MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 20162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013156	ATT	2	6	446408	446413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810424
6002	NC_013156	TTG	2	6	446432	446437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810424
6003	NC_013156	ATC	2	6	446530	446535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810424
6004	NC_013156	TTA	2	6	446554	446559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810424
6005	NC_013156	TCA	2	6	446633	446638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810424
6006	NC_013156	TTC	2	6	446644	446649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810424
6007	NC_013156	TAC	2	6	446658	446663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810424
6008	NC_013156	CTT	2	6	446764	446769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810425
6009	NC_013156	TTC	2	6	446955	446960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810425
6010	NC_013156	TAA	2	6	447082	447087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810425
6011	NC_013156	CTC	2	6	447188	447193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810425
6012	NC_013156	CTC	2	6	447283	447288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810425
6013	NC_013156	AGA	2	6	447290	447295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810425
6014	NC_013156	TCA	2	6	447328	447333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810425
6015	NC_013156	GCT	2	6	447417	447422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810425
6016	NC_013156	TGA	2	6	447423	447428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810425
6017	NC_013156	ACA	2	6	447432	447437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810425
6018	NC_013156	TTA	2	6	447525	447530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810425
6019	NC_013156	GTT	2	6	447534	447539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810425
6020	NC_013156	AAT	2	6	447551	447556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810425
6021	NC_013156	CAT	2	6	447559	447564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810425
6022	NC_013156	GTT	2	6	447566	447571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810425
6023	NC_013156	CAA	2	6	447586	447591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810425
6024	NC_013156	CAA	2	6	447663	447668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810426
6025	NC_013156	CAT	2	6	447762	447767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810426
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6030	NC_013156	GTT	2	6	447975	447980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810426
6031	NC_013156	TTC	2	6	448086	448091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810426
6032	NC_013156	TTC	2	6	448095	448100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810426
6033	NC_013156	TCG	2	6	448123	448128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810426
6034	NC_013156	GAT	2	6	448242	448247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810426
6035	NC_013156	CTT	2	6	448326	448331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810426
6036	NC_013156	TTC	2	6	448380	448385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810426
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6038	NC_013156	CAA	2	6	448442	448447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810426
6039	NC_013156	ATA	2	6	448458	448463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810426
6040	NC_013156	TTA	2	6	448528	448533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810426
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6042	NC_013156	CTC	2	6	448560	448565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810426
6043	NC_013156	TCC	2	6	448587	448592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810426
6044	NC_013156	AAC	2	6	448632	448637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810426
6045	NC_013156	GTT	2	6	448879	448884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810427
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6051	NC_013156	TGA	2	6	449433	449438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810427
6052	NC_013156	TAA	2	6	449462	449467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810427
6053	NC_013156	GAG	2	6	449500	449505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810427
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6059	NC_013156	ATC	2	6	449893	449898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810428
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6110	NC_013156	CAA	2	6	453575	453580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810432
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6118	NC_013156	TTA	2	6	454258	454263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810432
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6480	NC_013156	GTT	2	6	482758	482763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810462
6481	NC_013156	ATT	2	6	482836	482841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810462
6482	NC_013156	GAG	2	6	482842	482847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810462
6483	NC_013156	TTA	2	6	482905	482910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810462
6484	NC_013156	TTA	2	6	482930	482935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810462
6485	NC_013156	ATC	2	6	482963	482968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810462
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