MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013156	TCA	2	6	97039	97044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810073
1502	NC_013156	TGA	2	6	97112	97117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810073
1503	NC_013156	TAT	2	6	97208	97213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810073
1504	NC_013156	CAA	2	6	97234	97239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810073
1505	NC_013156	ATC	2	6	97278	97283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013156	TTC	2	6	97292	97297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810074
1507	NC_013156	TTA	2	6	97378	97383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810074
1508	NC_013156	CAA	2	6	97439	97444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810074
1509	NC_013156	ATT	2	6	97512	97517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810074
1510	NC_013156	CCT	2	6	97648	97653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810074
1511	NC_013156	TTG	2	6	97660	97665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810074
1512	NC_013156	TTA	2	6	97705	97710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810074
1513	NC_013156	TGT	2	6	97996	98001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810075
1514	NC_013156	AGG	2	6	98167	98172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810075
1515	NC_013156	TGA	2	6	98209	98214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810075
1516	NC_013156	TTC	2	6	98269	98274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810075
1517	NC_013156	TGT	2	6	98332	98337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810075
1518	NC_013156	AGA	2	6	98389	98394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810075
1519	NC_013156	TAA	2	6	98406	98411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810075
1520	NC_013156	TTA	2	6	98442	98447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810075
1521	NC_013156	GTT	2	6	98479	98484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810075
1522	NC_013156	AGA	2	6	98506	98511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810075
1523	NC_013156	ATT	2	6	98552	98557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810075
1524	NC_013156	CTC	2	6	98565	98570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810075
1525	NC_013156	CAG	2	6	98579	98584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810075
1526	NC_013156	TGA	2	6	98638	98643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810075
1527	NC_013156	GAG	2	6	98665	98670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810075
1528	NC_013156	CCT	2	6	98758	98763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_013156	CAA	2	6	98952	98957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810076
1530	NC_013156	TTA	2	6	99008	99013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810076
1531	NC_013156	TAA	2	6	99045	99050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810076
1532	NC_013156	ATG	2	6	99085	99090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810076
1533	NC_013156	TCA	2	6	99103	99108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810076
1534	NC_013156	CAA	2	6	99143	99148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810076
1535	NC_013156	TAT	2	6	99192	99197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810076
1536	NC_013156	TAT	2	6	99231	99236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810076
1537	NC_013156	GGA	2	6	99388	99393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810076
1538	NC_013156	TTA	2	6	99407	99412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810076
1539	NC_013156	TAA	2	6	99432	99437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810076
1540	NC_013156	ATA	2	6	99453	99458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013156	ATC	2	6	99485	99490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810077
1542	NC_013156	CTT	2	6	99519	99524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810077
1543	NC_013156	TCA	2	6	99677	99682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810077
1544	NC_013156	TCA	2	6	99758	99763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810077
1545	NC_013156	TCA	2	6	99771	99776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810077
1546	NC_013156	AAT	2	6	99777	99782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810077
1547	NC_013156	TCT	2	6	99834	99839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810077
1548	NC_013156	CAT	2	6	99870	99875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810077
1549	NC_013156	CAA	2	6	100006	100011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810078
1550	NC_013156	TCC	2	6	100058	100063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810078
1551	NC_013156	TTA	2	6	100084	100089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810078
1552	NC_013156	TTG	2	6	100135	100140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810078
1553	NC_013156	ATT	2	6	100248	100253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810078
1554	NC_013156	TCT	2	6	100302	100307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810078
1555	NC_013156	CAA	2	6	100309	100314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810078
1556	NC_013156	TAT	2	6	100325	100330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810078
1557	NC_013156	TTG	2	6	100372	100377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810078
1558	NC_013156	CTT	2	6	100411	100416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810078
1559	NC_013156	TTC	2	6	100436	100441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810078
1560	NC_013156	GAT	3	9	100787	100795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810079
1561	NC_013156	GAA	2	6	100811	100816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810079
1562	NC_013156	GAA	2	6	100892	100897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810079
1563	NC_013156	ATG	2	6	100998	101003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810079
1564	NC_013156	GTT	3	9	101018	101026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810079
1565	NC_013156	AAT	2	6	101084	101089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810079
1566	NC_013156	ATA	2	6	101093	101098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810079
1567	NC_013156	ATA	2	6	101128	101133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810079
1568	NC_013156	TAA	2	6	101213	101218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013156	TGG	2	6	101225	101230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013156	GTT	2	6	101243	101248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013156	AAT	2	6	101341	101346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013156	ATA	2	6	101373	101378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013156	CTT	2	6	101437	101442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_013156	AAT	2	6	101539	101544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013156	ATT	2	6	101649	101654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013156	AAT	2	6	101706	101711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013156	AGT	2	6	101750	101755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013156	ATT	2	6	101782	101787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013156	ATA	2	6	101834	101839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810080
1580	NC_013156	AAG	2	6	101840	101845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810080
1581	NC_013156	ATT	2	6	101877	101882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810080
1582	NC_013156	GAA	2	6	101890	101895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810080
1583	NC_013156	AAG	2	6	102024	102029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810080
1584	NC_013156	ATT	2	6	102098	102103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810080
1585	NC_013156	CAA	2	6	102145	102150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810080
1586	NC_013156	ATC	2	6	102163	102168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810080
1587	NC_013156	TAA	2	6	102273	102278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810080
1588	NC_013156	AGC	2	6	102387	102392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810080
1589	NC_013156	GAA	2	6	102454	102459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810080
1590	NC_013156	ACC	2	6	102464	102469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810080
1591	NC_013156	TGA	2	6	102512	102517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810080
1592	NC_013156	GAA	2	6	102520	102525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810080
1593	NC_013156	CAA	2	6	102620	102625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810080
1594	NC_013156	CCA	2	6	102682	102687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810080
1595	NC_013156	ATC	2	6	102707	102712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810080
1596	NC_013156	GAG	2	6	102853	102858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810080
1597	NC_013156	ATA	2	6	103149	103154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013156	ATA	2	6	103172	103177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013156	GAA	2	6	103406	103411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1600	NC_013156	GAT	2	6	103482	103487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810081
1601	NC_013156	GAA	2	6	103510	103515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1602	NC_013156	GCT	2	6	103534	103539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810081
1603	NC_013156	AGA	2	6	103548	103553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1604	NC_013156	AGA	2	6	103566	103571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1605	NC_013156	AGA	3	9	103584	103592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1606	NC_013156	GAA	2	6	103618	103623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1607	NC_013156	AAG	2	6	103661	103666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810081
1608	NC_013156	GGT	2	6	103740	103745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013156	TAT	2	6	103746	103751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810082
1610	NC_013156	GTT	2	6	103759	103764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810082
1611	NC_013156	TAA	2	6	103839	103844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810082
1612	NC_013156	GTT	2	6	103960	103965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810082
1613	NC_013156	TGA	2	6	103980	103985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810082
1614	NC_013156	TAA	2	6	104101	104106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810083
1615	NC_013156	GAA	2	6	104153	104158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810083
1616	NC_013156	TGA	2	6	104216	104221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810083
1617	NC_013156	AGA	2	6	104253	104258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810083
1618	NC_013156	ACC	2	6	104323	104328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810083
1619	NC_013156	GAG	2	6	104398	104403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810083
1620	NC_013156	GGA	2	6	104531	104536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810083
1621	NC_013156	AAC	2	6	104591	104596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810083
1622	NC_013156	TTG	2	6	104818	104823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810083
1623	NC_013156	AGA	2	6	105014	105019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810083
1624	NC_013156	GAA	2	6	105060	105065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810083
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1688	NC_013156	TAA	2	6	108539	108544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1689	NC_013156	TAA	2	6	108583	108588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1740	NC_013156	AAT	3	9	111777	111785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1741	NC_013156	TAT	2	6	111792	111797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1986	NC_013156	ATG	2	6	128977	128982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810109
1987	NC_013156	ATA	2	6	129206	129211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_013156	TTC	2	6	129364	129369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1989	NC_013156	TAA	2	6	129468	129473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1990	NC_013156	ATA	2	6	129509	129514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1991	NC_013156	ATA	2	6	129770	129775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1992	NC_013156	CTT	2	6	129809	129814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1993	NC_013156	TTC	2	6	129830	129835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1994	NC_013156	TAT	2	6	129880	129885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1995	NC_013156	TAG	3	9	130038	130046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810110
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