC_021082	ATTTA	2	10	2055083	2055092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021082	TGGGT	2	10	2056678	2056687	0 %	40 %	60 %	0 %	482886811
1509	NC_021082	GCCGG	2	10	2059907	2059916	0 %	0 %	60 %	40 %	482886813
1510	NC_021082	ATTCT	2	10	2059969	2059978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_021082	TAATT	2	10	2060176	2060185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021082	ATTAC	2	10	2060801	2060810	40 %	40 %	0 %	20 %	482886814
1513	NC_021082	TGATG	2	10	2060851	2060860	20 %	40 %	40 %	0 %	482886814
1514	NC_021082	ACTTA	2	10	2062122	2062131	40 %	40 %	0 %	20 %	482886815
1515	NC_021082	GTGCT	2	10	2062181	2062190	0 %	40 %	40 %	20 %	482886815
1516	NC_021082	TGATT	2	10	2065127	2065136	20 %	60 %	20 %	0 %	482886818
1517	NC_021082	TGGGT	2	10	2066294	2066303	0 %	40 %	60 %	0 %	482886819
1518	NC_021082	TCATT	2	10	2066582	2066591	20 %	60 %	0 %	20 %	482886819
1519	NC_021082	AAACG	2	10	2066779	2066788	60 %	0 %	20 %	20 %	482886819
1520	NC_021082	CTTGG	2	10	2068364	2068373	0 %	40 %	40 %	20 %	482886820
1521	NC_021082	ATTTA	2	10	2071063	2071072	40 %	60 %	0 %	0 %	482886823
1522	NC_021082	ATGCA	2	10	2071159	2071168	40 %	20 %	20 %	20 %	482886823
1523	NC_021082	AAAAC	2	10	2072372	2072381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1524	NC_021082	AAAAC	2	10	2074083	2074092	80 %	0 %	0 %	20 %	482886826
1525	NC_021082	AAATG	2	10	2074517	2074526	60 %	20 %	20 %	0 %	482886826
1526	NC_021082	TAGTT	2	10	2074860	2074869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021082	GCCAC	2	10	2081197	2081206	20 %	0 %	20 %	60 %	482886829
1528	NC_021082	ATCAT	2	10	2083077	2083086	40 %	40 %	0 %	20 %	482886831
1529	NC_021082	GTTGC	2	10	2083713	2083722	0 %	40 %	40 %	20 %	482886831
1530	NC_021082	GAAAC	2	10	2084845	2084854	60 %	0 %	20 %	20 %	482886833
1531	NC_021082	ATTGG	2	10	2084995	2085004	20 %	40 %	40 %	0 %	482886833
1532	NC_021082	GAAAC	2	10	2086531	2086540	60 %	0 %	20 %	20 %	482886834
1533	NC_021082	TAAAA	2	10	2086860	2086869	80 %	20 %	0 %	0 %	482886834
1534	NC_021082	ATAAG	2	10	2088107	2088116	60 %	20 %	20 %	0 %	482886836
1535	NC_021082	GTGAA	2	10	2088579	2088588	40 %	20 %	40 %	0 %	482886837
1536	NC_021082	CACTT	2	10	2089249	2089258	20 %	40 %	0 %	40 %	482886837
1537	NC_021082	CAGCT	2	10	2089552	2089561	20 %	20 %	20 %	40 %	482886837
1538	NC_021082	AAAAT	2	10	2092537	2092546	80 %	20 %	0 %	0 %	482886841
1539	NC_021082	AATTT	2	10	2092640	2092649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021082	GGTAT	2	10	2093453	2093462	20 %	40 %	40 %	0 %	482886842
1541	NC_021082	ATTCA	2	10	2094376	2094385	40 %	40 %	0 %	20 %	482886842
1542	NC_021082	GTATT	2	10	2097670	2097679	20 %	60 %	20 %	0 %	482886844
1543	NC_021082	TACAG	2	10	2099223	2099232	40 %	20 %	20 %	20 %	482886846
1544	NC_021082	TGAAT	2	10	2099414	2099423	40 %	40 %	20 %	0 %	482886846
1545	NC_021082	CGATC	2	10	2103174	2103183	20 %	20 %	20 %	40 %	482886848
1546	NC_021082	ATTTA	2	10	2109066	2109075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021082	GTTGA	2	10	2109160	2109169	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021082	CGAAA	2	10	2113372	2113381	60 %	0 %	20 %	20 %	482886860
1549	NC_021082	CATCC	2	10	2113455	2113464	20 %	20 %	0 %	60 %	482886860
1550	NC_021082	ATTTA	2	10	2115945	2115954	40 %	60 %	0 %	0 %	482886863
1551	NC_021082	AGTAA	2	10	2116336	2116345	60 %	20 %	20 %	0 %	482886863
1552	NC_021082	ATTAC	2	10	2118355	2118364	40 %	40 %	0 %	20 %	482886866
1553	NC_021082	TTGAT	2	10	2121860	2121869	20 %	60 %	20 %	0 %	482886871
1554	NC_021082	TCATC	2	10	2122278	2122287	20 %	40 %	0 %	40 %	482886871
1555	NC_021082	AATAA	2	10	2124946	2124955	80 %	20 %	0 %	0 %	482886874
1556	NC_021082	GCTTG	2	10	2125330	2125339	0 %	40 %	40 %	20 %	482886874
1557	NC_021082	CATCT	2	10	2128857	2128866	20 %	40 %	0 %	40 %	482886879
1558	NC_021082	GATCA	2	10	2129206	2129215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1559	NC_021082	GCAAA	2	10	2129248	2129257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_021082	GGATA	2	10	2129376	2129385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021082	CTCCC	2	10	2130037	2130046	0 %	20 %	0 %	80 %	482886880
1562	NC_021082	AAGGC	2	10	2130269	2130278	40 %	0 %	40 %	20 %	482886881
1563	NC_021082	AAATA	2	10	2132681	2132690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021082	TACAA	2	10	2138998	2139007	60 %	20 %	0 %	20 %	482886889
1565	NC_021082	GAAAT	2	10	2141876	2141885	60 %	20 %	20 %	0 %	482886892
1566	NC_021082	CATCC	2	10	2144331	2144340	20 %	20 %	0 %	60 %	482886896
1567	NC_021082	CGATT	2	10	2146214	2146223	20 %	40 %	20 %	20 %	482886899
1568	NC_021082	GCAAA	2	10	2147417	2147426	60 %	0 %	20 %	20 %	482886899
1569	NC_021082	TTGAT	2	10	2150737	2150746	20 %	60 %	20 %	0 %	482886903
1570	NC_021082	GTAAG	2	10	2151113	2151122	40 %	20 %	40 %	0 %	482886903
1571	NC_021082	TCATC	2	10	2151155	2151164	20 %	40 %	0 %	40 %	482886903
1572	NC_021082	AATAA	2	10	2151401	2151410	80 %	20 %	0 %	0 %	482886904
1573	NC_021082	CACGA	2	10	2151743	2151752	40 %	0 %	20 %	40 %	482886905
1574	NC_021082	TTTGG	2	10	2152702	2152711	0 %	60 %	40 %	0 %	482886906
1575	NC_021082	TAAGA	2	10	2153520	2153529	60 %	20 %	20 %	0 %	482886906
1576	NC_021082	AATAA	2	10	2153823	2153832	80 %	20 %	0 %	0 %	482886906
1577	NC_021082	GACCA	2	10	2154138	2154147	40 %	0 %	20 %	40 %	482886906
1578	NC_021082	GCTTG	2	10	2154210	2154219	0 %	40 %	40 %	20 %	482886906
1579	NC_021082	TGGTA	2	10	2155839	2155848	20 %	40 %	40 %	0 %	482886908
1580	NC_021082	TACCG	2	10	2157146	2157155	20 %	20 %	20 %	40 %	482886909
1581	NC_021082	TTTTC	2	10	2158230	2158239	0 %	80 %	0 %	20 %	482886911
1582	NC_021082	TCCAG	2	10	2162279	2162288	20 %	20 %	20 %	40 %	482886918
1583	NC_021082	CTGAG	2	10	2163549	2163558	20 %	20 %	40 %	20 %	482886919
1584	NC_021082	TAAAC	2	10	2163816	2163825	60 %	20 %	0 %	20 %	482886919
1585	NC_021082	AATCC	2	10	2167919	2167928	40 %	20 %	0 %	40 %	482886926
1586	NC_021082	TAAAG	2	10	2168158	2168167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021082	GAATT	2	10	2168936	2168945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021082	CATTG	2	10	2170076	2170085	20 %	40 %	20 %	20 %	482886928
1589	NC_021082	ATTTA	2	10	2170416	2170425	40 %	60 %	0 %	0 %	482886928
1590	NC_021082	TATGT	2	10	2172647	2172656	20 %	60 %	20 %	0 %	482886931
1591	NC_021082	ATTTT	2	10	2173613	2173622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021082	AAATT	2	10	2174711	2174720	60 %	40 %	0 %	0 %	482886933
1593	NC_021082	TGGCA	2	10	2174775	2174784	20 %	20 %	40 %	20 %	482886933
1594	NC_021082	AAGTG	2	10	2175595	2175604	40 %	20 %	40 %	0 %	482886934
1595	NC_021082	GCACG	2	10	2177432	2177441	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1596	NC_021082	CAAAA	2	10	2177710	2177719	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1597	NC_021082	AATGG	2	10	2177865	2177874	40 %	20 %	40 %	0 %	482886938
1598	NC_021082	AAAAT	2	10	2178902	2178911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021082	TTTTA	2	10	2182398	2182407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021082	TTCTT	2	10	2183903	2183912	0 %	80 %	0 %	20 %	482886947
1601	NC_021082	CAATC	2	10	2183994	2184003	40 %	20 %	0 %	40 %	482886947
1602	NC_021082	CAGTA	2	10	2185060	2185069	40 %	20 %	20 %	20 %	482886948
1603	NC_021082	AATTG	2	10	2185479	2185488	40 %	40 %	20 %	0 %	482886948
1604	NC_021082	TTGAT	2	10	2187234	2187243	20 %	60 %	20 %	0 %	482886950
1605	NC_021082	ATCTG	2	10	2188835	2188844	20 %	40 %	20 %	20 %	482886951
1606	NC_021082	TGTTT	2	10	2189751	2189760	0 %	80 %	20 %	0 %	482886952
1607	NC_021082	TCAAG	2	10	2190140	2190149	40 %	20 %	20 %	20 %	482886952
1608	NC_021082	TGGGT	2	10	2190263	2190272	0 %	40 %	60 %	0 %	482886952
1609	NC_021082	AGTTG	2	10	2192341	2192350	20 %	40 %	40 %	0 %	482886953
1610	NC_021082	ATTAA	2	10	2193908	2193917	60 %	40 %	0 %	0 %	482886954
1611	NC_021082	ATTTA	2	10	2194872	2194881	40 %	60 %	0 %	0 %	482886956
1612	NC_021082	AAAAT	2	10	2196082	2196091	80 %	20 %	0 %	0 %	482886957
1613	NC_021082	TTTGT	2	10	2198913	2198922	0 %	80 %	20 %	0 %	482886960
1614	NC_021082	ATACA	2	10	2201773	2201782	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_021082	TCTTA	2	10	2202060	2202069	20 %	60 %	0 %	20 %	482886964
1616	NC_021082	CTTTT	2	10	2205432	2205441	0 %	80 %	0 %	20 %	482886967
1617	NC_021082	AGCCA	2	10	2205755	2205764	40 %	0 %	20 %	40 %	482886967
1618	NC_021082	CAAAA	2	10	2207260	2207269	80 %	0 %	0 %	20 %	482886969
1619	NC_021082	CCACA	2	10	2209037	2209046	40 %	0 %	0 %	60 %	482886971
1620	NC_021082	CAAGC	2	10	2209090	2209099	40 %	0 %	20 %	40 %	482886971
1621	NC_021082	AAATA	2	10	2209103	2209112	80 %	20 %	0 %	0 %	482886971
1622	NC_021082	TAAAA	2	10	2213264	2213273	80 %	20 %	0 %	0 %	482886975
1623	NC_021082	GCAAT	2	10	2213875	2213884	40 %	20 %	20 %	20 %	482886976
1624	NC_021082	TAAAA	2	10	2214739	2214748	80 %	20 %	0 %	0 %	482886977
1625	NC_021082	TTCGT	2	10	2214877	2214886	0 %	60 %	20 %	20 %	482886978
1626	NC_021082	GGAGT	2	10	2219514	2219523	20 %	20 %	60 %	0 %	482886984
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1634	NC_021082	CCGCC	2	10	2227931	2227940	0 %	0 %	20 %	80 %	482886989
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1647	NC_021082	TTTCT	2	10	2245544	2245553	0 %	80 %	0 %	20 %	482887001
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1651	NC_021082	GCTGT	16	80	2248667	2248746	0 %	40 %	40 %	20 %	482887002
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1667	NC_021082	TGTGA	2	10	2277749	2277758	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1679	NC_021082	TAATT	2	10	2294182	2294191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1692	NC_021082	GATTG	2	10	2310849	2310858	20 %	40 %	40 %	0 %	482887053
1693	NC_021082	TTTAT	2	10	2312825	2312834	20 %	80 %	0 %	0 %	482887056
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1696	NC_021082	TAAAA	2	10	2314038	2314047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1697	NC_021082	TAAAA	2	10	2314507	2314516	80 %	20 %	0 %	0 %	482887058
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1720	NC_021082	AGCCG	2	10	2347847	2347856	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1722	NC_021082	GCTTT	2	10	2352621	2352630	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1743	NC_021082	TAATT	2	10	2378686	2378695	40 %	60 %	0 %	0 %	482887140
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1752	NC_021082	ATAAA	2	10	2389917	2389926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1753	NC_021082	TCGCT	2	10	2391524	2391533	0 %	40 %	20 %	40 %	482887159
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1755	NC_021082	GAATA	2	10	2394277	2394286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1878	NC_021082	AACAA	2	10	2561752	2561761	80 %	0 %	0 %	20 %	482887331
1879	NC_021082	ATTGA	2	10	2561907	2561916	40 %	40 %	20 %	0 %	482887331
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1882	NC_021082	TTTAC	2	10	2566207	2566216	20 %	60 %	0 %	20 %	482887337
1883	NC_021082	TGCTA	2	10	2566528	2566537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1884	NC_021082	CCATA	2	10	2568515	2568524	40 %	20 %	0 %	40 %	482887340
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1894	NC_021082	GCTCT	2	10	2586716	2586725	0 %	40 %	20 %	40 %	482887360
1895	NC_021082	TATTT	2	10	2587764	2587773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1896	NC_021082	AAACC	2	10	2592197	2592206	60 %	0 %	0 %	40 %	482887363
1897	NC_021082	TAGAT	2	10	2592535	2592544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1898	NC_021082	ATGAA	2	10	2592817	2592826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1899	NC_021082	TGCCT	2	10	2595168	2595177	0 %	40 %	20 %	40 %	482887367
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1902	NC_021082	TTGAT	2	10	2600685	2600694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1903	NC_021082	TAAAT	2	10	2601710	2601719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1904	NC_021082	ATCAG	2	10	2601776	2601785	40 %	20 %	20 %	20 %	482887375
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1908	NC_021082	CACTT	2	10	2604911	2604920	20 %	40 %	0 %	40 %	482887379
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1926	NC_021082	AAAAT	2	10	2629599	2629608	80 %	20 %	0 %	0 %	482887400
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1957	NC_021082	CTTTT	2	10	2662643	2662652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1981	NC_021082	GTTAT	2	10	2689169	2689178	20 %	60 %	20 %	0 %	482887452
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1986	NC_021082	CCCAA	2	10	2695006	2695015	40 %	0 %	0 %	60 %	482887458
1987	NC_021082	CCATA	2	10	2695676	2695685	40 %	20 %	0 %	40 %	482887459
1988	NC_021082	GGGCT	2	10	2696101	2696110	0 %	20 %	60 %	20 %	482887459
1989	NC_021082	GAAAC	2	10	2696457	2696466	60 %	0 %	20 %	20 %	482887459
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1991	NC_021082	AGCGA	2	10	2699664	2699673	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1992	NC_021082	TTTAC	2	10	2702767	2702776	20 %	60 %	0 %	20 %	482887466
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1995	NC_021082	AAAGC	2	10	2709951	2709960	60 %	0 %	20 %	20 %	482887473
1996	NC_021082	AACCA	2	10	2710148	2710157	60 %	0 %	0 %	40 %	482887474
1997	NC_021082	TTTAA	2	10	2711999	2712008	40 %	60 %	0 %	0 %	482887477
1998	NC_021082	TTGCA	2	10	2717182	2717191	20 %	40 %	20 %	20 %	482887481
1999	NC_021082	AAGCA	2	10	2720895	2720904	60 %	0 %	20 %	20 %	482887487
2000	NC_021082	ATAAA	2	10	2721105	2721114	80 %	20 %	0 %	0 %	482887488

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