MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 20162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013156	GAT	2	6	69299	69304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810044
1002	NC_013156	ATA	2	6	69317	69322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810044
1003	NC_013156	CTT	3	9	69382	69390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810044
1004	NC_013156	GTC	2	6	69401	69406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810044
1005	NC_013156	CCT	3	9	69468	69476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810044
1006	NC_013156	GCT	2	6	69606	69611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810044
1007	NC_013156	AGT	2	6	69661	69666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810044
1008	NC_013156	CAT	2	6	69787	69792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810044
1009	NC_013156	TAA	2	6	69913	69918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810045
1010	NC_013156	TAA	2	6	70000	70005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810045
1011	NC_013156	TTA	2	6	70132	70137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810045
1012	NC_013156	GTT	2	6	70155	70160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810045
1013	NC_013156	TCG	2	6	70188	70193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810045
1014	NC_013156	CTA	2	6	70243	70248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810045
1015	NC_013156	TTA	2	6	70488	70493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810046
1016	NC_013156	ACT	2	6	70532	70537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810046
1017	NC_013156	CCA	2	6	70739	70744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810046
1018	NC_013156	TAA	2	6	70800	70805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810046
1019	NC_013156	TAA	2	6	70936	70941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810046
1020	NC_013156	GAT	2	6	70943	70948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810046
1021	NC_013156	GAT	2	6	71051	71056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810046
1022	NC_013156	GAA	2	6	71084	71089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810046
1023	NC_013156	AAT	2	6	71095	71100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810046
1024	NC_013156	GTT	2	6	71132	71137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810046
1025	NC_013156	ATT	2	6	71185	71190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810046
1026	NC_013156	GAA	3	9	71204	71212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810046
1027	NC_013156	GAA	2	6	71246	71251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810046
1028	NC_013156	CTG	2	6	71252	71257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810046
1029	NC_013156	AGA	2	6	71287	71292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810046
1030	NC_013156	TTC	2	6	71453	71458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810047
1031	NC_013156	CTT	2	6	71465	71470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810047
1032	NC_013156	CTT	2	6	71498	71503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810047
1033	NC_013156	TTA	2	6	71581	71586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810047
1034	NC_013156	CAG	2	6	71879	71884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810047
1035	NC_013156	TAA	2	6	72020	72025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810047
1036	NC_013156	GCT	2	6	72051	72056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810047
1037	NC_013156	TAA	2	6	72070	72075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810047
1038	NC_013156	TAT	2	6	72162	72167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810048
1039	NC_013156	TTC	2	6	72187	72192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810048
1040	NC_013156	AAT	2	6	72222	72227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810048
1041	NC_013156	TCT	3	9	72292	72300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810048
1042	NC_013156	TAA	2	6	72684	72689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810049
1043	NC_013156	TGA	2	6	72823	72828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810049
1044	NC_013156	AAC	2	6	72920	72925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810049
1045	NC_013156	GAA	2	6	73014	73019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810049
1046	NC_013156	TAA	2	6	73030	73035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810049
1047	NC_013156	GAT	2	6	73075	73080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810049
1048	NC_013156	AAT	2	6	73162	73167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810050
1049	NC_013156	AGA	2	6	73324	73329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810050
1050	NC_013156	TGA	2	6	73413	73418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810050
1051	NC_013156	TAA	2	6	73419	73424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810050
1052	NC_013156	ACA	2	6	73494	73499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810050
1053	NC_013156	GGA	2	6	73543	73548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810050
1054	NC_013156	TGA	2	6	73549	73554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810050
1055	NC_013156	ATG	2	6	73698	73703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810050
1056	NC_013156	ATA	2	6	73712	73717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810050
1057	NC_013156	ATG	3	9	73749	73757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810050
1058	NC_013156	TAA	2	6	73938	73943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810050
1059	NC_013156	TTG	2	6	73990	73995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810051
1060	NC_013156	AAG	2	6	74038	74043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810051
1061	NC_013156	TAA	2	6	74164	74169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810051
1062	NC_013156	GTT	2	6	74171	74176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810051
1063	NC_013156	AAT	2	6	74238	74243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810051
1064	NC_013156	AAC	2	6	74282	74287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810051
1065	NC_013156	ATA	2	6	74313	74318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810051
1066	NC_013156	TAC	2	6	74321	74326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810051
1067	NC_013156	TAC	2	6	74521	74526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810051
1068	NC_013156	TAA	2	6	74572	74577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810051
1069	NC_013156	GAA	2	6	74772	74777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810051
1070	NC_013156	TTG	2	6	74854	74859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810051
1071	NC_013156	TCC	2	6	74881	74886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810051
1072	NC_013156	TGA	2	6	74906	74911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810051
1073	NC_013156	ACA	2	6	74952	74957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810051
1074	NC_013156	TGA	2	6	74981	74986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810051
1075	NC_013156	TAA	2	6	75116	75121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810051
1076	NC_013156	CTG	2	6	75224	75229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810051
1077	NC_013156	TTG	2	6	75277	75282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810051
1078	NC_013156	AAG	2	6	75299	75304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810051
1079	NC_013156	CAG	2	6	75401	75406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810052
1080	NC_013156	CTA	2	6	75476	75481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810052
1081	NC_013156	ACA	2	6	75502	75507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810052
1082	NC_013156	CTC	2	6	75555	75560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810052
1083	NC_013156	TAT	2	6	75591	75596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810052
1084	NC_013156	AAT	2	6	75617	75622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810052
1085	NC_013156	ATC	2	6	75708	75713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810052
1086	NC_013156	CAA	2	6	75887	75892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810052
1087	NC_013156	TTG	2	6	75966	75971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810052
1088	NC_013156	GCC	2	6	75982	75987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256810052
1089	NC_013156	GGA	2	6	76129	76134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810052
1090	NC_013156	CAA	2	6	76166	76171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810052
1091	NC_013156	CTC	2	6	76197	76202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810052
1092	NC_013156	CAA	2	6	76218	76223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810052
1093	NC_013156	CTT	2	6	76270	76275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810052
1094	NC_013156	TCA	2	6	76294	76299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810052
1095	NC_013156	CAC	2	6	76440	76445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810053
1096	NC_013156	TCC	2	6	76521	76526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810053
1097	NC_013156	TTA	2	6	76564	76569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810053
1098	NC_013156	TCA	2	6	76717	76722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810053
1099	NC_013156	ACT	2	6	76774	76779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810053
1100	NC_013156	ACT	2	6	77080	77085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810054
1101	NC_013156	TCT	2	6	77146	77151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810054
1102	NC_013156	CTT	2	6	77187	77192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810054
1103	NC_013156	CTT	2	6	77196	77201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810054
1104	NC_013156	TTC	2	6	77393	77398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810055
1105	NC_013156	TTC	2	6	77408	77413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810055
1106	NC_013156	TTC	2	6	77423	77428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810055
1107	NC_013156	TAA	2	6	77443	77448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810055
1108	NC_013156	TGT	2	6	77660	77665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810055
1109	NC_013156	GTA	2	6	77672	77677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810055
1110	NC_013156	TCC	2	6	77684	77689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810055
1111	NC_013156	AAT	2	6	77771	77776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810055
1112	NC_013156	TTC	2	6	77844	77849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810055
1113	NC_013156	ACT	2	6	77913	77918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810055
1114	NC_013156	CTC	2	6	77923	77928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810055
1115	NC_013156	GCA	2	6	77955	77960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810055
1116	NC_013156	TTA	2	6	77989	77994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810055
1117	NC_013156	CTA	2	6	78145	78150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810055
1118	NC_013156	TGT	2	6	78166	78171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810055
1119	NC_013156	ATT	2	6	78267	78272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810055
1120	NC_013156	TCA	2	6	78333	78338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810055
1121	NC_013156	CTT	2	6	78445	78450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810055
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1123	NC_013156	TTA	2	6	78487	78492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810055
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1492	NC_013156	TGA	2	6	104216	104221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810083
1493	NC_013156	AGA	2	6	104253	104258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810083
1494	NC_013156	ACC	2	6	104323	104328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810083
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1496	NC_013156	GGA	2	6	104531	104536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810083
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