MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 19299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018643	AAC	2	6	175757	175762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705781
2502	NC_018643	TCT	2	6	175801	175806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705781
2503	NC_018643	TTA	2	6	175874	175879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705781
2504	NC_018643	GCA	2	6	175922	175927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705781
2505	NC_018643	CAA	2	6	176147	176152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705781
2506	NC_018643	ATA	2	6	176226	176231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_018643	AAT	3	9	176292	176300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705782
2508	NC_018643	ATT	2	6	176355	176360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705782
2509	NC_018643	ATT	2	6	176402	176407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705782
2510	NC_018643	ATT	2	6	176434	176439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705782
2511	NC_018643	TCA	2	6	176440	176445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705782
2512	NC_018643	AAT	2	6	176448	176453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705782
2513	NC_018643	TTA	2	6	176619	176624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705782
2514	NC_018643	GAA	2	6	176705	176710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705782
2515	NC_018643	TTA	2	6	176758	176763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705782
2516	NC_018643	TTA	2	6	176839	176844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705782
2517	NC_018643	TAA	2	6	176900	176905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705782
2518	NC_018643	AAT	2	6	177007	177012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705782
2519	NC_018643	TCA	2	6	177317	177322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_018643	CTT	2	6	177413	177418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_018643	TAA	2	6	177430	177435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_018643	TAA	2	6	177690	177695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705783
2523	NC_018643	TGA	2	6	177768	177773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705783
2524	NC_018643	ATT	2	6	177782	177787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705783
2525	NC_018643	GAA	2	6	177839	177844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705783
2526	NC_018643	ATT	2	6	177861	177866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705783
2527	NC_018643	TTG	2	6	177899	177904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705783
2528	NC_018643	CAA	2	6	177935	177940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705783
2529	NC_018643	AGC	2	6	178007	178012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705783
2530	NC_018643	ACT	2	6	178088	178093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705784
2531	NC_018643	GGT	2	6	178107	178112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705784
2532	NC_018643	AGG	2	6	178115	178120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705784
2533	NC_018643	GCT	3	9	178287	178295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705784
2534	NC_018643	TGC	2	6	178352	178357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705784
2535	NC_018643	GTG	2	6	178366	178371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705784
2536	NC_018643	TGC	2	6	178385	178390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705784
2537	NC_018643	CAA	2	6	178491	178496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705784
2538	NC_018643	AAT	2	6	178608	178613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705784
2539	NC_018643	ATG	2	6	178722	178727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705784
2540	NC_018643	TGA	2	6	178799	178804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705784
2541	NC_018643	ATT	2	6	178829	178834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705784
2542	NC_018643	TGG	2	6	178847	178852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705784
2543	NC_018643	TGA	2	6	178877	178882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705784
2544	NC_018643	TTG	2	6	178981	178986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705784
2545	NC_018643	CAA	2	6	179004	179009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705784
2546	NC_018643	CAT	2	6	179095	179100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705784
2547	NC_018643	AGA	2	6	179174	179179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705784
2548	NC_018643	ATG	2	6	179190	179195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705784
2549	NC_018643	ATT	2	6	179250	179255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705784
2550	NC_018643	AAG	2	6	179299	179304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705784
2551	NC_018643	AAT	2	6	179310	179315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705784
2552	NC_018643	AGA	2	6	179327	179332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705784
2553	NC_018643	GAA	2	6	179385	179390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705784
2554	NC_018643	TTG	2	6	179439	179444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705784
2555	NC_018643	AAG	2	6	179455	179460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705784
2556	NC_018643	GAT	2	6	179463	179468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705784
2557	NC_018643	AAG	2	6	179489	179494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705784
2558	NC_018643	CCA	2	6	179533	179538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705785
2559	NC_018643	AAT	2	6	179582	179587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705785
2560	NC_018643	TTA	2	6	179593	179598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705785
2561	NC_018643	TGG	2	6	179609	179614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705785
2562	NC_018643	GGT	2	6	179643	179648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705785
2563	NC_018643	GAA	3	9	179964	179972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705785
2564	NC_018643	GAA	2	6	180000	180005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705785
2565	NC_018643	TAG	2	6	180076	180081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705785
2566	NC_018643	TAA	2	6	180164	180169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705785
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2568	NC_018643	CCA	2	6	180411	180416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705785
2569	NC_018643	GTT	2	6	180572	180577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705786
2570	NC_018643	TAC	2	6	180580	180585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705786
2571	NC_018643	TAA	2	6	180588	180593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705786
2572	NC_018643	AGA	2	6	180613	180618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705786
2573	NC_018643	TAT	2	6	180675	180680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705786
2574	NC_018643	GAA	2	6	180743	180748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705786
2575	NC_018643	TAT	2	6	180885	180890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705787
2576	NC_018643	AAT	2	6	180959	180964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705787
2577	NC_018643	TAA	3	9	181034	181042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705787
2578	NC_018643	ATT	2	6	181081	181086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705787
2579	NC_018643	TTA	2	6	181152	181157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705787
2580	NC_018643	AGA	2	6	181253	181258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705787
2581	NC_018643	TGA	3	9	181367	181375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705787
2582	NC_018643	TGA	2	6	181409	181414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705787
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2584	NC_018643	TGA	2	6	181537	181542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705787
2585	NC_018643	ATA	2	6	181560	181565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705787
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2587	NC_018643	TGA	2	6	181700	181705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705787
2588	NC_018643	AAG	2	6	181864	181869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705787
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2590	NC_018643	ACT	2	6	182013	182018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705787
2591	NC_018643	AAT	2	6	182048	182053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705787
2592	NC_018643	TGG	2	6	182060	182065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705787
2593	NC_018643	TAA	2	6	182086	182091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705787
2594	NC_018643	AGA	2	6	182112	182117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705787
2595	NC_018643	AAG	2	6	182182	182187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705787
2596	NC_018643	TGG	2	6	182225	182230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705787
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2599	NC_018643	CTT	2	6	182522	182527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705788
2600	NC_018643	ATT	2	6	182532	182537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705788
2601	NC_018643	ATG	2	6	182646	182651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705788
2602	NC_018643	ATG	2	6	182667	182672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705788
2603	NC_018643	ATT	3	9	182693	182701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705788
2604	NC_018643	TAA	2	6	182794	182799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
2605	NC_018643	TCT	2	6	182846	182851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705788
2606	NC_018643	AAT	2	6	182885	182890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
2607	NC_018643	GAA	2	6	183139	183144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705788
2608	NC_018643	TAA	2	6	183234	183239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
2609	NC_018643	AAT	2	6	183254	183259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
2610	NC_018643	TTA	2	6	183322	183327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705788
2611	NC_018643	TTG	2	6	183345	183350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705788
2612	NC_018643	TTA	2	6	183419	183424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705788
2613	NC_018643	GTT	2	6	183434	183439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705788
2614	NC_018643	AAT	2	6	183469	183474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
2615	NC_018643	GAC	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705788
2616	NC_018643	ATA	2	6	183534	183539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
2617	NC_018643	GAA	2	6	183687	183692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705788
2618	NC_018643	AAT	2	6	183943	183948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705788
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2979	NC_018643	CCA	2	6	209115	209120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705810
2980	NC_018643	ATG	2	6	209386	209391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705810
2981	NC_018643	ATC	2	6	209417	209422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705810
2982	NC_018643	ACC	2	6	209453	209458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705810
2983	NC_018643	CTT	2	6	209563	209568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705810
2984	NC_018643	TTC	2	6	209612	209617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705810
2985	NC_018643	TTA	2	6	209634	209639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705810
2986	NC_018643	TGG	2	6	209756	209761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705810
2987	NC_018643	TGC	2	6	209813	209818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705810
2988	NC_018643	AAT	2	6	209972	209977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_018643	GAT	2	6	210189	210194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705811
2990	NC_018643	TTC	3	9	210249	210257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705811
2991	NC_018643	AGC	2	6	210452	210457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705811
2992	NC_018643	TGA	2	6	210493	210498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705811
2993	NC_018643	GCT	2	6	210636	210641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705811
2994	NC_018643	GGT	2	6	210747	210752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705811
2995	NC_018643	CTT	2	6	210794	210799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705811
2996	NC_018643	CAA	2	6	210843	210848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705811
2997	NC_018643	TAA	2	6	210864	210869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705811
2998	NC_018643	TGG	3	9	211072	211080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705812
2999	NC_018643	AGA	2	6	211144	211149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705812
3000	NC_018643	TAG	2	6	211195	211200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705812

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