MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020054	CCGGC	2	10	483	492	0 %	0 %	40 %	60 %	436833392
2	NC_020054	GCCCG	2	10	3653	3662	0 %	0 %	40 %	60 %	436833395
3	NC_020054	CCGAC	2	10	4037	4046	20 %	0 %	20 %	60 %	436833395
4	NC_020054	GCAGC	2	10	6759	6768	20 %	0 %	40 %	40 %	436833398
5	NC_020054	GCGTT	2	10	9887	9896	0 %	40 %	40 %	20 %	436833401
6	NC_020054	GTATC	2	10	11003	11012	20 %	40 %	20 %	20 %	436833402
7	NC_020054	ATCGC	2	10	12455	12464	20 %	20 %	20 %	40 %	436833403
8	NC_020054	ACCCA	2	10	15340	15349	40 %	0 %	0 %	60 %	436833407
9	NC_020054	AACAC	2	10	18196	18205	60 %	0 %	0 %	40 %	436833409
10	NC_020054	CAACC	2	10	19920	19929	40 %	0 %	0 %	60 %	436833411
11	NC_020054	TTTGG	2	10	21903	21912	0 %	60 %	40 %	0 %	436833413
12	NC_020054	AATCG	2	10	23117	23126	40 %	20 %	20 %	20 %	436833413
13	NC_020054	CCGGC	2	10	23813	23822	0 %	0 %	40 %	60 %	436833414
14	NC_020054	GTGAA	2	10	24813	24822	40 %	20 %	40 %	0 %	436833416
15	NC_020054	AACCC	2	10	26839	26848	40 %	0 %	0 %	60 %	436833419
16	NC_020054	TCGAG	2	10	27117	27126	20 %	20 %	40 %	20 %	436833419
17	NC_020054	GCCGG	2	10	27226	27235	0 %	0 %	60 %	40 %	436833419
18	NC_020054	CAGGG	2	10	29641	29650	20 %	0 %	60 %	20 %	436833421
19	NC_020054	TGGCG	2	10	29661	29670	0 %	20 %	60 %	20 %	436833421
20	NC_020054	CCCGG	2	10	30672	30681	0 %	0 %	40 %	60 %	436833422
21	NC_020054	CCCGA	2	10	31164	31173	20 %	0 %	20 %	60 %	436833423
22	NC_020054	CGAGG	2	10	32184	32193	20 %	0 %	60 %	20 %	436833424
23	NC_020054	GTGCC	2	10	32471	32480	0 %	20 %	40 %	40 %	436833424
24	NC_020054	GTCGG	2	10	32829	32838	0 %	20 %	60 %	20 %	436833425
25	NC_020054	GTAGC	2	10	33254	33263	20 %	20 %	40 %	20 %	436833425
26	NC_020054	GGTAA	2	10	35042	35051	40 %	20 %	40 %	0 %	436833427
27	NC_020054	ACGAA	2	10	35138	35147	60 %	0 %	20 %	20 %	436833427
28	NC_020054	CGCCC	2	10	36567	36576	0 %	0 %	20 %	80 %	436833428
29	NC_020054	GTTAT	2	10	37044	37053	20 %	60 %	20 %	0 %	436833428
30	NC_020054	GCGCC	2	10	39390	39399	0 %	0 %	40 %	60 %	436833430
31	NC_020054	TGGGT	2	10	40876	40885	0 %	40 %	60 %	0 %	436833432
32	NC_020054	GATCT	2	10	40909	40918	20 %	40 %	20 %	20 %	436833432
33	NC_020054	GTCAG	2	10	43143	43152	20 %	20 %	40 %	20 %	436833433
34	NC_020054	GGCGC	2	10	43430	43439	0 %	0 %	60 %	40 %	436833433
35	NC_020054	TGGTG	2	10	44131	44140	0 %	40 %	60 %	0 %	436833433
36	NC_020054	CAGGC	2	10	45624	45633	20 %	0 %	40 %	40 %	436833436
37	NC_020054	GAACT	2	10	47616	47625	40 %	20 %	20 %	20 %	436833436
38	NC_020054	CCCCG	2	10	53345	53354	0 %	0 %	20 %	80 %	436833440
39	NC_020054	GTCGG	2	10	53817	53826	0 %	20 %	60 %	20 %	436833440
40	NC_020054	CTGGC	2	10	54072	54081	0 %	20 %	40 %	40 %	436833440
41	NC_020054	GGGCG	2	10	54533	54542	0 %	0 %	80 %	20 %	436833441
42	NC_020054	CCAAA	2	10	54837	54846	60 %	0 %	0 %	40 %	436833442
43	NC_020054	CACGC	2	10	55776	55785	20 %	0 %	20 %	60 %	436833443
44	NC_020054	TCGCC	2	10	56527	56536	0 %	20 %	20 %	60 %	436833444
45	NC_020054	TGGCT	2	10	61289	61298	0 %	40 %	40 %	20 %	436833447
46	NC_020054	AATGG	2	10	61590	61599	40 %	20 %	40 %	0 %	436833447
47	NC_020054	CCCGC	2	10	63753	63762	0 %	0 %	20 %	80 %	436833449
48	NC_020054	CAAAG	2	10	63788	63797	60 %	0 %	20 %	20 %	436833449
49	NC_020054	ACCCG	2	10	65767	65776	20 %	0 %	20 %	60 %	436833451
50	NC_020054	CGCCC	2	10	69265	69274	0 %	0 %	20 %	80 %	436833455
51	NC_020054	GCCCC	2	10	69647	69656	0 %	0 %	20 %	80 %	436833455
52	NC_020054	GATCC	2	10	70356	70365	20 %	20 %	20 %	40 %	436833456
53	NC_020054	TGCTC	2	10	73638	73647	0 %	40 %	20 %	40 %	436833457
54	NC_020054	TGACC	2	10	78264	78273	20 %	20 %	20 %	40 %	436833460
55	NC_020054	TCCTG	2	10	78383	78392	0 %	40 %	20 %	40 %	436833460
56	NC_020054	GTACG	2	10	79460	79469	20 %	20 %	40 %	20 %	436833461
57	NC_020054	ACCGC	2	10	82456	82465	20 %	0 %	20 %	60 %	436833462
58	NC_020054	GTCGG	2	10	84295	84304	0 %	20 %	60 %	20 %	436833464
59	NC_020054	GTTGG	2	10	92012	92021	0 %	40 %	60 %	0 %	436833470
60	NC_020054	GCTGG	2	10	92249	92258	0 %	20 %	60 %	20 %	436833470
61	NC_020054	AGCGT	2	10	92823	92832	20 %	20 %	40 %	20 %	436833470
62	NC_020054	CGTAC	2	10	99776	99785	20 %	20 %	20 %	40 %	436833474
63	NC_020054	GGCGC	2	10	102028	102037	0 %	0 %	60 %	40 %	436833475
64	NC_020054	CACGG	2	10	103370	103379	20 %	0 %	40 %	40 %	436833476
65	NC_020054	CCCCG	2	10	103429	103438	0 %	0 %	20 %	80 %	436833476
66	NC_020054	ACGCT	2	10	104267	104276	20 %	20 %	20 %	40 %	436833477
67	NC_020054	CTCGA	2	10	105178	105187	20 %	20 %	20 %	40 %	436833478
68	NC_020054	AGCGC	2	10	105552	105561	20 %	0 %	40 %	40 %	436833478
69	NC_020054	AGTGC	2	10	106245	106254	20 %	20 %	40 %	20 %	436833479
70	NC_020054	GCAAG	2	10	107785	107794	40 %	0 %	40 %	20 %	436833480
71	NC_020054	CCAAC	2	10	108736	108745	40 %	0 %	0 %	60 %	436833480
72	NC_020054	GTTGG	2	10	109758	109767	0 %	40 %	60 %	0 %	436833481
73	NC_020054	CTTCC	2	10	111048	111057	0 %	40 %	0 %	60 %	436833481
74	NC_020054	TGGCG	2	10	111641	111650	0 %	20 %	60 %	20 %	436833482
75	NC_020054	GCCAA	2	10	113091	113100	40 %	0 %	20 %	40 %	436833483
76	NC_020054	TTGCT	2	10	113597	113606	0 %	60 %	20 %	20 %	436833483
77	NC_020054	CCCCG	2	10	113936	113945	0 %	0 %	20 %	80 %	436833483
78	NC_020054	GCCAC	2	10	115123	115132	20 %	0 %	20 %	60 %	436833483
79	NC_020054	ATCGA	2	10	116539	116548	40 %	20 %	20 %	20 %	436833485
80	NC_020054	CCGAC	2	10	117324	117333	20 %	0 %	20 %	60 %	436833485
81	NC_020054	ACGGC	2	10	126409	126418	20 %	0 %	40 %	40 %	436833491
82	NC_020054	GTGTA	2	10	126609	126618	20 %	40 %	40 %	0 %	436833491
83	NC_020054	CCCTG	2	10	128921	128930	0 %	20 %	20 %	60 %	436833493
84	NC_020054	CCGTT	2	10	130600	130609	0 %	40 %	20 %	40 %	436833496
85	NC_020054	CGACC	2	10	131487	131496	20 %	0 %	20 %	60 %	436833496
86	NC_020054	CGCCC	2	10	132940	132949	0 %	0 %	20 %	80 %	436833497
87	NC_020054	CCAGC	2	10	133960	133969	20 %	0 %	20 %	60 %	436833498
88	NC_020054	CCAGG	2	10	136446	136455	20 %	0 %	40 %	40 %	436833500
89	NC_020054	CAGGT	2	10	137224	137233	20 %	20 %	40 %	20 %	436833500
90	NC_020054	CTCAA	2	10	138182	138191	40 %	20 %	0 %	40 %	436833501
91	NC_020054	CGACC	2	10	138807	138816	20 %	0 %	20 %	60 %	436833502
92	NC_020054	ATGCC	2	10	139201	139210	20 %	20 %	20 %	40 %	436833502
93	NC_020054	CGGCC	2	10	139583	139592	0 %	0 %	40 %	60 %	436833502
94	NC_020054	GCCGT	2	10	144090	144099	0 %	20 %	40 %	40 %	436833506
95	NC_020054	CTTTT	2	10	147296	147305	0 %	80 %	0 %	20 %	436833509
96	NC_020054	GCAAT	2	10	147902	147911	40 %	20 %	20 %	20 %	436833510
97	NC_020054	TGCCC	2	10	150679	150688	0 %	20 %	20 %	60 %	436833512
98	NC_020054	CCGAA	2	10	151453	151462	40 %	0 %	20 %	40 %	436833512
99	NC_020054	TTCGT	2	10	154130	154139	0 %	60 %	20 %	20 %	436833513
100	NC_020054	ACCCG	2	10	154184	154193	20 %	0 %	20 %	60 %	436833513
101	NC_020054	GGTTC	2	10	156179	156188	0 %	40 %	40 %	20 %	436833515
102	NC_020054	ACCGC	2	10	156673	156682	20 %	0 %	20 %	60 %	436833515
103	NC_020054	CGGCG	2	10	156755	156764	0 %	0 %	60 %	40 %	436833515
104	NC_020054	CAGTT	2	10	158909	158918	20 %	40 %	20 %	20 %	436833517
105	NC_020054	ACCGA	2	10	159502	159511	40 %	0 %	20 %	40 %	436833518
106	NC_020054	TGATC	2	10	161102	161111	20 %	40 %	20 %	20 %	436833520
107	NC_020054	GGACG	2	10	161837	161846	20 %	0 %	60 %	20 %	436833520
108	NC_020054	TTCAG	2	10	165284	165293	20 %	40 %	20 %	20 %	436833523
109	NC_020054	TCTGG	2	10	168412	168421	0 %	40 %	40 %	20 %	436833525
110	NC_020054	ACAGG	2	10	170762	170771	40 %	0 %	40 %	20 %	436833526
111	NC_020054	GACCT	2	10	171168	171177	20 %	20 %	20 %	40 %	436833526
112	NC_020054	AGGGG	2	10	172190	172199	20 %	0 %	80 %	0 %	436833527
113	NC_020054	TGGGG	2	10	172201	172210	0 %	20 %	80 %	0 %	436833527
114	NC_020054	AAATC	2	10	173747	173756	60 %	20 %	0 %	20 %	436833529
115	NC_020054	CGGTG	2	10	176372	176381	0 %	20 %	60 %	20 %	436833531
116	NC_020054	GGCCG	2	10	178539	178548	0 %	0 %	60 %	40 %	436833534
117	NC_020054	CCGCT	2	10	179310	179319	0 %	20 %	20 %	60 %	436833534
118	NC_020054	GGGCA	2	10	180917	180926	20 %	0 %	60 %	20 %	436833536
119	NC_020054	GCGGG	2	10	182019	182028	0 %	0 %	80 %	20 %	436833537
120	NC_020054	GTTGG	2	10	182936	182945	0 %	40 %	60 %	0 %	436833537
121	NC_020054	CTGGG	2	10	183196	183205	0 %	20 %	60 %	20 %	436833537
122	NC_020054	GGTTC	2	10	183521	183530	0 %	40 %	40 %	20 %	436833537
123	NC_020054	ATCAG	2	10	184104	184113	40 %	20 %	20 %	20 %	436833537
124	NC_020054	GGGCA	2	10	186148	186157	20 %	0 %	60 %	20 %	436833538
125	NC_020054	ACGCG	2	10	186852	186861	20 %	0 %	40 %	40 %	436833539
126	NC_020054	GGCCG	2	10	187125	187134	0 %	0 %	60 %	40 %	436833539
127	NC_020054	CCCAA	2	10	191511	191520	40 %	0 %	0 %	60 %	436833541
128	NC_020054	GCTGG	2	10	191587	191596	0 %	20 %	60 %	20 %	436833541
129	NC_020054	CCCGG	2	10	192496	192505	0 %	0 %	40 %	60 %	436833542
130	NC_020054	TGAGC	2	10	197266	197275	20 %	20 %	40 %	20 %	436833546
131	NC_020054	GTTGG	2	10	201481	201490	0 %	40 %	60 %	0 %	436833547
132	NC_020054	AGTCG	2	10	203205	203214	20 %	20 %	40 %	20 %	436833548
133	NC_020054	AGCTC	2	10	204515	204524	20 %	20 %	20 %	40 %	436833548
134	NC_020054	TCCAC	2	10	205604	205613	20 %	20 %	0 %	60 %	436833549
135	NC_020054	CGGGC	2	10	206883	206892	0 %	0 %	60 %	40 %	436833549
136	NC_020054	CGTTA	2	10	207712	207721	20 %	40 %	20 %	20 %	436833550
137	NC_020054	CGAAT	2	10	208761	208770	40 %	20 %	20 %	20 %	436833551
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149	NC_020054	GCCCA	2	10	235256	235265	20 %	0 %	20 %	60 %	436833574
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249	NC_020054	GGTAC	2	10	417609	417618	20 %	20 %	40 %	20 %	436833703
250	NC_020054	CTATT	2	10	419167	419176	20 %	60 %	0 %	20 %	436833704
251	NC_020054	TTCCT	2	10	419186	419195	0 %	60 %	0 %	40 %	436833704
252	NC_020054	TCAAC	2	10	420654	420663	40 %	20 %	0 %	40 %	436833706
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254	NC_020054	TACCC	2	10	425185	425194	20 %	20 %	0 %	60 %	436833708
255	NC_020054	CCGCC	2	10	425555	425564	0 %	0 %	20 %	80 %	436833709
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257	NC_020054	TCGAT	2	10	434280	434289	20 %	40 %	20 %	20 %	436833719
258	NC_020054	GCCAG	2	10	434679	434688	20 %	0 %	40 %	40 %	436833719
259	NC_020054	CGGGG	2	10	434709	434718	0 %	0 %	80 %	20 %	436833719
260	NC_020054	GCCCA	2	10	438324	438333	20 %	0 %	20 %	60 %	436833722
261	NC_020054	AACGC	2	10	438952	438961	40 %	0 %	20 %	40 %	436833723
262	NC_020054	TACGC	2	10	439619	439628	20 %	20 %	20 %	40 %	436833723
263	NC_020054	GACCA	2	10	439974	439983	40 %	0 %	20 %	40 %	436833723
264	NC_020054	TCGGT	2	10	440278	440287	0 %	40 %	40 %	20 %	436833723
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389	NC_020054	GGGGC	2	10	669843	669852	0 %	0 %	80 %	20 %	436833909
390	NC_020054	ACCGC	2	10	670129	670138	20 %	0 %	20 %	60 %	436833909
391	NC_020054	TTCTG	2	10	670571	670580	0 %	60 %	20 %	20 %	436833910
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