MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 3235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015564	ATGCC	2	10	2264324	2264333	20 %	20 %	20 %	40 %	333919854
1502	NC_015564	GGTCA	2	10	2272517	2272526	20 %	20 %	40 %	20 %	333919866
1503	NC_015564	GCGAT	2	10	2273426	2273435	20 %	20 %	40 %	20 %	333919867
1504	NC_015564	AACGC	2	10	2273701	2273710	40 %	0 %	20 %	40 %	333919868
1505	NC_015564	CTGAC	2	10	2273824	2273833	20 %	20 %	20 %	40 %	333919868
1506	NC_015564	ATCGG	2	10	2274151	2274160	20 %	20 %	40 %	20 %	333919868
1507	NC_015564	CCGGC	2	10	2275135	2275144	0 %	0 %	40 %	60 %	333919869
1508	NC_015564	CTGCT	2	10	2275368	2275377	0 %	40 %	20 %	40 %	333919869
1509	NC_015564	GAGCG	2	10	2275534	2275543	20 %	0 %	60 %	20 %	333919869
1510	NC_015564	GCGCC	2	10	2277793	2277802	0 %	0 %	40 %	60 %	333919871
1511	NC_015564	GGGCA	2	10	2280375	2280384	20 %	0 %	60 %	20 %	333919874
1512	NC_015564	ATCTC	2	10	2281672	2281681	20 %	40 %	0 %	40 %	333919875
1513	NC_015564	CACGC	2	10	2282159	2282168	20 %	0 %	20 %	60 %	333919875
1514	NC_015564	CATCA	2	10	2283172	2283181	40 %	20 %	0 %	40 %	333919877
1515	NC_015564	TCGAC	2	10	2286368	2286377	20 %	20 %	20 %	40 %	333919881
1516	NC_015564	ACTGC	2	10	2286610	2286619	20 %	20 %	20 %	40 %	333919881
1517	NC_015564	CTCGC	2	10	2289668	2289677	0 %	20 %	20 %	60 %	333919884
1518	NC_015564	CGTCA	2	10	2293108	2293117	20 %	20 %	20 %	40 %	333919889
1519	NC_015564	GACGC	2	10	2294056	2294065	20 %	0 %	40 %	40 %	333919890
1520	NC_015564	CGGCG	2	10	2296154	2296163	0 %	0 %	60 %	40 %	333919892
1521	NC_015564	ACGTC	2	10	2297633	2297642	20 %	20 %	20 %	40 %	333919893
1522	NC_015564	GGATT	2	10	2298213	2298222	20 %	40 %	40 %	0 %	333919894
1523	NC_015564	GGATC	2	10	2299684	2299693	20 %	20 %	40 %	20 %	333919895
1524	NC_015564	GATCA	2	10	2302821	2302830	40 %	20 %	20 %	20 %	333919898
1525	NC_015564	GGATG	2	10	2303182	2303191	20 %	20 %	60 %	0 %	333919898
1526	NC_015564	ACCGT	2	10	2303632	2303641	20 %	20 %	20 %	40 %	333919898
1527	NC_015564	CAGCC	2	10	2304706	2304715	20 %	0 %	20 %	60 %	333919899
1528	NC_015564	TCGCC	2	10	2305153	2305162	0 %	20 %	20 %	60 %	333919899
1529	NC_015564	TTGCC	2	10	2305195	2305204	0 %	40 %	20 %	40 %	333919899
1530	NC_015564	CGGCC	2	10	2307638	2307647	0 %	0 %	40 %	60 %	333919901
1531	NC_015564	AGGAG	2	10	2309344	2309353	40 %	0 %	60 %	0 %	333919903
1532	NC_015564	GACAG	2	10	2309530	2309539	40 %	0 %	40 %	20 %	333919903
1533	NC_015564	CCTCG	2	10	2309995	2310004	0 %	20 %	20 %	60 %	333919904
1534	NC_015564	GCCGA	2	10	2311816	2311825	20 %	0 %	40 %	40 %	333919905
1535	NC_015564	GCCCA	2	10	2313984	2313993	20 %	0 %	20 %	60 %	333919907
1536	NC_015564	CGATG	2	10	2315241	2315250	20 %	20 %	40 %	20 %	333919908
1537	NC_015564	CACCC	2	10	2316413	2316422	20 %	0 %	0 %	80 %	333919909
1538	NC_015564	GGCAT	2	10	2316595	2316604	20 %	20 %	40 %	20 %	333919909
1539	NC_015564	AGGGC	2	10	2317022	2317031	20 %	0 %	60 %	20 %	333919909
1540	NC_015564	GAACG	2	10	2319550	2319559	40 %	0 %	40 %	20 %	333919912
1541	NC_015564	TTCTG	2	10	2325464	2325473	0 %	60 %	20 %	20 %	333919917
1542	NC_015564	CGACC	2	10	2326028	2326037	20 %	0 %	20 %	60 %	333919918
1543	NC_015564	TCGGC	2	10	2329927	2329936	0 %	20 %	40 %	40 %	333919925
1544	NC_015564	GGCGG	2	10	2330623	2330632	0 %	0 %	80 %	20 %	333919925
1545	NC_015564	CGTCG	2	10	2331200	2331209	0 %	20 %	40 %	40 %	333919926
1546	NC_015564	CGACC	2	10	2333217	2333226	20 %	0 %	20 %	60 %	333919928
1547	NC_015564	GAGAT	2	10	2333314	2333323	40 %	20 %	40 %	0 %	333919928
1548	NC_015564	ACCGA	2	10	2333514	2333523	40 %	0 %	20 %	40 %	333919928
1549	NC_015564	AGTGG	2	10	2334275	2334284	20 %	20 %	60 %	0 %	333919928
1550	NC_015564	TCCGG	2	10	2337230	2337239	0 %	20 %	40 %	40 %	333919931
1551	NC_015564	TGCGG	2	10	2347032	2347041	0 %	20 %	60 %	20 %	333919943
1552	NC_015564	CGGAT	2	10	2350837	2350846	20 %	20 %	40 %	20 %	333919947
1553	NC_015564	GCTGC	2	10	2351160	2351169	0 %	20 %	40 %	40 %	333919947
1554	NC_015564	CTCGC	2	10	2352362	2352371	0 %	20 %	20 %	60 %	333919949
1555	NC_015564	GCCGC	2	10	2352458	2352467	0 %	0 %	40 %	60 %	333919949
1556	NC_015564	CGGAT	2	10	2352487	2352496	20 %	20 %	40 %	20 %	333919949
1557	NC_015564	TCGAA	2	10	2355161	2355170	40 %	20 %	20 %	20 %	333919954
1558	NC_015564	TTTGG	2	10	2356667	2356676	0 %	60 %	40 %	0 %	333919957
1559	NC_015564	GCTTC	2	10	2358050	2358059	0 %	40 %	20 %	40 %	333919958
1560	NC_015564	CGCGC	2	10	2358312	2358321	0 %	0 %	40 %	60 %	333919958
1561	NC_015564	CTGAC	2	10	2360187	2360196	20 %	20 %	20 %	40 %	333919959
1562	NC_015564	TGGGC	2	10	2363219	2363228	0 %	20 %	60 %	20 %	333919963
1563	NC_015564	CTGCG	2	10	2364675	2364684	0 %	20 %	40 %	40 %	333919965
1564	NC_015564	TTGAT	2	10	2364826	2364835	20 %	60 %	20 %	0 %	333919965
1565	NC_015564	CAGCG	2	10	2365694	2365703	20 %	0 %	40 %	40 %	333919966
1566	NC_015564	CGCTG	2	10	2368719	2368728	0 %	20 %	40 %	40 %	333919971
1567	NC_015564	TGGCG	2	10	2369380	2369389	0 %	20 %	60 %	20 %	333919971
1568	NC_015564	CGCAC	2	10	2369646	2369655	20 %	0 %	20 %	60 %	333919971
1569	NC_015564	TGACC	2	10	2373155	2373164	20 %	20 %	20 %	40 %	333919974
1570	NC_015564	CCGGC	2	10	2376796	2376805	0 %	0 %	40 %	60 %	333919979
1571	NC_015564	AGCAA	2	10	2377077	2377086	60 %	0 %	20 %	20 %	333919979
1572	NC_015564	CCCCG	2	10	2377466	2377475	0 %	0 %	20 %	80 %	333919980
1573	NC_015564	CCGCG	2	10	2381043	2381052	0 %	0 %	40 %	60 %	333919984
1574	NC_015564	AGGCG	2	10	2381376	2381385	20 %	0 %	60 %	20 %	333919984
1575	NC_015564	GACCA	2	10	2382268	2382277	40 %	0 %	20 %	40 %	333919984
1576	NC_015564	GGTGA	2	10	2382549	2382558	20 %	20 %	60 %	0 %	333919985
1577	NC_015564	GAACG	2	10	2382661	2382670	40 %	0 %	40 %	20 %	333919985
1578	NC_015564	AGCTT	2	10	2385425	2385434	20 %	40 %	20 %	20 %	333919989
1579	NC_015564	TGTCG	2	10	2390020	2390029	0 %	40 %	40 %	20 %	333919994
1580	NC_015564	CCCCA	2	10	2390895	2390904	20 %	0 %	0 %	80 %	333919994
1581	NC_015564	ACGTG	2	10	2391664	2391673	20 %	20 %	40 %	20 %	333919995
1582	NC_015564	GGCCT	2	10	2396645	2396654	0 %	20 %	40 %	40 %	333919999
1583	NC_015564	GCTTG	2	10	2397217	2397226	0 %	40 %	40 %	20 %	333920000
1584	NC_015564	CTGCC	2	10	2398211	2398220	0 %	20 %	20 %	60 %	333920001
1585	NC_015564	GACCT	2	10	2399763	2399772	20 %	20 %	20 %	40 %	333920002
1586	NC_015564	CGATC	2	10	2405211	2405220	20 %	20 %	20 %	40 %	333920008
1587	NC_015564	CGACT	2	10	2407995	2408004	20 %	20 %	20 %	40 %	333920011
1588	NC_015564	ACCGC	2	10	2409900	2409909	20 %	0 %	20 %	60 %	333920014
1589	NC_015564	GCCTC	2	10	2411730	2411739	0 %	20 %	20 %	60 %	333920015
1590	NC_015564	CGACG	2	10	2412419	2412428	20 %	0 %	40 %	40 %	333920015
1591	NC_015564	GCCGC	2	10	2414370	2414379	0 %	0 %	40 %	60 %	333920018
1592	NC_015564	CAGCC	2	10	2414646	2414655	20 %	0 %	20 %	60 %	333920019
1593	NC_015564	GCACA	2	10	2415531	2415540	40 %	0 %	20 %	40 %	333920019
1594	NC_015564	GCCGG	2	10	2416773	2416782	0 %	0 %	60 %	40 %	333920022
1595	NC_015564	TGCGA	2	10	2420164	2420173	20 %	20 %	40 %	20 %	333920024
1596	NC_015564	GCGCT	2	10	2425410	2425419	0 %	20 %	40 %	40 %	333920030
1597	NC_015564	GCGGG	2	10	2425643	2425652	0 %	0 %	80 %	20 %	333920030
1598	NC_015564	ACGAG	2	10	2431249	2431258	40 %	0 %	40 %	20 %	333920036
1599	NC_015564	GGCGC	2	10	2431957	2431966	0 %	0 %	60 %	40 %	333920038
1600	NC_015564	AGGCG	2	10	2434439	2434448	20 %	0 %	60 %	20 %	333920039
1601	NC_015564	GTGTG	2	10	2434471	2434480	0 %	40 %	60 %	0 %	333920039
1602	NC_015564	GAGCT	2	10	2434927	2434936	20 %	20 %	40 %	20 %	333920040
1603	NC_015564	CATCG	2	10	2437847	2437856	20 %	20 %	20 %	40 %	333920042
1604	NC_015564	TGCGG	2	10	2441878	2441887	0 %	20 %	60 %	20 %	333920047
1605	NC_015564	CACCG	2	10	2442061	2442070	20 %	0 %	20 %	60 %	333920047
1606	NC_015564	CACCG	2	10	2446215	2446224	20 %	0 %	20 %	60 %	333920049
1607	NC_015564	TGGAG	2	10	2446321	2446330	20 %	20 %	60 %	0 %	333920049
1608	NC_015564	CCGGA	2	10	2448781	2448790	20 %	0 %	40 %	40 %	333920051
1609	NC_015564	AGCCC	2	10	2450685	2450694	20 %	0 %	20 %	60 %	333920053
1610	NC_015564	GCTGA	2	10	2452210	2452219	20 %	20 %	40 %	20 %	333920054
1611	NC_015564	CGGCT	2	10	2453711	2453720	0 %	20 %	40 %	40 %	333920055
1612	NC_015564	CGGCC	2	10	2456317	2456326	0 %	0 %	40 %	60 %	333920057
1613	NC_015564	TGGCG	2	10	2458964	2458973	0 %	20 %	60 %	20 %	333920060
1614	NC_015564	GCTCG	2	10	2460101	2460110	0 %	20 %	40 %	40 %	333920061
1615	NC_015564	GTGCG	2	10	2460840	2460849	0 %	20 %	60 %	20 %	333920061
1616	NC_015564	GCCCC	2	10	2462441	2462450	0 %	0 %	20 %	80 %	333920064
1617	NC_015564	GAACA	2	10	2467970	2467979	60 %	0 %	20 %	20 %	333920073
1618	NC_015564	GTGTC	2	10	2470265	2470274	0 %	40 %	40 %	20 %	333920076
1619	NC_015564	GCTTG	2	10	2470308	2470317	0 %	40 %	40 %	20 %	333920076
1620	NC_015564	TGGCC	2	10	2474772	2474781	0 %	20 %	40 %	40 %	333920080
1621	NC_015564	CCGTT	2	10	2477185	2477194	0 %	40 %	20 %	40 %	333920082
1622	NC_015564	GACCT	2	10	2478515	2478524	20 %	20 %	20 %	40 %	333920083
1623	NC_015564	CTTCG	2	10	2479294	2479303	0 %	40 %	20 %	40 %	333920085
1624	NC_015564	GGTGA	2	10	2479766	2479775	20 %	20 %	60 %	0 %	333920085
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1730	NC_015564	GCCGC	2	10	2616105	2616114	0 %	0 %	40 %	60 %	333920233
1731	NC_015564	GTGGG	2	10	2616803	2616812	0 %	20 %	80 %	0 %	333920234
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1735	NC_015564	CCGTT	2	10	2620302	2620311	0 %	40 %	20 %	40 %	333920239
1736	NC_015564	CATGC	2	10	2621146	2621155	20 %	20 %	20 %	40 %	333920239
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1740	NC_015564	GGTGG	2	10	2630868	2630877	0 %	20 %	80 %	0 %	333920250
1741	NC_015564	GGCCG	2	10	2631143	2631152	0 %	0 %	60 %	40 %	333920250
1742	NC_015564	GCATC	2	10	2638274	2638283	20 %	20 %	20 %	40 %	333920256
1743	NC_015564	ACCTG	2	10	2638617	2638626	20 %	20 %	20 %	40 %	333920257
1744	NC_015564	CTTCA	2	10	2640928	2640937	20 %	40 %	0 %	40 %	333920260
1745	NC_015564	CGTCA	2	10	2646240	2646249	20 %	20 %	20 %	40 %	333920263
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1747	NC_015564	CCGTC	2	10	2648090	2648099	0 %	20 %	20 %	60 %	333920265
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1868	NC_015564	CCGAG	2	10	2780797	2780806	20 %	0 %	40 %	40 %	333920398
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1870	NC_015564	ACCGC	2	10	2782302	2782311	20 %	0 %	20 %	60 %	333920398
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1884	NC_015564	GCCGG	2	10	2799364	2799373	0 %	0 %	60 %	40 %	333920414
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1887	NC_015564	CGGGT	2	10	2801542	2801551	0 %	20 %	60 %	20 %	333920416
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1903	NC_015564	TGCGC	2	10	2815315	2815324	0 %	20 %	40 %	40 %	333920432
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1907	NC_015564	TGTGG	2	10	2817149	2817158	0 %	40 %	60 %	0 %	333920435
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1962	NC_015564	CAATC	2	10	2884957	2884966	40 %	20 %	0 %	40 %	333920492
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1964	NC_015564	TGACC	2	10	2886663	2886672	20 %	20 %	20 %	40 %	333920494
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1973	NC_015564	CCTGG	2	10	2899604	2899613	0 %	20 %	40 %	40 %	333920501
1974	NC_015564	GGCGC	2	10	2902760	2902769	0 %	0 %	60 %	40 %	333920503
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1976	NC_015564	GGCGT	2	10	2903774	2903783	0 %	20 %	60 %	20 %	333920504
1977	NC_015564	TCGAT	2	10	2905431	2905440	20 %	40 %	20 %	20 %	333920505
1978	NC_015564	GGGCG	2	10	2907473	2907482	0 %	0 %	80 %	20 %	333920508
1979	NC_015564	CAGCC	2	10	2908820	2908829	20 %	0 %	20 %	60 %	333920510
1980	NC_015564	GCCAT	2	10	2910564	2910573	20 %	20 %	20 %	40 %	333920512
1981	NC_015564	GCATC	2	10	2911018	2911027	20 %	20 %	20 %	40 %	333920512
1982	NC_015564	GTTGT	2	10	2912509	2912518	0 %	60 %	40 %	0 %	333920514
1983	NC_015564	TGGCG	2	10	2913054	2913063	0 %	20 %	60 %	20 %	333920515
1984	NC_015564	AGCCC	2	10	2913348	2913357	20 %	0 %	20 %	60 %	333920515
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1986	NC_015564	CGTCG	2	10	2916795	2916804	0 %	20 %	40 %	40 %	333920517
1987	NC_015564	GCTGC	2	10	2918690	2918699	0 %	20 %	40 %	40 %	333920517
1988	NC_015564	ACCGC	2	10	2920350	2920359	20 %	0 %	20 %	60 %	333920519
1989	NC_015564	AACTG	2	10	2920431	2920440	40 %	20 %	20 %	20 %	333920519
1990	NC_015564	CGGTG	2	10	2923279	2923288	0 %	20 %	60 %	20 %	333920523
1991	NC_015564	CGCGG	2	10	2923861	2923870	0 %	0 %	60 %	40 %	333920523
1992	NC_015564	GCGCG	2	10	2927608	2927617	0 %	0 %	60 %	40 %	333920525
1993	NC_015564	ACGGC	2	10	2930428	2930437	20 %	0 %	40 %	40 %	333920527
1994	NC_015564	CGCGG	2	10	2930760	2930769	0 %	0 %	60 %	40 %	333920527
1995	NC_015564	CCGGC	2	10	2932183	2932192	0 %	0 %	40 %	60 %	333920528
1996	NC_015564	ACAGC	2	10	2934243	2934252	40 %	0 %	20 %	40 %	333920530
1997	NC_015564	CGCTG	2	10	2935625	2935634	0 %	20 %	40 %	40 %	333920531
1998	NC_015564	CTCGA	2	10	2935722	2935731	20 %	20 %	20 %	40 %	333920531
1999	NC_015564	CGTTG	2	10	2936001	2936010	0 %	40 %	40 %	20 %	333920531
2000	NC_015564	TCACC	2	10	2938603	2938612	20 %	20 %	0 %	60 %	333920534

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