MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015564	TGCGC	2	10	4339	4348	0 %	20 %	40 %	40 %	333917682
2	NC_015564	CAGGG	2	10	4870	4879	20 %	0 %	60 %	20 %	333917683
3	NC_015564	GGTGA	2	10	7898	7907	20 %	20 %	60 %	0 %	333917685
4	NC_015564	GTCTC	2	10	9568	9577	0 %	40 %	20 %	40 %	333917685
5	NC_015564	GGGAC	2	10	13994	14003	20 %	0 %	60 %	20 %	333917690
6	NC_015564	CGTTG	2	10	15005	15014	0 %	40 %	40 %	20 %	333917692
7	NC_015564	GATGT	2	10	15437	15446	20 %	40 %	40 %	0 %	333917692
8	NC_015564	GCGTT	2	10	17427	17436	0 %	40 %	40 %	20 %	333917694
9	NC_015564	TTCGA	2	10	19702	19711	20 %	40 %	20 %	20 %	333917697
10	NC_015564	TTCGG	2	10	23555	23564	0 %	40 %	40 %	20 %	333917701
11	NC_015564	CCCGG	2	10	23572	23581	0 %	0 %	40 %	60 %	333917701
12	NC_015564	GGATT	2	10	23654	23663	20 %	40 %	40 %	0 %	333917701
13	NC_015564	TCAGT	2	10	23761	23770	20 %	40 %	20 %	20 %	333917702
14	NC_015564	GACCA	2	10	24037	24046	40 %	0 %	20 %	40 %	333917702
15	NC_015564	CTGGG	2	10	24175	24184	0 %	20 %	60 %	20 %	333917702
16	NC_015564	CAGCG	2	10	26610	26619	20 %	0 %	40 %	40 %	333917707
17	NC_015564	CCCGG	2	10	27936	27945	0 %	0 %	40 %	60 %	333917709
18	NC_015564	TCACG	2	10	29901	29910	20 %	20 %	20 %	40 %	333917710
19	NC_015564	TGCGC	2	10	30843	30852	0 %	20 %	40 %	40 %	333917711
20	NC_015564	CGGCG	2	10	31275	31284	0 %	0 %	60 %	40 %	333917711
21	NC_015564	CGGCC	2	10	31816	31825	0 %	0 %	40 %	60 %	333917712
22	NC_015564	GTTCT	2	10	32036	32045	0 %	60 %	20 %	20 %	333917712
23	NC_015564	GCCGG	2	10	38470	38479	0 %	0 %	60 %	40 %	333917717
24	NC_015564	GTGTG	2	10	38515	38524	0 %	40 %	60 %	0 %	333917717
25	NC_015564	GCGTC	2	10	38944	38953	0 %	20 %	40 %	40 %	333917717
26	NC_015564	CGGCC	2	10	39517	39526	0 %	0 %	40 %	60 %	333917717
27	NC_015564	GTTCC	2	10	40228	40237	0 %	40 %	20 %	40 %	333917717
28	NC_015564	GTTGC	2	10	43095	43104	0 %	40 %	40 %	20 %	333917718
29	NC_015564	CGGCA	2	10	43928	43937	20 %	0 %	40 %	40 %	333917718
30	NC_015564	GCGCG	2	10	45401	45410	0 %	0 %	60 %	40 %	333917719
31	NC_015564	GATTC	2	10	45806	45815	20 %	40 %	20 %	20 %	333917719
32	NC_015564	CGGAC	2	10	46922	46931	20 %	0 %	40 %	40 %	333917720
33	NC_015564	TCTCA	2	10	49969	49978	20 %	40 %	0 %	40 %	333917723
34	NC_015564	CGGTC	2	10	50146	50155	0 %	20 %	40 %	40 %	333917723
35	NC_015564	CGGAG	2	10	52807	52816	20 %	0 %	60 %	20 %	333917727
36	NC_015564	CTGCG	2	10	54975	54984	0 %	20 %	40 %	40 %	333917730
37	NC_015564	TGCCG	2	10	55371	55380	0 %	20 %	40 %	40 %	333917731
38	NC_015564	GCCGA	2	10	57260	57269	20 %	0 %	40 %	40 %	333917733
39	NC_015564	ACCGC	2	10	57731	57740	20 %	0 %	20 %	60 %	333917733
40	NC_015564	GCTGC	2	10	58247	58256	0 %	20 %	40 %	40 %	333917733
41	NC_015564	CATGC	2	10	59238	59247	20 %	20 %	20 %	40 %	333917734
42	NC_015564	ATCGG	2	10	63462	63471	20 %	20 %	40 %	20 %	333917738
43	NC_015564	CGCGC	2	10	65995	66004	0 %	0 %	40 %	60 %	333917741
44	NC_015564	CGCGA	2	10	66592	66601	20 %	0 %	40 %	40 %	333917742
45	NC_015564	TGTGG	2	10	67218	67227	0 %	40 %	60 %	0 %	333917742
46	NC_015564	GGGGC	2	10	67793	67802	0 %	0 %	80 %	20 %	333917744
47	NC_015564	CAGAT	2	10	68079	68088	40 %	20 %	20 %	20 %	333917744
48	NC_015564	CGGCC	2	10	70113	70122	0 %	0 %	40 %	60 %	333917748
49	NC_015564	GTCGA	2	10	70951	70960	20 %	20 %	40 %	20 %	333917750
50	NC_015564	AGCGA	2	10	71458	71467	40 %	0 %	40 %	20 %	333917750
51	NC_015564	GCCAC	2	10	72356	72365	20 %	0 %	20 %	60 %	333917750
52	NC_015564	GCACG	2	10	72825	72834	20 %	0 %	40 %	40 %	333917751
53	NC_015564	CGCCC	2	10	74490	74499	0 %	0 %	20 %	80 %	333917754
54	NC_015564	GTTCG	2	10	74903	74912	0 %	40 %	40 %	20 %	333917754
55	NC_015564	CGCTG	2	10	77172	77181	0 %	20 %	40 %	40 %	333917756
56	NC_015564	CCGGC	2	10	79277	79286	0 %	0 %	40 %	60 %	333917759
57	NC_015564	CGGCT	2	10	81502	81511	0 %	20 %	40 %	40 %	333917762
58	NC_015564	CGGAC	2	10	81930	81939	20 %	0 %	40 %	40 %	333917762
59	NC_015564	GCCCG	2	10	82651	82660	0 %	0 %	40 %	60 %	333917763
60	NC_015564	CAGGA	2	10	82795	82804	40 %	0 %	40 %	20 %	333917763
61	NC_015564	AACGG	2	10	83449	83458	40 %	0 %	40 %	20 %	333917764
62	NC_015564	CGTGA	2	10	83650	83659	20 %	20 %	40 %	20 %	333917764
63	NC_015564	GGGCT	2	10	84173	84182	0 %	20 %	60 %	20 %	333917765
64	NC_015564	GCACC	2	10	84873	84882	20 %	0 %	20 %	60 %	333917766
65	NC_015564	GCGCT	2	10	85778	85787	0 %	20 %	40 %	40 %	333917767
66	NC_015564	CGAAG	2	10	87245	87254	40 %	0 %	40 %	20 %	333917769
67	NC_015564	GAGAA	2	10	90222	90231	60 %	0 %	40 %	0 %	333917773
68	NC_015564	TGCTG	2	10	90942	90951	0 %	40 %	40 %	20 %	333917774
69	NC_015564	GCTGT	2	10	91378	91387	0 %	40 %	40 %	20 %	333917774
70	NC_015564	CGGTG	2	10	91960	91969	0 %	20 %	60 %	20 %	333917775
71	NC_015564	CGTTC	2	10	92859	92868	0 %	40 %	20 %	40 %	333917776
72	NC_015564	TGCCG	2	10	96519	96528	0 %	20 %	40 %	40 %	333917778
73	NC_015564	GTCTC	2	10	98584	98593	0 %	40 %	20 %	40 %	333917779
74	NC_015564	GTTCG	2	10	99318	99327	0 %	40 %	40 %	20 %	333917780
75	NC_015564	GGTGC	2	10	101138	101147	0 %	20 %	60 %	20 %	333917781
76	NC_015564	CGAAA	2	10	105249	105258	60 %	0 %	20 %	20 %	333917783
77	NC_015564	ACGAC	2	10	105993	106002	40 %	0 %	20 %	40 %	333917785
78	NC_015564	TGCGC	2	10	106094	106103	0 %	20 %	40 %	40 %	333917785
79	NC_015564	ACCGC	2	10	108404	108413	20 %	0 %	20 %	60 %	333917786
80	NC_015564	CACGG	2	10	110480	110489	20 %	0 %	40 %	40 %	333917787
81	NC_015564	CGTCG	2	10	110925	110934	0 %	20 %	40 %	40 %	333917787
82	NC_015564	CGAAA	2	10	111021	111030	60 %	0 %	20 %	20 %	333917787
83	NC_015564	CAGCG	2	10	113015	113024	20 %	0 %	40 %	40 %	333917787
84	NC_015564	CAGTC	2	10	116173	116182	20 %	20 %	20 %	40 %	333917789
85	NC_015564	CGCGT	2	10	116282	116291	0 %	20 %	40 %	40 %	333917789
86	NC_015564	CGAGG	2	10	117728	117737	20 %	0 %	60 %	20 %	333917789
87	NC_015564	GCGAC	2	10	122121	122130	20 %	0 %	40 %	40 %	333917790
88	NC_015564	AGGCG	2	10	123534	123543	20 %	0 %	60 %	20 %	333917792
89	NC_015564	CGCGG	2	10	123974	123983	0 %	0 %	60 %	40 %	333917794
90	NC_015564	TCGCA	2	10	126098	126107	20 %	20 %	20 %	40 %	333917794
91	NC_015564	CGGCG	2	10	126438	126447	0 %	0 %	60 %	40 %	333917795
92	NC_015564	CGGCC	2	10	128322	128331	0 %	0 %	40 %	60 %	333917797
93	NC_015564	GCCCA	2	10	129020	129029	20 %	0 %	20 %	60 %	333917797
94	NC_015564	CGCGC	2	10	131484	131493	0 %	0 %	40 %	60 %	333917802
95	NC_015564	GCCTG	2	10	131512	131521	0 %	20 %	40 %	40 %	333917802
96	NC_015564	TGCCT	2	10	131862	131871	0 %	40 %	20 %	40 %	333917803
97	NC_015564	CTTTG	2	10	138240	138249	0 %	60 %	20 %	20 %	333917809
98	NC_015564	CGGTC	2	10	140134	140143	0 %	20 %	40 %	40 %	333917811
99	NC_015564	CCACG	2	10	140315	140324	20 %	0 %	20 %	60 %	333917811
100	NC_015564	CGTCC	2	10	144334	144343	0 %	20 %	20 %	60 %	333917814
101	NC_015564	AGCTC	2	10	146590	146599	20 %	20 %	20 %	40 %	333917817
102	NC_015564	GCGTG	2	10	147343	147352	0 %	20 %	60 %	20 %	333917817
103	NC_015564	CGGTG	2	10	148444	148453	0 %	20 %	60 %	20 %	333917817
104	NC_015564	CAACG	2	10	148617	148626	40 %	0 %	20 %	40 %	333917817
105	NC_015564	GCCCT	2	10	149694	149703	0 %	20 %	20 %	60 %	333917817
106	NC_015564	CGATC	2	10	150608	150617	20 %	20 %	20 %	40 %	333917817
107	NC_015564	GACTG	2	10	151489	151498	20 %	20 %	40 %	20 %	333917817
108	NC_015564	CGGGT	2	10	153356	153365	0 %	20 %	60 %	20 %	333917817
109	NC_015564	GACTC	2	10	154401	154410	20 %	20 %	20 %	40 %	333917818
110	NC_015564	CTGGT	2	10	155566	155575	0 %	40 %	40 %	20 %	333917819
111	NC_015564	TGCAG	2	10	157265	157274	20 %	20 %	40 %	20 %	333917819
112	NC_015564	TCACA	2	10	159767	159776	40 %	20 %	0 %	40 %	333917819
113	NC_015564	GACTC	2	10	159889	159898	20 %	20 %	20 %	40 %	333917820
114	NC_015564	TGACC	2	10	160159	160168	20 %	20 %	20 %	40 %	333917821
115	NC_015564	CGTCG	2	10	160651	160660	0 %	20 %	40 %	40 %	333917821
116	NC_015564	ACGCG	2	10	162475	162484	20 %	0 %	40 %	40 %	333917823
117	NC_015564	GGGTG	2	10	164519	164528	0 %	20 %	80 %	0 %	333917824
118	NC_015564	CCTTG	2	10	164537	164546	0 %	40 %	20 %	40 %	333917824
119	NC_015564	CGGCC	2	10	164569	164578	0 %	0 %	40 %	60 %	333917824
120	NC_015564	GACGG	2	10	167251	167260	20 %	0 %	60 %	20 %	333917826
121	NC_015564	GCCAG	2	10	168606	168615	20 %	0 %	40 %	40 %	333917828
122	NC_015564	GGGCA	2	10	170081	170090	20 %	0 %	60 %	20 %	333917829
123	NC_015564	CGCGG	2	10	174516	174525	0 %	0 %	60 %	40 %	333917835
124	NC_015564	GCGTC	2	10	176256	176265	0 %	20 %	40 %	40 %	333917837
125	NC_015564	ACCCC	2	10	181509	181518	20 %	0 %	0 %	80 %	333917840
126	NC_015564	CGATC	2	10	184666	184675	20 %	20 %	20 %	40 %	333917842
127	NC_015564	GCATC	2	10	185292	185301	20 %	20 %	20 %	40 %	333917843
128	NC_015564	GCCGT	2	10	186615	186624	0 %	20 %	40 %	40 %	333917844
129	NC_015564	GCCTC	2	10	189433	189442	0 %	20 %	20 %	60 %	333917847
130	NC_015564	TACGG	2	10	189537	189546	20 %	20 %	40 %	20 %	333917847
131	NC_015564	ACACC	2	10	190730	190739	40 %	0 %	0 %	60 %	333917849
132	NC_015564	TCGAC	2	10	191791	191800	20 %	20 %	20 %	40 %	333917850
133	NC_015564	CAGCG	2	10	195701	195710	20 %	0 %	40 %	40 %	333917855
134	NC_015564	CAGCG	2	10	197732	197741	20 %	0 %	40 %	40 %	333917857
135	NC_015564	GGGGA	2	10	199090	199099	20 %	0 %	80 %	0 %	333917859
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156	NC_015564	CCGGG	2	10	234610	234619	0 %	0 %	60 %	40 %	333917898
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252	NC_015564	CAGTT	2	10	374423	374432	20 %	40 %	20 %	20 %	333918043
253	NC_015564	CGCTC	2	10	374692	374701	0 %	20 %	20 %	60 %	333918043
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255	NC_015564	CTCGT	2	10	379937	379946	0 %	40 %	20 %	40 %	333918049
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259	NC_015564	GCGCC	2	10	385649	385658	0 %	0 %	40 %	60 %	333918055
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261	NC_015564	AGACG	2	10	390080	390089	40 %	0 %	40 %	20 %	333918060
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263	NC_015564	GCTCG	2	10	392407	392416	0 %	20 %	40 %	40 %	333918063
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