MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 20162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013156	AAT	2	6	294877	294882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810264
4002	NC_013156	TTC	2	6	294910	294915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810264
4003	NC_013156	TAA	2	6	295006	295011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810265
4004	NC_013156	ATC	3	9	295064	295072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810265
4005	NC_013156	TCA	2	6	295116	295121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810265
4006	NC_013156	TCA	2	6	295371	295376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810265
4007	NC_013156	CAA	2	6	295390	295395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810265
4008	NC_013156	TTA	2	6	295435	295440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810265
4009	NC_013156	ATA	2	6	295453	295458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810265
4010	NC_013156	TGA	2	6	295583	295588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810265
4011	NC_013156	ATA	2	6	295589	295594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810265
4012	NC_013156	TCC	2	6	295614	295619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810265
4013	NC_013156	AGA	2	6	295643	295648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810265
4014	NC_013156	TAA	2	6	295661	295666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810265
4015	NC_013156	TTA	2	6	295732	295737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810265
4016	NC_013156	CAA	2	6	295753	295758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810265
4017	NC_013156	TTA	2	6	295792	295797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810266
4018	NC_013156	CAT	2	6	295804	295809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
4019	NC_013156	CAT	2	6	295843	295848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
4020	NC_013156	CCA	2	6	295872	295877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810266
4021	NC_013156	TAT	2	6	295925	295930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810266
4022	NC_013156	AGT	2	6	295940	295945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810266
4023	NC_013156	CTC	2	6	295975	295980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810266
4024	NC_013156	TAA	2	6	295990	295995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810266
4025	NC_013156	CAA	2	6	296131	296136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810266
4026	NC_013156	AAC	2	6	296165	296170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810266
4027	NC_013156	TCA	2	6	296229	296234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
4028	NC_013156	CAA	2	6	296251	296256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810266
4029	NC_013156	CAT	2	6	296485	296490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
4030	NC_013156	TCA	2	6	296493	296498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
4031	NC_013156	CTT	2	6	296584	296589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810266
4032	NC_013156	TAA	2	6	296617	296622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810266
4033	NC_013156	CTA	2	6	296746	296751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810267
4034	NC_013156	CAA	2	6	296752	296757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810267
4035	NC_013156	CTT	2	6	296806	296811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810267
4036	NC_013156	TCA	2	6	296868	296873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810267
4037	NC_013156	TAC	2	6	296902	296907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810267
4038	NC_013156	AAC	2	6	296937	296942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810267
4039	NC_013156	ATC	2	6	297015	297020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810268
4040	NC_013156	TCT	2	6	297064	297069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810268
4041	NC_013156	ACA	2	6	297094	297099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810268
4042	NC_013156	TAA	2	6	297233	297238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810268
4043	NC_013156	AAC	2	6	297270	297275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810268
4044	NC_013156	AAT	2	6	297371	297376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810268
4045	NC_013156	CAA	2	6	297422	297427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810268
4046	NC_013156	TAA	2	6	297450	297455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810268
4047	NC_013156	ACC	2	6	297537	297542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810268
4048	NC_013156	ATA	2	6	297655	297660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810269
4049	NC_013156	ATG	2	6	297700	297705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810269
4050	NC_013156	TAT	2	6	297743	297748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810269
4051	NC_013156	GAT	2	6	297751	297756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810269
4052	NC_013156	AGT	2	6	297759	297764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810269
4053	NC_013156	ATA	2	6	298070	298075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810269
4054	NC_013156	TTG	2	6	298177	298182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810269
4055	NC_013156	TAT	2	6	298264	298269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810269
4056	NC_013156	ATA	2	6	298277	298282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810269
4057	NC_013156	ATT	2	6	298291	298296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810269
4058	NC_013156	TGG	2	6	298434	298439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810269
4059	NC_013156	GAA	2	6	298572	298577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810269
4060	NC_013156	ATT	2	6	298579	298584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810269
4061	NC_013156	AGA	2	6	298587	298592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810269
4062	NC_013156	AGA	2	6	298698	298703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810269
4063	NC_013156	GTT	2	6	298714	298719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810269
4064	NC_013156	TGA	2	6	298737	298742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810269
4065	NC_013156	GTT	2	6	298743	298748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810269
4066	NC_013156	TGG	2	6	298749	298754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810269
4067	NC_013156	GAG	3	9	298792	298800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810269
4068	NC_013156	GAC	2	6	298858	298863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810269
4069	NC_013156	GTT	2	6	298918	298923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810269
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4071	NC_013156	ATT	2	6	299146	299151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810269
4072	NC_013156	TTA	2	6	299190	299195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810270
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4077	NC_013156	GTT	2	6	299663	299668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810270
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4090	NC_013156	ATT	2	6	300781	300786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810271
4091	NC_013156	ATT	2	6	300792	300797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810271
4092	NC_013156	AAT	2	6	300825	300830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810271
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4099	NC_013156	TGA	2	6	301187	301192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810272
4100	NC_013156	GTT	2	6	301406	301411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810272
4101	NC_013156	GAA	2	6	301472	301477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810272
4102	NC_013156	ATT	2	6	301479	301484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810272
4103	NC_013156	TAA	2	6	301523	301528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810272
4104	NC_013156	TGT	2	6	301553	301558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810272
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4106	NC_013156	AGA	2	6	301751	301756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810272
4107	NC_013156	TGT	2	6	301757	301762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810272
4108	NC_013156	TGA	2	6	301763	301768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810272
4109	NC_013156	ATT	2	6	301870	301875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810272
4110	NC_013156	TCC	2	6	301934	301939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810272
4111	NC_013156	TTA	2	6	301993	301998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810272
4112	NC_013156	TAC	2	6	302034	302039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810272
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4116	NC_013156	CCT	2	6	302694	302699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810273
4117	NC_013156	GTT	2	6	302717	302722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810273
4118	NC_013156	AAT	2	6	302806	302811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810273
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4241	NC_013156	ATA	4	12	311290	311301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810281
4242	NC_013156	TGG	2	6	311371	311376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810281
4243	NC_013156	GAT	2	6	311381	311386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810282
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4245	NC_013156	ATA	2	6	311466	311471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810282
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4249	NC_013156	TGT	3	9	311636	311644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810282
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4271	NC_013156	CTT	3	9	313599	313607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810284
4272	NC_013156	TTC	2	6	313642	313647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810284
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4479	NC_013156	TCC	2	6	329376	329381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810308
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