MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015564	CGGGC	2	10	1591848	1591857	0 %	0 %	60 %	40 %	333919196
1002	NC_015564	ACGGG	2	10	1594093	1594102	20 %	0 %	60 %	20 %	333919198
1003	NC_015564	CTTCC	2	10	1595113	1595122	0 %	40 %	0 %	60 %	333919199
1004	NC_015564	ACCCG	2	10	1599893	1599902	20 %	0 %	20 %	60 %	333919204
1005	NC_015564	GCGTC	2	10	1600511	1600520	0 %	20 %	40 %	40 %	333919205
1006	NC_015564	GCCCT	2	10	1603659	1603668	0 %	20 %	20 %	60 %	333919208
1007	NC_015564	TGAAG	2	10	1605049	1605058	40 %	20 %	40 %	0 %	333919210
1008	NC_015564	TTTCC	2	10	1605384	1605393	0 %	60 %	0 %	40 %	333919211
1009	NC_015564	TCAGC	2	10	1605574	1605583	20 %	20 %	20 %	40 %	333919211
1010	NC_015564	GATTC	2	10	1606872	1606881	20 %	40 %	20 %	20 %	333919212
1011	NC_015564	GGGCG	2	10	1607678	1607687	0 %	0 %	80 %	20 %	333919213
1012	NC_015564	CGACT	2	10	1607940	1607949	20 %	20 %	20 %	40 %	333919213
1013	NC_015564	CGCGG	2	10	1610275	1610284	0 %	0 %	60 %	40 %	333919215
1014	NC_015564	TCCTG	2	10	1616088	1616097	0 %	40 %	20 %	40 %	333919222
1015	NC_015564	CTGGT	2	10	1616510	1616519	0 %	40 %	40 %	20 %	333919222
1016	NC_015564	CGCAT	2	10	1618527	1618536	20 %	20 %	20 %	40 %	333919224
1017	NC_015564	CGACG	2	10	1621331	1621340	20 %	0 %	40 %	40 %	333919225
1018	NC_015564	AAGTG	2	10	1623006	1623015	40 %	20 %	40 %	0 %	333919226
1019	NC_015564	GAGCA	2	10	1623447	1623456	40 %	0 %	40 %	20 %	333919227
1020	NC_015564	AAATG	2	10	1624617	1624626	60 %	20 %	20 %	0 %	333919228
1021	NC_015564	CGCGG	2	10	1624762	1624771	0 %	0 %	60 %	40 %	333919228
1022	NC_015564	ACTCG	2	10	1625107	1625116	20 %	20 %	20 %	40 %	333919229
1023	NC_015564	CGCAG	2	10	1629005	1629014	20 %	0 %	40 %	40 %	333919230
1024	NC_015564	GCGCG	2	10	1629944	1629953	0 %	0 %	60 %	40 %	333919231
1025	NC_015564	GTCGA	2	10	1630416	1630425	20 %	20 %	40 %	20 %	333919232
1026	NC_015564	CTGTC	2	10	1631137	1631146	0 %	40 %	20 %	40 %	333919232
1027	NC_015564	ACGGC	2	10	1631222	1631231	20 %	0 %	40 %	40 %	333919232
1028	NC_015564	ACTCG	2	10	1631570	1631579	20 %	20 %	20 %	40 %	333919234
1029	NC_015564	ACTGC	2	10	1632044	1632053	20 %	20 %	20 %	40 %	333919235
1030	NC_015564	GAAAC	2	10	1634689	1634698	60 %	0 %	20 %	20 %	333919238
1031	NC_015564	GGTTC	2	10	1635056	1635065	0 %	40 %	40 %	20 %	333919238
1032	NC_015564	CGGTC	2	10	1637003	1637012	0 %	20 %	40 %	40 %	333919240
1033	NC_015564	CGCGT	2	10	1640360	1640369	0 %	20 %	40 %	40 %	333919245
1034	NC_015564	GCCCG	2	10	1641157	1641166	0 %	0 %	40 %	60 %	333919246
1035	NC_015564	GACCG	2	10	1642177	1642186	20 %	0 %	40 %	40 %	333919247
1036	NC_015564	GGCGT	2	10	1643151	1643160	0 %	20 %	60 %	20 %	333919248
1037	NC_015564	CGACG	2	10	1646161	1646170	20 %	0 %	40 %	40 %	333919251
1038	NC_015564	GAAGA	2	10	1646403	1646412	60 %	0 %	40 %	0 %	333919252
1039	NC_015564	TCGAC	2	10	1647826	1647835	20 %	20 %	20 %	40 %	333919253
1040	NC_015564	CGTCG	2	10	1648467	1648476	0 %	20 %	40 %	40 %	333919254
1041	NC_015564	GAGCA	2	10	1648759	1648768	40 %	0 %	40 %	20 %	333919255
1042	NC_015564	GCGCC	2	10	1649211	1649220	0 %	0 %	40 %	60 %	333919256
1043	NC_015564	AGGCC	2	10	1651210	1651219	20 %	0 %	40 %	40 %	333919258
1044	NC_015564	CTCGT	2	10	1651292	1651301	0 %	40 %	20 %	40 %	333919258
1045	NC_015564	GCTGG	2	10	1651605	1651614	0 %	20 %	60 %	20 %	333919258
1046	NC_015564	GCTGG	2	10	1652321	1652330	0 %	20 %	60 %	20 %	333919259
1047	NC_015564	CTGAA	2	10	1653260	1653269	40 %	20 %	20 %	20 %	333919260
1048	NC_015564	CAGTC	2	10	1653413	1653422	20 %	20 %	20 %	40 %	333919260
1049	NC_015564	TCGTG	2	10	1654130	1654139	0 %	40 %	40 %	20 %	333919260
1050	NC_015564	CCACC	2	10	1659887	1659896	20 %	0 %	0 %	80 %	333919265
1051	NC_015564	CACCG	2	10	1660087	1660096	20 %	0 %	20 %	60 %	333919266
1052	NC_015564	TCGGG	2	10	1665292	1665301	0 %	20 %	60 %	20 %	333919272
1053	NC_015564	GAACT	2	10	1665924	1665933	40 %	20 %	20 %	20 %	333919273
1054	NC_015564	GAATT	2	10	1669579	1669588	40 %	40 %	20 %	0 %	333919276
1055	NC_015564	GGACG	2	10	1670649	1670658	20 %	0 %	60 %	20 %	333919276
1056	NC_015564	ACGCG	2	10	1671651	1671660	20 %	0 %	40 %	40 %	333919277
1057	NC_015564	GGCGC	2	10	1671785	1671794	0 %	0 %	60 %	40 %	333919277
1058	NC_015564	AGGGC	2	10	1673212	1673221	20 %	0 %	60 %	20 %	333919278
1059	NC_015564	GACGG	2	10	1673736	1673745	20 %	0 %	60 %	20 %	333919279
1060	NC_015564	GCTGC	2	10	1673911	1673920	0 %	20 %	40 %	40 %	333919279
1061	NC_015564	CTGGG	2	10	1677147	1677156	0 %	20 %	60 %	20 %	333919283
1062	NC_015564	CGTCG	2	10	1677383	1677392	0 %	20 %	40 %	40 %	333919283
1063	NC_015564	TCGCC	2	10	1677466	1677475	0 %	20 %	20 %	60 %	333919283
1064	NC_015564	TGTTC	2	10	1677890	1677899	0 %	60 %	20 %	20 %	333919283
1065	NC_015564	GGCCT	2	10	1678143	1678152	0 %	20 %	40 %	40 %	333919283
1066	NC_015564	GCTCA	2	10	1678564	1678573	20 %	20 %	20 %	40 %	333919283
1067	NC_015564	GGGAT	2	10	1681824	1681833	20 %	20 %	60 %	0 %	333919286
1068	NC_015564	GTGCG	2	10	1681938	1681947	0 %	20 %	60 %	20 %	333919287
1069	NC_015564	GCCAC	2	10	1683216	1683225	20 %	0 %	20 %	60 %	333919288
1070	NC_015564	GCGCC	2	10	1683228	1683237	0 %	0 %	40 %	60 %	333919288
1071	NC_015564	GCTGA	2	10	1688373	1688382	20 %	20 %	40 %	20 %	333919293
1072	NC_015564	GTACG	2	10	1690345	1690354	20 %	20 %	40 %	20 %	333919296
1073	NC_015564	ACGAT	2	10	1690614	1690623	40 %	20 %	20 %	20 %	333919296
1074	NC_015564	GTCTC	2	10	1692115	1692124	0 %	40 %	20 %	40 %	333919297
1075	NC_015564	TCCGC	2	10	1692490	1692499	0 %	20 %	20 %	60 %	333919298
1076	NC_015564	GCCTG	2	10	1694037	1694046	0 %	20 %	40 %	40 %	333919299
1077	NC_015564	GCCTT	2	10	1694551	1694560	0 %	40 %	20 %	40 %	333919300
1078	NC_015564	CGTGC	2	10	1695929	1695938	0 %	20 %	40 %	40 %	333919302
1079	NC_015564	GTGAT	2	10	1699276	1699285	20 %	40 %	40 %	0 %	333919305
1080	NC_015564	CCGGT	2	10	1703224	1703233	0 %	20 %	40 %	40 %	333919308
1081	NC_015564	GACGC	2	10	1703726	1703735	20 %	0 %	40 %	40 %	333919308
1082	NC_015564	AAACT	2	10	1705310	1705319	60 %	20 %	0 %	20 %	333919310
1083	NC_015564	TGCTC	2	10	1707863	1707872	0 %	40 %	20 %	40 %	333919314
1084	NC_015564	GTGCC	2	10	1709528	1709537	0 %	20 %	40 %	40 %	333919316
1085	NC_015564	CATCG	2	10	1710847	1710856	20 %	20 %	20 %	40 %	333919316
1086	NC_015564	ATGCG	2	10	1714249	1714258	20 %	20 %	40 %	20 %	333919319
1087	NC_015564	ACCTG	2	10	1715000	1715009	20 %	20 %	20 %	40 %	333919320
1088	NC_015564	CGCTG	2	10	1715552	1715561	0 %	20 %	40 %	40 %	333919321
1089	NC_015564	GCGGA	2	10	1715873	1715882	20 %	0 %	60 %	20 %	333919321
1090	NC_015564	CGGCA	2	10	1716060	1716069	20 %	0 %	40 %	40 %	333919321
1091	NC_015564	CAGCT	2	10	1716223	1716232	20 %	20 %	20 %	40 %	333919321
1092	NC_015564	GGTTG	2	10	1716878	1716887	0 %	40 %	60 %	0 %	333919322
1093	NC_015564	TGTGG	2	10	1717478	1717487	0 %	40 %	60 %	0 %	333919322
1094	NC_015564	GGTCT	2	10	1717572	1717581	0 %	40 %	40 %	20 %	333919322
1095	NC_015564	CGATC	2	10	1721915	1721924	20 %	20 %	20 %	40 %	333919326
1096	NC_015564	CAGGA	2	10	1723157	1723166	40 %	0 %	40 %	20 %	333919328
1097	NC_015564	CGGTT	2	10	1724173	1724182	0 %	40 %	40 %	20 %	333919329
1098	NC_015564	CGTCG	2	10	1726261	1726270	0 %	20 %	40 %	40 %	333919331
1099	NC_015564	TCCCG	2	10	1729762	1729771	0 %	20 %	20 %	60 %	333919332
1100	NC_015564	CGCTG	2	10	1730165	1730174	0 %	20 %	40 %	40 %	333919332
1101	NC_015564	GCATG	2	10	1733686	1733695	20 %	20 %	40 %	20 %	333919336
1102	NC_015564	CCACT	2	10	1736697	1736706	20 %	20 %	0 %	60 %	333919339
1103	NC_015564	ACGCC	2	10	1742317	1742326	20 %	0 %	20 %	60 %	333919343
1104	NC_015564	GCCGC	2	10	1742614	1742623	0 %	0 %	40 %	60 %	333919343
1105	NC_015564	GGGCC	2	10	1746546	1746555	0 %	0 %	60 %	40 %	333919346
1106	NC_015564	CCCAG	2	10	1747328	1747337	20 %	0 %	20 %	60 %	333919347
1107	NC_015564	GGCCG	2	10	1747473	1747482	0 %	0 %	60 %	40 %	333919347
1108	NC_015564	TCGCG	2	10	1747642	1747651	0 %	20 %	40 %	40 %	333919347
1109	NC_015564	GTCGG	2	10	1748436	1748445	0 %	20 %	60 %	20 %	333919348
1110	NC_015564	GCCGC	2	10	1748819	1748828	0 %	0 %	40 %	60 %	333919348
1111	NC_015564	CATGT	2	10	1749838	1749847	20 %	40 %	20 %	20 %	333919349
1112	NC_015564	TCAGC	2	10	1749945	1749954	20 %	20 %	20 %	40 %	333919349
1113	NC_015564	GATCC	2	10	1750461	1750470	20 %	20 %	20 %	40 %	333919350
1114	NC_015564	TGCGC	2	10	1752223	1752232	0 %	20 %	40 %	40 %	333919351
1115	NC_015564	ATCGG	2	10	1754556	1754565	20 %	20 %	40 %	20 %	333919355
1116	NC_015564	GATCA	2	10	1755144	1755153	40 %	20 %	20 %	20 %	333919355
1117	NC_015564	TCGAT	2	10	1757783	1757792	20 %	40 %	20 %	20 %	333919356
1118	NC_015564	GCCGG	2	10	1759208	1759217	0 %	0 %	60 %	40 %	333919358
1119	NC_015564	CGCGG	2	10	1760011	1760020	0 %	0 %	60 %	40 %	333919358
1120	NC_015564	GCGCA	2	10	1760236	1760245	20 %	0 %	40 %	40 %	333919359
1121	NC_015564	CTTCA	2	10	1760616	1760625	20 %	40 %	0 %	40 %	333919360
1122	NC_015564	CGCTG	2	10	1761742	1761751	0 %	20 %	40 %	40 %	333919362
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1124	NC_015564	CGTGG	2	10	1764430	1764439	0 %	20 %	60 %	20 %	333919365
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1493	NC_015564	CGTTC	2	10	2255570	2255579	0 %	40 %	20 %	40 %	333919841
1494	NC_015564	CGCTG	2	10	2255813	2255822	0 %	20 %	40 %	40 %	333919841
1495	NC_015564	GAGCG	2	10	2256253	2256262	20 %	0 %	60 %	20 %	333919841
1496	NC_015564	CGCGA	2	10	2256694	2256703	20 %	0 %	40 %	40 %	333919842
1497	NC_015564	AAGCA	2	10	2258295	2258304	60 %	0 %	20 %	20 %	333919845
1498	NC_015564	CCCCG	2	10	2258720	2258729	0 %	0 %	20 %	80 %	333919845
1499	NC_015564	CCGAA	2	10	2261894	2261903	40 %	0 %	20 %	40 %	333919851
1500	NC_015564	TGTCG	2	10	2262542	2262551	0 %	40 %	40 %	20 %	333919852

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