MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 19299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	TGA	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705598
2	NC_018643	GGA	3	9	180	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705598
3	NC_018643	TGA	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705598
4	NC_018643	GTT	2	6	240	245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705598
5	NC_018643	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705598
6	NC_018643	CAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705598
7	NC_018643	GAA	2	6	393	398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705598
8	NC_018643	TGG	2	6	425	430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705598
9	NC_018643	CAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705598
10	NC_018643	ATT	2	6	470	475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705598
11	NC_018643	CTA	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705598
12	NC_018643	ATG	2	6	508	513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705598
13	NC_018643	ACC	2	6	557	562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705598
14	NC_018643	GGA	2	6	569	574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705598
15	NC_018643	TTA	2	6	594	599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705598
16	NC_018643	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705599
17	NC_018643	TGT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705599
18	NC_018643	TTC	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705599
19	NC_018643	AAG	2	6	1007	1012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705599
20	NC_018643	TAT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705599
21	NC_018643	GAA	2	6	1122	1127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705599
22	NC_018643	AAG	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705599
23	NC_018643	AGA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705599
24	NC_018643	ATC	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705600
25	NC_018643	GAT	2	6	1339	1344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705600
26	NC_018643	TAT	2	6	1355	1360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705600
27	NC_018643	TTG	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705600
28	NC_018643	GAT	2	6	1585	1590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705600
29	NC_018643	ATA	2	6	1612	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705600
30	NC_018643	ATT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705600
31	NC_018643	CAG	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705600
32	NC_018643	TAA	2	6	1904	1909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705600
33	NC_018643	GGT	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705600
34	NC_018643	ATT	2	6	2006	2011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705600
35	NC_018643	TGA	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705600
36	NC_018643	CAC	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705600
37	NC_018643	AGC	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705600
38	NC_018643	TGG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705600
39	NC_018643	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705600
40	NC_018643	GAA	2	6	2545	2550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705600
41	NC_018643	AGG	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705600
42	NC_018643	GCT	3	9	2635	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705600
43	NC_018643	TAA	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705601
44	NC_018643	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705601
45	NC_018643	ATG	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705601
46	NC_018643	TTC	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705601
47	NC_018643	TTA	2	6	2955	2960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705601
48	NC_018643	TTC	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705601
49	NC_018643	AAT	2	6	3041	3046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705601
50	NC_018643	AGA	2	6	3095	3100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705601
51	NC_018643	GAT	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705601
52	NC_018643	AGG	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705602
53	NC_018643	TGA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705602
54	NC_018643	ATT	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705602
55	NC_018643	AGA	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705602
56	NC_018643	ATT	2	6	4086	4091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705602
57	NC_018643	CAT	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705602
58	NC_018643	CAA	2	6	4205	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705602
59	NC_018643	AAG	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705602
60	NC_018643	AAG	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705602
61	NC_018643	ATG	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
62	NC_018643	GCA	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705603
63	NC_018643	AGT	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
64	NC_018643	CCT	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705603
65	NC_018643	AAG	2	6	4654	4659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705603
66	NC_018643	AGA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705603
67	NC_018643	ATC	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705603
68	NC_018643	TGA	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
69	NC_018643	TTG	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705603
70	NC_018643	TTA	2	6	5005	5010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705603
71	NC_018643	CAG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705603
72	NC_018643	AGA	2	6	5129	5134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705603
73	NC_018643	TGA	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
74	NC_018643	ATG	2	6	5286	5291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
75	NC_018643	ATA	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705603
76	NC_018643	CAA	2	6	5514	5519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705603
77	NC_018643	ATG	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
78	NC_018643	TGG	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705603
79	NC_018643	ATT	2	6	5796	5801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705603
80	NC_018643	GAA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705603
81	NC_018643	TCA	3	9	5835	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705603
82	NC_018643	TTG	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705603
83	NC_018643	CTT	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705603
84	NC_018643	GAT	2	6	5943	5948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705603
85	NC_018643	ATT	2	6	5968	5973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705603
86	NC_018643	GAA	2	6	6066	6071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705603
87	NC_018643	ATG	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705604
88	NC_018643	CTC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705604
89	NC_018643	ACT	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705604
90	NC_018643	ATA	2	6	6604	6609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705604
91	NC_018643	GAT	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705604
92	NC_018643	TTA	2	6	6643	6648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705604
93	NC_018643	GTA	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705604
94	NC_018643	ATC	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705604
95	NC_018643	GGA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705604
96	NC_018643	ATG	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705604
97	NC_018643	AGA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705604
98	NC_018643	TGA	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705604
99	NC_018643	TGT	2	6	7374	7379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705604
100	NC_018643	AGC	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705604
101	NC_018643	ATA	2	6	7507	7512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705604
102	NC_018643	AGG	2	6	7518	7523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705604
103	NC_018643	ATC	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705604
104	NC_018643	GCA	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705604
105	NC_018643	GTT	2	6	7591	7596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705604
106	NC_018643	TGA	2	6	7605	7610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705604
107	NC_018643	AGA	2	6	8024	8029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705605
108	NC_018643	ATT	2	6	8157	8162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705605
109	NC_018643	TGG	2	6	8168	8173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705605
110	NC_018643	TGA	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705605
111	NC_018643	TGG	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705605
112	NC_018643	AAT	2	6	8364	8369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705605
113	NC_018643	TGC	2	6	8387	8392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705605
114	NC_018643	AAG	2	6	8608	8613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705606
115	NC_018643	GAA	2	6	8714	8719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705606
116	NC_018643	GCA	2	6	8798	8803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705606
117	NC_018643	GTT	2	6	8856	8861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705606
118	NC_018643	TGA	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705606
119	NC_018643	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705606
120	NC_018643	GAA	2	6	9088	9093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705606
121	NC_018643	GGT	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705606
122	NC_018643	CTT	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705606
123	NC_018643	GAG	2	6	9245	9250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705606
124	NC_018643	ATT	2	6	9310	9315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705606
125	NC_018643	ATT	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018643	GAA	2	6	9743	9748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705607
127	NC_018643	GTT	2	6	9856	9861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705607
128	NC_018643	GGT	2	6	9916	9921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705607
129	NC_018643	GCT	2	6	9949	9954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705607
130	NC_018643	GAT	2	6	10036	10041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705607
131	NC_018643	GTT	2	6	10147	10152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705607
132	NC_018643	GGT	2	6	10177	10182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705607
133	NC_018643	TGA	2	6	10305	10310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705607
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135	NC_018643	GGA	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705607
136	NC_018643	AGC	2	6	10548	10553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705607
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255	NC_018643	TGA	2	6	18678	18683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705616
256	NC_018643	GAA	2	6	18691	18696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705616
257	NC_018643	TTG	2	6	18704	18709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705616
258	NC_018643	TTA	2	6	18898	18903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705616
259	NC_018643	AGA	2	6	18945	18950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705616
260	NC_018643	TAA	2	6	19062	19067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705616
261	NC_018643	AAG	2	6	19187	19192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705616
262	NC_018643	AAT	2	6	19311	19316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705616
263	NC_018643	TGG	2	6	19323	19328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705616
264	NC_018643	AAG	2	6	19343	19348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705616
265	NC_018643	ATC	2	6	19449	19454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705616
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272	NC_018643	TGG	2	6	19829	19834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705616
273	NC_018643	AGT	2	6	19875	19880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705616
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276	NC_018643	TTA	2	6	20122	20127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705616
277	NC_018643	GTG	2	6	20234	20239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705616
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281	NC_018643	TAG	2	6	20612	20617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705616
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284	NC_018643	TCT	2	6	20782	20787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705616
285	NC_018643	ATA	2	6	20825	20830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705616
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288	NC_018643	ATA	2	6	20914	20919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705616
289	NC_018643	TAG	2	6	20966	20971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705616
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