MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019965	CCGCA	2	10	1255166	1255175	20 %	0 %	20 %	60 %	433641266
1002	NC_019965	GGACC	2	10	1257284	1257293	20 %	0 %	40 %	40 %	433641268
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1004	NC_019965	GGCGT	2	10	1261813	1261822	0 %	20 %	60 %	20 %	433641272
1005	NC_019965	CGCGA	2	10	1265157	1265166	20 %	0 %	40 %	40 %	433641276
1006	NC_019965	CAGCC	2	10	1265308	1265317	20 %	0 %	20 %	60 %	433641276
1007	NC_019965	TCCGC	2	10	1266026	1266035	0 %	20 %	20 %	60 %	433641276
1008	NC_019965	CGCAC	2	10	1268661	1268670	20 %	0 %	20 %	60 %	433641278
1009	NC_019965	GCCGA	2	10	1269585	1269594	20 %	0 %	40 %	40 %	433641279
1010	NC_019965	GGGCT	2	10	1269642	1269651	0 %	20 %	60 %	20 %	433641279
1011	NC_019965	GACGT	2	10	1271367	1271376	20 %	20 %	40 %	20 %	433641280
1012	NC_019965	CGCAG	2	10	1271544	1271553	20 %	0 %	40 %	40 %	433641280
1013	NC_019965	CGCGG	2	10	1273300	1273309	0 %	0 %	60 %	40 %	433641280
1014	NC_019965	CCGAT	2	10	1273420	1273429	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_019965	GCGCG	2	10	1273501	1273510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_019965	TGGCC	2	10	1275452	1275461	0 %	20 %	40 %	40 %	433641282
1017	NC_019965	GCCAA	2	10	1276544	1276553	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_019965	CCCGC	2	10	1277771	1277780	0 %	0 %	20 %	80 %	433641285
1019	NC_019965	CGCCC	2	10	1278233	1278242	0 %	0 %	20 %	80 %	433641285
1020	NC_019965	GGCCA	2	10	1278345	1278354	20 %	0 %	40 %	40 %	433641285
1021	NC_019965	CAGCC	2	10	1279084	1279093	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1022	NC_019965	GCCGG	2	10	1280396	1280405	0 %	0 %	60 %	40 %	433641288
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1035	NC_019965	GGCGC	2	10	1296327	1296336	0 %	0 %	60 %	40 %	433641306
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1038	NC_019965	CGGCC	2	10	1297793	1297802	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1039	NC_019965	CGGCG	2	10	1297939	1297948	0 %	0 %	60 %	40 %	433641309
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1047	NC_019965	CCGCG	2	10	1304627	1304636	0 %	0 %	40 %	60 %	433641312
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1049	NC_019965	GCCCA	2	10	1306666	1306675	20 %	0 %	20 %	60 %	433641314
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1102	NC_019965	GCGTC	2	10	1376647	1376656	0 %	20 %	40 %	40 %	433641371
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1111	NC_019965	TTCGT	2	10	1384884	1384893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_019965	CGGCG	2	10	1385470	1385479	0 %	0 %	60 %	40 %	433641380
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1499	NC_019965	CGGGT	2	10	1904494	1904503	0 %	20 %	60 %	20 %	433641801
1500	NC_019965	GCTCG	2	10	1905758	1905767	0 %	20 %	40 %	40 %	433641801

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