MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019965	TCCGA	2	10	1906352	1906361	20 %	20 %	20 %	40 %	433641801
1502	NC_019965	CCAAC	2	10	1906694	1906703	40 %	0 %	0 %	60 %	433641801
1503	NC_019965	CCAAC	2	10	1906754	1906763	40 %	0 %	0 %	60 %	433641801
1504	NC_019965	GCGAG	2	10	1907100	1907109	20 %	0 %	60 %	20 %	433641802
1505	NC_019965	CGCGG	2	10	1907836	1907845	0 %	0 %	60 %	40 %	433641802
1506	NC_019965	GGCGG	2	10	1908235	1908244	0 %	0 %	80 %	20 %	433641802
1507	NC_019965	CGGAC	2	10	1910766	1910775	20 %	0 %	40 %	40 %	433641803
1508	NC_019965	CAGCG	2	10	1911437	1911446	20 %	0 %	40 %	40 %	433641804
1509	NC_019965	GATGC	2	10	1911529	1911538	20 %	20 %	40 %	20 %	433641804
1510	NC_019965	CCGAG	2	10	1913419	1913428	20 %	0 %	40 %	40 %	433641805
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1512	NC_019965	GGGTG	2	10	1914498	1914507	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019965	TGCTG	2	10	1915448	1915457	0 %	40 %	40 %	20 %	433641807
1514	NC_019965	TGGTG	2	10	1915586	1915595	0 %	40 %	60 %	0 %	433641807
1515	NC_019965	CCCAG	2	10	1917387	1917396	20 %	0 %	20 %	60 %	433641809
1516	NC_019965	GCGCC	2	10	1918943	1918952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1517	NC_019965	GCGCT	2	10	1919219	1919228	0 %	20 %	40 %	40 %	433641812
1518	NC_019965	GGCGC	2	10	1919552	1919561	0 %	0 %	60 %	40 %	433641812
1519	NC_019965	GGTAT	2	10	1920029	1920038	20 %	40 %	40 %	0 %	433641813
1520	NC_019965	ACGCC	2	10	1921167	1921176	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1521	NC_019965	AACCG	2	10	1923301	1923310	40 %	0 %	20 %	40 %	433641817
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1524	NC_019965	TCCGC	2	10	1925360	1925369	0 %	20 %	20 %	60 %	433641819
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1530	NC_019965	GGGGA	2	10	1932949	1932958	20 %	0 %	80 %	0 %	433641826
1531	NC_019965	GGCGC	2	10	1933587	1933596	0 %	0 %	60 %	40 %	433641826
1532	NC_019965	GGGTG	2	10	1933608	1933617	0 %	20 %	80 %	0 %	433641826
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1534	NC_019965	GGGGT	2	10	1933856	1933865	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_019965	CTGTG	2	10	1934310	1934319	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1536	NC_019965	GGACG	2	10	1935609	1935618	20 %	0 %	60 %	20 %	433641829
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1539	NC_019965	AGGTC	2	10	1937373	1937382	20 %	20 %	40 %	20 %	433641831
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1541	NC_019965	GCTGG	2	10	1937457	1937466	0 %	20 %	60 %	20 %	433641831
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1551	NC_019965	GGGTT	2	10	1953739	1953748	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1557	NC_019965	GGGCC	2	10	1961405	1961414	0 %	0 %	60 %	40 %	433641852
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1559	NC_019965	GCCGC	2	10	1966792	1966801	0 %	0 %	40 %	60 %	433641861
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1563	NC_019965	GCGGG	2	10	1971314	1971323	0 %	0 %	80 %	20 %	433641865
1564	NC_019965	CGGTC	2	10	1971374	1971383	0 %	20 %	40 %	40 %	433641865
1565	NC_019965	CGCGA	2	10	1971945	1971954	20 %	0 %	40 %	40 %	433641865
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1571	NC_019965	CGCCC	2	10	1984576	1984585	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1572	NC_019965	CCTCT	2	10	1987271	1987280	0 %	40 %	0 %	60 %	433641877
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1597	NC_019965	CGGCG	2	10	2009771	2009780	0 %	0 %	60 %	40 %	433641894
1598	NC_019965	CACAA	2	10	2013405	2013414	60 %	0 %	0 %	40 %	433641896
1599	NC_019965	GGCAG	2	10	2014156	2014165	20 %	0 %	60 %	20 %	433641896
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1604	NC_019965	CCGGT	2	10	2023642	2023651	0 %	20 %	40 %	40 %	433641904
1605	NC_019965	GCCGT	2	10	2024780	2024789	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1606	NC_019965	AGTCC	2	10	2033249	2033258	20 %	20 %	20 %	40 %	433641912
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1612	NC_019965	CCAGT	2	10	2043691	2043700	20 %	20 %	20 %	40 %	433641920
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1614	NC_019965	GCGGA	2	10	2043885	2043894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_019965	CTCGA	2	10	2047438	2047447	20 %	20 %	20 %	40 %	433641922
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1622	NC_019965	AGGCA	2	10	2055267	2055276	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1623	NC_019965	GCCCG	2	10	2056065	2056074	0 %	0 %	40 %	60 %	433641930
1624	NC_019965	GATGT	2	10	2057885	2057894	20 %	40 %	40 %	0 %	433641931
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1725	NC_019965	CGGGG	2	10	2187736	2187745	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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1751	NC_019965	ACCGG	2	10	2212219	2212228	20 %	0 %	40 %	40 %	433642070
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1755	NC_019965	GCGCC	2	10	2218299	2218308	0 %	0 %	40 %	60 %	433642078
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1759	NC_019965	GCCGG	2	10	2222553	2222562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1760	NC_019965	CCGAC	2	10	2223104	2223113	20 %	0 %	20 %	60 %	433642086
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1764	NC_019965	GGCGC	2	10	2226329	2226338	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1802	NC_019965	GTCGT	2	10	2273293	2273302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1819	NC_019965	CGAGC	2	10	2295882	2295891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1820	NC_019965	GCCGG	2	10	2296395	2296404	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1858	NC_019965	CCGGC	2	10	2335366	2335375	0 %	0 %	40 %	60 %	433642201
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1860	NC_019965	GCGTA	2	10	2335643	2335652	20 %	20 %	40 %	20 %	433642201
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1871	NC_019965	TGGCC	2	10	2343920	2343929	0 %	20 %	40 %	40 %	433642202
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1993	NC_019965	ACCGG	2	10	2487768	2487777	20 %	0 %	40 %	40 %	433642353
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1998	NC_019965	TCAGA	2	10	2491938	2491947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1999	NC_019965	GTGAA	2	10	2492447	2492456	40 %	20 %	40 %	0 %	433642360
2000	NC_019965	CCGGC	2	10	2496778	2496787	0 %	0 %	40 %	60 %	433642364

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