MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013156	TAA	2	6	163682	163687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_013156	GTT	2	6	163759	163764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810142
2503	NC_013156	GCT	2	6	163852	163857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810142
2504	NC_013156	GCA	2	6	163867	163872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810142
2505	NC_013156	TAG	2	6	163958	163963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810142
2506	NC_013156	TAA	2	6	163994	163999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810142
2507	NC_013156	GAT	2	6	164058	164063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810143
2508	NC_013156	TTG	2	6	164173	164178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810143
2509	NC_013156	TTG	2	6	164211	164216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810143
2510	NC_013156	CTT	2	6	164230	164235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810143
2511	NC_013156	TCT	2	6	164274	164279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810143
2512	NC_013156	TTC	2	6	164363	164368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810143
2513	NC_013156	TCC	2	6	164549	164554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810143
2514	NC_013156	ATG	2	6	164650	164655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810143
2515	NC_013156	TGA	2	6	164666	164671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810143
2516	NC_013156	AAT	2	6	164705	164710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810143
2517	NC_013156	TAT	2	6	164903	164908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810143
2518	NC_013156	CTT	2	6	164932	164937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810143
2519	NC_013156	TTA	2	6	164941	164946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810143
2520	NC_013156	ATT	2	6	164982	164987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810143
2521	NC_013156	ATT	2	6	165003	165008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_013156	TTA	2	6	165021	165026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_013156	AAT	2	6	165064	165069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_013156	GAT	2	6	165118	165123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810144
2525	NC_013156	AGT	2	6	165223	165228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810144
2526	NC_013156	GAA	2	6	165289	165294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810144
2527	NC_013156	TTA	2	6	165367	165372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810144
2528	NC_013156	GGA	2	6	165390	165395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810144
2529	NC_013156	GTA	2	6	165520	165525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810144
2530	NC_013156	TAT	2	6	165653	165658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810144
2531	NC_013156	ATA	2	6	165766	165771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810144
2532	NC_013156	TAT	2	6	165782	165787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810144
2533	NC_013156	GAA	2	6	165791	165796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810144
2534	NC_013156	TGA	2	6	165843	165848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810144
2535	NC_013156	GAA	2	6	165901	165906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810144
2536	NC_013156	TAT	2	6	166056	166061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_013156	ATG	2	6	166204	166209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810145
2538	NC_013156	TCA	2	6	166341	166346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
2539	NC_013156	GAA	2	6	166368	166373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
2540	NC_013156	TGT	2	6	166381	166386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810145
2541	NC_013156	AGA	2	6	166435	166440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
2542	NC_013156	AAG	2	6	166502	166507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
2543	NC_013156	AGA	2	6	166538	166543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
2544	NC_013156	TTC	2	6	166581	166586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810145
2545	NC_013156	TTA	2	6	166587	166592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810145
2546	NC_013156	CAC	2	6	166737	166742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810145
2547	NC_013156	CCA	2	6	166916	166921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810145
2548	NC_013156	CAT	2	6	166945	166950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
2549	NC_013156	CAT	2	6	167019	167024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
2550	NC_013156	CAT	2	6	167135	167140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
2551	NC_013156	AAG	3	9	167256	167264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
2552	NC_013156	AGA	3	9	167309	167317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
2553	NC_013156	CAG	2	6	167359	167364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810145
2554	NC_013156	ATG	2	6	167383	167388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810145
2555	NC_013156	TAA	2	6	167548	167553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_013156	GTG	2	6	167618	167623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810146
2557	NC_013156	AGA	2	6	167735	167740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810146
2558	NC_013156	TTG	3	9	167768	167776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810146
2559	NC_013156	TAA	2	6	167813	167818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810146
2560	NC_013156	TAA	2	6	167912	167917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810146
2561	NC_013156	TTG	2	6	168023	168028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810146
2562	NC_013156	AGG	2	6	168104	168109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810146
2563	NC_013156	GAG	2	6	168234	168239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810146
2564	NC_013156	ATA	2	6	168291	168296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810146
2565	NC_013156	TCA	2	6	168376	168381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810147
2566	NC_013156	TTA	2	6	168440	168445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810147
2567	NC_013156	CAA	2	6	168572	168577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810147
2568	NC_013156	CAT	2	6	168653	168658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810147
2569	NC_013156	ATC	2	6	168673	168678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810147
2570	NC_013156	TGA	2	6	168762	168767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810147
2571	NC_013156	TTA	2	6	168788	168793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810147
2572	NC_013156	TCT	2	6	168910	168915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810147
2573	NC_013156	AAC	2	6	169023	169028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810147
2574	NC_013156	AAT	2	6	169212	169217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810147
2575	NC_013156	TCA	2	6	169246	169251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810147
2576	NC_013156	TCT	2	6	169273	169278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810147
2577	NC_013156	CTT	2	6	169355	169360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810147
2578	NC_013156	ATT	2	6	169396	169401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_013156	AAT	2	6	169420	169425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_013156	TCT	2	6	169530	169535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810148
2581	NC_013156	TTC	2	6	169559	169564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810148
2582	NC_013156	CTC	2	6	169666	169671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810148
2583	NC_013156	TTC	2	6	169693	169698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810148
2584	NC_013156	TCA	2	6	169728	169733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810148
2585	NC_013156	TCC	2	6	169754	169759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810148
2586	NC_013156	TCC	2	6	169883	169888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810148
2587	NC_013156	ACT	2	6	169916	169921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810148
2588	NC_013156	CAT	2	6	169942	169947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810148
2589	NC_013156	CCA	2	6	170025	170030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810148
2590	NC_013156	CAG	2	6	170254	170259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810149
2591	NC_013156	CTC	2	6	170302	170307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810149
2592	NC_013156	TCC	2	6	170603	170608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810149
2593	NC_013156	TCC	2	6	170732	170737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810149
2594	NC_013156	AAC	2	6	170753	170758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810149
2595	NC_013156	TTG	2	6	170848	170853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810149
2596	NC_013156	CTT	2	6	170854	170859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810149
2597	NC_013156	GAG	2	6	170911	170916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810149
2598	NC_013156	CTG	2	6	170968	170973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810149
2599	NC_013156	TCC	2	6	170996	171001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810149
2600	NC_013156	TCA	2	6	171052	171057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810149
2601	NC_013156	ATT	2	6	171243	171248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810149
2602	NC_013156	CAA	2	6	171328	171333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810149
2603	NC_013156	TAA	2	6	171488	171493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810149
2604	NC_013156	TTA	2	6	171652	171657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810149
2605	NC_013156	GGA	2	6	171756	171761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810149
2606	NC_013156	TAT	2	6	171792	171797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_013156	TTC	2	6	171904	171909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810150
2608	NC_013156	ATC	2	6	171928	171933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810150
2609	NC_013156	TTG	2	6	171987	171992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810150
2610	NC_013156	TCT	2	6	171995	172000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810150
2611	NC_013156	TCC	2	6	172118	172123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810150
2612	NC_013156	TAA	2	6	172204	172209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810150
2613	NC_013156	TAA	2	6	172243	172248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810150
2614	NC_013156	AAC	2	6	172318	172323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810150
2615	NC_013156	TAA	2	6	172333	172338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810150
2616	NC_013156	CTC	2	6	172353	172358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810150
2617	NC_013156	CAC	2	6	172361	172366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810150
2618	NC_013156	ACA	3	9	172547	172555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810150
2619	NC_013156	TCC	2	6	172556	172561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810150
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2621	NC_013156	TCT	2	6	172634	172639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810150
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2986	NC_013156	CTT	2	6	196976	196981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810170
2987	NC_013156	ACT	2	6	197008	197013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810170
2988	NC_013156	GCT	2	6	197104	197109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810170
2989	NC_013156	ACC	2	6	197130	197135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810170
2990	NC_013156	TTG	2	6	197260	197265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810170
2991	NC_013156	CTT	2	6	197291	197296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810170
2992	NC_013156	CAC	2	6	197540	197545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810170
2993	NC_013156	ATC	2	6	197625	197630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810170
2994	NC_013156	ACT	2	6	197641	197646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810170
2995	NC_013156	CTT	2	6	198044	198049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810171
2996	NC_013156	AAT	2	6	198213	198218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810171
2997	NC_013156	CAA	2	6	198244	198249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810172
2998	NC_013156	TTA	2	6	198251	198256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810172
2999	NC_013156	CTC	2	6	198271	198276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810172
3000	NC_013156	TGC	2	6	198370	198375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810172

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