MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012943	CACCG	2	10	1217161	1217170	20 %	0 %	20 %	60 %	253798025
1002	NC_012943	GTCGG	2	10	1217969	1217978	0 %	20 %	60 %	20 %	253798026
1003	NC_012943	TGCCG	2	10	1218628	1218637	0 %	20 %	40 %	40 %	253798027
1004	NC_012943	GACGC	2	10	1218686	1218695	20 %	0 %	40 %	40 %	253798027
1005	NC_012943	CACCT	2	10	1218748	1218757	20 %	20 %	0 %	60 %	253798027
1006	NC_012943	CAAGT	2	10	1219651	1219660	40 %	20 %	20 %	20 %	253798027
1007	NC_012943	CAGAA	2	10	1220477	1220486	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_012943	GCAGC	2	10	1221174	1221183	20 %	0 %	40 %	40 %	253798029
1009	NC_012943	GCAAG	2	10	1224606	1224615	40 %	0 %	40 %	20 %	253798033
1010	NC_012943	GCCGA	2	10	1228397	1228406	20 %	0 %	40 %	40 %	253798037
1011	NC_012943	GCTGG	2	10	1231637	1231646	0 %	20 %	60 %	20 %	253798041
1012	NC_012943	CGGCG	2	10	1232215	1232224	0 %	0 %	60 %	40 %	253798042
1013	NC_012943	CTCGG	2	10	1235029	1235038	0 %	20 %	40 %	40 %	253798044
1014	NC_012943	CCACG	2	10	1235504	1235513	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1015	NC_012943	CGGCA	2	10	1237107	1237116	20 %	0 %	40 %	40 %	253798047
1016	NC_012943	CGGTC	2	10	1237608	1237617	0 %	20 %	40 %	40 %	253798047
1017	NC_012943	CGTGC	2	10	1242879	1242888	0 %	20 %	40 %	40 %	253798053
1018	NC_012943	GCAGC	2	10	1243916	1243925	20 %	0 %	40 %	40 %	253798054
1019	NC_012943	CCAAC	2	10	1246184	1246193	40 %	0 %	0 %	60 %	253798058
1020	NC_012943	GCAGA	2	10	1247636	1247645	40 %	0 %	40 %	20 %	253798059
1021	NC_012943	CGATG	2	10	1247951	1247960	20 %	20 %	40 %	20 %	253798059
1022	NC_012943	GATCG	2	10	1248350	1248359	20 %	20 %	40 %	20 %	253798059
1023	NC_012943	ACGCG	2	10	1248428	1248437	20 %	0 %	40 %	40 %	253798059
1024	NC_012943	GTGTG	2	10	1249518	1249527	0 %	40 %	60 %	0 %	253798060
1025	NC_012943	CGAAC	2	10	1251849	1251858	40 %	0 %	20 %	40 %	253798062
1026	NC_012943	TGCGC	2	10	1252884	1252893	0 %	20 %	40 %	40 %	253798062
1027	NC_012943	CGGCC	2	10	1256471	1256480	0 %	0 %	40 %	60 %	253798066
1028	NC_012943	CGGTG	2	10	1257625	1257634	0 %	20 %	60 %	20 %	253798066
1029	NC_012943	GCCGG	2	10	1257694	1257703	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1030	NC_012943	CGCCC	2	10	1258537	1258546	0 %	0 %	20 %	80 %	253798067
1031	NC_012943	GAGCT	2	10	1259439	1259448	20 %	20 %	40 %	20 %	253798068
1032	NC_012943	CCTGC	2	10	1261096	1261105	0 %	20 %	20 %	60 %	253798069
1033	NC_012943	GCTGC	2	10	1264884	1264893	0 %	20 %	40 %	40 %	253798073
1034	NC_012943	CGGGG	2	10	1265687	1265696	0 %	0 %	80 %	20 %	253798074
1035	NC_012943	AACAG	2	10	1265842	1265851	60 %	0 %	20 %	20 %	253798074
1036	NC_012943	CACCC	2	10	1266336	1266345	20 %	0 %	0 %	80 %	253798075
1037	NC_012943	CCCCG	2	10	1266470	1266479	0 %	0 %	20 %	80 %	253798075
1038	NC_012943	GCCCG	2	10	1266485	1266494	0 %	0 %	40 %	60 %	253798075
1039	NC_012943	AAGGC	2	10	1268241	1268250	40 %	0 %	40 %	20 %	253798075
1040	NC_012943	TCGCT	2	10	1268517	1268526	0 %	40 %	20 %	40 %	253798075
1041	NC_012943	CGCTG	2	10	1269259	1269268	0 %	20 %	40 %	40 %	253798077
1042	NC_012943	CGCTG	2	10	1272658	1272667	0 %	20 %	40 %	40 %	253798080
1043	NC_012943	TGGCT	2	10	1276948	1276957	0 %	40 %	40 %	20 %	253798085
1044	NC_012943	CCGAC	2	10	1277458	1277467	20 %	0 %	20 %	60 %	253798086
1045	NC_012943	ATAGT	2	10	1278312	1278321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012943	TCGGT	2	10	1280996	1281005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_012943	GCGCG	2	10	1281864	1281873	0 %	0 %	60 %	40 %	253798091
1048	NC_012943	CTGCG	2	10	1282292	1282301	0 %	20 %	40 %	40 %	253798092
1049	NC_012943	AACTC	2	10	1283312	1283321	40 %	20 %	0 %	40 %	253798092
1050	NC_012943	AGCCG	2	10	1283539	1283548	20 %	0 %	40 %	40 %	253798092
1051	NC_012943	CGCGG	2	10	1285911	1285920	0 %	0 %	60 %	40 %	253798095
1052	NC_012943	CACCG	2	10	1289126	1289135	20 %	0 %	20 %	60 %	253798098
1053	NC_012943	AATCG	2	10	1289705	1289714	40 %	20 %	20 %	20 %	253798098
1054	NC_012943	TAAGA	2	10	1290133	1290142	60 %	20 %	20 %	0 %	253798099
1055	NC_012943	GTCGT	2	10	1290406	1290415	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_012943	GCTGA	2	10	1292120	1292129	20 %	20 %	40 %	20 %	253798100
1057	NC_012943	GTCGA	2	10	1292293	1292302	20 %	20 %	40 %	20 %	253798101
1058	NC_012943	TCAGA	2	10	1293170	1293179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_012943	CTCAG	2	10	1293324	1293333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_012943	CACGA	2	10	1293536	1293545	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_012943	GGTGT	2	10	1294611	1294620	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012943	CTGGT	2	10	1294748	1294757	0 %	40 %	40 %	20 %	253798102
1063	NC_012943	GGCAT	2	10	1294859	1294868	20 %	20 %	40 %	20 %	253798102
1064	NC_012943	GCGGT	2	10	1295585	1295594	0 %	20 %	60 %	20 %	253798103
1065	NC_012943	GTTGC	2	10	1296435	1296444	0 %	40 %	40 %	20 %	253798103
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1067	NC_012943	ACCCG	2	10	1297236	1297245	20 %	0 %	20 %	60 %	253798104
1068	NC_012943	CGGCG	2	10	1297293	1297302	0 %	0 %	60 %	40 %	253798104
1069	NC_012943	CAGCT	2	10	1297454	1297463	20 %	20 %	20 %	40 %	253798104
1070	NC_012943	TCCAC	2	10	1297946	1297955	20 %	20 %	0 %	60 %	253798106
1071	NC_012943	CGGAT	2	10	1301018	1301027	20 %	20 %	40 %	20 %	253798111
1072	NC_012943	TCGGG	3	15	1301114	1301128	0 %	20 %	60 %	20 %	253798111
1073	NC_012943	CGGCC	2	10	1301136	1301145	0 %	0 %	40 %	60 %	253798111
1074	NC_012943	AGCGA	2	10	1303185	1303194	40 %	0 %	40 %	20 %	253798115
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1076	NC_012943	GTCGG	2	10	1304055	1304064	0 %	20 %	60 %	20 %	253798116
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1079	NC_012943	GCGCG	2	10	1305451	1305460	0 %	0 %	60 %	40 %	253798117
1080	NC_012943	GCAGC	2	10	1305566	1305575	20 %	0 %	40 %	40 %	253798117
1081	NC_012943	GCGTC	2	10	1306446	1306455	0 %	20 %	40 %	40 %	253798119
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1083	NC_012943	CGCGG	2	10	1310008	1310017	0 %	0 %	60 %	40 %	253798122
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1087	NC_012943	CAACA	2	10	1314631	1314640	60 %	0 %	0 %	40 %	253798126
1088	NC_012943	ACCAG	2	10	1317162	1317171	40 %	0 %	20 %	40 %	253798129
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1090	NC_012943	GGGGC	2	10	1319383	1319392	0 %	0 %	80 %	20 %	253798130
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1095	NC_012943	GGTGG	2	10	1332277	1332286	0 %	20 %	80 %	0 %	253798143
1096	NC_012943	GGTGC	2	10	1332434	1332443	0 %	20 %	60 %	20 %	253798143
1097	NC_012943	GCCGC	2	10	1333533	1333542	0 %	0 %	40 %	60 %	253798145
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1101	NC_012943	GTGGC	2	10	1335304	1335313	0 %	20 %	60 %	20 %	253798147
1102	NC_012943	TCGGC	2	10	1336092	1336101	0 %	20 %	40 %	40 %	253798148
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1104	NC_012943	TGCGG	2	10	1339762	1339771	0 %	20 %	60 %	20 %	253798153
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1107	NC_012943	CCAAC	2	10	1347538	1347547	40 %	0 %	0 %	60 %	253798164
1108	NC_012943	CGCGG	2	10	1347990	1347999	0 %	0 %	60 %	40 %	253798165
1109	NC_012943	CGGTG	2	10	1350141	1350150	0 %	20 %	60 %	20 %	253798166
1110	NC_012943	CCGAT	2	10	1350395	1350404	20 %	20 %	20 %	40 %	253798166
1111	NC_012943	CGGCC	2	10	1350596	1350605	0 %	0 %	40 %	60 %	253798167
1112	NC_012943	CGGTA	2	10	1350877	1350886	20 %	20 %	40 %	20 %	253798167
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1116	NC_012943	CGATC	2	10	1356063	1356072	20 %	20 %	20 %	40 %	253798172
1117	NC_012943	TCGGC	2	10	1356089	1356098	0 %	20 %	40 %	40 %	253798172
1118	NC_012943	CGGCG	2	10	1359328	1359337	0 %	0 %	60 %	40 %	253798176
1119	NC_012943	CGCGT	2	10	1359427	1359436	0 %	20 %	40 %	40 %	253798176
1120	NC_012943	GCCGG	2	10	1361845	1361854	0 %	0 %	60 %	40 %	253798180
1121	NC_012943	CGCAT	2	10	1364391	1364400	20 %	20 %	20 %	40 %	253798182
1122	NC_012943	CTCTT	2	10	1366631	1366640	0 %	60 %	0 %	40 %	253798184
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1498	NC_012943	GCCCG	2	10	1816126	1816135	0 %	0 %	40 %	60 %	253798600
1499	NC_012943	CGGCG	2	10	1817061	1817070	0 %	0 %	60 %	40 %	253798601
1500	NC_012943	GTTGG	2	10	1818421	1818430	0 %	40 %	60 %	0 %	253798601

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