MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 20162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013156	CAA	2	6	222272	222277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810199
3002	NC_013156	GAT	2	6	222375	222380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810199
3003	NC_013156	AGA	2	6	222536	222541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810199
3004	NC_013156	TAC	2	6	222660	222665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810199
3005	NC_013156	CTC	2	6	222671	222676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810199
3006	NC_013156	AGA	2	6	222677	222682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810199
3007	NC_013156	TAA	2	6	222686	222691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810199
3008	NC_013156	TGA	2	6	222701	222706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810199
3009	NC_013156	GTA	2	6	223089	223094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810199
3010	NC_013156	TTA	2	6	223146	223151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810199
3011	NC_013156	ATT	2	6	223254	223259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3012	NC_013156	AGA	2	6	223263	223268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810200
3013	NC_013156	ATT	2	6	223409	223414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3014	NC_013156	TTA	2	6	223454	223459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3015	NC_013156	GTT	2	6	223513	223518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810200
3016	NC_013156	TAA	2	6	223577	223582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810200
3017	NC_013156	ATT	2	6	223667	223672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3018	NC_013156	TTA	2	6	223685	223690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3019	NC_013156	ACA	2	6	223761	223766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810201
3020	NC_013156	GTT	2	6	223886	223891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810201
3021	NC_013156	GAT	2	6	224052	224057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810201
3022	NC_013156	AGA	2	6	224082	224087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810201
3023	NC_013156	TAT	2	6	224119	224124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810201
3024	NC_013156	AAT	2	6	224200	224205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810201
3025	NC_013156	TTG	2	6	224314	224319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810202
3026	NC_013156	CAA	2	6	224435	224440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810202
3027	NC_013156	TCT	2	6	224443	224448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3028	NC_013156	CAA	2	6	224454	224459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810202
3029	NC_013156	AAC	2	6	224625	224630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810202
3030	NC_013156	AGC	2	6	224703	224708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810202
3031	NC_013156	AGC	2	6	224772	224777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810202
3032	NC_013156	AAT	2	6	224839	224844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810202
3033	NC_013156	TCT	2	6	224887	224892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3034	NC_013156	CTT	2	6	224931	224936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3035	NC_013156	TGC	2	6	225096	225101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810202
3036	NC_013156	TTA	2	6	225202	225207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810202
3037	NC_013156	TCT	2	6	225233	225238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3038	NC_013156	TCT	2	6	225256	225261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3039	NC_013156	CCA	2	6	225337	225342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810202
3040	NC_013156	TCA	2	6	225355	225360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810202
3041	NC_013156	AAC	2	6	225387	225392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810202
3042	NC_013156	TAA	2	6	225412	225417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810202
3043	NC_013156	ATC	2	6	225447	225452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810202
3044	NC_013156	TAT	2	6	225489	225494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810202
3045	NC_013156	CCT	2	6	225520	225525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810202
3046	NC_013156	TGC	2	6	225534	225539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810202
3047	NC_013156	TCT	2	6	225544	225549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3048	NC_013156	CAA	2	6	225557	225562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810202
3049	NC_013156	CAT	2	6	225683	225688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810202
3050	NC_013156	ATT	2	6	225795	225800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810202
3051	NC_013156	TGA	2	6	225840	225845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810202
3052	NC_013156	TCC	2	6	225897	225902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810202
3053	NC_013156	AAT	2	6	225903	225908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810202
3054	NC_013156	CAT	2	6	225947	225952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810202
3055	NC_013156	TAT	2	6	225980	225985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810202
3056	NC_013156	TTC	2	6	226018	226023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3057	NC_013156	AAT	2	6	226026	226031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810202
3058	NC_013156	GTT	2	6	226045	226050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810202
3059	NC_013156	ATA	2	6	226227	226232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810203
3060	NC_013156	GAA	2	6	226299	226304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810203
3061	NC_013156	ATT	2	6	226483	226488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810203
3062	NC_013156	ATG	3	9	226503	226511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810203
3063	NC_013156	ACA	2	6	226720	226725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810203
3064	NC_013156	CAA	2	6	226729	226734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810203
3065	NC_013156	GAA	2	6	226779	226784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810203
3066	NC_013156	TAA	2	6	226801	226806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810203
3067	NC_013156	TTA	2	6	226869	226874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810203
3068	NC_013156	ATT	2	6	226900	226905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810203
3069	NC_013156	ATT	2	6	226996	227001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810203
3070	NC_013156	TTG	2	6	227044	227049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810203
3071	NC_013156	ATC	2	6	227318	227323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810204
3072	NC_013156	CAT	2	6	227536	227541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810204
3073	NC_013156	AGC	2	6	227639	227644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810204
3074	NC_013156	TGG	2	6	227696	227701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810204
3075	NC_013156	TAT	2	6	227914	227919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810204
3076	NC_013156	GAT	2	6	228242	228247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810205
3077	NC_013156	ATT	2	6	228264	228269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810205
3078	NC_013156	TAA	2	6	228327	228332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810205
3079	NC_013156	AAG	2	6	228345	228350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810205
3080	NC_013156	ATT	2	6	228459	228464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810205
3081	NC_013156	AGT	2	6	228479	228484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810205
3082	NC_013156	ACA	2	6	228528	228533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810205
3083	NC_013156	AAC	2	6	228584	228589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810205
3084	NC_013156	TTA	2	6	228665	228670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810205
3085	NC_013156	ATT	2	6	228771	228776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810205
3086	NC_013156	GTT	2	6	228803	228808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810205
3087	NC_013156	TGG	2	6	228877	228882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810205
3088	NC_013156	TTA	2	6	228928	228933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810205
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3090	NC_013156	TCT	3	9	229041	229049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810206
3091	NC_013156	TAA	2	6	229148	229153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810206
3092	NC_013156	ATG	2	6	229175	229180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810206
3093	NC_013156	TAT	2	6	229241	229246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810206
3094	NC_013156	AAC	2	6	229262	229267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810206
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3096	NC_013156	AAT	2	6	229392	229397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810206
3097	NC_013156	TAA	2	6	229460	229465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810206
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3099	NC_013156	ATT	2	6	229568	229573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810206
3100	NC_013156	GTT	2	6	229586	229591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810206
3101	NC_013156	ATA	2	6	229625	229630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810206
3102	NC_013156	TTA	2	6	229660	229665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810206
3103	NC_013156	GTT	2	6	230348	230353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810207
3104	NC_013156	AGT	2	6	230395	230400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
3105	NC_013156	GTT	2	6	230486	230491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810207
3106	NC_013156	AAG	2	6	230544	230549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3107	NC_013156	TAC	2	6	230564	230569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810207
3108	NC_013156	AGA	2	6	230686	230691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3109	NC_013156	ATT	2	6	230732	230737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810207
3110	NC_013156	GGA	2	6	230738	230743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3111	NC_013156	GGA	2	6	230825	230830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3112	NC_013156	ACC	2	6	230913	230918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810207
3113	NC_013156	TGA	2	6	231013	231018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
3114	NC_013156	GAA	2	6	231233	231238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3115	NC_013156	ATC	2	6	231260	231265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810207
3116	NC_013156	ACG	2	6	231279	231284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3117	NC_013156	AGA	2	6	231304	231309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3118	NC_013156	CAG	2	6	231372	231377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3119	NC_013156	AGG	2	6	231385	231390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3120	NC_013156	CTG	2	6	231496	231501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3121	NC_013156	GAA	2	6	231514	231519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3122	NC_013156	GCA	2	6	231535	231540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3123	NC_013156	GAG	2	6	231602	231607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3124	NC_013156	AGA	2	6	231614	231619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3125	NC_013156	AGA	2	6	231709	231714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3126	NC_013156	TTC	2	6	231839	231844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810207
3127	NC_013156	TGT	2	6	232021	232026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810207
3128	NC_013156	TGA	2	6	232027	232032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
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3130	NC_013156	TAG	2	6	232113	232118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
3131	NC_013156	ATC	2	6	232214	232219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810207
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3233	NC_013156	TTG	2	6	240677	240682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810214
3234	NC_013156	TGA	2	6	240855	240860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810214
3235	NC_013156	TGA	2	6	240963	240968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810214
3236	NC_013156	CCA	2	6	241096	241101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810214
3237	NC_013156	GAT	2	6	241119	241124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810214
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3479	NC_013156	ATT	3	9	257094	257102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810230
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3483	NC_013156	GAA	2	6	257248	257253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810231
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