MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020054	AGGCG	2	10	5023627	5023636	20 %	0 %	60 %	20 %	436837451
3002	NC_020054	CCCCG	2	10	5024019	5024028	0 %	0 %	20 %	80 %	436837452
3003	NC_020054	CGTTA	2	10	5024254	5024263	20 %	40 %	20 %	20 %	436837452
3004	NC_020054	TCGGT	2	10	5028234	5028243	0 %	40 %	40 %	20 %	436837455
3005	NC_020054	CGTAC	2	10	5032780	5032789	20 %	20 %	20 %	40 %	436837458
3006	NC_020054	CCCAA	2	10	5039211	5039220	40 %	0 %	0 %	60 %	436837461
3007	NC_020054	CGGCG	2	10	5039623	5039632	0 %	0 %	60 %	40 %	436837462
3008	NC_020054	GTCAG	2	10	5039836	5039845	20 %	20 %	40 %	20 %	436837462
3009	NC_020054	GTTGC	2	10	5041800	5041809	0 %	40 %	40 %	20 %	436837464
3010	NC_020054	CCGTT	2	10	5045135	5045144	0 %	40 %	20 %	40 %	436837467
3011	NC_020054	CGGTC	2	10	5047726	5047735	0 %	20 %	40 %	40 %	436837471
3012	NC_020054	CCTCT	2	10	5048739	5048748	0 %	40 %	0 %	60 %	436837472
3013	NC_020054	GTCGC	2	10	5052102	5052111	0 %	20 %	40 %	40 %	436837474
3014	NC_020054	CGGCC	2	10	5052697	5052706	0 %	0 %	40 %	60 %	436837474
3015	NC_020054	ATTGA	2	10	5053075	5053084	40 %	40 %	20 %	0 %	436837475
3016	NC_020054	CCGGC	2	10	5054366	5054375	0 %	0 %	40 %	60 %	436837476
3017	NC_020054	TGCCC	2	10	5055269	5055278	0 %	20 %	20 %	60 %	436837477
3018	NC_020054	CAGTT	2	10	5056558	5056567	20 %	40 %	20 %	20 %	436837479
3019	NC_020054	GCGTT	2	10	5058656	5058665	0 %	40 %	40 %	20 %	436837481
3020	NC_020054	CGCGG	2	10	5062215	5062224	0 %	0 %	60 %	40 %	436837482
3021	NC_020054	CGGGC	2	10	5065153	5065162	0 %	0 %	60 %	40 %	436837485
3022	NC_020054	CGTGG	2	10	5068104	5068113	0 %	20 %	60 %	20 %	436837488
3023	NC_020054	ACGTA	2	10	5072580	5072589	40 %	20 %	20 %	20 %	436837492
3024	NC_020054	ACGTT	2	10	5074226	5074235	20 %	40 %	20 %	20 %	436837493
3025	NC_020054	GCGCT	2	10	5074289	5074298	0 %	20 %	40 %	40 %	436837493
3026	NC_020054	CGATT	2	10	5074866	5074875	20 %	40 %	20 %	20 %	436837493
3027	NC_020054	TAACG	2	10	5074947	5074956	40 %	20 %	20 %	20 %	436837493
3028	NC_020054	AAACG	2	10	5074998	5075007	60 %	0 %	20 %	20 %	436837493
3029	NC_020054	TTGGC	2	10	5078003	5078012	0 %	40 %	40 %	20 %	436837496
3030	NC_020054	CCCCG	2	10	5081831	5081840	0 %	0 %	20 %	80 %	436837500
3031	NC_020054	ACGCC	2	10	5083508	5083517	20 %	0 %	20 %	60 %	436837501
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3033	NC_020054	ATGCC	2	10	5088647	5088656	20 %	20 %	20 %	40 %	436837505
3034	NC_020054	GGGCC	2	10	5088699	5088708	0 %	0 %	60 %	40 %	436837505
3035	NC_020054	CCCAG	2	10	5089520	5089529	20 %	0 %	20 %	60 %	436837506
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3039	NC_020054	CGATT	2	10	5092824	5092833	20 %	40 %	20 %	20 %	436837508
3040	NC_020054	CCGAA	2	10	5092966	5092975	40 %	0 %	20 %	40 %	436837508
3041	NC_020054	TTACC	2	10	5093798	5093807	20 %	40 %	0 %	40 %	436837508
3042	NC_020054	CGGCC	2	10	5094448	5094457	0 %	0 %	40 %	60 %	436837508
3043	NC_020054	TGATC	2	10	5095034	5095043	20 %	40 %	20 %	20 %	436837508
3044	NC_020054	TTCTA	2	10	5097895	5097904	20 %	60 %	0 %	20 %	436837511
3045	NC_020054	ACCGC	2	10	5098397	5098406	20 %	0 %	20 %	60 %	436837511
3046	NC_020054	ACCGG	2	10	5101494	5101503	20 %	0 %	40 %	40 %	436837513
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3049	NC_020054	TCAGC	2	10	5109193	5109202	20 %	20 %	20 %	40 %	436837518
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3051	NC_020054	TGCCG	2	10	5111710	5111719	0 %	20 %	40 %	40 %	436837522
3052	NC_020054	AACCG	2	10	5114858	5114867	40 %	0 %	20 %	40 %	436837526
3053	NC_020054	GGGTC	2	10	5119198	5119207	0 %	20 %	60 %	20 %	436837531
3054	NC_020054	TGCGC	2	10	5119460	5119469	0 %	20 %	40 %	40 %	436837531
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3056	NC_020054	TACCT	2	10	5126489	5126498	20 %	40 %	0 %	40 %	436837537
3057	NC_020054	AATTC	2	10	5127433	5127442	40 %	40 %	0 %	20 %	436837537
3058	NC_020054	GCCGC	2	10	5128600	5128609	0 %	0 %	40 %	60 %	436837538
3059	NC_020054	AGCCC	2	10	5128676	5128685	20 %	0 %	20 %	60 %	436837538
3060	NC_020054	GCAGG	2	10	5131396	5131405	20 %	0 %	60 %	20 %	436837541
3061	NC_020054	AGCGC	2	10	5133284	5133293	20 %	0 %	40 %	40 %	436837542
3062	NC_020054	TCATC	2	10	5137787	5137796	20 %	40 %	0 %	40 %	436837546
3063	NC_020054	GATTG	2	10	5139292	5139301	20 %	40 %	40 %	0 %	436837547
3064	NC_020054	TGGGC	2	10	5140725	5140734	0 %	20 %	60 %	20 %	436837548
3065	NC_020054	CTCGA	2	10	5140984	5140993	20 %	20 %	20 %	40 %	436837548
3066	NC_020054	TACCA	2	10	5148513	5148522	40 %	20 %	0 %	40 %	436837557
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3070	NC_020054	TCGGC	2	10	5151739	5151748	0 %	20 %	40 %	40 %	436837559
3071	NC_020054	CGGAA	2	10	5151963	5151972	40 %	0 %	40 %	20 %	436837559
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3074	NC_020054	ACTGT	2	10	5156999	5157008	20 %	40 %	20 %	20 %	436837562
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3088	NC_020054	GATCG	2	10	5178671	5178680	20 %	20 %	40 %	20 %	436837577
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3094	NC_020054	ACGGC	2	10	5185685	5185694	20 %	0 %	40 %	40 %	436837583
3095	NC_020054	ATGAC	2	10	5187410	5187419	40 %	20 %	20 %	20 %	436837584
3096	NC_020054	AGCAA	2	10	5188067	5188076	60 %	0 %	20 %	20 %	436837584
3097	NC_020054	TTGTT	2	10	5192109	5192118	0 %	80 %	20 %	0 %	436837586
3098	NC_020054	AATTC	2	10	5193244	5193253	40 %	40 %	0 %	20 %	436837589
3099	NC_020054	TGACC	2	10	5199147	5199156	20 %	20 %	20 %	40 %	436837596
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3101	NC_020054	CTTTT	2	10	5201296	5201305	0 %	80 %	0 %	20 %	436837598
3102	NC_020054	TCCAG	2	10	5201331	5201340	20 %	20 %	20 %	40 %	436837598
3103	NC_020054	TCCAT	2	10	5202756	5202765	20 %	40 %	0 %	40 %	436837599
3104	NC_020054	TTCTG	2	10	5202848	5202857	0 %	60 %	20 %	20 %	436837599
3105	NC_020054	CCAAA	2	10	5203266	5203275	60 %	0 %	0 %	40 %	436837599
3106	NC_020054	TTAGC	2	10	5204591	5204600	20 %	40 %	20 %	20 %	436837600
3107	NC_020054	AGTTC	2	10	5204669	5204678	20 %	40 %	20 %	20 %	436837600
3108	NC_020054	CGACG	2	10	5206187	5206196	20 %	0 %	40 %	40 %	436837601
3109	NC_020054	CTCAC	2	10	5207233	5207242	20 %	20 %	0 %	60 %	436837602
3110	NC_020054	CGACC	2	10	5208152	5208161	20 %	0 %	20 %	60 %	436837603
3111	NC_020054	CGTCG	2	10	5208194	5208203	0 %	20 %	40 %	40 %	436837603
3112	NC_020054	TCCCC	2	10	5208546	5208555	0 %	20 %	0 %	80 %	436837604
3113	NC_020054	ACGCC	2	10	5209955	5209964	20 %	0 %	20 %	60 %	436837605
3114	NC_020054	GGTAA	2	10	5210185	5210194	40 %	20 %	40 %	0 %	436837605
3115	NC_020054	GCACC	2	10	5212296	5212305	20 %	0 %	20 %	60 %	436837607
3116	NC_020054	GCGCG	2	10	5213283	5213292	0 %	0 %	60 %	40 %	436837608
3117	NC_020054	TAACG	2	10	5213860	5213869	40 %	20 %	20 %	20 %	436837608
3118	NC_020054	GGTTG	2	10	5216027	5216036	0 %	40 %	60 %	0 %	436837609
3119	NC_020054	CAAAA	2	10	5216160	5216169	80 %	0 %	0 %	20 %	436837609
3120	NC_020054	GGCGG	2	10	5220282	5220291	0 %	0 %	80 %	20 %	436837612
3121	NC_020054	AAACG	2	10	5222843	5222852	60 %	0 %	20 %	20 %	436837614
3122	NC_020054	CCGAC	2	10	5223969	5223978	20 %	0 %	20 %	60 %	436837615
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3124	NC_020054	CTCAC	2	10	5227994	5228003	20 %	20 %	0 %	60 %	436837618
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3366	NC_020054	CCCCG	2	10	5605802	5605811	0 %	0 %	20 %	80 %	436837907
3367	NC_020054	CCGAA	2	10	5608774	5608783	40 %	0 %	20 %	40 %	436837910
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3495	NC_020054	CTGAC	2	10	5784075	5784084	20 %	20 %	20 %	40 %	436838062
3496	NC_020054	TACGC	2	10	5784370	5784379	20 %	20 %	20 %	40 %	436838062
3497	NC_020054	CGGCG	2	10	5784647	5784656	0 %	0 %	60 %	40 %	436838062
3498	NC_020054	GCCTA	2	10	5784836	5784845	20 %	20 %	20 %	40 %	436838062
3499	NC_020054	CGCGG	2	10	5786339	5786348	0 %	0 %	60 %	40 %	436838064
3500	NC_020054	TTTGC	2	10	5790044	5790053	0 %	60 %	20 %	20 %	436838066

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