MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013156	ATT	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013156	ATT	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013156	TGA	2	6	117	122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809974
5	NC_013156	TTG	2	6	135	140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809974
6	NC_013156	CTT	2	6	192	197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809974
7	NC_013156	GCA	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809974
8	NC_013156	TCA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013156	GCT	2	6	684	689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809975
10	NC_013156	CTC	2	6	755	760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
11	NC_013156	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
12	NC_013156	AAC	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
13	NC_013156	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
14	NC_013156	ACA	2	6	900	905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
15	NC_013156	CAT	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809975
16	NC_013156	CTG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809975
17	NC_013156	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809975
18	NC_013156	CAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809975
19	NC_013156	ACA	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
20	NC_013156	CAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
21	NC_013156	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809975
22	NC_013156	ATA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
23	NC_013156	TCC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
24	NC_013156	TCT	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
25	NC_013156	ACT	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809975
26	NC_013156	TAA	2	6	1426	1431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
27	NC_013156	CTT	3	9	1486	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
28	NC_013156	TCC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
29	NC_013156	CTT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
30	NC_013156	AAT	2	6	1596	1601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
31	NC_013156	TCT	2	6	1632	1637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
32	NC_013156	TTC	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
33	NC_013156	TAA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013156	CTT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013156	GTT	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809976
36	NC_013156	AAT	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809976
37	NC_013156	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809976
38	NC_013156	GAT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809976
39	NC_013156	TAT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809976
40	NC_013156	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809976
41	NC_013156	TGA	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809976
42	NC_013156	GAA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809976
43	NC_013156	CAT	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809976
44	NC_013156	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809976
45	NC_013156	TGA	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013156	AAT	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013156	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013156	TCA	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013156	TCA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013156	ATC	3	9	3283	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013156	TAA	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013156	CTG	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809978
53	NC_013156	GCT	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809978
54	NC_013156	CTT	2	6	3478	3483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
55	NC_013156	TAT	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
56	NC_013156	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
57	NC_013156	CAA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809978
58	NC_013156	CTT	2	6	3947	3952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
59	NC_013156	CTC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
60	NC_013156	CTT	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
61	NC_013156	AAC	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809978
62	NC_013156	CTA	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809978
63	NC_013156	ATT	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
64	NC_013156	GAG	2	6	4208	4213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809978
65	NC_013156	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
66	NC_013156	TCC	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
67	NC_013156	TCC	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
68	NC_013156	CCT	3	9	4502	4510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
69	NC_013156	TCC	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
70	NC_013156	CTT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
71	NC_013156	TCT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
72	NC_013156	AGT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809978
73	NC_013156	GTT	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809978
74	NC_013156	ATT	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
75	NC_013156	AAT	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
76	NC_013156	AAT	2	6	4920	4925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
77	NC_013156	TAA	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
78	NC_013156	GAT	2	6	5058	5063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809978
79	NC_013156	CTT	2	6	5262	5267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
80	NC_013156	TCT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
81	NC_013156	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809979
82	NC_013156	TCA	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
83	NC_013156	CTA	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
84	NC_013156	TCT	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
85	NC_013156	TCA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
86	NC_013156	CTT	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
87	NC_013156	ACA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809979
88	NC_013156	CAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
89	NC_013156	CTT	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
90	NC_013156	CCT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
91	NC_013156	AGC	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809979
92	NC_013156	ACA	2	6	5926	5931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809979
93	NC_013156	TCA	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
94	NC_013156	TGA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809979
95	NC_013156	CTC	2	6	6114	6119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
96	NC_013156	TGT	2	6	6122	6127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809979
97	NC_013156	TCC	3	9	6135	6143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
98	NC_013156	TCC	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
99	NC_013156	TCA	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
100	NC_013156	TCT	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
101	NC_013156	CTC	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
102	NC_013156	TCC	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
103	NC_013156	TTG	2	6	6407	6412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809979
104	NC_013156	AAT	2	6	6441	6446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809979
105	NC_013156	CTT	2	6	6554	6559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
106	NC_013156	CCA	2	6	6672	6677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013156	ATA	2	6	6796	6801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013156	GAA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809980
109	NC_013156	AAG	2	6	6957	6962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809980
110	NC_013156	ATT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809980
111	NC_013156	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809980
112	NC_013156	GAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809980
113	NC_013156	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809980
114	NC_013156	GGA	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809980
115	NC_013156	ACT	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809980
116	NC_013156	TGA	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
117	NC_013156	TAT	2	6	7315	7320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809980
118	NC_013156	TTA	2	6	7342	7347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809980
119	NC_013156	TGA	2	6	7660	7665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
120	NC_013156	TCA	2	6	7817	7822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809980
121	NC_013156	AAG	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809980
122	NC_013156	GAT	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
123	NC_013156	AAG	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809980
124	NC_013156	TTC	2	6	8030	8035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809980
125	NC_013156	AAG	2	6	8051	8056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809980
126	NC_013156	TGT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809980
127	NC_013156	ATT	2	6	8206	8211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809980
128	NC_013156	GTT	2	6	8219	8224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809980
129	NC_013156	ATG	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
130	NC_013156	GAT	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
131	NC_013156	TGA	2	6	8407	8412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
132	NC_013156	ATG	2	6	8463	8468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809980
133	NC_013156	AAT	2	6	8545	8550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809981
134	NC_013156	TTC	2	6	8559	8564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809981
135	NC_013156	TCC	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809981
136	NC_013156	ATC	2	6	8724	8729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809981
137	NC_013156	GTT	2	6	8806	8811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809981
138	NC_013156	CCT	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809981
139	NC_013156	TTC	2	6	9095	9100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809981
140	NC_013156	TAA	2	6	9107	9112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809981
141	NC_013156	TAA	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809981
142	NC_013156	TTC	2	6	9230	9235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809981
143	NC_013156	ATT	2	6	9308	9313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013156	AGG	2	6	9619	9624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809982
145	NC_013156	CTT	2	6	9645	9650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809982
146	NC_013156	ATT	2	6	9721	9726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809982
147	NC_013156	TTG	2	6	9756	9761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809982
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149	NC_013156	CCT	4	12	9996	10007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809982
150	NC_013156	TAA	2	6	10038	10043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809982
151	NC_013156	TCA	2	6	10211	10216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809982
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153	NC_013156	CTA	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809982
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155	NC_013156	AAT	2	6	10495	10500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809982
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159	NC_013156	TTA	2	6	10827	10832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809983
160	NC_013156	TTG	2	6	10881	10886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809983
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162	NC_013156	CAA	2	6	11112	11117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809983
163	NC_013156	CCA	2	6	11309	11314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256809983
164	NC_013156	TAT	2	6	11386	11391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013156	CTT	2	6	11416	11421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809984
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167	NC_013156	TAA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809984
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169	NC_013156	ATT	2	6	11553	11558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809984
170	NC_013156	TAT	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013156	TAA	4	12	11625	11636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013156	ATT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013156	AGA	2	6	11815	11820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809985
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179	NC_013156	TAT	2	6	12165	12170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809986
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386	NC_013156	ACC	2	6	24974	24979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810000
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407	NC_013156	GGA	2	6	26458	26463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810000
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443	NC_013156	ATT	2	6	28759	28764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810002
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453	NC_013156	AAC	2	6	29961	29966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810003
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455	NC_013156	TGG	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810003
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457	NC_013156	TAC	2	6	30313	30318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810003
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460	NC_013156	GTT	2	6	30440	30445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810004
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471	NC_013156	TAA	2	6	31224	31229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810004
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481	NC_013156	TAA	2	6	32109	32114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810005
482	NC_013156	TGA	2	6	32137	32142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810005
483	NC_013156	GTG	2	6	32184	32189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810005
484	NC_013156	ATT	2	6	32287	32292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810005
485	NC_013156	GGT	2	6	32429	32434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
486	NC_013156	GAA	2	6	32476	32481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810006
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489	NC_013156	TAA	2	6	32700	32705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013156	AAG	2	6	32845	32850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810007
491	NC_013156	GTT	2	6	32928	32933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810007
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493	NC_013156	TGA	2	6	33002	33007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810007
494	NC_013156	AAT	2	6	33014	33019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810007
495	NC_013156	CAT	2	6	33088	33093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810007
496	NC_013156	AAC	2	6	33301	33306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810007
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498	NC_013156	GTT	2	6	33354	33359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810007
499	NC_013156	GCT	2	6	33369	33374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810007
500	NC_013156	GTT	2	6	33408	33413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810007

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