MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 19299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018643	TAA	2	6	211292	211297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705813
3002	NC_018643	TCA	2	6	211329	211334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705813
3003	NC_018643	TGG	2	6	211386	211391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705813
3004	NC_018643	GAA	2	6	211531	211536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705813
3005	NC_018643	AAT	2	6	211573	211578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705813
3006	NC_018643	TGG	2	6	211614	211619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705813
3007	NC_018643	TGG	3	9	211740	211748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705813
3008	NC_018643	AGA	2	6	211810	211815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705813
3009	NC_018643	GTG	2	6	211826	211831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705813
3010	NC_018643	ATG	3	9	211952	211960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705813
3011	NC_018643	TAA	2	6	212009	212014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705813
3012	NC_018643	GTT	2	6	212195	212200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705813
3013	NC_018643	ACT	2	6	212245	212250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705813
3014	NC_018643	AGC	2	6	212256	212261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705813
3015	NC_018643	TAT	2	6	212333	212338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705814
3016	NC_018643	AGA	2	6	212342	212347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705814
3017	NC_018643	GAT	2	6	212391	212396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705814
3018	NC_018643	ATA	2	6	212464	212469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705814
3019	NC_018643	GCA	2	6	212603	212608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705814
3020	NC_018643	TCA	2	6	212609	212614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705814
3021	NC_018643	CAT	2	6	212619	212624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705814
3022	NC_018643	AGA	2	6	212676	212681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705814
3023	NC_018643	CAG	2	6	212854	212859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705814
3024	NC_018643	TGA	2	6	212860	212865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705814
3025	NC_018643	GTG	2	6	212887	212892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705814
3026	NC_018643	AAG	2	6	212893	212898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705814
3027	NC_018643	GTC	2	6	212918	212923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705815
3028	NC_018643	CAG	2	6	213163	213168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705815
3029	NC_018643	ATC	2	6	213179	213184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705815
3030	NC_018643	ATT	2	6	213209	213214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705815
3031	NC_018643	CAG	2	6	213497	213502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_018643	ATT	2	6	213503	213508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_018643	ATT	2	6	213526	213531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_018643	ATT	2	6	213578	213583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3035	NC_018643	ATT	2	6	213596	213601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3036	NC_018643	AGT	2	6	213681	213686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705816
3037	NC_018643	TAA	2	6	213704	213709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705816
3038	NC_018643	CCA	2	6	213714	213719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705816
3039	NC_018643	TTA	2	6	213776	213781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3040	NC_018643	ATT	2	6	213794	213799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3041	NC_018643	TAT	2	6	213969	213974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3042	NC_018643	AAT	2	6	213998	214003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705816
3043	NC_018643	GCT	2	6	214038	214043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705816
3044	NC_018643	TAT	2	6	214081	214086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3045	NC_018643	TAT	2	6	214109	214114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3046	NC_018643	TAT	3	9	214151	214159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3047	NC_018643	TTA	2	6	214179	214184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705816
3048	NC_018643	AAT	2	6	214212	214217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705816
3049	NC_018643	GAA	2	6	214257	214262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705816
3050	NC_018643	AAG	2	6	214392	214397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705816
3051	NC_018643	CGA	2	6	214736	214741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705816
3052	NC_018643	TGA	2	6	215006	215011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705817
3053	NC_018643	TAG	2	6	215047	215052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705817
3054	NC_018643	ATG	2	6	215056	215061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705817
3055	NC_018643	TAA	2	6	215099	215104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705817
3056	NC_018643	AAT	2	6	215294	215299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705817
3057	NC_018643	TGT	2	6	215329	215334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705817
3058	NC_018643	ATT	2	6	215589	215594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705817
3059	NC_018643	ATT	2	6	215640	215645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705817
3060	NC_018643	ATG	2	6	215860	215865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705818
3061	NC_018643	TAA	2	6	215906	215911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705818
3062	NC_018643	ATT	2	6	216208	216213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705818
3063	NC_018643	ATA	2	6	216247	216252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705818
3064	NC_018643	ACC	2	6	216288	216293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705818
3065	NC_018643	CAT	2	6	216309	216314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705818
3066	NC_018643	AGA	2	6	216359	216364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3067	NC_018643	GAA	3	9	216370	216378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3068	NC_018643	GTT	2	6	216419	216424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705818
3069	NC_018643	TGT	2	6	216470	216475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705818
3070	NC_018643	CAA	2	6	216504	216509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705818
3071	NC_018643	ATC	2	6	216562	216567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705818
3072	NC_018643	CTG	2	6	216625	216630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705818
3073	NC_018643	TTG	2	6	216670	216675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705818
3074	NC_018643	GAA	2	6	216717	216722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3075	NC_018643	TAT	2	6	216734	216739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705818
3076	NC_018643	ATG	2	6	216757	216762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705818
3077	NC_018643	ATA	2	6	216811	216816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705818
3078	NC_018643	CCT	2	6	216888	216893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705818
3079	NC_018643	CAA	2	6	216934	216939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705818
3080	NC_018643	CAT	2	6	216981	216986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705818
3081	NC_018643	AAC	2	6	217000	217005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705818
3082	NC_018643	AGA	2	6	217028	217033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3083	NC_018643	TTA	2	6	217050	217055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705818
3084	NC_018643	AGA	2	6	217059	217064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3085	NC_018643	GAA	2	6	217122	217127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3086	NC_018643	TTG	2	6	217141	217146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705818
3087	NC_018643	AAT	2	6	217172	217177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705818
3088	NC_018643	ATC	2	6	217231	217236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705818
3089	NC_018643	GCA	2	6	217541	217546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705819
3090	NC_018643	CAA	2	6	217554	217559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705819
3091	NC_018643	GTT	2	6	217714	217719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705819
3092	NC_018643	ATT	2	6	217746	217751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705819
3093	NC_018643	CAA	2	6	217779	217784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705819
3094	NC_018643	ATT	2	6	217793	217798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705819
3095	NC_018643	ATG	2	6	217818	217823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705819
3096	NC_018643	TGC	2	6	217984	217989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705819
3097	NC_018643	ATG	2	6	218034	218039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705819
3098	NC_018643	ATA	2	6	218085	218090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705819
3099	NC_018643	GAA	2	6	218118	218123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705819
3100	NC_018643	GGA	2	6	218186	218191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705819
3101	NC_018643	AAG	2	6	218198	218203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705819
3102	NC_018643	CAA	2	6	218271	218276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705819
3103	NC_018643	AAG	2	6	218346	218351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705819
3104	NC_018643	ATT	2	6	218376	218381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705819
3105	NC_018643	CAG	2	6	218436	218441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705820
3106	NC_018643	AGA	2	6	218452	218457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705820
3107	NC_018643	TCT	2	6	218464	218469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705820
3108	NC_018643	CAT	2	6	218607	218612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3109	NC_018643	CTG	2	6	218691	218696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705820
3110	NC_018643	TGT	2	6	218715	218720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705820
3111	NC_018643	TAA	2	6	218759	218764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3112	NC_018643	CTT	2	6	218874	218879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705820
3113	NC_018643	ACA	2	6	218924	218929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705820
3114	NC_018643	TGT	2	6	218950	218955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705820
3115	NC_018643	GTT	2	6	219054	219059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705820
3116	NC_018643	CAT	2	6	219120	219125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3117	NC_018643	TCA	2	6	219320	219325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3118	NC_018643	TCA	2	6	219353	219358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3119	NC_018643	TCA	2	6	219402	219407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3120	NC_018643	AAT	2	6	219435	219440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3121	NC_018643	TGA	2	6	219442	219447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705820
3122	NC_018643	CAT	2	6	219459	219464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3123	NC_018643	ATA	2	6	219473	219478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3124	NC_018643	ATA	2	6	219545	219550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3125	NC_018643	CAT	2	6	219555	219560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3126	NC_018643	ACA	2	6	219572	219577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705820
3127	NC_018643	AAT	2	6	219605	219610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3128	NC_018643	TTC	2	6	219713	219718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705821
3129	NC_018643	AAC	2	6	219797	219802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705821
3130	NC_018643	TCA	2	6	219807	219812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705821
3131	NC_018643	CCA	2	6	219898	219903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705821
3132	NC_018643	ATA	2	6	219924	219929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705821
3133	NC_018643	TCT	2	6	219975	219980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705821
3134	NC_018643	ACA	2	6	220161	220166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_018643	AGT	2	6	220198	220203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_018643	GAT	2	6	220272	220277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705822
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3139	NC_018643	CAT	2	6	220669	220674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705823
3140	NC_018643	ATC	2	6	220775	220780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705823
3141	NC_018643	TGA	2	6	220815	220820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705824
3142	NC_018643	TTA	2	6	220856	220861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705824
3143	NC_018643	TTG	2	6	220976	220981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705824
3144	NC_018643	AGG	2	6	220989	220994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705824
3145	NC_018643	AAC	2	6	221010	221015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705824
3146	NC_018643	TGA	2	6	221082	221087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705824
3147	NC_018643	TGA	2	6	221259	221264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705824
3148	NC_018643	ATT	2	6	221364	221369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705824
3149	NC_018643	ATA	2	6	221576	221581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705824
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3151	NC_018643	AAT	2	6	221826	221831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705825
3152	NC_018643	GAA	2	6	221871	221876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705825
3153	NC_018643	TGG	2	6	221969	221974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705825
3154	NC_018643	TGC	2	6	221978	221983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705825
3155	NC_018643	GCA	2	6	222162	222167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705825
3156	NC_018643	TTA	2	6	222204	222209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3157	NC_018643	TTA	2	6	222333	222338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3158	NC_018643	TAA	2	6	222449	222454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705825
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3235	NC_018643	GCT	2	6	227345	227350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705828
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3237	NC_018643	CAT	2	6	227448	227453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705828
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3239	NC_018643	CTT	2	6	227580	227585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705828
3240	NC_018643	CAT	2	6	227607	227612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705828
3241	NC_018643	AAT	2	6	227875	227880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705828
3242	NC_018643	AAT	2	6	227926	227931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705828
3243	NC_018643	CCA	2	6	227951	227956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705828
3244	NC_018643	TCA	2	6	228026	228031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705828
3245	NC_018643	TTG	2	6	228039	228044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705828
3246	NC_018643	ATC	2	6	228103	228108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705828
3247	NC_018643	TAA	2	6	228186	228191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705828
3248	NC_018643	TCA	2	6	228215	228220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705828
3249	NC_018643	AGA	2	6	228330	228335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_018643	TAT	2	6	228414	228419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705829
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3252	NC_018643	ATG	2	6	228510	228515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705829
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3254	NC_018643	TAT	2	6	228752	228757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705829
3255	NC_018643	ATT	2	6	228785	228790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705829
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3259	NC_018643	TGC	2	6	229147	229152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705830
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3352	NC_018643	AAT	2	6	236236	236241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705839
3353	NC_018643	ATT	2	6	236262	236267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705839
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3355	NC_018643	CCA	2	6	236446	236451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705839
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3362	NC_018643	ATT	2	6	236673	236678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3478	NC_018643	AAT	2	6	246714	246719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705849
3479	NC_018643	TGA	2	6	246791	246796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705849
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3481	NC_018643	AAG	2	6	246829	246834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705849
3482	NC_018643	AGT	2	6	246882	246887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705849
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3487	NC_018643	TGA	2	6	247453	247458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705850
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3489	NC_018643	GGT	2	6	247598	247603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705850
3490	NC_018643	ATG	2	6	247629	247634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705850
3491	NC_018643	TGA	2	6	247885	247890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705850
3492	NC_018643	TTC	2	6	247956	247961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705850
3493	NC_018643	TAA	2	6	247978	247983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705850
3494	NC_018643	ATT	2	6	248090	248095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705850
3495	NC_018643	AAT	2	6	248221	248226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_018643	AAT	2	6	248232	248237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705851
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3498	NC_018643	ATA	2	6	248288	248293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705851
3499	NC_018643	AGA	2	6	248307	248312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705851
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