MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 2010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021082	GATTG	2	10	1372880	1372889	20 %	40 %	40 %	0 %	482886069
1002	NC_021082	CCAAA	2	10	1373559	1373568	60 %	0 %	0 %	40 %	482886070
1003	NC_021082	GTAAT	2	10	1377117	1377126	40 %	40 %	20 %	0 %	482886071
1004	NC_021082	AAAAT	2	10	1380515	1380524	80 %	20 %	0 %	0 %	482886075
1005	NC_021082	AACTT	2	10	1381070	1381079	40 %	40 %	0 %	20 %	482886076
1006	NC_021082	TAAGT	2	10	1381256	1381265	40 %	40 %	20 %	0 %	482886076
1007	NC_021082	CGAAC	2	10	1381634	1381643	40 %	0 %	20 %	40 %	482886076
1008	NC_021082	GTAAT	2	10	1381691	1381700	40 %	40 %	20 %	0 %	482886076
1009	NC_021082	AATAA	2	10	1382693	1382702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021082	TGATG	2	10	1383294	1383303	20 %	40 %	40 %	0 %	482886078
1011	NC_021082	ATTTA	2	10	1385000	1385009	40 %	60 %	0 %	0 %	482886079
1012	NC_021082	GATTG	2	10	1388514	1388523	20 %	40 %	40 %	0 %	482886083
1013	NC_021082	AGTTG	2	10	1390751	1390760	20 %	40 %	40 %	0 %	482886085
1014	NC_021082	AAGAA	2	10	1391094	1391103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021082	TTTGG	2	10	1391331	1391340	0 %	60 %	40 %	0 %	482886086
1016	NC_021082	TTGGG	2	10	1396049	1396058	0 %	40 %	60 %	0 %	482886090
1017	NC_021082	TAGCT	2	10	1396086	1396095	20 %	40 %	20 %	20 %	482886090
1018	NC_021082	TGCTT	2	10	1396238	1396247	0 %	60 %	20 %	20 %	482886090
1019	NC_021082	GATAA	2	10	1397407	1397416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021082	TTAAA	2	10	1400753	1400762	60 %	40 %	0 %	0 %	482886092
1021	NC_021082	GAAAA	2	10	1401047	1401056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021082	TAAGG	2	10	1401133	1401142	40 %	20 %	40 %	0 %	482886093
1023	NC_021082	ATCTT	2	10	1403060	1403069	20 %	60 %	0 %	20 %	482886094
1024	NC_021082	AGATA	2	10	1406237	1406246	60 %	20 %	20 %	0 %	482886096
1025	NC_021082	CATAC	2	10	1406718	1406727	40 %	20 %	0 %	40 %	482886096
1026	NC_021082	GAATT	2	10	1409784	1409793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021082	TATCA	2	10	1409794	1409803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_021082	TTCAC	2	10	1409869	1409878	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_021082	ACCAA	2	10	1410455	1410464	60 %	0 %	0 %	40 %	482886099
1030	NC_021082	TAGTT	2	10	1412945	1412954	20 %	60 %	20 %	0 %	482886102
1031	NC_021082	AACCA	2	10	1413277	1413286	60 %	0 %	0 %	40 %	482886103
1032	NC_021082	GAGCG	2	10	1413889	1413898	20 %	0 %	60 %	20 %	482886104
1033	NC_021082	GCAAA	2	10	1413985	1413994	60 %	0 %	20 %	20 %	482886104
1034	NC_021082	TTGCT	2	10	1414096	1414105	0 %	60 %	20 %	20 %	482886105
1035	NC_021082	TTTAA	2	10	1414773	1414782	40 %	60 %	0 %	0 %	482886105
1036	NC_021082	AATTA	2	10	1415462	1415471	60 %	40 %	0 %	0 %	482886106
1037	NC_021082	AATAT	2	10	1415535	1415544	60 %	40 %	0 %	0 %	482886106
1038	NC_021082	GGCGA	2	10	1419027	1419036	20 %	0 %	60 %	20 %	482886110
1039	NC_021082	CCGTG	2	10	1420022	1420031	0 %	20 %	40 %	40 %	482886112
1040	NC_021082	GCAAT	2	10	1420226	1420235	40 %	20 %	20 %	20 %	482886112
1041	NC_021082	GAAAT	2	10	1420783	1420792	60 %	20 %	20 %	0 %	482886114
1042	NC_021082	TACAG	2	10	1423226	1423235	40 %	20 %	20 %	20 %	482886117
1043	NC_021082	TGAAT	2	10	1423417	1423426	40 %	40 %	20 %	0 %	482886117
1044	NC_021082	GAACC	2	10	1426423	1426432	40 %	0 %	20 %	40 %	482886119
1045	NC_021082	TATGA	2	10	1427548	1427557	40 %	40 %	20 %	0 %	482886120
1046	NC_021082	CAATT	2	10	1427710	1427719	40 %	40 %	0 %	20 %	482886120
1047	NC_021082	GCAAA	2	10	1429157	1429166	60 %	0 %	20 %	20 %	482886120
1048	NC_021082	AAAAT	2	10	1429940	1429949	80 %	20 %	0 %	0 %	482886120
1049	NC_021082	TCTGC	2	10	1430185	1430194	0 %	40 %	20 %	40 %	482886120
1050	NC_021082	CAACT	2	10	1433109	1433118	40 %	20 %	0 %	40 %	482886123
1051	NC_021082	CAAAT	2	10	1440858	1440867	60 %	20 %	0 %	20 %	482886139
1052	NC_021082	TTGTT	2	10	1441285	1441294	0 %	80 %	20 %	0 %	482886139
1053	NC_021082	GGTTA	2	10	1441605	1441614	20 %	40 %	40 %	0 %	482886139
1054	NC_021082	TGCTT	2	10	1441803	1441812	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_021082	ACCAT	2	10	1442597	1442606	40 %	20 %	0 %	40 %	482886141
1056	NC_021082	TCACT	2	10	1443477	1443486	20 %	40 %	0 %	40 %	482886141
1057	NC_021082	AATTC	2	10	1445312	1445321	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_021082	AAATC	2	10	1449054	1449063	60 %	20 %	0 %	20 %	482886148
1059	NC_021082	AATCA	2	10	1450128	1450137	60 %	20 %	0 %	20 %	482886149
1060	NC_021082	GATGA	2	10	1452344	1452353	40 %	20 %	40 %	0 %	482886152
1061	NC_021082	ACATC	2	10	1452753	1452762	40 %	20 %	0 %	40 %	482886152
1062	NC_021082	CCTTG	2	10	1455724	1455733	0 %	40 %	20 %	40 %	482886156
1063	NC_021082	GATGG	2	10	1458096	1458105	20 %	20 %	60 %	0 %	482886158
1064	NC_021082	TTTTG	2	10	1460631	1460640	0 %	80 %	20 %	0 %	482886163
1065	NC_021082	CATTA	2	10	1460775	1460784	40 %	40 %	0 %	20 %	482886163
1066	NC_021082	AAGAT	2	10	1461166	1461175	60 %	20 %	20 %	0 %	482886163
1067	NC_021082	AAAAG	2	10	1467585	1467594	80 %	0 %	20 %	0 %	482886170
1068	NC_021082	TGAAT	2	10	1477041	1477050	40 %	40 %	20 %	0 %	482886184
1069	NC_021082	ATGAT	2	10	1479312	1479321	40 %	40 %	20 %	0 %	482886185
1070	NC_021082	ACGAA	2	10	1479800	1479809	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_021082	TCAAA	2	10	1480808	1480817	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_021082	CTTTT	2	10	1481149	1481158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_021082	ATGGG	2	10	1484551	1484560	20 %	20 %	60 %	0 %	482886189
1074	NC_021082	TATGA	2	10	1484788	1484797	40 %	40 %	20 %	0 %	482886189
1075	NC_021082	GATTT	2	10	1485287	1485296	20 %	60 %	20 %	0 %	482886190
1076	NC_021082	GATGA	2	10	1486240	1486249	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021082	TGGTT	2	10	1487177	1487186	0 %	60 %	40 %	0 %	482886191
1078	NC_021082	TTTTG	2	10	1487637	1487646	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021082	GAATT	2	10	1488189	1488198	40 %	40 %	20 %	0 %	482886192
1080	NC_021082	TGAAG	2	10	1488286	1488295	40 %	20 %	40 %	0 %	482886192
1081	NC_021082	TCGCA	2	10	1489792	1489801	20 %	20 %	20 %	40 %	482886193
1082	NC_021082	GGAAA	2	10	1490020	1490029	60 %	0 %	40 %	0 %	482886193
1083	NC_021082	TGGTT	2	10	1490955	1490964	0 %	60 %	40 %	0 %	482886194
1084	NC_021082	GCTGA	2	10	1491644	1491653	20 %	20 %	40 %	20 %	482886194
1085	NC_021082	TTAGC	2	10	1492126	1492135	20 %	40 %	20 %	20 %	482886195
1086	NC_021082	TACCG	2	10	1497202	1497211	20 %	20 %	20 %	40 %	482886202
1087	NC_021082	TTCAA	2	10	1498219	1498228	40 %	40 %	0 %	20 %	482886202
1088	NC_021082	TATGA	2	10	1499368	1499377	40 %	40 %	20 %	0 %	482886205
1089	NC_021082	TTTTA	2	10	1500365	1500374	20 %	80 %	0 %	0 %	482886206
1090	NC_021082	GGTTT	2	10	1500927	1500936	0 %	60 %	40 %	0 %	482886207
1091	NC_021082	TTTAT	2	10	1505319	1505328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021082	ATTTT	2	10	1507075	1507084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021082	TGAGG	2	10	1507671	1507680	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021082	TGCTC	2	10	1509545	1509554	0 %	40 %	20 %	40 %	482886218
1095	NC_021082	GGTTG	2	10	1511066	1511075	0 %	40 %	60 %	0 %	482886221
1096	NC_021082	GTTGC	2	10	1514508	1514517	0 %	40 %	40 %	20 %	482886223
1097	NC_021082	TAAAA	2	10	1517180	1517189	80 %	20 %	0 %	0 %	482886226
1098	NC_021082	TAGAA	2	10	1518167	1518176	60 %	20 %	20 %	0 %	482886228
1099	NC_021082	TCATT	2	10	1518220	1518229	20 %	60 %	0 %	20 %	482886228
1100	NC_021082	AGTTT	2	10	1518240	1518249	20 %	60 %	20 %	0 %	482886228
1101	NC_021082	ATTTC	2	10	1519247	1519256	20 %	60 %	0 %	20 %	482886230
1102	NC_021082	GGATG	2	10	1520792	1520801	20 %	20 %	60 %	0 %	482886231
1103	NC_021082	TTGCA	2	10	1522383	1522392	20 %	40 %	20 %	20 %	482886234
1104	NC_021082	TTGGG	2	10	1522821	1522830	0 %	40 %	60 %	0 %	482886235
1105	NC_021082	AACCA	2	10	1523077	1523086	60 %	0 %	0 %	40 %	482886236
1106	NC_021082	CTCGC	2	10	1523963	1523972	0 %	20 %	20 %	60 %	482886236
1107	NC_021082	GTTTT	2	10	1524688	1524697	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021082	GCATT	2	10	1526242	1526251	20 %	40 %	20 %	20 %	482886237
1109	NC_021082	AGTTT	2	10	1526286	1526295	20 %	60 %	20 %	0 %	482886237
1110	NC_021082	GTACC	2	10	1527227	1527236	20 %	20 %	20 %	40 %	482886238
1111	NC_021082	ACTTA	2	10	1527768	1527777	40 %	40 %	0 %	20 %	482886239
1112	NC_021082	TTCAT	2	10	1528103	1528112	20 %	60 %	0 %	20 %	482886240
1113	NC_021082	AGTAA	2	10	1530913	1530922	60 %	20 %	20 %	0 %	482886242
1114	NC_021082	ATTGA	2	10	1531609	1531618	40 %	40 %	20 %	0 %	482886242
1115	NC_021082	TAAAA	2	10	1533736	1533745	80 %	20 %	0 %	0 %	482886243
1116	NC_021082	ACGGC	2	10	1538205	1538214	20 %	0 %	40 %	40 %	482886248
1117	NC_021082	GATGC	2	10	1538848	1538857	20 %	20 %	40 %	20 %	482886248
1118	NC_021082	TAATA	2	10	1541815	1541824	60 %	40 %	0 %	0 %	482886252
1119	NC_021082	TGCGT	2	10	1542345	1542354	0 %	40 %	40 %	20 %	482886253
1120	NC_021082	TATAA	2	10	1543073	1543082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021082	TGGGT	2	10	1543707	1543716	0 %	40 %	60 %	0 %	482886255
1122	NC_021082	TTGAG	2	10	1546978	1546987	20 %	40 %	40 %	0 %	482886258
1123	NC_021082	AGCGT	2	10	1547666	1547675	20 %	20 %	40 %	20 %	482886259
1124	NC_021082	ATTTT	2	10	1549237	1549246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021082	TCCGA	2	10	1550441	1550450	20 %	20 %	20 %	40 %	482886260
1126	NC_021082	TTGGG	2	10	1551164	1551173	0 %	40 %	60 %	0 %	482886260
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1140	NC_021082	TTTTA	2	10	1565586	1565595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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