MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019965	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	433640129
2	NC_019965	CCAAC	2	10	1679	1688	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_019965	CGTTT	2	10	2093	2102	0 %	60 %	20 %	20 %	433640130
4	NC_019965	CGGTT	2	10	3242	3251	0 %	40 %	40 %	20 %	433640130
5	NC_019965	CGTCG	2	10	4584	4593	0 %	20 %	40 %	40 %	433640132
6	NC_019965	GCAGC	2	10	7374	7383	20 %	0 %	40 %	40 %	433640134
7	NC_019965	CGGTG	2	10	9282	9291	0 %	20 %	60 %	20 %	433640134
8	NC_019965	CAGAC	2	10	9800	9809	40 %	0 %	20 %	40 %	433640134
9	NC_019965	CGCAA	2	10	10324	10333	40 %	0 %	20 %	40 %	433640135
10	NC_019965	CGGCG	2	10	10450	10459	0 %	0 %	60 %	40 %	433640135
11	NC_019965	ACCCG	2	10	11280	11289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019965	AGGCC	2	10	12252	12261	20 %	0 %	40 %	40 %	433640136
13	NC_019965	CGACC	2	10	13673	13682	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_019965	GGGCC	2	10	14438	14447	0 %	0 %	60 %	40 %	433640140
15	NC_019965	GCGTT	2	10	15183	15192	0 %	40 %	40 %	20 %	433640141
16	NC_019965	CCAGC	2	10	15723	15732	20 %	0 %	20 %	60 %	433640142
17	NC_019965	ACCGA	2	10	16486	16495	40 %	0 %	20 %	40 %	433640142
18	NC_019965	ATCGG	2	10	16878	16887	20 %	20 %	40 %	20 %	433640142
19	NC_019965	CGGCC	2	10	17887	17896	0 %	0 %	40 %	60 %	433640143
20	NC_019965	TTAGC	2	10	19115	19124	20 %	40 %	20 %	20 %	433640144
21	NC_019965	GGTCC	2	10	19187	19196	0 %	20 %	40 %	40 %	433640144
22	NC_019965	GTCGT	2	10	21706	21715	0 %	40 %	40 %	20 %	433640145
23	NC_019965	ATCAC	2	10	23979	23988	40 %	20 %	0 %	40 %	433640148
24	NC_019965	GCCGG	2	10	24666	24675	0 %	0 %	60 %	40 %	433640148
25	NC_019965	CGAGC	2	10	27028	27037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019965	GGCAA	2	10	29361	29370	40 %	0 %	40 %	20 %	433640153
27	NC_019965	CGATC	2	10	30187	30196	20 %	20 %	20 %	40 %	433640154
28	NC_019965	CGACG	2	10	32374	32383	20 %	0 %	40 %	40 %	433640158
29	NC_019965	GCGTC	2	10	32429	32438	0 %	20 %	40 %	40 %	433640158
30	NC_019965	GACAC	2	10	32526	32535	40 %	0 %	20 %	40 %	433640158
31	NC_019965	CCGCC	2	10	33866	33875	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_019965	TCCTG	2	10	37524	37533	0 %	40 %	20 %	40 %	433640164
33	NC_019965	CTCGG	2	10	37617	37626	0 %	20 %	40 %	40 %	433640164
34	NC_019965	GGCGC	2	10	38160	38169	0 %	0 %	60 %	40 %	433640164
35	NC_019965	TGGCC	2	10	38308	38317	0 %	20 %	40 %	40 %	433640164
36	NC_019965	CGGCG	2	10	38840	38849	0 %	0 %	60 %	40 %	433640164
37	NC_019965	GTCCA	2	10	39396	39405	20 %	20 %	20 %	40 %	433640165
38	NC_019965	GCGTC	2	10	41945	41954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019965	GCACA	2	10	42329	42338	40 %	0 %	20 %	40 %	433640168
40	NC_019965	GGTAC	2	10	44863	44872	20 %	20 %	40 %	20 %	433640170
41	NC_019965	TCGAA	2	10	45095	45104	40 %	20 %	20 %	20 %	433640170
42	NC_019965	GCACC	2	10	46025	46034	20 %	0 %	20 %	60 %	433640170
43	NC_019965	CGGTG	2	10	47059	47068	0 %	20 %	60 %	20 %	433640171
44	NC_019965	TCATG	2	10	47205	47214	20 %	40 %	20 %	20 %	433640171
45	NC_019965	ATCGG	2	10	47352	47361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019965	GCAGC	2	10	48599	48608	20 %	0 %	40 %	40 %	433640173
47	NC_019965	CCCGA	2	10	48682	48691	20 %	0 %	20 %	60 %	433640173
48	NC_019965	CAGCG	2	10	49807	49816	20 %	0 %	40 %	40 %	433640174
49	NC_019965	CTCCC	2	10	56247	56256	0 %	20 %	0 %	80 %	433640180
50	NC_019965	CGGCG	2	10	56696	56705	0 %	0 %	60 %	40 %	433640180
51	NC_019965	GACCC	2	10	58229	58238	20 %	0 %	20 %	60 %	433640182
52	NC_019965	CTTCG	2	10	58915	58924	0 %	40 %	20 %	40 %	433640183
53	NC_019965	CGGTG	2	10	59971	59980	0 %	20 %	60 %	20 %	433640186
54	NC_019965	TCAGG	2	10	62418	62427	20 %	20 %	40 %	20 %	433640187
55	NC_019965	CGGCG	2	10	64410	64419	0 %	0 %	60 %	40 %	433640188
56	NC_019965	GGCGA	2	10	64831	64840	20 %	0 %	60 %	20 %	433640188
57	NC_019965	CGGGT	2	10	66234	66243	0 %	20 %	60 %	20 %	433640189
58	NC_019965	CGGCC	2	10	67673	67682	0 %	0 %	40 %	60 %	433640191
59	NC_019965	TGCCA	2	10	67997	68006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_019965	GGTGT	2	10	68826	68835	0 %	40 %	60 %	0 %	433640194
61	NC_019965	ATCGG	2	10	69463	69472	20 %	20 %	40 %	20 %	433640194
62	NC_019965	CCGCG	2	10	70000	70009	0 %	0 %	40 %	60 %	433640194
63	NC_019965	GGCAA	2	10	70351	70360	40 %	0 %	40 %	20 %	433640194
64	NC_019965	CGACC	2	10	70640	70649	20 %	0 %	20 %	60 %	433640194
65	NC_019965	GGTCG	2	10	71154	71163	0 %	20 %	60 %	20 %	433640194
66	NC_019965	TGCCT	2	10	71895	71904	0 %	40 %	20 %	40 %	433640196
67	NC_019965	GTCCA	2	10	72766	72775	20 %	20 %	20 %	40 %	433640197
68	NC_019965	TGACC	2	10	75390	75399	20 %	20 %	20 %	40 %	433640199
69	NC_019965	GCCAA	2	10	75704	75713	40 %	0 %	20 %	40 %	433640199
70	NC_019965	GTCGC	2	10	75781	75790	0 %	20 %	40 %	40 %	433640199
71	NC_019965	GCGCG	2	10	76869	76878	0 %	0 %	60 %	40 %	433640200
72	NC_019965	CGCCA	2	10	80637	80646	20 %	0 %	20 %	60 %	433640202
73	NC_019965	CGGGC	2	10	80708	80717	0 %	0 %	60 %	40 %	433640202
74	NC_019965	GAGCA	2	10	82544	82553	40 %	0 %	40 %	20 %	433640204
75	NC_019965	GCCGG	2	10	82643	82652	0 %	0 %	60 %	40 %	433640204
76	NC_019965	GCGAC	2	10	82719	82728	20 %	0 %	40 %	40 %	433640204
77	NC_019965	TGCGG	2	10	83366	83375	0 %	20 %	60 %	20 %	433640205
78	NC_019965	ATCCG	2	10	83441	83450	20 %	20 %	20 %	40 %	433640205
79	NC_019965	CACCG	2	10	84221	84230	20 %	0 %	20 %	60 %	433640206
80	NC_019965	TGGTC	2	10	86356	86365	0 %	40 %	40 %	20 %	433640208
81	NC_019965	GCTGG	2	10	86993	87002	0 %	20 %	60 %	20 %	433640209
82	NC_019965	TGGGT	2	10	90031	90040	0 %	40 %	60 %	0 %	433640214
83	NC_019965	TCGCC	2	10	90238	90247	0 %	20 %	20 %	60 %	433640214
84	NC_019965	GGGCC	2	10	91211	91220	0 %	0 %	60 %	40 %	433640215
85	NC_019965	GGCCG	2	10	92530	92539	0 %	0 %	60 %	40 %	433640216
86	NC_019965	GCGCC	2	10	93182	93191	0 %	0 %	40 %	60 %	433640216
87	NC_019965	GCTTG	2	10	95214	95223	0 %	40 %	40 %	20 %	433640218
88	NC_019965	CGTGT	2	10	95646	95655	0 %	40 %	40 %	20 %	433640219
89	NC_019965	AGATC	2	10	95725	95734	40 %	20 %	20 %	20 %	433640219
90	NC_019965	CGGCG	2	10	98752	98761	0 %	0 %	60 %	40 %	433640221
91	NC_019965	CGGCG	2	10	98879	98888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019965	ATCGA	2	10	99596	99605	40 %	20 %	20 %	20 %	433640223
93	NC_019965	GCGGT	2	10	99828	99837	0 %	20 %	60 %	20 %	433640223
94	NC_019965	GGTGA	2	10	100046	100055	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019965	GCGCC	2	10	102660	102669	0 %	0 %	40 %	60 %	433640225
96	NC_019965	GTCGA	2	10	103033	103042	20 %	20 %	40 %	20 %	433640225
97	NC_019965	GGTGG	2	10	103340	103349	0 %	20 %	80 %	0 %	433640226
98	NC_019965	CTGGC	2	10	105112	105121	0 %	20 %	40 %	40 %	433640227
99	NC_019965	GCACA	2	10	106233	106242	40 %	0 %	20 %	40 %	433640227
100	NC_019965	ATCGC	2	10	109058	109067	20 %	20 %	20 %	40 %	433640230
101	NC_019965	CGGTC	2	10	110667	110676	0 %	20 %	40 %	40 %	433640232
102	NC_019965	GACCA	2	10	111805	111814	40 %	0 %	20 %	40 %	433640232
103	NC_019965	GGCTG	2	10	114369	114378	0 %	20 %	60 %	20 %	433640232
104	NC_019965	CCGCG	2	10	118289	118298	0 %	0 %	40 %	60 %	433640233
105	NC_019965	TCGTG	2	10	122242	122251	0 %	40 %	40 %	20 %	433640235
106	NC_019965	CAGCG	2	10	122485	122494	20 %	0 %	40 %	40 %	433640235
107	NC_019965	GCACG	2	10	123937	123946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019965	CCGGA	2	10	124062	124071	20 %	0 %	40 %	40 %	433640237
109	NC_019965	GGCCG	2	10	126422	126431	0 %	0 %	60 %	40 %	433640238
110	NC_019965	TGCGC	2	10	126534	126543	0 %	20 %	40 %	40 %	433640238
111	NC_019965	GCGAG	2	10	127045	127054	20 %	0 %	60 %	20 %	433640238
112	NC_019965	GGGGT	2	10	128054	128063	0 %	20 %	80 %	0 %	433640238
113	NC_019965	CCCAC	2	10	128616	128625	20 %	0 %	0 %	80 %	433640238
114	NC_019965	CCGGC	2	10	129126	129135	0 %	0 %	40 %	60 %	433640238
115	NC_019965	TGCGG	2	10	129536	129545	0 %	20 %	60 %	20 %	433640238
116	NC_019965	ATCGG	2	10	131058	131067	20 %	20 %	40 %	20 %	433640240
117	NC_019965	CGGGC	2	10	132149	132158	0 %	0 %	60 %	40 %	433640240
118	NC_019965	GCGAT	2	10	133954	133963	20 %	20 %	40 %	20 %	433640242
119	NC_019965	GTTCG	2	10	134175	134184	0 %	40 %	40 %	20 %	433640242
120	NC_019965	CCTGG	2	10	134567	134576	0 %	20 %	40 %	40 %	433640242
121	NC_019965	GGCCC	2	10	134673	134682	0 %	0 %	40 %	60 %	433640242
122	NC_019965	CGTTG	2	10	135185	135194	0 %	40 %	40 %	20 %	433640242
123	NC_019965	CGACC	2	10	135257	135266	20 %	0 %	20 %	60 %	433640242
124	NC_019965	GAGAT	2	10	138277	138286	40 %	20 %	40 %	0 %	433640246
125	NC_019965	CGGCG	2	10	140432	140441	0 %	0 %	60 %	40 %	433640248
126	NC_019965	TGCGG	2	10	141065	141074	0 %	20 %	60 %	20 %	433640249
127	NC_019965	CGCTG	2	10	141772	141781	0 %	20 %	40 %	40 %	433640250
128	NC_019965	GTTGC	2	10	142318	142327	0 %	40 %	40 %	20 %	433640250
129	NC_019965	CCGAT	2	10	143066	143075	20 %	20 %	20 %	40 %	433640250
130	NC_019965	AACCG	2	10	144496	144505	40 %	0 %	20 %	40 %	433640251
131	NC_019965	CCGCC	2	10	145083	145092	0 %	0 %	20 %	80 %	433640251
132	NC_019965	CCGCC	2	10	145726	145735	0 %	0 %	20 %	80 %	433640252
133	NC_019965	ATCGG	2	10	149199	149208	20 %	20 %	40 %	20 %	433640256
134	NC_019965	ATTGG	2	10	152034	152043	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019965	AGCGA	2	10	153937	153946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019965	AGCGA	2	10	153990	153999	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019965	AGCGA	2	10	154043	154052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019965	TCGTC	2	10	154390	154399	0 %	40 %	20 %	40 %	433640259
139	NC_019965	CACGC	2	10	154854	154863	20 %	0 %	20 %	60 %	433640259
140	NC_019965	ATTCT	2	10	155698	155707	20 %	60 %	0 %	20 %	433640260
141	NC_019965	AGGCG	2	10	156226	156235	20 %	0 %	60 %	20 %	433640260
142	NC_019965	GTCTG	2	10	158597	158606	0 %	40 %	40 %	20 %	433640263
143	NC_019965	TGACC	2	10	159230	159239	20 %	20 %	20 %	40 %	433640263
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146	NC_019965	CCGCA	2	10	160824	160833	20 %	0 %	20 %	60 %	433640265
147	NC_019965	CGCGG	2	10	160903	160912	0 %	0 %	60 %	40 %	433640265
148	NC_019965	CGGTT	2	10	161230	161239	0 %	40 %	40 %	20 %	433640265
149	NC_019965	GTCGC	2	10	161392	161401	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_019965	GCCGG	2	10	161691	161700	0 %	0 %	60 %	40 %	433640266
151	NC_019965	GCGCG	2	10	161813	161822	0 %	0 %	60 %	40 %	433640266
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154	NC_019965	GTTGG	2	10	166589	166598	0 %	40 %	60 %	0 %	433640271
155	NC_019965	GCGTG	2	10	167755	167764	0 %	20 %	60 %	20 %	433640274
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158	NC_019965	GCATG	2	10	171047	171056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_019965	GCGCC	2	10	173809	173818	0 %	0 %	40 %	60 %	433640279
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165	NC_019965	GTTCG	2	10	177937	177946	0 %	40 %	40 %	20 %	433640283
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172	NC_019965	GTCGC	2	10	183546	183555	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_019965	ACGGC	2	10	187707	187716	20 %	0 %	40 %	40 %	433640290
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175	NC_019965	GGCTG	2	10	190797	190806	0 %	20 %	60 %	20 %	433640292
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191	NC_019965	GCCGA	2	10	214765	214774	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_019965	CCTCG	2	10	215201	215210	0 %	20 %	20 %	60 %	433640315
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198	NC_019965	GAATC	2	10	220304	220313	40 %	20 %	20 %	20 %	433640320
199	NC_019965	CCCGA	2	10	220604	220613	20 %	0 %	20 %	60 %	433640320
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201	NC_019965	CCGTG	2	10	221913	221922	0 %	20 %	40 %	40 %	433640321
202	NC_019965	GGTGC	2	10	222037	222046	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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209	NC_019965	GGCCG	2	10	231399	231408	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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239	NC_019965	CGAGT	2	10	272611	272620	20 %	20 %	40 %	20 %	433640359
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243	NC_019965	GCAGT	2	10	275933	275942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
244	NC_019965	GCTCA	2	10	277443	277452	20 %	20 %	20 %	40 %	433640364
245	NC_019965	GATCC	2	10	278375	278384	20 %	20 %	20 %	40 %	433640365
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248	NC_019965	GGCGA	2	10	282541	282550	20 %	0 %	60 %	20 %	433640368
249	NC_019965	CAGCG	2	10	284152	284161	20 %	0 %	40 %	40 %	433640369
250	NC_019965	GCCGA	2	10	285335	285344	20 %	0 %	40 %	40 %	433640369
251	NC_019965	CGAAC	2	10	291256	291265	40 %	0 %	20 %	40 %	433640375
252	NC_019965	TGGCC	2	10	291995	292004	0 %	20 %	40 %	40 %	433640376
253	NC_019965	GCGGT	2	10	293676	293685	0 %	20 %	60 %	20 %	433640377
254	NC_019965	ACGCC	2	10	295542	295551	20 %	0 %	20 %	60 %	433640378
255	NC_019965	CGGCC	2	10	303458	303467	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
256	NC_019965	TGCGC	2	10	303505	303514	0 %	20 %	40 %	40 %	433640385
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259	NC_019965	TGGGG	2	10	309705	309714	0 %	20 %	80 %	0 %	433640390
260	NC_019965	TGCGG	2	10	310354	310363	0 %	20 %	60 %	20 %	433640390
261	NC_019965	TGCCA	2	10	312220	312229	20 %	20 %	20 %	40 %	433640393
262	NC_019965	CGCAG	2	10	313376	313385	20 %	0 %	40 %	40 %	433640394
263	NC_019965	CGGCG	2	10	314010	314019	0 %	0 %	60 %	40 %	433640394
264	NC_019965	CGGCC	2	10	314584	314593	0 %	0 %	40 %	60 %	433640395
265	NC_019965	CAGAT	2	10	315491	315500	40 %	20 %	20 %	20 %	433640395
266	NC_019965	AGCGG	2	10	315715	315724	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
267	NC_019965	CGGAC	2	10	315829	315838	20 %	0 %	40 %	40 %	433640396
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399	NC_019965	ATCGA	2	10	492890	492899	40 %	20 %	20 %	20 %	433640528
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