MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013156	TTG	2	6	364110	364115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810338
5502	NC_013156	TCA	2	6	364250	364255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810338
5503	NC_013156	AAT	2	6	364273	364278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810338
5504	NC_013156	ATA	2	6	364352	364357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810338
5505	NC_013156	CAA	2	6	364362	364367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810338
5506	NC_013156	TTC	2	6	364396	364401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810338
5507	NC_013156	ATC	2	6	364402	364407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810338
5508	NC_013156	CTT	2	6	364458	364463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810338
5509	NC_013156	ATC	2	6	364564	364569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810338
5510	NC_013156	CAA	3	9	364578	364586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810338
5511	NC_013156	TGA	2	6	364594	364599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810338
5512	NC_013156	ATC	2	6	364639	364644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810338
5513	NC_013156	TTA	2	6	364761	364766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810339
5514	NC_013156	TTC	2	6	364837	364842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810339
5515	NC_013156	AGT	2	6	364846	364851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810339
5516	NC_013156	CAA	2	6	364941	364946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810339
5517	NC_013156	TTG	2	6	364949	364954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810339
5518	NC_013156	GCT	2	6	364964	364969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810339
5519	NC_013156	ATC	2	6	365029	365034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810339
5520	NC_013156	GTT	2	6	365051	365056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810339
5521	NC_013156	CAA	2	6	365064	365069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810339
5522	NC_013156	TGG	2	6	365372	365377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_013156	GAT	2	6	365454	365459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_013156	TTC	2	6	365507	365512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_013156	GAT	2	6	365631	365636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810340
5526	NC_013156	GGA	2	6	365737	365742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810340
5527	NC_013156	AAG	2	6	365765	365770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810340
5528	NC_013156	GTT	2	6	365908	365913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810340
5529	NC_013156	AAG	2	6	366059	366064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810340
5530	NC_013156	AAG	2	6	366084	366089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810340
5531	NC_013156	GGA	2	6	366163	366168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810340
5532	NC_013156	TGG	2	6	366258	366263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810340
5533	NC_013156	TTG	2	6	366377	366382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810340
5534	NC_013156	CTG	2	6	366398	366403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810340
5535	NC_013156	AGA	2	6	366423	366428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810340
5536	NC_013156	ATT	2	6	366471	366476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810340
5537	NC_013156	GAA	2	6	366700	366705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810341
5538	NC_013156	GAA	2	6	366814	366819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810341
5539	NC_013156	GGT	2	6	366888	366893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810341
5540	NC_013156	AGA	2	6	366918	366923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810341
5541	NC_013156	AAT	2	6	366943	366948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810341
5542	NC_013156	TTG	2	6	367152	367157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810342
5543	NC_013156	TGT	2	6	367226	367231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810342
5544	NC_013156	TGA	2	6	367268	367273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810342
5545	NC_013156	AAT	2	6	367298	367303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810342
5546	NC_013156	AAT	2	6	367322	367327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810342
5547	NC_013156	GAG	2	6	367348	367353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_013156	AGA	2	6	367365	367370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810343
5549	NC_013156	GAA	2	6	367401	367406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810343
5550	NC_013156	GAA	2	6	367524	367529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810343
5551	NC_013156	GCT	2	6	367530	367535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810343
5552	NC_013156	AAG	2	6	367553	367558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810343
5553	NC_013156	TTA	2	6	367572	367577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810343
5554	NC_013156	GAA	2	6	367589	367594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810343
5555	NC_013156	TAA	2	6	367609	367614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810343
5556	NC_013156	AGG	2	6	367768	367773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810344
5557	NC_013156	AAT	2	6	367904	367909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810344
5558	NC_013156	GGA	2	6	368238	368243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810344
5559	NC_013156	ATA	2	6	368380	368385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810344
5560	NC_013156	AGA	2	6	368558	368563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810344
5561	NC_013156	TAT	2	6	368564	368569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810344
5562	NC_013156	ACT	2	6	368593	368598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810344
5563	NC_013156	CCT	2	6	368733	368738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810344
5564	NC_013156	GAA	2	6	368970	368975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810344
5565	NC_013156	TAA	2	6	369055	369060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810344
5566	NC_013156	GTT	2	6	369072	369077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810344
5567	NC_013156	TGA	2	6	369229	369234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810344
5568	NC_013156	TAA	2	6	369247	369252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810344
5569	NC_013156	GGA	2	6	369266	369271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810344
5570	NC_013156	TTG	2	6	369274	369279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810344
5571	NC_013156	TTA	2	6	369282	369287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810344
5572	NC_013156	AGG	2	6	369292	369297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810344
5573	NC_013156	AGA	2	6	369298	369303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810344
5574	NC_013156	AAC	2	6	369362	369367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810345
5575	NC_013156	CAA	2	6	369396	369401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810345
5576	NC_013156	ATC	2	6	369412	369417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810345
5577	NC_013156	TAT	2	6	369441	369446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810345
5578	NC_013156	TCC	2	6	369464	369469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810345
5579	NC_013156	ATC	2	6	369529	369534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810345
5580	NC_013156	TTG	2	6	369540	369545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810345
5581	NC_013156	ATA	2	6	369601	369606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810345
5582	NC_013156	TTC	2	6	369622	369627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810345
5583	NC_013156	CTA	2	6	369719	369724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810345
5584	NC_013156	CTT	2	6	369742	369747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810345
5585	NC_013156	TAA	2	6	369811	369816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810345
5586	NC_013156	AAC	2	6	369853	369858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810345
5587	NC_013156	AAT	2	6	369922	369927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810345
5588	NC_013156	TAA	2	6	369929	369934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810345
5589	NC_013156	CAA	2	6	369948	369953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810345
5590	NC_013156	ACA	2	6	369968	369973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810345
5591	NC_013156	TCA	2	6	369974	369979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810345
5592	NC_013156	AAT	2	6	370037	370042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_013156	CAA	2	6	370046	370051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_013156	AAT	2	6	370063	370068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_013156	TAA	2	6	370091	370096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_013156	ATG	2	6	370174	370179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810346
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5598	NC_013156	ATA	2	6	370251	370256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810346
5599	NC_013156	TTA	2	6	370263	370268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810346
5600	NC_013156	TTA	2	6	370320	370325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810346
5601	NC_013156	ATG	2	6	370449	370454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810346
5602	NC_013156	CAA	2	6	370597	370602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810346
5603	NC_013156	AAG	3	9	370603	370611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810346
5604	NC_013156	TTA	2	6	370969	370974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810346
5605	NC_013156	AGA	2	6	370997	371002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810346
5606	NC_013156	TGT	2	6	371003	371008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810346
5607	NC_013156	GAT	2	6	371067	371072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810346
5608	NC_013156	GAA	2	6	371089	371094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810346
5609	NC_013156	TGA	2	6	371210	371215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810346
5610	NC_013156	GAA	2	6	371403	371408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810346
5611	NC_013156	CTA	2	6	371486	371491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810346
5612	NC_013156	ACC	2	6	371588	371593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810347
5613	NC_013156	GAT	2	6	371612	371617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810347
5614	NC_013156	TAG	2	6	371661	371666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810347
5615	NC_013156	AGG	2	6	371673	371678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810347
5616	NC_013156	TGA	2	6	371698	371703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810347
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5618	NC_013156	ATC	2	6	371885	371890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810347
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