MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012943	CGAAC	2	10	1826449	1826458	40 %	0 %	20 %	40 %	253798610
1502	NC_012943	GCCGC	2	10	1829602	1829611	0 %	0 %	40 %	60 %	253798613
1503	NC_012943	GCGCG	2	10	1830036	1830045	0 %	0 %	60 %	40 %	253798613
1504	NC_012943	CGACC	2	10	1830423	1830432	20 %	0 %	20 %	60 %	253798613
1505	NC_012943	CTGGG	2	10	1831037	1831046	0 %	20 %	60 %	20 %	253798614
1506	NC_012943	GGCCT	2	10	1832688	1832697	0 %	20 %	40 %	40 %	253798616
1507	NC_012943	GCAGC	2	10	1833142	1833151	20 %	0 %	40 %	40 %	253798617
1508	NC_012943	GCCGC	2	10	1833247	1833256	0 %	0 %	40 %	60 %	253798618
1509	NC_012943	GGCTG	2	10	1833640	1833649	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1510	NC_012943	GCTGG	2	10	1837247	1837256	0 %	20 %	60 %	20 %	253798625
1511	NC_012943	CGGCG	2	10	1838366	1838375	0 %	0 %	60 %	40 %	253798626
1512	NC_012943	TGAGC	2	10	1838804	1838813	20 %	20 %	40 %	20 %	253798627
1513	NC_012943	CGGGC	2	10	1841233	1841242	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1514	NC_012943	GCCCG	2	10	1842551	1842560	0 %	0 %	40 %	60 %	253798631
1515	NC_012943	AGCGC	2	10	1843355	1843364	20 %	0 %	40 %	40 %	253798632
1516	NC_012943	CGAAG	2	10	1843715	1843724	40 %	0 %	40 %	20 %	253798633
1517	NC_012943	GCCAG	2	10	1846736	1846745	20 %	0 %	40 %	40 %	253798635
1518	NC_012943	CGGCG	2	10	1847534	1847543	0 %	0 %	60 %	40 %	253798635
1519	NC_012943	GCGCA	2	10	1849323	1849332	20 %	0 %	40 %	40 %	253798638
1520	NC_012943	TGGCG	2	10	1851616	1851625	0 %	20 %	60 %	20 %	253798640
1521	NC_012943	GACGG	2	10	1852582	1852591	20 %	0 %	60 %	20 %	253798642
1522	NC_012943	ACTCC	2	10	1852603	1852612	20 %	20 %	0 %	60 %	253798642
1523	NC_012943	CCGCG	2	10	1855788	1855797	0 %	0 %	40 %	60 %	253798646
1524	NC_012943	GGCCG	2	10	1856335	1856344	0 %	0 %	60 %	40 %	253798646
1525	NC_012943	CACCC	2	10	1858688	1858697	20 %	0 %	0 %	80 %	253798648
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1527	NC_012943	GCCGA	2	10	1859255	1859264	20 %	0 %	40 %	40 %	253798649
1528	NC_012943	ACGGC	2	10	1859562	1859571	20 %	0 %	40 %	40 %	253798649
1529	NC_012943	GCTGA	2	10	1860931	1860940	20 %	20 %	40 %	20 %	253798650
1530	NC_012943	GTCGA	2	10	1861104	1861113	20 %	20 %	40 %	20 %	253798651
1531	NC_012943	TCAGA	2	10	1861981	1861990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1532	NC_012943	CGAAC	2	10	1862694	1862703	40 %	0 %	20 %	40 %	253798652
1533	NC_012943	CGCTG	2	10	1866410	1866419	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1534	NC_012943	CGTGA	2	10	1867148	1867157	20 %	20 %	40 %	20 %	253798655
1535	NC_012943	TGCAG	2	10	1868402	1868411	20 %	20 %	40 %	20 %	253798656
1536	NC_012943	CAGCC	2	10	1870341	1870350	20 %	0 %	20 %	60 %	253798660
1537	NC_012943	GCCAG	2	10	1870768	1870777	20 %	0 %	40 %	40 %	253798661
1538	NC_012943	GCGCC	2	10	1871231	1871240	0 %	0 %	40 %	60 %	253798662
1539	NC_012943	TTGCG	2	10	1872223	1872232	0 %	40 %	40 %	20 %	253798664
1540	NC_012943	GCGGT	2	10	1881433	1881442	0 %	20 %	60 %	20 %	253798671
1541	NC_012943	CCGCA	2	10	1882925	1882934	20 %	0 %	20 %	60 %	253798672
1542	NC_012943	AGGTC	2	10	1884204	1884213	20 %	20 %	40 %	20 %	253798673
1543	NC_012943	AGCGA	2	10	1884400	1884409	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_012943	AGCGA	2	10	1884453	1884462	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_012943	AGCGA	2	10	1884506	1884515	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_012943	AGCGA	2	10	1884559	1884568	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_012943	AGCGA	2	10	1884612	1884621	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_012943	AGCGA	2	10	1884665	1884674	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_012943	GGCCG	2	10	1884983	1884992	0 %	0 %	60 %	40 %	253798674
1550	NC_012943	GGGCT	2	10	1886368	1886377	0 %	20 %	60 %	20 %	253798675
1551	NC_012943	GACGT	2	10	1886761	1886770	20 %	20 %	40 %	20 %	253798676
1552	NC_012943	GGTGT	2	10	1886773	1886782	0 %	40 %	60 %	0 %	253798676
1553	NC_012943	GATCG	2	10	1889802	1889811	20 %	20 %	40 %	20 %	253798681
1554	NC_012943	CGGCG	2	10	1890030	1890039	0 %	0 %	60 %	40 %	253798681
1555	NC_012943	CATGC	2	10	1892116	1892125	20 %	20 %	20 %	40 %	253798683
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1557	NC_012943	AGCGC	2	10	1893837	1893846	20 %	0 %	40 %	40 %	253798684
1558	NC_012943	GCCGT	2	10	1897536	1897545	0 %	20 %	40 %	40 %	253798687
1559	NC_012943	AGTTG	2	10	1900060	1900069	20 %	40 %	40 %	0 %	253798690
1560	NC_012943	CAGCG	2	10	1900568	1900577	20 %	0 %	40 %	40 %	253798690
1561	NC_012943	AGGCG	2	10	1904362	1904371	20 %	0 %	60 %	20 %	253798692
1562	NC_012943	GCGCG	2	10	1906080	1906089	0 %	0 %	60 %	40 %	253798695
1563	NC_012943	GATGC	2	10	1906166	1906175	20 %	20 %	40 %	20 %	253798695
1564	NC_012943	GCGAC	2	10	1906277	1906286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1565	NC_012943	CGGCC	2	10	1906551	1906560	0 %	0 %	40 %	60 %	253798696
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1569	NC_012943	TGCGG	2	10	1911713	1911722	0 %	20 %	60 %	20 %	253798703
1570	NC_012943	GACGC	2	10	1912118	1912127	20 %	0 %	40 %	40 %	253798704
1571	NC_012943	GCTGA	2	10	1913173	1913182	20 %	20 %	40 %	20 %	253798705
1572	NC_012943	GGTGG	2	10	1914431	1914440	0 %	20 %	80 %	0 %	253798706
1573	NC_012943	GGCGC	2	10	1914470	1914479	0 %	0 %	60 %	40 %	253798706
1574	NC_012943	GTCGA	2	10	1915835	1915844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1587	NC_012943	TGCGC	2	10	1936503	1936512	0 %	20 %	40 %	40 %	253798721
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1589	NC_012943	CCGTG	2	10	1938913	1938922	0 %	20 %	40 %	40 %	253798723
1590	NC_012943	GGCCG	2	10	1940282	1940291	0 %	0 %	60 %	40 %	253798724
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1597	NC_012943	GCGCC	2	10	1943981	1943990	0 %	0 %	40 %	60 %	253798727
1598	NC_012943	CGGTC	2	10	1944118	1944127	0 %	20 %	40 %	40 %	253798728
1599	NC_012943	GCGCA	2	10	1944477	1944486	20 %	0 %	40 %	40 %	253798728
1600	NC_012943	TCGGT	2	10	1945197	1945206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1601	NC_012943	CGGCA	2	10	1945484	1945493	20 %	0 %	40 %	40 %	253798729
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1603	NC_012943	ATGCG	2	10	1951502	1951511	20 %	20 %	40 %	20 %	253798734
1604	NC_012943	GGACC	2	10	1952478	1952487	20 %	0 %	40 %	40 %	253798735
1605	NC_012943	CGTGA	2	10	1952632	1952641	20 %	20 %	40 %	20 %	253798735
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1611	NC_012943	CCGGG	2	10	1956118	1956127	0 %	0 %	60 %	40 %	253798739
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1876	NC_012943	CTTGG	2	10	2247154	2247163	0 %	40 %	40 %	20 %	253799030
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1884	NC_012943	GATCA	2	10	2255474	2255483	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1970	NC_012943	GGCAA	2	10	2370206	2370215	40 %	0 %	40 %	20 %	253799147
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1977	NC_012943	GGGCG	2	10	2377915	2377924	0 %	0 %	80 %	20 %	253799155
1978	NC_012943	AAGCC	2	10	2380116	2380125	40 %	0 %	20 %	40 %	253799156
1979	NC_012943	GACCC	2	10	2380777	2380786	20 %	0 %	20 %	60 %	253799156
1980	NC_012943	CGGCG	2	10	2381150	2381159	0 %	0 %	60 %	40 %	253799157
1981	NC_012943	GCAAA	2	10	2381320	2381329	60 %	0 %	20 %	20 %	253799157
1982	NC_012943	CCGCC	2	10	2381494	2381503	0 %	0 %	20 %	80 %	253799157
1983	NC_012943	CGGTG	2	10	2383167	2383176	0 %	20 %	60 %	20 %	253799158
1984	NC_012943	ACACC	2	10	2385555	2385564	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1985	NC_012943	CCGCC	3	15	2385601	2385615	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1986	NC_012943	CCGCA	2	10	2387294	2387303	20 %	0 %	20 %	60 %	253799160
1987	NC_012943	GGCTG	2	10	2387431	2387440	0 %	20 %	60 %	20 %	253799160
1988	NC_012943	CGACC	2	10	2387761	2387770	20 %	0 %	20 %	60 %	253799161
1989	NC_012943	CCCCG	2	10	2388231	2388240	0 %	0 %	20 %	80 %	253799161
1990	NC_012943	CCGAC	2	10	2388352	2388361	20 %	0 %	20 %	60 %	253799161
1991	NC_012943	ACCGC	2	10	2388787	2388796	20 %	0 %	20 %	60 %	253799162
1992	NC_012943	CACAT	2	10	2389498	2389507	40 %	20 %	0 %	40 %	253799162
1993	NC_012943	ACCAC	2	10	2390457	2390466	40 %	0 %	0 %	60 %	253799162
1994	NC_012943	CCGGG	2	10	2391318	2391327	0 %	0 %	60 %	40 %	253799163
1995	NC_012943	TGCCT	2	10	2392117	2392126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1996	NC_012943	CCTTG	2	10	2392150	2392159	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1997	NC_012943	CGTCA	2	10	2392733	2392742	20 %	20 %	20 %	40 %	253799164
1998	NC_012943	CGCAT	2	10	2393843	2393852	20 %	20 %	20 %	40 %	253799167
1999	NC_012943	GCAAC	2	10	2394382	2394391	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2000	NC_012943	TCCAC	2	10	2396442	2396451	20 %	20 %	0 %	60 %	253799171

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