MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020054	CGACC	2	10	4158733	4158742	20 %	0 %	20 %	60 %	436836744
2502	NC_020054	GCCGG	2	10	4161353	4161362	0 %	0 %	60 %	40 %	436836747
2503	NC_020054	CCGCC	2	10	4163679	4163688	0 %	0 %	20 %	80 %	436836750
2504	NC_020054	ATTAT	2	10	4172382	4172391	40 %	60 %	0 %	0 %	436836754
2505	NC_020054	TGTCT	2	10	4172561	4172570	0 %	60 %	20 %	20 %	436836754
2506	NC_020054	TAAAT	2	10	4172767	4172776	60 %	40 %	0 %	0 %	436836754
2507	NC_020054	TAAAA	2	10	4173229	4173238	80 %	20 %	0 %	0 %	436836754
2508	NC_020054	GTGTT	2	10	4174537	4174546	0 %	60 %	40 %	0 %	436836755
2509	NC_020054	TAAGC	2	10	4174708	4174717	40 %	20 %	20 %	20 %	436836755
2510	NC_020054	ACTTT	2	10	4175988	4175997	20 %	60 %	0 %	20 %	436836756
2511	NC_020054	TGCTC	2	10	4180766	4180775	0 %	40 %	20 %	40 %	436836758
2512	NC_020054	AGGTA	2	10	4183228	4183237	40 %	20 %	40 %	0 %	436836760
2513	NC_020054	TCCTA	2	10	4183305	4183314	20 %	40 %	0 %	40 %	436836760
2514	NC_020054	ATAAC	2	10	4183823	4183832	60 %	20 %	0 %	20 %	436836760
2515	NC_020054	TGTCA	2	10	4184049	4184058	20 %	40 %	20 %	20 %	436836760
2516	NC_020054	GATCA	2	10	4188000	4188009	40 %	20 %	20 %	20 %	436836763
2517	NC_020054	ATTCG	2	10	4192462	4192471	20 %	40 %	20 %	20 %	436836767
2518	NC_020054	CGGGT	2	10	4193555	4193564	0 %	20 %	60 %	20 %	436836768
2519	NC_020054	ACGTG	2	10	4194410	4194419	20 %	20 %	40 %	20 %	436836769
2520	NC_020054	TGAGC	2	10	4195250	4195259	20 %	20 %	40 %	20 %	436836770
2521	NC_020054	CCTGG	2	10	4196003	4196012	0 %	20 %	40 %	40 %	436836770
2522	NC_020054	ACCGG	2	10	4196727	4196736	20 %	0 %	40 %	40 %	436836771
2523	NC_020054	CCAGC	2	10	4198979	4198988	20 %	0 %	20 %	60 %	436836773
2524	NC_020054	GGCCG	2	10	4199432	4199441	0 %	0 %	60 %	40 %	436836773
2525	NC_020054	CGGCC	2	10	4200488	4200497	0 %	0 %	40 %	60 %	436836774
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2527	NC_020054	TGAGT	2	10	4202551	4202560	20 %	40 %	40 %	0 %	436836776
2528	NC_020054	CGGTT	2	10	4202862	4202871	0 %	40 %	40 %	20 %	436836777
2529	NC_020054	CCCCA	2	10	4206224	4206233	20 %	0 %	0 %	80 %	436836779
2530	NC_020054	GCCAC	2	10	4206353	4206362	20 %	0 %	20 %	60 %	436836779
2531	NC_020054	TTTTG	2	10	4207455	4207464	0 %	80 %	20 %	0 %	436836779
2532	NC_020054	CTTGC	2	10	4208064	4208073	0 %	40 %	20 %	40 %	436836779
2533	NC_020054	AAGCC	2	10	4209325	4209334	40 %	0 %	20 %	40 %	436836780
2534	NC_020054	TACCG	2	10	4209746	4209755	20 %	20 %	20 %	40 %	436836782
2535	NC_020054	TGGTC	2	10	4209938	4209947	0 %	40 %	40 %	20 %	436836782
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2537	NC_020054	GCCCA	2	10	4217414	4217423	20 %	0 %	20 %	60 %	436836790
2538	NC_020054	ACCGG	2	10	4218505	4218514	20 %	0 %	40 %	40 %	436836791
2539	NC_020054	GAGTT	2	10	4220102	4220111	20 %	40 %	40 %	0 %	436836794
2540	NC_020054	CCAGC	2	10	4224831	4224840	20 %	0 %	20 %	60 %	436836799
2541	NC_020054	CGGCC	2	10	4231749	4231758	0 %	0 %	40 %	60 %	436836805
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2543	NC_020054	AGTTT	2	10	4238820	4238829	20 %	60 %	20 %	0 %	436836811
2544	NC_020054	GCGCC	2	10	4239802	4239811	0 %	0 %	40 %	60 %	436836811
2545	NC_020054	TGATC	2	10	4241174	4241183	20 %	40 %	20 %	20 %	436836812
2546	NC_020054	TTTAC	2	10	4242715	4242724	20 %	60 %	0 %	20 %	436836813
2547	NC_020054	AACTC	2	10	4242745	4242754	40 %	20 %	0 %	40 %	436836813
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2549	NC_020054	CAACT	2	10	4246327	4246336	40 %	20 %	0 %	40 %	436836816
2550	NC_020054	ACGTA	2	10	4247200	4247209	40 %	20 %	20 %	20 %	436836817
2551	NC_020054	TCCGA	2	10	4247855	4247864	20 %	20 %	20 %	40 %	436836817
2552	NC_020054	GGGCC	2	10	4248620	4248629	0 %	0 %	60 %	40 %	436836817
2553	NC_020054	GTCGC	2	10	4248659	4248668	0 %	20 %	40 %	40 %	436836817
2554	NC_020054	ATGGG	2	10	4250118	4250127	20 %	20 %	60 %	0 %	436836818
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2556	NC_020054	GCCGG	2	10	4250701	4250710	0 %	0 %	60 %	40 %	436836819
2557	NC_020054	CGGCT	2	10	4252483	4252492	0 %	20 %	40 %	40 %	436836820
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2559	NC_020054	ACCAA	2	10	4254274	4254283	60 %	0 %	0 %	40 %	436836822
2560	NC_020054	CGTCG	2	10	4254978	4254987	0 %	20 %	40 %	40 %	436836823
2561	NC_020054	CAAAA	2	10	4255691	4255700	80 %	0 %	0 %	20 %	436836824
2562	NC_020054	GATCA	2	10	4256046	4256055	40 %	20 %	20 %	20 %	436836824
2563	NC_020054	GATGC	2	10	4256556	4256565	20 %	20 %	40 %	20 %	436836824
2564	NC_020054	CGGCC	2	10	4263453	4263462	0 %	0 %	40 %	60 %	436836829
2565	NC_020054	TGCGC	2	10	4263610	4263619	0 %	20 %	40 %	40 %	436836829
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2571	NC_020054	GGGCA	2	10	4275703	4275712	20 %	0 %	60 %	20 %	436836840
2572	NC_020054	CTTTC	2	10	4275931	4275940	0 %	60 %	0 %	40 %	436836841
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2594	NC_020054	CGGCG	2	10	4301133	4301142	0 %	0 %	60 %	40 %	436836860
2595	NC_020054	GTCAG	2	10	4301906	4301915	20 %	20 %	40 %	20 %	436836860
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2599	NC_020054	GCCAG	2	10	4306247	4306256	20 %	0 %	40 %	40 %	436836862
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2602	NC_020054	GCCCC	2	10	4310681	4310690	0 %	0 %	20 %	80 %	436836867
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2605	NC_020054	CGGCG	2	10	4313931	4313940	0 %	0 %	60 %	40 %	436836871
2606	NC_020054	CCCAG	2	10	4314339	4314348	20 %	0 %	20 %	60 %	436836871
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2609	NC_020054	GTGGC	2	10	4323147	4323156	0 %	20 %	60 %	20 %	436836879
2610	NC_020054	ACACC	2	10	4324500	4324509	40 %	0 %	0 %	60 %	436836880
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2614	NC_020054	GCCGC	2	10	4335629	4335638	0 %	0 %	40 %	60 %	436836888
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2993	NC_020054	GCCCG	2	10	5012306	5012315	0 %	0 %	40 %	60 %	436837435
2994	NC_020054	GGCCG	2	10	5013743	5013752	0 %	0 %	60 %	40 %	436837438
2995	NC_020054	CCCTT	2	10	5018125	5018134	0 %	40 %	0 %	60 %	436837445
2996	NC_020054	CCAAG	2	10	5018636	5018645	40 %	0 %	20 %	40 %	436837445
2997	NC_020054	CGCCC	3	15	5018880	5018894	0 %	0 %	20 %	80 %	436837445
2998	NC_020054	GGCCC	2	10	5020835	5020844	0 %	0 %	40 %	60 %	436837448
2999	NC_020054	ATTCG	2	10	5021590	5021599	20 %	40 %	20 %	20 %	436837450
3000	NC_020054	ACTTC	2	10	5023306	5023315	20 %	40 %	0 %	40 %	436837451

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