MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 19299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018643	CTG	2	6	248420	248425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705851
3502	NC_018643	GAT	2	6	248482	248487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705851
3503	NC_018643	GAT	2	6	248527	248532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705851
3504	NC_018643	CAG	2	6	248549	248554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705851
3505	NC_018643	TGT	2	6	248559	248564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705851
3506	NC_018643	GAT	2	6	248659	248664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705851
3507	NC_018643	CAA	2	6	248705	248710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705851
3508	NC_018643	TGT	2	6	248745	248750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705851
3509	NC_018643	CTA	2	6	248796	248801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705852
3510	NC_018643	GAA	2	6	248823	248828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705852
3511	NC_018643	CAT	2	6	248901	248906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705852
3512	NC_018643	CAG	2	6	248916	248921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705852
3513	NC_018643	ATT	2	6	249055	249060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705852
3514	NC_018643	CTT	2	6	249419	249424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705852
3515	NC_018643	ATT	2	6	249564	249569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705853
3516	NC_018643	TGG	2	6	249615	249620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705853
3517	NC_018643	CAT	2	6	249671	249676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705853
3518	NC_018643	TCC	2	6	249681	249686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705853
3519	NC_018643	ACA	2	6	249712	249717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705853
3520	NC_018643	ATG	2	6	249727	249732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705853
3521	NC_018643	TTA	2	6	249880	249885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705853
3522	NC_018643	GAT	2	6	250023	250028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705854
3523	NC_018643	GTA	2	6	250029	250034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705854
3524	NC_018643	TGG	3	9	250040	250048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705854
3525	NC_018643	AAT	2	6	250049	250054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705854
3526	NC_018643	AGC	2	6	250058	250063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705854
3527	NC_018643	AAG	2	6	250084	250089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705854
3528	NC_018643	AGG	2	6	250154	250159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705854
3529	NC_018643	AGA	2	6	250164	250169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705854
3530	NC_018643	TTA	2	6	250194	250199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705854
3531	NC_018643	AGA	2	6	250322	250327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705854
3532	NC_018643	ATT	2	6	250402	250407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705854
3533	NC_018643	ATG	2	6	250423	250428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705854
3534	NC_018643	ATA	2	6	250453	250458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705854
3535	NC_018643	TTA	2	6	250534	250539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705854
3536	NC_018643	GCT	2	6	250590	250595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705854
3537	NC_018643	AAC	2	6	250709	250714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705854
3538	NC_018643	GAT	2	6	250782	250787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705854
3539	NC_018643	GAT	2	6	250803	250808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705854
3540	NC_018643	GAA	2	6	250812	250817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705854
3541	NC_018643	GAA	2	6	250857	250862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705854
3542	NC_018643	TGG	2	6	250874	250879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705854
3543	NC_018643	TTA	2	6	250889	250894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705854
3544	NC_018643	TAA	2	6	251026	251031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705854
3545	NC_018643	AAG	2	6	251092	251097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705854
3546	NC_018643	GTT	2	6	251209	251214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705855
3547	NC_018643	ATT	2	6	251312	251317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705855
3548	NC_018643	TAA	2	6	251509	251514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705855
3549	NC_018643	GCA	2	6	252009	252014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705855
3550	NC_018643	CTT	2	6	252097	252102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705855
3551	NC_018643	ACC	2	6	252114	252119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705855
3552	NC_018643	GTA	2	6	252132	252137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705855
3553	NC_018643	AAG	2	6	252147	252152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705855
3554	NC_018643	AGC	2	6	252197	252202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705855
3555	NC_018643	CAC	2	6	252211	252216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705855
3556	NC_018643	AAG	2	6	252226	252231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705855
3557	NC_018643	TGA	2	6	252339	252344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705855
3558	NC_018643	GTA	2	6	252539	252544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705855
3559	NC_018643	AAC	2	6	252584	252589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705856
3560	NC_018643	GAA	2	6	252657	252662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705856
3561	NC_018643	TTC	2	6	252686	252691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3562	NC_018643	CTT	2	6	252760	252765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3563	NC_018643	TCT	2	6	252848	252853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3564	NC_018643	TTC	2	6	252913	252918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3565	NC_018643	TTG	2	6	252925	252930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3566	NC_018643	TTG	2	6	252958	252963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3567	NC_018643	TCT	2	6	253089	253094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3568	NC_018643	GAA	2	6	253148	253153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705856
3569	NC_018643	CAT	2	6	253192	253197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3570	NC_018643	CAT	2	6	253226	253231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3571	NC_018643	AGG	2	6	253271	253276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705856
3572	NC_018643	TTC	2	6	253300	253305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3573	NC_018643	AAC	2	6	253403	253408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705856
3574	NC_018643	TCT	2	6	253473	253478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3575	NC_018643	TGC	2	6	253514	253519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705856
3576	NC_018643	TGA	2	6	253632	253637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705856
3577	NC_018643	TTC	2	6	253708	253713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3578	NC_018643	CAT	2	6	253991	253996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3579	NC_018643	TTG	2	6	254108	254113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3580	NC_018643	TTG	2	6	254231	254236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3581	NC_018643	CAA	2	6	254274	254279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705856
3582	NC_018643	GCT	2	6	254301	254306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705856
3583	NC_018643	TTC	2	6	254333	254338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3584	NC_018643	AAG	2	6	254440	254445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705856
3585	NC_018643	CTT	2	6	254446	254451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3586	NC_018643	TAA	2	6	254470	254475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705856
3587	NC_018643	CAA	2	6	254581	254586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705856
3588	NC_018643	ATC	2	6	254591	254596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3589	NC_018643	AGT	2	6	254642	254647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705856
3590	NC_018643	CAG	2	6	254665	254670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705856
3591	NC_018643	CAC	2	6	254728	254733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705856
3592	NC_018643	AAG	2	6	254743	254748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705856
3593	NC_018643	AGT	2	6	254774	254779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705856
3594	NC_018643	TCA	2	6	254835	254840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3595	NC_018643	TGT	2	6	254928	254933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3596	NC_018643	ATT	2	6	254939	254944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705856
3597	NC_018643	ATT	3	9	254996	255004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705856
3598	NC_018643	ATC	2	6	255218	255223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3599	NC_018643	ATC	2	6	255367	255372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705857
3600	NC_018643	CAA	2	6	255466	255471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705857
3601	NC_018643	CTC	2	6	255580	255585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705857
3602	NC_018643	CTG	2	6	255675	255680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705857
3603	NC_018643	TCA	2	6	255710	255715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705857
3604	NC_018643	CAC	2	6	255730	255735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705857
3605	NC_018643	ACC	2	6	255736	255741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705857
3606	NC_018643	ACC	2	6	255748	255753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705857
3607	NC_018643	TCT	2	6	255773	255778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705857
3608	NC_018643	ACC	3	9	255784	255792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705857
3609	NC_018643	TTC	2	6	255796	255801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705857
3610	NC_018643	ATT	2	6	255850	255855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705857
3611	NC_018643	CAG	2	6	255888	255893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705857
3612	NC_018643	TGA	2	6	255910	255915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705857
3613	NC_018643	TAA	2	6	255934	255939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705857
3614	NC_018643	CAC	2	6	256080	256085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705857
3615	NC_018643	TAA	2	6	256156	256161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705857
3616	NC_018643	TTG	2	6	256163	256168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705857
3617	NC_018643	TCA	2	6	256244	256249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705857
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3619	NC_018643	TAA	2	6	256467	256472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705857
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3739	NC_018643	TCA	2	6	265016	265021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705867
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3977	NC_018643	AAC	2	6	280970	280975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3978	NC_018643	CTA	2	6	280981	280986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3979	NC_018643	GAT	2	6	281108	281113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705884
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3981	NC_018643	GAT	2	6	281275	281280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705885
3982	NC_018643	ATC	2	6	281298	281303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705885
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