MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015564	CGGGC	2	10	815142	815151	0 %	0 %	60 %	40 %	333918457
502	NC_015564	TCGGA	2	10	815931	815940	20 %	20 %	40 %	20 %	333918457
503	NC_015564	TGAGT	2	10	816715	816724	20 %	40 %	40 %	0 %	333918458
504	NC_015564	TTCGG	2	10	818809	818818	0 %	40 %	40 %	20 %	333918461
505	NC_015564	GACCC	2	10	819256	819265	20 %	0 %	20 %	60 %	333918461
506	NC_015564	GCGCT	2	10	820830	820839	0 %	20 %	40 %	40 %	333918462
507	NC_015564	GGCGC	2	10	824543	824552	0 %	0 %	60 %	40 %	333918466
508	NC_015564	CGCGG	2	10	825502	825511	0 %	0 %	60 %	40 %	333918466
509	NC_015564	AAAGG	2	10	828172	828181	60 %	0 %	40 %	0 %	333918469
510	NC_015564	GTTCT	2	10	832599	832608	0 %	60 %	20 %	20 %	333918471
511	NC_015564	GCACG	2	10	833475	833484	20 %	0 %	40 %	40 %	333918472
512	NC_015564	CGCTG	2	10	833816	833825	0 %	20 %	40 %	40 %	333918472
513	NC_015564	AGCGC	2	10	836674	836683	20 %	0 %	40 %	40 %	333918475
514	NC_015564	TGGGG	2	10	837687	837696	0 %	20 %	80 %	0 %	333918477
515	NC_015564	TGGTG	2	10	840675	840684	0 %	40 %	60 %	0 %	333918479
516	NC_015564	CGTTC	2	10	841620	841629	0 %	40 %	20 %	40 %	333918482
517	NC_015564	CCTCG	2	10	847008	847017	0 %	20 %	20 %	60 %	333918488
518	NC_015564	CGTCG	2	10	847200	847209	0 %	20 %	40 %	40 %	333918488
519	NC_015564	GCGCC	2	10	847484	847493	0 %	0 %	40 %	60 %	333918488
520	NC_015564	GCCAC	2	10	848746	848755	20 %	0 %	20 %	60 %	333918489
521	NC_015564	CCAGT	2	10	849884	849893	20 %	20 %	20 %	40 %	333918490
522	NC_015564	GCTGC	2	10	850706	850715	0 %	20 %	40 %	40 %	333918491
523	NC_015564	CGAAC	2	10	851798	851807	40 %	0 %	20 %	40 %	333918492
524	NC_015564	CGGCC	2	10	854988	854997	0 %	0 %	40 %	60 %	333918493
525	NC_015564	TGATC	2	10	856034	856043	20 %	40 %	20 %	20 %	333918494
526	NC_015564	ACAGA	2	10	857420	857429	60 %	0 %	20 %	20 %	333918494
527	NC_015564	ATGGG	2	10	859950	859959	20 %	20 %	60 %	0 %	333918499
528	NC_015564	GCCGC	2	10	864166	864175	0 %	0 %	40 %	60 %	333918505
529	NC_015564	GTCGC	2	10	864442	864451	0 %	20 %	40 %	40 %	333918505
530	NC_015564	GGTCG	2	10	867201	867210	0 %	20 %	60 %	20 %	333918510
531	NC_015564	GGGCC	2	10	867820	867829	0 %	0 %	60 %	40 %	333918510
532	NC_015564	GCGGG	2	10	870474	870483	0 %	0 %	80 %	20 %	333918514
533	NC_015564	TTGCG	2	10	871061	871070	0 %	40 %	40 %	20 %	333918515
534	NC_015564	CTCGC	2	10	871830	871839	0 %	20 %	20 %	60 %	333918517
535	NC_015564	ACCCC	2	10	872154	872163	20 %	0 %	0 %	80 %	333918518
536	NC_015564	GAACG	2	10	872685	872694	40 %	0 %	40 %	20 %	333918518
537	NC_015564	AGCTG	2	10	874812	874821	20 %	20 %	40 %	20 %	333918521
538	NC_015564	GATTC	2	10	875246	875255	20 %	40 %	20 %	20 %	333918521
539	NC_015564	CGGAC	2	10	877231	877240	20 %	0 %	40 %	40 %	333918523
540	NC_015564	GCCGA	2	10	880598	880607	20 %	0 %	40 %	40 %	333918527
541	NC_015564	AGCCG	2	10	881497	881506	20 %	0 %	40 %	40 %	333918527
542	NC_015564	CCAGC	2	10	884485	884494	20 %	0 %	20 %	60 %	333918530
543	NC_015564	CGTGC	2	10	886446	886455	0 %	20 %	40 %	40 %	333918532
544	NC_015564	CACCG	2	10	886607	886616	20 %	0 %	20 %	60 %	333918532
545	NC_015564	CTGGG	2	10	889255	889264	0 %	20 %	60 %	20 %	333918536
546	NC_015564	GCTTG	2	10	890689	890698	0 %	40 %	40 %	20 %	333918537
547	NC_015564	GGAGG	2	10	891674	891683	20 %	0 %	80 %	0 %	333918540
548	NC_015564	ATCGC	2	10	891809	891818	20 %	20 %	20 %	40 %	333918540
549	NC_015564	TTCTC	2	10	892030	892039	0 %	60 %	0 %	40 %	333918540
550	NC_015564	CGGGG	2	10	892264	892273	0 %	0 %	80 %	20 %	333918540
551	NC_015564	CACGA	2	10	894357	894366	40 %	0 %	20 %	40 %	333918542
552	NC_015564	GCCCG	2	10	896024	896033	0 %	0 %	40 %	60 %	333918544
553	NC_015564	CGAAC	2	10	896401	896410	40 %	0 %	20 %	40 %	333918544
554	NC_015564	GACGC	2	10	899699	899708	20 %	0 %	40 %	40 %	333918547
555	NC_015564	CTTCG	2	10	900029	900038	0 %	40 %	20 %	40 %	333918547
556	NC_015564	CCGCG	2	10	901114	901123	0 %	0 %	40 %	60 %	333918548
557	NC_015564	GCCGC	2	10	902572	902581	0 %	0 %	40 %	60 %	333918550
558	NC_015564	CATTT	2	10	904590	904599	20 %	60 %	0 %	20 %	333918552
559	NC_015564	GGCAT	2	10	904876	904885	20 %	20 %	40 %	20 %	333918552
560	NC_015564	CGGCT	2	10	905773	905782	0 %	20 %	40 %	40 %	333918553
561	NC_015564	ATCGA	2	10	906388	906397	40 %	20 %	20 %	20 %	333918554
562	NC_015564	AGGAG	2	10	906476	906485	40 %	0 %	60 %	0 %	333918554
563	NC_015564	TGCGC	2	10	907665	907674	0 %	20 %	40 %	40 %	333918556
564	NC_015564	GTTCG	2	10	908003	908012	0 %	40 %	40 %	20 %	333918557
565	NC_015564	GTCGC	2	10	908036	908045	0 %	20 %	40 %	40 %	333918557
566	NC_015564	CGGCG	2	10	909382	909391	0 %	0 %	60 %	40 %	333918557
567	NC_015564	GGGGC	2	10	909649	909658	0 %	0 %	80 %	20 %	333918557
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569	NC_015564	ATCTC	2	10	910996	911005	20 %	40 %	0 %	40 %	333918559
570	NC_015564	GCCTC	2	10	911599	911608	0 %	20 %	20 %	60 %	333918559
571	NC_015564	TCGGT	2	10	911746	911755	0 %	40 %	40 %	20 %	333918559
572	NC_015564	GCGTG	2	10	913516	913525	0 %	20 %	60 %	20 %	333918560
573	NC_015564	TGGCG	2	10	913681	913690	0 %	20 %	60 %	20 %	333918561
574	NC_015564	CGGCA	2	10	920242	920251	20 %	0 %	40 %	40 %	333918568
575	NC_015564	GTCGT	2	10	921305	921314	0 %	40 %	40 %	20 %	333918569
576	NC_015564	CGGTT	2	10	922014	922023	0 %	40 %	40 %	20 %	333918569
577	NC_015564	CGAGG	2	10	923349	923358	20 %	0 %	60 %	20 %	333918571
578	NC_015564	GGTGA	2	10	926079	926088	20 %	20 %	60 %	0 %	333918573
579	NC_015564	GGATC	2	10	926121	926130	20 %	20 %	40 %	20 %	333918573
580	NC_015564	GCGAA	2	10	927882	927891	40 %	0 %	40 %	20 %	333918574
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582	NC_015564	GCACG	2	10	929767	929776	20 %	0 %	40 %	40 %	333918576
583	NC_015564	CGCGC	2	10	931132	931141	0 %	0 %	40 %	60 %	333918578
584	NC_015564	CGAAA	2	10	931367	931376	60 %	0 %	20 %	20 %	333918578
585	NC_015564	ATCAC	2	10	932766	932775	40 %	20 %	0 %	40 %	333918580
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589	NC_015564	CCACC	2	10	941122	941131	20 %	0 %	0 %	80 %	333918586
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591	NC_015564	TGCGC	2	10	943336	943345	0 %	20 %	40 %	40 %	333918589
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593	NC_015564	TGCGG	2	10	946207	946216	0 %	20 %	60 %	20 %	333918592
594	NC_015564	GGCTG	2	10	946258	946267	0 %	20 %	60 %	20 %	333918592
595	NC_015564	CCGGC	2	10	951808	951817	0 %	0 %	40 %	60 %	333918597
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598	NC_015564	CGGCC	2	10	954614	954623	0 %	0 %	40 %	60 %	333918600
599	NC_015564	GGACT	2	10	955574	955583	20 %	20 %	40 %	20 %	333918600
600	NC_015564	AATCG	2	10	957831	957840	40 %	20 %	20 %	20 %	333918602
601	NC_015564	TGCGC	2	10	958163	958172	0 %	20 %	40 %	40 %	333918602
602	NC_015564	TGCAG	2	10	960670	960679	20 %	20 %	40 %	20 %	333918604
603	NC_015564	GCAGC	2	10	962282	962291	20 %	0 %	40 %	40 %	333918606
604	NC_015564	GGCCG	2	10	962635	962644	0 %	0 %	60 %	40 %	333918606
605	NC_015564	CGGAT	2	10	962719	962728	20 %	20 %	40 %	20 %	333918606
606	NC_015564	CATCG	2	10	963105	963114	20 %	20 %	20 %	40 %	333918606
607	NC_015564	GAGCA	2	10	963932	963941	40 %	0 %	40 %	20 %	333918607
608	NC_015564	GCCGT	2	10	964869	964878	0 %	20 %	40 %	40 %	333918608
609	NC_015564	GCCGA	2	10	965402	965411	20 %	0 %	40 %	40 %	333918610
610	NC_015564	CGGGC	2	10	968202	968211	0 %	0 %	60 %	40 %	333918612
611	NC_015564	TGCGA	2	10	971877	971886	20 %	20 %	40 %	20 %	333918615
612	NC_015564	TGACG	2	10	973532	973541	20 %	20 %	40 %	20 %	333918617
613	NC_015564	CGGGC	2	10	973981	973990	0 %	0 %	60 %	40 %	333918617
614	NC_015564	TTCGA	2	10	974252	974261	20 %	40 %	20 %	20 %	333918618
615	NC_015564	GGTGC	2	10	978635	978644	0 %	20 %	60 %	20 %	333918622
616	NC_015564	ACCAA	2	10	980204	980213	60 %	0 %	0 %	40 %	333918623
617	NC_015564	GGATG	2	10	982667	982676	20 %	20 %	60 %	0 %	333918626
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619	NC_015564	CTTTG	2	10	984784	984793	0 %	60 %	20 %	20 %	333918629
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621	NC_015564	CCTCG	2	10	986170	986179	0 %	20 %	20 %	60 %	333918630
622	NC_015564	GTGCA	2	10	989434	989443	20 %	20 %	40 %	20 %	333918635
623	NC_015564	AGCGG	2	10	992979	992988	20 %	0 %	60 %	20 %	333918637
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625	NC_015564	GCAGG	2	10	993688	993697	20 %	0 %	60 %	20 %	333918638
626	NC_015564	ACCGA	2	10	995003	995012	40 %	0 %	20 %	40 %	333918639
627	NC_015564	GGCCA	2	10	996139	996148	20 %	0 %	40 %	40 %	333918639
628	NC_015564	GAATG	2	10	997723	997732	40 %	20 %	40 %	0 %	333918642
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997	NC_015564	CGGCG	2	10	1580453	1580462	0 %	0 %	60 %	40 %	333919189
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