MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012943	AGGTG	2	10	2396796	2396805	20 %	20 %	60 %	0 %	253799171
2002	NC_012943	CCGGC	2	10	2402045	2402054	0 %	0 %	40 %	60 %	253799176
2003	NC_012943	GGGTT	2	10	2402517	2402526	0 %	40 %	60 %	0 %	253799176
2004	NC_012943	TGGGC	2	10	2402672	2402681	0 %	20 %	60 %	20 %	253799176
2005	NC_012943	TCGGC	2	10	2403001	2403010	0 %	20 %	40 %	40 %	253799176
2006	NC_012943	TCGAG	2	10	2403071	2403080	20 %	20 %	40 %	20 %	253799176
2007	NC_012943	TCCGC	2	10	2406624	2406633	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2008	NC_012943	GTGCT	2	10	2406680	2406689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2009	NC_012943	GGACT	2	10	2406816	2406825	20 %	20 %	40 %	20 %	253799178
2010	NC_012943	CCGGG	2	10	2408296	2408305	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2011	NC_012943	CGCTG	2	10	2410114	2410123	0 %	20 %	40 %	40 %	253799180
2012	NC_012943	CGACG	2	10	2410180	2410189	20 %	0 %	40 %	40 %	253799180
2013	NC_012943	GGGCT	2	10	2411767	2411776	0 %	20 %	60 %	20 %	253799181
2014	NC_012943	ATCCG	2	10	2413976	2413985	20 %	20 %	20 %	40 %	253799183
2015	NC_012943	GGACT	2	10	2417193	2417202	20 %	20 %	40 %	20 %	253799186
2016	NC_012943	GCCGC	2	10	2419262	2419271	0 %	0 %	40 %	60 %	253799189
2017	NC_012943	GCCGC	2	10	2424271	2424280	0 %	0 %	40 %	60 %	253799193
2018	NC_012943	GTGCG	2	10	2425456	2425465	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2019	NC_012943	CAGTT	2	10	2426199	2426208	20 %	40 %	20 %	20 %	253799195
2020	NC_012943	ACCGG	2	10	2426784	2426793	20 %	0 %	40 %	40 %	253799195
2021	NC_012943	GCTCG	2	10	2427150	2427159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2022	NC_012943	CGCGA	2	10	2430006	2430015	20 %	0 %	40 %	40 %	253799199
2023	NC_012943	GGGCG	2	10	2432115	2432124	0 %	0 %	80 %	20 %	253799200
2024	NC_012943	GCTGA	2	10	2435017	2435026	20 %	20 %	40 %	20 %	253799202
2025	NC_012943	GTCGA	2	10	2435190	2435199	20 %	20 %	40 %	20 %	253799203
2026	NC_012943	TCAGA	2	10	2436067	2436076	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2027	NC_012943	GCCGC	2	10	2436540	2436549	0 %	0 %	40 %	60 %	253799204
2028	NC_012943	GACCG	2	10	2436746	2436755	20 %	0 %	40 %	40 %	253799204
2029	NC_012943	CCGGA	2	10	2437231	2437240	20 %	0 %	40 %	40 %	253799204
2030	NC_012943	GGGCG	2	10	2438113	2438122	0 %	0 %	80 %	20 %	253799205
2031	NC_012943	GGGCA	2	10	2439299	2439308	20 %	0 %	60 %	20 %	253799205
2032	NC_012943	GGCCG	2	10	2442837	2442846	0 %	0 %	60 %	40 %	253799207
2033	NC_012943	CCAGG	2	10	2445986	2445995	20 %	0 %	40 %	40 %	253799210
2034	NC_012943	GTCGC	2	10	2446328	2446337	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2035	NC_012943	GCTGC	2	10	2449491	2449500	0 %	20 %	40 %	40 %	253799212
2036	NC_012943	GCGAC	2	10	2450716	2450725	20 %	0 %	40 %	40 %	253799213
2037	NC_012943	GCCGA	2	10	2453266	2453275	20 %	0 %	40 %	40 %	253799215
2038	NC_012943	GGCGA	2	10	2453966	2453975	20 %	0 %	60 %	20 %	253799216
2039	NC_012943	AGAGG	2	10	2454534	2454543	40 %	0 %	60 %	0 %	253799217
2040	NC_012943	CGGCG	2	10	2457655	2457664	0 %	0 %	60 %	40 %	253799221
2041	NC_012943	CACGA	2	10	2460633	2460642	40 %	0 %	20 %	40 %	253799223
2042	NC_012943	TGCCG	2	10	2462217	2462226	0 %	20 %	40 %	40 %	253799226
2043	NC_012943	CCGCA	2	10	2464031	2464040	20 %	0 %	20 %	60 %	253799228
2044	NC_012943	CGCAT	2	10	2466162	2466171	20 %	20 %	20 %	40 %	253799229
2045	NC_012943	AGCAC	2	10	2466953	2466962	40 %	0 %	20 %	40 %	253799229
2046	NC_012943	GTCCG	2	10	2469248	2469257	0 %	20 %	40 %	40 %	253799233
2047	NC_012943	TCGCG	2	10	2469648	2469657	0 %	20 %	40 %	40 %	253799234
2048	NC_012943	GACCG	2	10	2470219	2470228	20 %	0 %	40 %	40 %	253799234
2049	NC_012943	CCCGC	2	10	2470279	2470288	0 %	0 %	20 %	80 %	253799234
2050	NC_012943	CGTGG	2	10	2470489	2470498	0 %	20 %	60 %	20 %	253799234
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2052	NC_012943	GCGCG	2	10	2473999	2474008	0 %	0 %	60 %	40 %	253799238
2053	NC_012943	TCGCT	2	10	2477913	2477922	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2054	NC_012943	GGCCC	2	10	2480187	2480196	0 %	0 %	40 %	60 %	253799247
2055	NC_012943	GCCCG	2	10	2481345	2481354	0 %	0 %	40 %	60 %	253799248
2056	NC_012943	CTGGC	2	10	2481621	2481630	0 %	20 %	40 %	40 %	253799248
2057	NC_012943	GCCCA	2	10	2483379	2483388	20 %	0 %	20 %	60 %	253799250
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2060	NC_012943	GCGCG	2	10	2486169	2486178	0 %	0 %	60 %	40 %	253799253
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2063	NC_012943	CGGCG	2	10	2490629	2490638	0 %	0 %	60 %	40 %	253799257
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2096	NC_012943	CCACC	2	10	2527061	2527070	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2097	NC_012943	ACTGC	2	10	2527093	2527102	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2098	NC_012943	GCTCG	2	10	2528197	2528206	0 %	20 %	40 %	40 %	253799293
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2127	NC_012943	CGCGC	3	15	2553333	2553347	0 %	0 %	40 %	60 %	253799305
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