MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012943	GACCA	2	10	4369832	4369841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3502	NC_012943	CGTCG	2	10	4369987	4369996	0 %	20 %	40 %	40 %	253800947
3503	NC_012943	GCCGG	2	10	4370902	4370911	0 %	0 %	60 %	40 %	253800948
3504	NC_012943	CCAGG	2	10	4371146	4371155	20 %	0 %	40 %	40 %	253800949
3505	NC_012943	CCGGC	2	10	4372069	4372078	0 %	0 %	40 %	60 %	253800949
3506	NC_012943	CAGCG	2	10	4373628	4373637	20 %	0 %	40 %	40 %	253800951
3507	NC_012943	TATCT	2	10	4374252	4374261	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3508	NC_012943	GCCAC	2	10	4376909	4376918	20 %	0 %	20 %	60 %	253800953
3509	NC_012943	AGCCC	2	10	4381264	4381273	20 %	0 %	20 %	60 %	253800959
3510	NC_012943	CTGGC	2	10	4382725	4382734	0 %	20 %	40 %	40 %	253800959
3511	NC_012943	GCCGT	2	10	4383508	4383517	0 %	20 %	40 %	40 %	253800959
3512	NC_012943	CCCGT	2	10	4386779	4386788	0 %	20 %	20 %	60 %	253800960
3513	NC_012943	CGGCC	2	10	4386965	4386974	0 %	0 %	40 %	60 %	253800960
3514	NC_012943	CCGGG	2	10	4387103	4387112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3515	NC_012943	CGGAC	2	10	4387492	4387501	20 %	0 %	40 %	40 %	253800961
3516	NC_012943	CCGCC	2	10	4388682	4388691	0 %	0 %	20 %	80 %	253800963
3517	NC_012943	CCGCG	2	10	4390151	4390160	0 %	0 %	40 %	60 %	253800965
3518	NC_012943	TGCGC	2	10	4390171	4390180	0 %	20 %	40 %	40 %	253800965
3519	NC_012943	CTGCG	2	10	4390946	4390955	0 %	20 %	40 %	40 %	253800965
3520	NC_012943	GTCGC	2	10	4392627	4392636	0 %	20 %	40 %	40 %	253800967
3521	NC_012943	TCCGG	2	10	4392747	4392756	0 %	20 %	40 %	40 %	253800967
3522	NC_012943	CGCGC	2	10	4393510	4393519	0 %	0 %	40 %	60 %	253800968
3523	NC_012943	CCGAG	2	10	4397295	4397304	20 %	0 %	40 %	40 %	253800973

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.