MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020054	CAACT	2	10	1679367	1679376	40 %	20 %	0 %	40 %	436834746
1002	NC_020054	TTTTA	2	10	1684161	1684170	20 %	80 %	0 %	0 %	436834748
1003	NC_020054	AAAAT	2	10	1684492	1684501	80 %	20 %	0 %	0 %	436834748
1004	NC_020054	AACGC	2	10	1687090	1687099	40 %	0 %	20 %	40 %	436834751
1005	NC_020054	AAGGC	2	10	1689389	1689398	40 %	0 %	40 %	20 %	436834754
1006	NC_020054	TGTGG	2	10	1689605	1689614	0 %	40 %	60 %	0 %	436834754
1007	NC_020054	GACAA	2	10	1692311	1692320	60 %	0 %	20 %	20 %	436834756
1008	NC_020054	TGGCG	2	10	1693690	1693699	0 %	20 %	60 %	20 %	436834756
1009	NC_020054	ACGAT	2	10	1697767	1697776	40 %	20 %	20 %	20 %	436834759
1010	NC_020054	TGCTC	2	10	1701188	1701197	0 %	40 %	20 %	40 %	436834761
1011	NC_020054	GCGGG	2	10	1703205	1703214	0 %	0 %	80 %	20 %	436834764
1012	NC_020054	TCGGC	2	10	1703836	1703845	0 %	20 %	40 %	40 %	436834764
1013	NC_020054	GGGGT	2	10	1709786	1709795	0 %	20 %	80 %	0 %	436834769
1014	NC_020054	GTAGG	2	10	1711967	1711976	20 %	20 %	60 %	0 %	436834771
1015	NC_020054	TAGCG	2	10	1716155	1716164	20 %	20 %	40 %	20 %	436834775
1016	NC_020054	AGGCC	2	10	1716314	1716323	20 %	0 %	40 %	40 %	436834775
1017	NC_020054	GGCCA	2	10	1718371	1718380	20 %	0 %	40 %	40 %	436834776
1018	NC_020054	GTTGA	2	10	1718384	1718393	20 %	40 %	40 %	0 %	436834776
1019	NC_020054	CGGCC	3	15	1720797	1720811	0 %	0 %	40 %	60 %	436834779
1020	NC_020054	GCCCG	2	10	1724057	1724066	0 %	0 %	40 %	60 %	436834783
1021	NC_020054	GGCAG	2	10	1725443	1725452	20 %	0 %	60 %	20 %	436834785
1022	NC_020054	GTCGG	2	10	1725794	1725803	0 %	20 %	60 %	20 %	436834785
1023	NC_020054	GGGCA	2	10	1726968	1726977	20 %	0 %	60 %	20 %	436834786
1024	NC_020054	GCTGG	2	10	1727238	1727247	0 %	20 %	60 %	20 %	436834786
1025	NC_020054	CGGGC	2	10	1728924	1728933	0 %	0 %	60 %	40 %	436834788
1026	NC_020054	ATCCC	2	10	1729135	1729144	20 %	20 %	0 %	60 %	436834788
1027	NC_020054	CCATT	2	10	1729995	1730004	20 %	40 %	0 %	40 %	436834789
1028	NC_020054	TACCG	2	10	1732695	1732704	20 %	20 %	20 %	40 %	436834790
1029	NC_020054	TTTGT	2	10	1734851	1734860	0 %	80 %	20 %	0 %	436834791
1030	NC_020054	AAAGC	2	10	1735664	1735673	60 %	0 %	20 %	20 %	436834792
1031	NC_020054	TGGAA	2	10	1736275	1736284	40 %	20 %	40 %	0 %	436834793
1032	NC_020054	GGTGC	2	10	1738159	1738168	0 %	20 %	60 %	20 %	436834794
1033	NC_020054	GCGCG	2	10	1738221	1738230	0 %	0 %	60 %	40 %	436834794
1034	NC_020054	TGCGC	2	10	1739085	1739094	0 %	20 %	40 %	40 %	436834795
1035	NC_020054	GGGTG	2	10	1739847	1739856	0 %	20 %	80 %	0 %	436834796
1036	NC_020054	GCCCA	2	10	1741124	1741133	20 %	0 %	20 %	60 %	436834797
1037	NC_020054	CAGGG	2	10	1741590	1741599	20 %	0 %	60 %	20 %	436834797
1038	NC_020054	GCGCG	2	10	1741714	1741723	0 %	0 %	60 %	40 %	436834797
1039	NC_020054	CAGCT	2	10	1741788	1741797	20 %	20 %	20 %	40 %	436834797
1040	NC_020054	CCCGA	2	10	1742286	1742295	20 %	0 %	20 %	60 %	436834797
1041	NC_020054	GCGTC	2	10	1742485	1742494	0 %	20 %	40 %	40 %	436834798
1042	NC_020054	TGGTC	2	10	1742740	1742749	0 %	40 %	40 %	20 %	436834798
1043	NC_020054	CAACC	2	10	1750355	1750364	40 %	0 %	0 %	60 %	436834805
1044	NC_020054	TTTGG	2	10	1751294	1751303	0 %	60 %	40 %	0 %	436834805
1045	NC_020054	GCCGT	2	10	1754519	1754528	0 %	20 %	40 %	40 %	436834807
1046	NC_020054	GTTCG	2	10	1756206	1756215	0 %	40 %	40 %	20 %	436834807
1047	NC_020054	TCGGT	2	10	1759938	1759947	0 %	40 %	40 %	20 %	436834810
1048	NC_020054	CCCGC	2	10	1760281	1760290	0 %	0 %	20 %	80 %	436834810
1049	NC_020054	GTCGA	2	10	1760987	1760996	20 %	20 %	40 %	20 %	436834810
1050	NC_020054	GACGT	2	10	1763885	1763894	20 %	20 %	40 %	20 %	436834811
1051	NC_020054	CGCCC	2	10	1765008	1765017	0 %	0 %	20 %	80 %	436834812
1052	NC_020054	CCGCC	2	10	1766028	1766037	0 %	0 %	20 %	80 %	436834812
1053	NC_020054	CGTAT	2	10	1769648	1769657	20 %	40 %	20 %	20 %	436834817
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1055	NC_020054	CGGTG	2	10	1771101	1771110	0 %	20 %	60 %	20 %	436834818
1056	NC_020054	GACCA	2	10	1771277	1771286	40 %	0 %	20 %	40 %	436834818
1057	NC_020054	CGTAC	2	10	1771987	1771996	20 %	20 %	20 %	40 %	436834819
1058	NC_020054	TTTGC	2	10	1774372	1774381	0 %	60 %	20 %	20 %	436834820
1059	NC_020054	GCCCT	2	10	1778059	1778068	0 %	20 %	20 %	60 %	436834826
1060	NC_020054	ATTCG	2	10	1781285	1781294	20 %	40 %	20 %	20 %	436834828
1061	NC_020054	CGGCG	2	10	1782734	1782743	0 %	0 %	60 %	40 %	436834829
1062	NC_020054	CCCAA	2	10	1783060	1783069	40 %	0 %	0 %	60 %	436834830
1063	NC_020054	GCTGT	2	10	1783368	1783377	0 %	40 %	40 %	20 %	436834830
1064	NC_020054	GCGCC	2	10	1786380	1786389	0 %	0 %	40 %	60 %	436834832
1065	NC_020054	TGCTC	2	10	1786779	1786788	0 %	40 %	20 %	40 %	436834832
1066	NC_020054	GCCCG	2	10	1790187	1790196	0 %	0 %	40 %	60 %	436834834
1067	NC_020054	GCGCT	2	10	1792138	1792147	0 %	20 %	40 %	40 %	436834836
1068	NC_020054	GGGCC	2	10	1793505	1793514	0 %	0 %	60 %	40 %	436834837
1069	NC_020054	TACGG	2	10	1794338	1794347	20 %	20 %	40 %	20 %	436834838
1070	NC_020054	CGCAA	2	10	1796530	1796539	40 %	0 %	20 %	40 %	436834840
1071	NC_020054	GCCCC	2	10	1797104	1797113	0 %	0 %	20 %	80 %	436834840
1072	NC_020054	CAGGC	2	10	1797638	1797647	20 %	0 %	40 %	40 %	436834841
1073	NC_020054	TGGTG	2	10	1799197	1799206	0 %	40 %	60 %	0 %	436834841
1074	NC_020054	GCTAC	2	10	1799848	1799857	20 %	20 %	20 %	40 %	436834842
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1079	NC_020054	GCGCG	2	10	1805301	1805310	0 %	0 %	60 %	40 %	436834846
1080	NC_020054	GGCTG	2	10	1805424	1805433	0 %	20 %	60 %	20 %	436834846
1081	NC_020054	CTTGC	2	10	1808860	1808869	0 %	40 %	20 %	40 %	436834850
1082	NC_020054	TTTTA	2	10	1812480	1812489	20 %	80 %	0 %	0 %	436834855
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1085	NC_020054	CACGA	2	10	1821788	1821797	40 %	0 %	20 %	40 %	436834864
1086	NC_020054	GGTAC	2	10	1825150	1825159	20 %	20 %	40 %	20 %	436834865
1087	NC_020054	GGGAC	2	10	1828140	1828149	20 %	0 %	60 %	20 %	436834867
1088	NC_020054	CGGTT	2	10	1829597	1829606	0 %	40 %	40 %	20 %	436834868
1089	NC_020054	TGCCC	2	10	1831377	1831386	0 %	20 %	20 %	60 %	436834868
1090	NC_020054	TCGAC	2	10	1837251	1837260	20 %	20 %	20 %	40 %	436834872
1091	NC_020054	CCTGA	2	10	1839609	1839618	20 %	20 %	20 %	40 %	436834873
1092	NC_020054	GAAAC	2	10	1839924	1839933	60 %	0 %	20 %	20 %	436834873
1093	NC_020054	CGAAG	2	10	1840690	1840699	40 %	0 %	40 %	20 %	436834874
1094	NC_020054	GGCCA	2	10	1841595	1841604	20 %	0 %	40 %	40 %	436834875
1095	NC_020054	GGGCA	2	10	1842141	1842150	20 %	0 %	60 %	20 %	436834875
1096	NC_020054	TATTG	2	10	1842167	1842176	20 %	60 %	20 %	0 %	436834875
1097	NC_020054	GCTGG	2	10	1842882	1842891	0 %	20 %	60 %	20 %	436834876
1098	NC_020054	GGTCG	2	10	1843848	1843857	0 %	20 %	60 %	20 %	436834876
1099	NC_020054	GCCTG	2	10	1845404	1845413	0 %	20 %	40 %	40 %	436834877
1100	NC_020054	ACCGT	2	10	1846399	1846408	20 %	20 %	20 %	40 %	436834878
1101	NC_020054	GGCTG	2	10	1848932	1848941	0 %	20 %	60 %	20 %	436834881
1102	NC_020054	GTTGG	2	10	1849126	1849135	0 %	40 %	60 %	0 %	436834881
1103	NC_020054	CGGCC	2	10	1849333	1849342	0 %	0 %	40 %	60 %	436834881
1104	NC_020054	GCCCA	2	10	1849684	1849693	20 %	0 %	20 %	60 %	436834881
1105	NC_020054	TACTA	2	10	1854674	1854683	40 %	40 %	0 %	20 %	436834885
1106	NC_020054	CCGGG	2	10	1855713	1855722	0 %	0 %	60 %	40 %	436834885
1107	NC_020054	AGTGC	2	10	1855968	1855977	20 %	20 %	40 %	20 %	436834885
1108	NC_020054	CGGGT	2	10	1857792	1857801	0 %	20 %	60 %	20 %	436834888
1109	NC_020054	AAGTA	2	10	1858309	1858318	60 %	20 %	20 %	0 %	436834889
1110	NC_020054	TTTTC	2	10	1867472	1867481	0 %	80 %	0 %	20 %	436834896
1111	NC_020054	GCTGG	2	10	1868366	1868375	0 %	20 %	60 %	20 %	436834896
1112	NC_020054	CGGTG	2	10	1870670	1870679	0 %	20 %	60 %	20 %	436834896
1113	NC_020054	GCTAC	2	10	1871702	1871711	20 %	20 %	20 %	40 %	436834896
1114	NC_020054	GAATG	2	10	1873288	1873297	40 %	20 %	40 %	0 %	436834897
1115	NC_020054	CGTTC	2	10	1875542	1875551	0 %	40 %	20 %	40 %	436834900
1116	NC_020054	GATCA	2	10	1878683	1878692	40 %	20 %	20 %	20 %	436834902
1117	NC_020054	CGCCA	2	10	1878719	1878728	20 %	0 %	20 %	60 %	436834902
1118	NC_020054	CGACT	2	10	1878913	1878922	20 %	20 %	20 %	40 %	436834902
1119	NC_020054	GGCCG	2	10	1879208	1879217	0 %	0 %	60 %	40 %	436834902
1120	NC_020054	CCGTA	2	10	1882969	1882978	20 %	20 %	20 %	40 %	436834904
1121	NC_020054	ACGGT	2	10	1883415	1883424	20 %	20 %	40 %	20 %	436834904
1122	NC_020054	GACCT	2	10	1883669	1883678	20 %	20 %	20 %	40 %	436834904
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1124	NC_020054	ATCGG	2	10	1886142	1886151	20 %	20 %	40 %	20 %	436834905
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1242	NC_020054	CCTGC	2	10	2083839	2083848	0 %	20 %	20 %	60 %	436835055
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1252	NC_020054	CGCCC	2	10	2095925	2095934	0 %	0 %	20 %	80 %	436835060
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1352	NC_020054	ACCGT	2	10	2255023	2255032	20 %	20 %	20 %	40 %	436835210
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1354	NC_020054	CGGCA	2	10	2257484	2257493	20 %	0 %	40 %	40 %	436835213
1355	NC_020054	ATCAC	2	10	2258049	2258058	40 %	20 %	0 %	40 %	436835213
1356	NC_020054	CGTTG	2	10	2258566	2258575	0 %	40 %	40 %	20 %	436835214
1357	NC_020054	CCGCC	2	10	2259324	2259333	0 %	0 %	20 %	80 %	436835214
1358	NC_020054	GCGTC	2	10	2259636	2259645	0 %	20 %	40 %	40 %	436835214
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1361	NC_020054	TCAGC	2	10	2261626	2261635	20 %	20 %	20 %	40 %	436835215
1362	NC_020054	CCCGA	2	10	2261769	2261778	20 %	0 %	20 %	60 %	436835215
1363	NC_020054	CACCC	2	10	2262044	2262053	20 %	0 %	0 %	80 %	436835215
1364	NC_020054	GCGCG	2	10	2262337	2262346	0 %	0 %	60 %	40 %	436835215
1365	NC_020054	TAGGG	2	10	2265175	2265184	20 %	20 %	60 %	0 %	436835218
1366	NC_020054	GTTTT	2	10	2271037	2271046	0 %	80 %	20 %	0 %	436835220
1367	NC_020054	GGTCA	2	10	2280699	2280708	20 %	20 %	40 %	20 %	436835230
1368	NC_020054	CGTTT	2	10	2282601	2282610	0 %	60 %	20 %	20 %	436835233
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1370	NC_020054	CGCCC	2	10	2284013	2284022	0 %	0 %	20 %	80 %	436835235
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1488	NC_020054	CGGTG	2	10	2498795	2498804	0 %	20 %	60 %	20 %	436835412
1489	NC_020054	GCCGG	2	10	2502962	2502971	0 %	0 %	60 %	40 %	436835415
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1492	NC_020054	GCCGG	2	10	2506432	2506441	0 %	0 %	60 %	40 %	436835421
1493	NC_020054	CTGGT	2	10	2513819	2513828	0 %	40 %	40 %	20 %	436835426
1494	NC_020054	TCACG	2	10	2516127	2516136	20 %	20 %	20 %	40 %	436835429
1495	NC_020054	GACGT	2	10	2518743	2518752	20 %	20 %	40 %	20 %	436835431
1496	NC_020054	ACGTC	2	10	2520150	2520159	20 %	20 %	20 %	40 %	436835432
1497	NC_020054	GACCG	2	10	2520166	2520175	20 %	0 %	40 %	40 %	436835432
1498	NC_020054	ACGGC	2	10	2521194	2521203	20 %	0 %	40 %	40 %	436835433
1499	NC_020054	CGGCC	2	10	2523124	2523133	0 %	0 %	40 %	60 %	436835435
1500	NC_020054	GCTCG	2	10	2523878	2523887	0 %	20 %	40 %	40 %	436835435

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