MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019965	GCCGC	2	10	2497868	2497877	0 %	0 %	40 %	60 %	433642365
2002	NC_019965	ACCGC	2	10	2498361	2498370	20 %	0 %	20 %	60 %	433642365
2003	NC_019965	GGCGT	2	10	2499430	2499439	0 %	20 %	60 %	20 %	433642367
2004	NC_019965	TGGCG	2	10	2500058	2500067	0 %	20 %	60 %	20 %	433642367
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2006	NC_019965	GCCGC	2	10	2505246	2505255	0 %	0 %	40 %	60 %	433642373
2007	NC_019965	CGGTG	2	10	2505547	2505556	0 %	20 %	60 %	20 %	433642373
2008	NC_019965	GCAAC	2	10	2505757	2505766	40 %	0 %	20 %	40 %	433642373
2009	NC_019965	GGCAT	2	10	2506357	2506366	20 %	20 %	40 %	20 %	433642374
2010	NC_019965	CCCGG	2	10	2509710	2509719	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2011	NC_019965	GCCGG	2	10	2512154	2512163	0 %	0 %	60 %	40 %	433642378
2012	NC_019965	GCATT	2	10	2515582	2515591	20 %	40 %	20 %	20 %	433642381
2013	NC_019965	CCCGG	2	10	2516457	2516466	0 %	0 %	40 %	60 %	433642382
2014	NC_019965	CAGCG	2	10	2517042	2517051	20 %	0 %	40 %	40 %	433642382
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2019	NC_019965	GCTCG	2	10	2525296	2525305	0 %	20 %	40 %	40 %	433642390
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2021	NC_019965	ACCGA	2	10	2527417	2527426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2035	NC_019965	GCGCC	2	10	2538601	2538610	0 %	0 %	40 %	60 %	433642401
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2039	NC_019965	CGGCG	2	10	2544150	2544159	0 %	0 %	60 %	40 %	433642407
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2047	NC_019965	CCACC	2	10	2558196	2558205	20 %	0 %	0 %	80 %	433642416
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2057	NC_019965	CGCGC	2	10	2566547	2566556	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2126	NC_019965	TCGGG	2	10	2666168	2666177	0 %	20 %	60 %	20 %	433642531
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2142	NC_019965	CCCGG	2	10	2684753	2684762	0 %	0 %	40 %	60 %	433642545
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2146	NC_019965	CGTGT	2	10	2690405	2690414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2147	NC_019965	CCAGG	2	10	2691677	2691686	20 %	0 %	40 %	40 %	433642551
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2154	NC_019965	GTCGG	2	10	2698920	2698929	0 %	20 %	60 %	20 %	433642558
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2166	NC_019965	CGCAA	2	10	2712525	2712534	40 %	0 %	20 %	40 %	433642573
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2197	NC_019965	CCGGG	2	10	2758955	2758964	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2230	NC_019965	CGATG	2	10	2806154	2806163	20 %	20 %	40 %	20 %	433642648
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2232	NC_019965	CCCGG	2	10	2806622	2806631	0 %	0 %	40 %	60 %	433642648
2233	NC_019965	CGGCA	2	10	2807425	2807434	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2234	NC_019965	TGCAG	2	10	2808807	2808816	20 %	20 %	40 %	20 %	433642652
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2236	NC_019965	GTCTT	2	10	2809937	2809946	0 %	60 %	20 %	20 %	433642653
2237	NC_019965	CTTGG	2	10	2810323	2810332	0 %	40 %	40 %	20 %	433642653
2238	NC_019965	CAGCG	2	10	2810899	2810908	20 %	0 %	40 %	40 %	433642653
2239	NC_019965	GGCCC	2	10	2811818	2811827	0 %	0 %	40 %	60 %	433642653
2240	NC_019965	CATTT	2	10	2811964	2811973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2241	NC_019965	GGTCC	2	10	2813113	2813122	0 %	20 %	40 %	40 %	433642654
2242	NC_019965	GCGCC	2	10	2815664	2815673	0 %	0 %	40 %	60 %	433642656
2243	NC_019965	CAACT	2	10	2816567	2816576	40 %	20 %	0 %	40 %	433642657
2244	NC_019965	GCCAC	2	10	2817650	2817659	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2245	NC_019965	ACGCG	2	10	2820851	2820860	20 %	0 %	40 %	40 %	433642661
2246	NC_019965	CGGGT	2	10	2822422	2822431	0 %	20 %	60 %	20 %	433642662
2247	NC_019965	GCGCC	2	10	2824326	2824335	0 %	0 %	40 %	60 %	433642665
2248	NC_019965	ACGCA	2	10	2827677	2827686	40 %	0 %	20 %	40 %	433642668
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2499	NC_019965	CCGCG	2	10	3150273	3150282	0 %	0 %	40 %	60 %	433642984
2500	NC_019965	CCGAC	2	10	3151673	3151682	20 %	0 %	20 %	60 %	433642985

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